Parabacteroides sp. CT06: CI960_11835
Help
Entry
CI960_11835 CDS
T05011
Name
(GenBank) RagB/SusD family nutrient uptake outer membrane protein
KO
K21572
starch-binding outer membrane protein, SusD/RagB family
Organism
parc
Parabacteroides sp. CT06
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
parc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
parc02000
]
CI960_11835
Transporters [BR:
parc02000
]
Other transporters
Accessory factors involved in transport [TC:
8
]
CI960_11835
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SusD_RagB
SusD-like_3
TPR_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AST53986
LinkDB
All DBs
Position
complement(2716063..2717841)
Genome browser
AA seq
592 aa
AA seq
DB search
MKHNKYILALAFASMLTLGSCGDDFLGKEPQGVLTPEALANAQGVELLVTSAYAGLASPV
EGYDPYQASPFNWVWGGIYGGDANKGSDPNDQSTVNEIELYNTLSTNGYIKQKWVWVYQM
SKRVNLALQVLENAEDMKEEIRQMRKGELKFLRALAYFEGMRVFGVYLPYIDETNQENDP
KVHNDKDIYSLVVADVDDAIANLSDDPEVVGEVGRANKSAAKALKAKILMWHGDLAEAQP
ILADVLTNGVTSKGMAYGLEDDLDNNFNALTENGKESIFAVQYSNAAENMGGAAFCLAYP
HNTGPGGCCGFYQPSFELVNSFQVDANGLPYLNGEYRTKKSVSVRNSDSSQDAVLAVNDN
NIAVDPRLDFAVGRFGIPYKDWGFPENGWVRDATNGGIFMPKKHVYSKAEDAAGMKALYG
GWAPGSAMNLQYLSVRDLTLLYAECLANAGNLKGAMEQVNKIRRRAALDVNIVKLDDGTP
AANYKIAEYPSSHAAFSNKDVCIKAIRMERKLELAMEGERWFDLSRWGGDVMASELKAYV
DYEKQYISKFAGASYLSSKKTMLPVPDDEILTLGTDPETGTPYLVQPEAWRN
NT seq
1779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacacaacaaatatatattagcgttggcttttgccagtatgctgactttagggtct
tgtggcgatgatttcttgggaaaggagccgcaaggagttttgaccccggaggctttggcg
aatgctcaaggtgtggagttgctggttactagtgcttatgcgggtttagcctctcctgtg
gaaggatacgatccctatcaagcttctccgtttaactgggtatggggtggtatttatggg
ggtgatgctaacaagggatcagaccctaacgaccaatctacggtgaatgagatagaattg
tataatacattgtcgaccaatggctatatcaagcaaaaatgggtttgggtgtatcaaatg
agcaaacgtgttaacttggctcttcaggtcttggaaaatgcggaggatatgaaggaggaa
attcgccaaatgcgtaaaggcgagttgaaattcttacgagccttggcttatttcgaggga
atgcgtgtgtttggtgtttatctcccctatattgatgagactaatcaagagaatgaccca
aaggtgcataatgacaaagatatctatagcttggtcgttgccgacgtggatgatgctata
gcgaatttatcagatgatcctgaggttgttggtgaggttggccgggcgaataagtccgct
gcgaaggctctgaaggctaagatcttgatgtggcatggtgatttggcggaagcgcaacct
atcttagcggatgtgttgacgaatggtgttacgtctaagggtatggcttatggactggaa
gatgatctggacaataacttcaatgctttgacagaaaatggtaaggaatctatttttgcg
gtacaatattcaaatgcggcagagaatatgggaggtgctgccttctgtttagcatatccg
cataatacgggtcccggtggatgttgtggtttctaccagccttcttttgagttggtgaat
tcgttccaagtagatgcgaatggccttccttacttgaacggtgaatatcgtacgaagaaa
agtgtatctgttcgtaactccgatagttcccaagatgctgtgctagccgttaacgataat
aacattgcggtcgatcctcgattggattttgctgtaggtcgttttggtattccttataag
gattggggattcccagagaatggttgggtacgagatgctacgaatggcggtatcttcatg
ccgaaaaagcatgtatatagcaaggctgaggatgcggctggtatgaaagcgttatatggt
ggttgggcaccgggttctgctatgaacttgcaatatttaagtgttcgtgacttgacttta
ttatatgctgaatgcttggctaacgctgggaatctgaaaggtgcgatggagcaggttaac
aagattcgtcgtcgtgcggctttggatgttaatattgttaagttagatgatgggactcca
gccgctaattataagattgccgaatatccttcttcacatgccgcattctcaaacaaagat
gtttgtatcaaggcgattcgcatggagcgtaagttagagttggctatggaaggtgagcgc
tggttcgatttgtcccgttggggtggtgatgtgatggctagtgagttgaaagcctatgtg
gactatgagaaacagtatatctctaagtttgcgggagcttcttatctgtcatcgaaaaag
acaatgttgcccgttcctgacgatgagatcttgactttgggtacagatccggaaacaggt
actccgtacttggtacagccggaagcttggagaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
