Phalacrocorax aristotelis (European shag): 142050117
Help
Entry
142050117 CDS
T11493
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
parx Phalacrocorax aristotelis (European shag)
Pathway
parx04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
parx00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
142050117 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
parx00536
]
142050117 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
parx00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
142050117 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
142050117
NCBI-ProteinID:
XP_074934561
LinkDB
All DBs
Position
Z:complement(31137732..31323374)
Genome browser
AA seq
2900 aa
AA seq
DB search
MGRRRWLWAQRCLLWLGCLALWAPGAAGQQKPPPVRPAGRAAGGGTHPAAVYREDGAGSA
AAAARVRRRGQQDVLRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPN
MCTCASGQISPTCGSKSIQQCGIRCLNGGTCTDDRCQCQKGYVGTYCGQPVCENGCQNGG
RCIGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFTQVNSQLCQGQLTGIVCTKTLCCATIGRAWG
HPCETCPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGVCQGGNCMNTVGSYECKCPAGHK
QNEATQKCDDIDECSIIPGICEGGECSNTMGSYICICPRGFVSSTDGSRCIDQRASTCFS
NIVNGRCAQELPGRFTKRQCCCESGRCWAIGSVPEMCPVRGSDEHRRLCVDGTPAGGGSR
GGGTGGNGFLPGGNGHGYGPGGAGFIPIPGSNGFSPGVGGAGVGTGGQSPTGSGPIITGL
TILNQTIDICKHHPNLCLNGRCIPTLSSYRCECNMGYKQDANGDCIDVDECTSNPCSNGD
CVNTPGSYYCKCHTGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTDGSFQCICNAGFEL
TADGKNCVDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCSDIDECQTSGIC
MNGHCINTEGSFRCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGVCVRPFPGAVTKSEC
CCASPDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGIGITVDGRDINECALDPDICSNGICENLR
GSYRCNCNSGYEPDHSGRNCVDIDECSVNGLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPKGYVFSTETD
TCEDINECESSPCVNGACRNNLGFFSCECSPGSKLDSTGLICIDSLKGTCWLNIQDSRCE
VNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACSRGFARVKGVTCEDVNECDVFPGVCPN
GRCINSRGSFRCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECIQSVPGKFRMDACCCA
VGAAWGSDCEECPKPGTKEYEALCPRGPGFSNRGDILTGRPFYKDINECKVFPGMCMNGK
CRNTIGSFKCRCNSGFTLDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFDGYES
GFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFQCDCPLGHELSLSREECIDVNECSLSD
TLCRNGKCVNMVGTYQCSCNSGYQATPDRQGCIDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSYECSC
SDGYALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCIDVNE
CDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGATGCTDVDECEIGAHNCDMHATCVNIP
GSFKCSCREGWIGNGIKCIDLDECSNGTHQCSVNAQCVNTPGSYRCACAEGFTGDGFTCS
DVDECAENVHLCENGQCLNVPAAYRCECEMGFTPAADSKSCQDIDECSFQNICVFGTCNN
LPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTG
VGCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVNSTE
YNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPKGYYLSEETR
ICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYNGTS
CENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKNICGNIPGFTFDIHTGKAVD
IDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECGNGDNICQRNADCI
NSPGSYRCECAAGFKLSPSGVCVDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGSYQCICHNGFKASQD
QTMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDIDECSSFFGQVCRNG
RCFNEISSFKCLCNEGYELTLDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYE
VKSESCIDINECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPTGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTNF
ENGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFHDLCPYGHGTIPGIDDT
REDVNECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGVHCIDTDECSVGNPCGNGTC
TNAIGSFECNCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPVGYELRED
QKMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMTRRPDGEGCTDENECRTKPGI
CENGRCMNIIGSYRCECNEGFLSSPSGTECLDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLVTKS
ECCCDGGRGWGNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDIDECKVMPNLCRNGQCINT
MGSFRCFCKIGYTTDISGTSCIDLDECSQSPKPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYILQEDGK
TCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPSLCGSKGIC
QNTPGSFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGYIQHYQ
WNQCVDENECSNPNTCGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQFSNACHDVNECSSTKNPCNY
GCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPLDRDADEENALSPEACYECKIN
GYSKKDNRKKRSANDTIEQISLESLDMGSPLKMRVNISRLDNKDHILELMPAIEPLTNHV
RYIISRGNDDGIFRIHQKDGLSYLHTVKKKSVPGTHTLEITSIPLYKKKELKKLEDSNED
NYLLGELGEALRMRLWLDLY
NT seq
8703 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggagacggcggtggctctgggcgcagcgctgcctgctgtggctgggctgcctggcg
ctctgggcgccgggagcagccgggcaacaaaagccgccgccggttcgccctgcgggaaga
gcagcgggcggcggcacccaccccgccgccgtgtaccgggaggacggggccggcagcgcc
gccgccgccgcccgggtccgccggcgaggacagcaggacgtgctccgcggaccaaatgtg
tgtggctctagattccattcctactgttgccctggatggaaaacgctccctggaggaaat
cagtgcattgttccaatttgtagaaatagctgtggtgatggattttgttcccgtccgaac
atgtgtacttgcgcaagtggacaaatatcacctacttgtggatcaaaatctatacaacag
tgcggcatcaggtgcttgaacggcggcacatgcacggacgaccggtgccagtgccagaag
ggctacgttggaacttactgtgggcagcctgtctgtgaaaatggctgccagaatggagga
cggtgtattggacctaatcgctgtgcatgtgtctacggatttactggccctcaatgtgaa
agagattacagaacaggcccgtgtttcacacaagttaacagccagctgtgtcagggccag
ctaacaggaattgtttgcacaaaaaccctctgttgcgcaaccattgggcgtgcatggggt
catccctgtgaaacgtgccctgctcagcctcagccatgccgtcgtggcttcatccctaat
attcgcactggagcatgtcaagatgttgatgaatgccaggctattcctggagtctgtcaa
ggaggaaactgcatgaatacagtaggttcctacgagtgcaagtgtcctgctggccacaaa
cagaatgaggcaactcaaaaatgtgatgacattgatgaatgcagcatcatcccaggaatc
tgtgaaggtggtgaatgctctaacaccatgggaagttatatctgcatctgcccacggggt
tttgtttcatccacggatggctcccgctgtattgatcaaagggcaagtacatgtttctcc
aacatagtgaatggccgctgtgcacaggagcttcccggtaggttcaccaaaaggcagtgc
tgctgtgagtctggccggtgctgggccatcgggtctgttccagagatgtgtcctgtcaga
gggtctgatgaacaccgcagactttgtgtggatggcactcctgctggaggtggttccaga
ggtggtgggacaggaggaaacgggttccttcctggtggcaatggccatggctatggccca
ggaggagcaggattcattcccatccctggaagcaatggtttctccccaggtgtaggtgga
gcaggggtagggacaggtggtcaaagtcccactggaagtggcccaataattacagggcta
acaatactcaatcagacaatagacatctgtaagcaccatcccaacctttgtttaaatgga
cgttgtataccaaccctttccagttatcgatgtgagtgcaacatgggatataagcaggat
gcaaacggggattgtattgatgttgatgaatgcacttcaaacccatgctctaatggagac
tgtgtcaacacacctggttcctattactgcaagtgccacacaggtttccagagaactcct
actaagcaagcttgcatcgatatagatgagtgcatccagaatggtgttctctgtaaaaat
ggccggtgtgtaaacactgatggaagtttccagtgtatttgcaatgctgggtttgaactg
actgcagatggaaaaaattgtgtggaccacgatgaatgtacgactacaaacatgtgttta
aacgggatgtgcataaacgaagatgggagttttaaatgcatctgcaaaccaggatttgtc
ctggctccaaatgggcgttactgttctgatatcgatgaatgtcagacatcaggaatttgc
atgaatggtcattgcataaatactgaaggatcgtttcggtgtgagtgtccacctggcttg
gctgtgggagttgatggtcgtgtgtgtgtagatactcatatgcgtagcacatgctatgga
ggcatcaaaaaaggagtatgtgtccgtcctttccctggtgctgtgacaaagtctgaatgt
tgctgtgccagtcctgactatggttttggagagccatgtcacccctgccctgctaaaaac
tcagctgaattccatggtctgtgtagcagtggaataggtattactgtggacgggcgagat
attaatgagtgtgcattggatcctgatatttgctccaatggaatttgtgaaaacttacgt
ggcagctatcgttgtaactgtaatagtggctatgagccggatcattctggaaggaattgt
gtggacattgatgaatgctcagtgaacgggctgctgtgtgataatgggctctgtcgaaac
acccctggaagctacagctgtacttgtccaaagggttatgtgttcagcactgagacagac
acatgtgaagatataaatgaatgtgaaagcagcccgtgtgtcaatggtgcctgcaggaac
aatcttggatttttcagttgtgaatgttcaccgggcagcaagttggactctacaggactg
atatgtattgatagcctgaaggggacttgctggcttaacatccaagacagtcgctgtgaa
gtcaacatcaatggtgctacactgaaatctgaatgctgtgctaccttaggagcagcctgg
ggtagcccttgtgagcgatgtgaattagacacagcttgctcaagaggatttgccagagtg
aagggtgttacctgtgaagatgtaaatgagtgtgatgtcttcccgggggtttgtcccaac
gggcggtgcattaacagcagaggctcatttcgctgcgagtgccctgaaggactgacactg
gatggaacagggcgagtgtgtttagatattcgcatggagcaatgctacctgaaatgggat
gaagatgagtgcattcagtctgtgcctggcaagtttcgtatggatgcctgctgctgtgct
gtgggggctgcctggggctccgactgtgaggagtgtcctaagcctggcaccaaggaatat
gaggctctgtgccccagaggtcctggcttttccaacaggggagatattctaactggcagg
ccattttataaagatatcaatgaatgtaaagtgttccctggtatgtgcatgaatggtaaa
tgcagaaacacaattggaagtttcaaatgtagatgtaacagtgggtttactttagatatg
gaggaaagaaactgtacagacattgatgagtgccggatctccccagacttatgtggaagt
ggtacttgtgtcaacactcctggaagctttgagtgtgagtgctttgatggttacgaaagt
ggatttatgatgatgaagaactgtatggatattgatgaatgtgaacgcaaccctctgctg
tgcaggggtggcacatgtgtgaacactgaagggagttttcagtgtgactgtcctttggga
catgagctgtcactatcacgtgaggaatgcatagatgtaaatgagtgctcattaagtgac
actctctgcagaaatggcaagtgtgtgaacatggttggaacataccagtgttcctgtaac
tctgggtaccaggccactcctgacagacaaggctgcatagatattgatgaatgtatgata
atgaatggaggctgtgacacccactgcactaactcagaaggcagctatgaatgtagctgc
agtgatggctatgctctaatgccggatgtcaggacatgtgcagatattgatgaatgtgaa
aacaatccagatatctgtgatggtgggcaatgtactaatattccaggggaatatcgctgt
ctctgttatgatggatttatggcttctatggacatgaaaacttgtattgatgtgaacgaa
tgtgatttgaattccaacatctgtatgtttggggagtgtgaaaacactaaaggttccttc
atttgtcactgtcagctaggatattcagtcaagaaaggagccactggatgcacagatgtg
gatgagtgcgagattggtgctcacaactgtgacatgcatgccacatgtgtcaacatacca
ggaagttttaaatgtagttgcagagaaggatggattggaaacggcattaaatgtattgat
ctcgatgaatgctccaacggaacccaccagtgcagcgtgaacgctcagtgtgtgaacacc
ccagggtcataccgctgtgcctgtgcggagggattcactggtgatggatttacttgttct
gatgttgatgagtgtgcagaaaacgttcatctgtgtgaaaatggacagtgtctgaatgtc
cctgctgcctaccgttgcgagtgtgagatgggattcactcctgccgcagacagcaaatca
tgccaagatatcgatgaatgctccttccagaatatatgtgtatttggtacctgtaataat
ctaccaggaatgtttcattgtatctgtgatgatggctatgaactagatcgaactggtgga
aactgtacagatattgatgaatgtgccgatcccattaattgtgttaatggtctctgtgta
aatactcctggaaggtatgagtgtaattgccctccagacttccagctgaatccaactgga
gtgggttgcgtagataaccgtgttggcaattgctacctgaagtatggaccacgaggggat
ggcagcctatcctgcaacactgaaattggggttggagtcagtcgttcctcatgctgctgc
tcgctgggaaaggcttggggaaacccctgtgagacatgcccccctgtaaacagcacggaa
tataatactctctgtccagggggagaaggattcagaccaaatcccatcaccattatttta
gaagacattgatgaatgtcaggaactgccaggtctctgccaaggtggaaattgcatcaat
acttttggcagcttccagtgtgaatgtccaaaaggctactacctcagtgaagagacaaga
atttgtgaagatattgatgagtgtgttgcacatcctggtgtctgtggtcccggcacctgc
tacaatactttggggaactacacctgcatttgcccacctgaatatatgcaggtgaacgga
ggacataactgcatggacatgaggaaaagcttttgctacagaagctataatggaacctcc
tgtgagaatgaattgcccttcaatgtgaccaaaaggatgtgttgctgtacatacaatgtt
gggaaagcctggaacaaaccttgtgaaccatgtccaactccaggaacagctgaattcaag
aacatatgcgggaatattcctggcttcacttttgatattcatactggaaaagctgttgac
attgatgaatgtaaggaaatcccaggaatctgtgcaaatggtgtttgcatcaatcagatt
ggcagcttccgctgtgaatgccccactggattcagctacaatgacctgctcttggtctgt
gaagatattgacgagtgcggcaatggagacaatatctgccagagaaatgcagactgtatc
aacagtcctggtagttaccgctgtgaatgtgctgctggttttaaactttcacccagtggt
gtctgtgttgatcgcaatgaatgtctggaaattcctaatgtttgcagtcacggtttatgt
gtggacatgcaagggagttaccagtgcatatgtcacaatggttttaaggcatcccaagac
cagactatgtgcatggatgttgatgaatgtgaacgccatccatgtggaaatggaacttgt
aaaaacacggttggatcatataactgcctgtgttatcccggatttgaattaactcataat
aatgattgtatggatatcgatgagtgcagttccttctttggtcaggtgtgcagaaacggg
cggtgtttcaatgaaattagttccttcaaatgtttatgtaatgaaggatatgaacttact
ctagatggcaagaattgcattgatactaatgagtgtgtggcgctacccggttcatgctct
cctggtacctgtcaaaatttggaaggatcattcagatgcatctgtccaccaggatacgaa
gtaaaaagtgaaagttgtattgatattaatgagtgtaatgaggatcccaacatctgtctc
tttggctcttgtacaaacactccaggaggattccagtgcatctgtcctacaggttttgtg
ctctctgataatggacggagatgttttgatactcgccagagcttctgtttcactaatttt
gagaatgggaaatgctcagtgccaaaggctttcaacaccacaaaggcaaagtgttgctgc
agtaaaatgccaggagaaggatggggtgatccttgtgagctctgcccaaaggaagaagaa
gttgcttttcacgacctgtgtccatatggtcatggaactattcctggaattgatgataca
cgtgaagatgtcaatgaatgccttgaaagcccagggatttgctcaaatggtcactgcatc
aatactgatggatcattccgctgtgagtgccccatgggatacaacttagattacactgga
gtacattgcatcgatactgatgaatgttcagttggcaacccatgtggaaacggtacatgc
actaacgcgataggtagttttgaatgcaactgtcatgaaggatttgaaccaggcccaatg
atgaattgtgaagatataaatgagtgcgctcagaatcccttgctgtgtgcttttcgttgc
atcaacacttatggcttctatgaatgcacatgtccagttggctatgaactaagagaagac
caaaagatgtgcaaagatctagatgagtgtgctgaaggtctccatgactgcgagtcaaga
ggcatgatgtgcaaaaatttgattggtaccttcatgtgcatttgtcctcctggaatgacc
cggagaccggatggagagggctgcacagatgaaaatgagtgccgcaccaagccaggtatc
tgtgaaaatggtcgttgcatgaacattattgggagctaccgatgtgaatgtaatgaagga
ttcctctcaagtccgtcaggcaccgagtgtcttgataatcgtcaaggattttgctttgct
gaagttttacagacaatgtgtcagatggcttccagtagccggaatcttgtcactaaatct
gagtgctgctgtgatggaggccggggctggggtaaccagtgtgagctctgtcctcttccc
ggaaccacccaatataagaaactctgtccacatggaccaggctatactacagatggaaga
gatattgatgaatgtaaagtcatgccaaacctatgtagaaatggacagtgtattaacact
atgggctccttccgatgcttttgcaaaattggctataccactgacataagtggcacatct
tgtattgatcttgatgagtgctcccagtctcctaaaccatgcaattttatctgcaagaac
tcagaaggaagctatcagtgctcatgtcctcggggctacatcctccaagaagatggaaag
acatgtaaagatcttgatgaatgtcaaaccaaacaacacaattgtcagtttctctgtgtc
aatacccttggaggcttcacatgcaaatgtccacctggttttacacaacatcacacagct
tgtattgataacaatgaatgtggttctcagccatcgctttgtggatcaaaaggaatttgc
caaaacacccctggaagttttacctgtgaatgtcaaaggggattttctctggattctact
ggattaaactgtgaagatgtggatgaatgtgatggaaaccatagatgccagcatggctgt
caaaatatcctgggtggatacagatgtgggtgcccacaaggatatattcagcattaccag
tggaatcaatgtgttgatgaaaatgaatgctccaatcctaacacatgtggctctgcttct
tgctacaatacacttggaagttacaagtgtgcctgcccatctggattttcttatgaccaa
ttctccaatgcatgccatgatgtgaatgagtgttcttctaccaagaacccctgtaattac
ggttgttccaacactgaaggtggatatctttgtggctgtccacctgggtattacagagtt
ggacaaggccactgtgtctcagggatgggatttaacaaaggccagtatctgccactggat
agagatgctgatgaagagaatgctttgtcccctgaagcgtgttatgagtgcaaaatcaat
ggctactccaaaaaagacaacaggaagaagagaagtgctaatgacactattgagcagatt
agcttggaaagtctagacatgggtagtcctttgaagatgagagtcaacatttccaggctt
gacaacaaggaccacatcctagaactcatgccagccattgagccccttaccaaccacgtg
cgctacatcatctcacgtggcaatgatgatggcatctttcgaatccatcagaaggatgga
ctgagttatttgcacacagttaagaaaaagtcagtgcctggaactcacacactggaaatc
actagcattcctctatataagaaaaaggagctaaagaaactggaagacagcaatgaggac
aactacctcctgggagagctcggggaagctctcagaatgaggctgtggctagacctctac
tag
DBGET
integrated database retrieval system