Pseudoalteromonas arctica: PARC_b0047 Help Entry PARC_b0047        CDS       T05179                                  Symbol sbcC Name (GenBank) exonuclease SbcC   KO K03546   DNA repair protein SbcC/Rad50 Organism part  Pseudoalteromonas arctica Brite KEGG Orthology (KO) [BR:part00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:part03400]     PARC_b0047 (sbcC) DNA repair and recombination proteins [BR:part03400]  Prokaryotic type   DSBR (double strand breaks repair)    HR (homologous recombination)     RecBC pathway proteins      PARC_b0047 (sbcC)     Archaeal homologous recombinant proteins      PARC_b0047 (sbcC) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  AAA_23 SbcC_Walker_B AAA_29 SMC_N ABC_tran nSTAND_NTPase5 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ATC88302 UniProt:  A0A290S8A2 LinkDB All DBs Position II:50454..54104 Genome browser AA seq 1216 aa AA seqDB search MKITAVRIHNLASIVDAEIDFTKAPLKDAGLFAITGDTGAGKSTFLDAICLALYTKTARL RGDKGNLIEFNGDSIKLNDARNLLRRGTWEGYAEVDFLGQDKQLYRARYTIARTHKKVTG KLKVAEHTLVTLPDETLIADKSHTIKEVESKIGLNFEQFSRAVLLAQHEFAAFLKATGDE RAQLLECLTGTDKFSRIGVRIFERHKEQVAKLEALKAGLESYTLLTPEELELQQTKLTDL KAQTEHTKKELSKTEKALNWYQQATVLEQNLLQAQQTQQQASSALESIVEQSEQAKQAKQ SLEIKDNRSRFNLLTDQNTALDQQITSFKSVDHLAVINERNTALAKHTELLNNANEQKQN AAPVIAKARELDSSIALQTQAVKGTESQITKEQSQLDEFTQQLKQSNSELELANTESTKS QQWLNEHAQLHVLAKDWSYYQQSFDTYLNAQQQLTANLAQSQTLNRELASQTERLNTQNN KVQQCEVALSGEQSTLQALNTQLNEFNAEHCDAQLKSIDYLKEQRERYGQFNAELKQSTQ RQQVLNQQLNESQQAHALLNQHLITSEQALKGNEYALNQARLRASENVEHLRTELRPNEP CLVCGATEHPYAVNQNQQLNNLITDFENAFNAAKKQFDHAQSELHKHQTQHAVLTAEHGQ LEQVIQTAKAKQLDIKNTMQGARTELNDLTPDQLEVTYKQLTEQKAQYFEQQKRQRTLQT KVNELLAALKAEQQVQQQLSNKHLELTHQQNQITSKHSELSAQINELGTTLNSQFENSDF WQQLQANTLELTQLHEQVTQYQQTQMQLEQSQKRQDTANEQIKQLTPLISNNEQSLKALN EELVKAKNLLSTVQSERLALFNNEQISADDYQAKLTSAQEQLQSQVQASQKAYDDAIKQR DEHAITLKNVEQRLLENSQELATLEARYNQWFTDFKVQYSNATHEQVKILLTLSSETIKA HLTQHEQLIQALTDANAALKQQQLTLEKHNSSDKPTQSAEALSTQLSSLNEQQTQLQNSL LATNTAIEQHNQNAKALEGKQAELTTLKTEVEQWHLLNKVLGDATGKTMRNLAQTQTLKI LLHYANSHLKTLNKRYELTAIAQTLDIAIIDRDMADEQRSVNTLSGGESFLVSLALALGL ASLSSNKVQINSLFIDEGFGTLDSETLSIAMDALDSLQAQGRKVGVISHVTQMSERVATQ VHVAKKPGGYSTVEVL NT seq 3651 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaaataaccgcagttcgtattcataatttagcctcaatagttgacgctgaaatagat tttactaaagccccattaaaagacgcaggtctatttgccatcacaggcgatactggcgct ggtaaaagtacctttttagatgccatttgtttagccctttatacaaaaacagcgaggctg cgcggtgataaaggtaacttaattgagtttaacggcgacagcattaagcttaatgatgcg cgaaacttgctacgcagaggtacatgggaaggctacgccgaggtcgactttttaggacaa gataaacagctttatcgtgcgcgctatacaattgcacgaacccataaaaaagtaacaggc aaacttaaagtagcagagcacactttagtaaccctgccagacgaaacccttatagctgac aaaagccacacaataaaagaagtcgagagtaaaatagggcttaactttgagcagttctcc cgtgccgtacttttagcacaacatgagtttgctgcgtttttaaaagccactggcgatgag cgagcgcaacttttagagtgcttaacaggtaccgataaatttagccgtattggcgtgcgt atttttgagcgccataaagagcaagtagcaaagcttgaagcgcttaaagctggtcttgaa agctatactttgttaaccccagaagaacttgagctacaacaaaccaagttaaccgattta aaagcgcaaaccgaacacactaaaaaagagctatccaaaaccgaaaaagcacttaactgg tatcagcaagctacagtacttgagcaaaacttactgcaagcacagcaaacccagcaacaa gcaagctcagcgcttgaaagtatcgttgagcaaagcgagcaggcaaaacaagctaaacaa tcgcttgaaataaaagataaccgcagccgttttaatttgttaaccgatcaaaatacggcg ttggatcagcaaataacatcgtttaaaagtgttgatcatttagcggtaattaacgagcgt aataccgcgcttgctaagcataccgagctgcttaataacgccaatgagcaaaaacaaaat gcagcgcccgttatagctaaagcgagagagctcgacagcagcattgcgttgcaaactcaa gctgtaaaaggtactgagtcgcaaataaccaaagagcaatctcaattagatgagttcaca cagcagcttaaacaaagcaatagcgagcttgaactcgctaataccgaatcaactaaaagc cagcaatggcttaatgaacatgcacagctgcatgttttagcaaaagactggagctactat cagcaaagctttgatacttacttaaatgcacagcagcaattaaccgcaaaccttgcacaa agccaaactcttaatagggagcttgcaagtcagactgagcgtttaaatacacaaaataat aaagtgcagcagtgcgaggtggcacttagtggtgagcaatcaactttacaggcattaaat actcagcttaatgagtttaatgcagagcactgcgacgcgcagttaaaaagtattgattac ttaaaagagcagcgagagcgctacgggcaatttaacgcagaactaaaacaaagtactcaa cgccaacaagtgcttaatcagcagttaaatgaaagccagcaagcccatgctttacttaat cagcatttaataaccagcgagcaagcgcttaaaggcaacgagtacgcacttaaccaagcg cgcttaagagccagcgagaacgtagagcatttacgcactgagcttcgccctaatgaacct tgtttagtgtgcggtgcaactgagcacccgtatgcggtaaatcaaaatcagcaattaaat aacttaattactgattttgaaaacgcttttaatgccgctaaaaagcaatttgaccatgca caaagcgagctgcataagcaccaaactcaacatgccgtattaactgctgaacacgggcaa cttgagcaagtaatacaaacggcaaaagctaaacagctcgacattaaaaataccatgcaa ggcgcacgcacagagcttaacgacttaacgcctgatcagcttgaagtaacttataagcag ttaacggagcaaaaagcgcaatactttgagcaacaaaaacgtcaacgtacactgcaaact aaagtaaatgagctactagcagcacttaaagcagagcagcaagtacagcagcaacttagt aataaacaccttgagcttacacatcagcaaaaccaaataacgagtaagcatagcgaacta agtgcgcaaattaacgagctcggtacaacgcttaatagccaatttgaaaacagtgatttt tggcagcaactacaagccaatacgcttgagcttacccagttgcacgagcaagttacgcag tatcagcaaactcaaatgcaacttgagcaaagccaaaaacgtcaagacacagctaatgag caaataaagcagctcacaccgcttataagtaacaacgagcaatcgttaaaagcacttaat gaagagcttgtaaaagctaaaaatttactaagcactgtacaaagtgagcgcttagcttta tttaataacgagcaaataagcgcagacgactaccaagcaaaactcacaagtgcgcaagag caactgcaatcgcaggttcaagcgagtcaaaaagcctatgacgacgcgataaaacaacga gatgagcacgccataacgcttaaaaatgtagagcaacgcttacttgaaaacagccaagag ctagcaacgcttgaggcacgttataaccagtggtttactgactttaaagtgcaatatagc aatgcaacgcacgaacaggtcaaaattttactaacgcttagtagcgagactattaaagcg catttaactcagcacgagcagttaattcaagcgctaacagatgcaaacgccgcattaaaa cagcagcaacttacgcttgaaaaacacaacagtagcgataaaccaacgcaaagtgcagag gctttaagtacgcaactaagcagcttaaacgagcaacaaacgcagctgcaaaattcatta ctagcaactaataccgctattgagcaacataaccaaaatgcgaaagcgcttgaaggtaag caggctgagttaactacgcttaaaaccgaggttgaacaatggcacttgcttaataaagta ttgggtgatgcaacgggtaaaaccatgcgtaacttagcgcaaacacaaacgttaaaaata ttactgcactatgccaacagccatttaaaaacactcaacaaacgttacgaattaaccgcc atagcgcaaacgctcgacattgcaattatcgaccgcgacatggccgacgagcaacgctct gttaatacactctcaggcggggagtcatttttagtatcgctcgcacttgcacttggttta gcatcgctttcgtcaaacaaagtacaaatcaattctttgtttattgacgaagggtttggt acgttagacagcgaaaccctaagcattgcaatggacgctttggattctttgcaagcacaa ggcagaaaagtaggcgttatatcgcacgtaacacaaatgagcgagcgtgtagccactcaa gtgcatgtagccaaaaagccaggtggatattccacagttgaagttttataa

DBGET integrated database retrieval system