Paenibacillus sp. S02: KAI36_03862
Help
Entry
KAI36_03862 CDS
T11472
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
pasz Paenibacillus sp. S02
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
ResIII
Helicase_C
AAA_22
SLFN-g3_helicase
DEAD_2
SNF2-rel_dom
Terminase_6N
Trm5_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYK68709
LinkDB
All DBs
Position
complement(4322599..4325142)
Genome browser
AA seq
847 aa
AA seq
DB search
MSFESLIYRMEYSGNIDFLIKKIKKMEIQLEFFNQTDEELSGEETRILLESANILAASVK
IKNKQKALNIATTLPLIKPSNSIVMASSLILRKLGNYPGIKLLEDRNKLSNYKRQLNGMA
LFEAHVFENANTRNLSGKDYLLTNFQKRVVDMIEEEVDGISISAPTSAGKSFVYLKVLLD
KIVKQKGTTAIYIVPTRALIKQVMNDFLSSISEMGLKNIFVGCSSEIEVLIEHPERSNIL
VLTQERLYQLCNRKDVNRVKTNIIVVDEAHNIQYGGRGVLLENAVKFSRLLWPETKILFS
SPLVKNPQKLLDTFEFENGVNERDNLPLVRQNIITVKLLEDTLLVTALFNKEEIAIGKKS
YTYSGSKTISKILSSATLDLWNNQTSIVYSNEPMLSTDVIRELYNNGNFPLLDDVRLNDF
ADFIEEYITESYELANFIRRGLAFHFGSLPAIIRSGIEDLFKLGLLKIVSCTSTLLEGVN
MPAKNIFVYKPKKGRKNPIDNLSFWNLVGRAGRIGNDFSGNVICIELESWVTNPVIGERY
QDIIPSSEIRLVKEPEKFKEFIKSENPKRQESDDYNEQLFSLVIKEHLLGERLENSLYST
DQNLDILKEIDTITGSTINAFKPPTELLNKNPGVMPQKINALWDFLVDNESEIDYLCPVF
PLNESGYERFDLIVNAINVFFNDSSWTEKQVKRITTVGDKWMKGVSLTSLIFYDRQILNR
EQREITKHVKDQIEFINKTIRYQIVKYTQTYIEVLKTFLISINRREDSEKIINISAYLEY
GACATSALEFMAIGLHREAAIKLSRIMGFHDNITTDTCIEWLKNLDVESIDVANYLKKEI
YGLQMTL
NT seq
2544 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcttcgagtccctaatatatagaatggaatactcaggaaatatagattttttaata
aaaaaaataaagaaaatggaaattcaactagaattctttaatcaaactgatgaagagtta
tcgggtgaagaaactaggatacttttggagtctgcaaatatattagctgcatcagttaaa
attaaaaataaacaaaaagcattaaacattgctaccactcttcctttgatcaaaccgtcg
aattcgattgtaatggcttcttcattaatattgaggaaacttggaaattaccctggaata
aaattgttagaagatcgaaataaactaagtaattataaaagacaattaaatgggatggcg
cttttcgaagcacatgtgtttgagaatgctaacactagaaatttatcagggaaagattat
cttttaactaattttcagaaaagagtagttgacatgatcgaggaagaggtagatgggatt
agtatttctgctcctacatctgctggaaagtcatttgtatatctcaaagtgttattagat
aagatagttaaacagaagggtactactgctatttatattgtgccaacaagagcactaatt
aagcaagttatgaacgatttcctttcaagtatatcagaaatgggactaaagaatatcttt
gtaggatgttcttcggaaattgaagtcctaatcgagcatccagaacgatcgaatatacta
gttttaactcaagaaaggttatatcaactttgtaacagaaaagatgtaaacagagttaaa
acaaatattattgtagtggacgaggctcataacattcaatatggtgggagaggagtatta
cttgaaaacgcagttaaattttctcgtttactctggccagagacaaagatactgttttca
agcccgcttgttaaaaatccacaaaaattattggacacatttgagttcgagaatggggta
aatgaaagagataatttgccactggtacgtcagaacattataacagtaaagttgttagaa
gatacgttgttggttaccgcattatttaacaaagaagaaatagctatagggaagaaaagt
tatacttattcgggaagtaaaacaatttctaaaattctttccagtgcaacgttagacctt
tggaataatcaaacttcaattgtctactcaaatgagccaatgctttccactgatgtaatc
agagagttatataacaatggaaattttcctcttctagatgatgtgcgtttaaatgatttt
gctgactttattgaagaatatattacagaaagctatgaacttgcaaattttataagaagg
ggactagcattccattttggttctttgcctgcaataataagatccggtattgaagatcta
tttaaattaggactcttaaaaatagtgagttgtacgtcaaccttattagaaggtgtaaac
atgccagctaagaatatttttgtttacaaacctaaaaaaggtagaaaaaaccctattgat
aaccttagtttctggaatttagtggggagagctggacgaatcggaaatgacttttctggt
aacgttatatgtatagaattagaaagttgggtcacaaatccagttataggagaaagatat
caggatataattccctcttctgaaatcaggttagttaaggaaccagaaaaatttaaagag
tttatcaagagcgaaaatccaaaaaggcaagaaagtgatgattataacgagcagttattc
tcgctagttattaaagagcatctgcttggcgaaagattggaaaattctttgtatagtaca
gatcaaaatttagatattttaaaagagattgacactataactggttcaacaattaacgca
tttaagcctcctacagagttattgaataagaatccaggggttatgccccagaaaataaat
gcattgtgggattttttggttgataatgagagtgagattgattatctctgcccagttttc
ccattaaacgaaagtggctatgaacgttttgacttgatagttaatgctatcaatgttttc
tttaatgatagttcatggactgaaaaacaggttaaaagaatcactacagtaggagataaa
tggatgaaaggcgtttctttgacaagtcttattttttacgatagacagattctaaacaga
gaacaaagagaaattactaagcatgttaaagaccagattgaatttataaataaaacaatc
agatatcaaatagttaaatatactcaaacatatatcgaagtattaaaaaccttccttatt
agcattaatagaagagaggattctgaaaaaataataaatatatcggcatatttagagtat
ggagcttgcgctacttctgcattagagtttatggcaattggtttacatcgtgaagctgca
atcaagttgtctcgtattatgggatttcacgataatattactacagatacttgtatagag
tggttaaagaatctagatgtagaatcaattgatgtagcaaattatttgaaaaaagagatt
tatggattacagatgactttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system