Candidatus Profftella armatura (Diaphorina cf. continua): PADco_3480
Help
Entry
PADco_3480 CDS
T11131
Name
(GenBank) PD-(D/E)XK nuclease family protein
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
parm Candidatus Profftella armatura (Diaphorina cf. continua)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
parm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
parm03400
]
PADco_3480
Enzymes [BR:
parm01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
PADco_3480
DNA repair and recombination proteins [BR:
parm03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
PADco_3480
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PDDEXK_1
Cas_Cas4
DUF5007
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCG49768
UniProt:
A0A7R6W0A4
LinkDB
All DBs
Position
444869..447613
Genome browser
AA seq
914 aa
AA seq
DB search
MLYPALRIPPSTSFWFDSIKKIIKHCEDLQIILPKKYDFSSFRVVVPNSLHIQCFKKSFN
KILSSKNYIPPFIGTFDNWLELQAFNFDFFFPIQNHEKLLYLYLKLQKNYLLKKNNVNNK
IDLLIFSRVLIKLFHELTQALLPSIYTLDKIKIRWKSALNYLSPFVRTILKDEIELIWSI
WCDQIKNDEAVWRFINIQKLIIEVEMPLIWFTSIQPSPIEINFLNNYSKNCSVLPIIIDW
SKIPYLYFKAWPEIQLSKTEFTITKKIISPLYNDDKNINTPSNISICSCNSLEDIAIQGA
QNIINWLILGYKKIAIIELDSLVVRRICSLLERSKVFVFNKVGCKLSNTSAAAFLISFFN
VIDEPQKSNKFLIFLKSPYILNDISDKSNYILIIESICRDIMVFNNLDFVLTKLKNINSN
LHELIQKIINKYKKLNSKYYSVSKWNSIILKFFLELNIDKVLDTNESGKLLLKILSNMYK
NIDSLFTFFEYRKFIELQMDMTRFISKSDDHRVIVLSISDVYLLRFNAILIVGIDINNFP
SLVKEILFFSNTFRKKLKLKTNYSLRQKQLRELTELLCCCEKIMLLWQIYKNSELNFISP
LIERLQLILNFSEKKLRTYRSEISLYNIKSIPINPPLPSCSELLPNKISITSYNNFIACP
YKFFAQNMLNLNSINNFYNIPQKYHYGNWVHKILFLYHSSLNSSKKIISLDERFKLLNLI
SEKIFKEAIKICPVSLNYYIFWKKSIQCYLKWSYAHESFGWNFIFGEKKYKKTLFLFNNK
KITLYGRIDRIDKNNINDKYLILDYKTSDYNSLRKKIYNNEDYQLLLYKFLLEKNVNISK
YHAQYIVLSSKQIKIIDIPENILNSITTKILISKIKKQMHSIATGAPLPALGVESICRFC
NMKGLCRKKEWLIN
NT seq
2745 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatatccagcattaagaattcctccatcaacttcattctggttcgattctattaaa
aaaataataaaacattgtgaagatttacaaataattttacctaaaaaatatgatttttcg
tcttttcgtgttgtggttccaaattctcttcatatacaatgttttaaaaaatcatttaat
aagattttatcttctaaaaattatattcccccatttattggaacatttgataattggtta
gaattacaagcatttaattttgattttttttttccaattcaaaatcatgaaaaattacta
tatttatatttgaaattacaaaaaaattatttattaaaaaaaaataatgtaaataataaa
attgatttattaatattttctcgagtattaatcaaattatttcatgaactaactcaagcg
ctattaccatcaatttatacattagataaaattaaaattcgttggaaatcagctttaaat
tatttatcgccatttgtacgtactatattaaaagatgaaattgaattaatatggtcaatt
tggtgtgatcaaattaaaaatgatgaagcagtatggcgttttataaatatacaaaaatta
ataattgaagtagagatgccattaatttggtttacttctattcaaccatctccaattgaa
ataaattttttaaataattatagtaaaaattgttctgtattacctataataatagattgg
tctaaaataccatatttatattttaaagcttggccggaaattcaattatcaaaaactgaa
tttactataactaaaaaaattatatctcctttatataatgatgataaaaatattaatact
ccgtcaaatatatcaatttgttcttgtaatagcttagaagatattgctatacaaggagct
caaaatattattaattggttaattttaggttataaaaaaatcgctattattgaattagat
agtttagtagtacgtagaatttgttctttattggagcgatcaaaagtttttgtttttaat
aaggtgggatgtaaattatcaaacactagtgcagcggcttttttaattagtttttttaat
gtaatagatgaaccgcaaaaatctaataaatttttaatttttttaaagtcaccatatatt
ttaaatgatatttcagataagagtaattatatattaataattgaatcaatttgtcgtgat
attatggtttttaataatttagatttcgttcttacaaaattaaaaaatattaattcaaat
ttacatgaattaatacaaaaaataataaataaatataagaaattaaatagtaaatattat
tctgtatcaaaatggaattctataattttaaaattttttttagaattaaatattgataaa
gtattagatacaaatgaatcaggaaaacttttattaaaaattttatcaaatatgtataaa
aatatagattcattatttacattttttgaatatagaaaatttattgaattacaaatggat
atgacaagatttatatcaaaatcagatgatcatcgtgttattgtgttatcaataagtgat
gtatatttattacgctttaatgctatattgatagttggaattgatattaataattttcct
tccttagtaaaggaaattttatttttttcgaatacatttcgaaaaaaattaaaattaaag
acaaattattctttacgtcaaaaacaattacgcgaattaacggaactattatgttgttgt
gaaaaaattatgttactttggcaaatatataaaaattcagaattaaactttattagtcct
ttaattgagcgcttacaattaatattaaatttctctgaaaaaaaattaagaacatatcgc
tctgaaataagtttatataatataaaatcaattcctataaaccctcctcttccgagttgt
agtgaattacttcccaataaaatatctattactagttataataattttatagcatgtcct
tataaattttttgcacagaatatgcttaatttaaattctattaataatttttataatatt
ccccaaaaatatcattacggaaattgggtgcataaaattctttttttatatcatagttca
ttaaatagctcaaaaaaaataatttctttagatgagcgttttaaattattaaatttaatt
tcggaaaaaatatttaaggaagctataaaaatttgtccagtttccttaaattactacatt
ttttggaaaaaatctattcaatgttatttaaaatggtcttatgctcatgaatcttttggt
tggaattttatatttggtgaaaaaaaatataaaaaaactttatttttatttaataacaaa
aaaataacattatatggtcgtattgatcgtattgataaaaataatataaatgataaatat
ctgatattagattataaaactagtgactataattctttacgaaaaaaaatatacaataat
gaggattatcaattactgctttataaatttttattagaaaaaaacgtaaatatttctaag
tatcatgctcaatatattgtattaagtagtaaacaaataaaaataatagatattcctgaa
aatatattaaattctattacaacgaaaatattaatatcaaaaataaaaaagcaaatgcat
tcaattgcaactggagcaccattacctgctttaggggttgaatcaatttgtcgtttttgt
aatatgaaaggtttatgtagaaaaaaagaatggttaataaattag
DBGET
integrated database retrieval system
