Pseudoalteromonas arctica: PARC_a1917
Help
Entry
PARC_a1917 CDS
T05179
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
part
Pseudoalteromonas arctica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TIG
TIG_SUH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATC86470
UniProt:
A0A290S5G9
LinkDB
All DBs
Position
I:1855755..1859996
Genome browser
AA seq
1413 aa
AA seq
DB search
MNAKQLLALLLAGSLSVTLVGCNESLSEDDSTSIPDGTGGDTGGDTGGDTGGDTGGDTGG
DTGGDTGGDTGGEPIENVGTWENKDEDGDGVPDEQDDYPFDADKTQYPVYIEEEPNDNPS
VANPVELGKGFKVQGVISSRTDKGDLYGFDVDDVTFITAVFKTDAPRFDPQVYLSDSDGL
VQDSIVLFQDELTKTHIVNFQIRESGRYQLSVLDNNYAGGSDLSYEISVFYDEDVDAFDD
QKERGLGSSTETSDMDQDGIKDGFEFVLLNSPADVDFDEDGIPNWQDTDSDGDSFSDKIE
GIEDLNKDRFPNYLDRDADGNSIDDKLESGDFNNPNNFDDDLYIDHLDLDDDGDLILDTF
DTQRLKKAQTVKRTGPDSLLVRWVYNVNFEGQSIRDFIRVGDKVEFEVDGLPSDANNLVF
IFQYADDLINLEPTIARVEENKTYFSVELPSKVGEANVYLAHDEVITDALFIEVNDSKTP
LLKDDNRNISAEETITLVGENFNEQAVVHFNDIAVNANLIDENRLSVEVPKGITGGRYWV
SNEFGRSNSVTYIVETVVSINFDKQYNKSVVSAGGILPAYAKPIINDAYSLQLMGKKPEV
HFTYTNTDSNELEQFLSAIVDPSNTESVTFSYETTAVASLALYMSMYYEPKGIDKLEFSA
MLKNMDFYNTFISEASQHLESNSAFFSHSNPLNSAQEFLSKYSALFKSKLSAELDKTPLG
HSQLLNKTPRSYTSKYSMYTYSSNATNSQDISIEPSIVSYPETNGSWDAFDMTMDATTFL
ENSGEVGKKCGEGVESKWYEVLKYDGCVELQNRSQLYLSTRVYSLDPITGEVPADSLNKP
ISDHIDTPWHKDMMSPQSGSFLGLEYWSADSLIDKCVYKDCLYQIITPGVAGTYGPSIFN
LTGSESYNLRGQEAKKMLAIRTIIDNVMIRFFTLLFDAAGYDINDNSLDKAKISKAVIMA
VYDYLPAITHEVEVLAGKPNATQDDWETLGYNIGLEIYNKEIKPIFSDGSTFPNIKVGPA
TTALLAIYKIKLPDFREKLAIKMAEKFIPIIGNAAAAYQASQLASAMIDMGKTIKDLAAV
PTKLDYVVTWGLNLSDVSPRAIQKTGETKKFTLVGSGLAEVKGIFKDTQAEVIVKDLGNN
LAELDVEYLGVDKIGTHLEFSLSNISQIEAVVGPLQVSVKHRDDEATLPYEILVGTELSI
IDVTPNNGGASDKIEIKGIGFSNKIADNIVTFSGENGVRLTAQIEDATTTALTVAVPSGV
QTGFITVEVNDELSNEFDFFGPKQLLITFGDNGNLKDDVYKLSVNGNVLYDNSSPQRKIG
PVSVSLDEGEHLVELTGIRADDGIGTYYIEFAGDVASVTGDAQSGRDLCPNTIKAYYVTI
ASNSTTKIKPALSNKQLVLQAESDESQTECTNF
NT seq
4242 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgcaaaacaacttttagcattgcttttagcaggctcattgagtgtcacactagtc
ggatgtaacgaatcattaagtgaagatgattcaacatcaataccagatggaaccggtgga
gatactggtggagatactggtggagatactggtggagataccggtggagataccggtgga
gataccggtggagataccggtggagataccggtggagaacctattgaaaatgtaggtact
tgggaaaataaagacgaagacggcgatggcgtgcctgatgaacaggatgattatccgttt
gatgcggataaaactcaataccctgtttatattgaagaagagcctaacgataacccatct
gttgcaaaccctgtggagctgggtaaaggttttaaagttcagggcgttatttcctctaga
acagataaaggggatttatatggctttgatgttgatgatgttactttcataacagctgta
tttaaaacagacgctcctcggtttgaccctcaagtatacctatcagattctgatggatta
gtacaagactcgattgttttattccaagatgaacttacaaaaacacatattgtaaacttt
caaattcgtgaaagtggccgttatcagttaagtgttttagacaacaattacgcaggtggc
tctgatttaagctatgagataagtgttttttacgatgaagatgtagatgcatttgacgat
cagaaagagcgaggattaggttcgtcaactgaaacaagtgacatggatcaagatggcatt
aaagatggctttgaatttgttttattgaatagtcctgcagatgttgactttgatgaagat
ggaatacccaattggcaagatactgactctgatggtgattcattttcagacaaaatagaa
gggattgaagatctaaataaagatcgcttcccaaattatttagaccgcgatgctgatggt
aatagcattgacgataaattggaaagtggtgactttaacaaccctaataattttgatgat
gatttatacatagatcatttagatttagatgatgatggtgatttaattttagatactttt
gatacgcaaaggctaaaaaaagcgcagacagtaaaaagaactgggccggatagtttactt
gttcgctgggtttataatgtaaactttgaaggacaatccattcgagattttatccgagtt
ggggataaagtagaattcgaggttgacggtttaccatctgatgcaaataatttggtcttt
atttttcaatacgctgatgacctaatcaacttagaaccaactatcgctagagtcgaagaa
aacaaaacgtatttcagtgtagagcttcctagcaaggtaggtgaggctaatgtatattta
gcacatgatgaggttattactgatgctctgttcattgaagtcaatgatagtaaaacacca
cttttgaaagatgataatcgtaatattagtgctgaagaaacgattactcttgtaggtgaa
aattttaatgagcaggcggttgtccattttaacgatattgccgtaaacgcaaacttaatt
gatgaaaatagattatcagttgaagttccaaaaggtatcactggtggccgttattgggta
agtaatgaatttgggagaagtaattctgttacttacatagttgaaactgtggtttcgatt
aatttcgacaagcaatataataaatcagtagtctctgctggaggaattttaccagcttac
gcaaagcctattattaatgatgcttactctcttcaattaatgggtaaaaaacctgaagtc
catttcacctatacaaatacagattcaaatgaattagaacaatttttaagtgcaatagtc
gatccaagtaatactgaaagtgttacatttagctatgaaactacagctgtagcaagctta
gcgctttatatgtcaatgtattatgaacctaaaggaatcgataagcttgaattttcagcc
atgctgaaaaatatggatttttataatacttttattagtgaagcgagtcagcatcttgag
agtaatagcgcttttttttcacattcgaacccactaaattcagcgcaagagtttctaagt
aaatatagcgcattatttaaaagtaaattatcagctgaattggataaaactccacttggg
cattctcaattattgaataaaacaccaagatcttatacttcaaaatatagtatgtatacg
tattcctcgaatgcaacaaactctcaagacatttcaattgagccatccattgtttcctac
cctgaaaccaatgggtcgtgggacgcatttgatatgactatggatgcaactactttctta
gaaaactcaggggaagttggaaaaaagtgtggtgaaggtgttgaaagcaaatggtatgaa
gttcttaaatatgatggatgtgtcgagcttcaaaatagaagtcaattatatctaagtaca
cgggtatatagtttagatccaattacaggagaagtaccagcagactcacttaataagcct
atttctgatcatattgatacaccttggcataaagacatgatgtccccacaatcaggttca
tttttaggattagagtattggtcagctgatagcttaatagataaatgtgtatataaagac
tgcttatatcaaataataacacctggagtagcaggtacttatgggccaagtatatttaat
ttaacgggttcagagtcgtataatttaagagggcaggaagccaaaaagatgctcgctata
cggactattattgataatgtgatgatccgcttttttactcttttgttcgatgcagctggc
tatgacataaatgacaactcattagataaagctaagatatctaaagctgtaattatggct
gtttatgattatttaccagcaataactcacgaagttgaagttttagccggaaagccaaac
gctacgcaagatgactgggaaaccttgggctacaacataggccttgagatatataataaa
gaaataaagcctatcttttcagatggtagtactttcccaaatataaaagtaggccctgct
actacagcattgttggctatatataaaataaaacttcctgactttagagaaaaattagct
ataaaaatggctgaaaaatttattccaattatcggtaatgcagcagctgcataccaagct
agtcagcttgcctcagcgatgatagatatggggaaaacgataaaagacctagcagccgtg
ccaacaaagttagattatgttgttacatggggcttaaatttatcagatgtatcacctaga
gcaatacaaaaaactggggagacaaaaaagtttacacttgttggcagtggcttagctgaa
gttaaagggatatttaaagatacacaagctgaagtaattgtaaaggatttaggtaataac
ttggctgagctagatgtagagtatttaggtgtagacaaaataggtacccatcttgagttt
agcttaagtaatatcagccaaatagaggcagttgttggccctttacaagtaagtgtaaaa
catcgcgatgacgaagctactttgccttatgaaatacttgtaggaactgagcttagtatt
attgatgtaacgccaaataatggtggggctagtgataaaatagagattaaagggattggc
tttagtaataaaatagctgataacattgtaacctttagtggagaaaatggtgttaggctt
actgcacaaatagaggatgcaacaacaactgctctaacagtagctgtccctagtggggtc
caaacaggtttcattactgtagaagtaaatgatgagttaagtaatgaattcgattttttt
ggacctaaacagctattaattacgtttggtgataacggtaatttaaaagatgatgtgtat
aaattaagcgtaaatggcaatgtactttatgataatagcagccctcaacgtaaaattggt
cctgttagtgtatcactcgatgaaggagagcatttagtagagcttaccggtattcgcgca
gatgatggcataggcacctattacatcgaatttgcaggagatgtcgcatcagtaacggga
gatgcacaatctggaagagatttatgccccaatacaataaaagcgtattacgtcacaata
gcaagtaatagcaccacgaagataaagcctgcattaagtaataaacaattagtattacaa
gcagaatcggacgaatcacaaactgaatgtacaaacttttga
DBGET
integrated database retrieval system
