KEGG   Paraglaciecola sp. T6c: Patl_1966
Entry
Patl_1966         CDS       T00372                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
pat  Paraglaciecola sp. T6c
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug ACR_tran RE_SacI_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABG40484
LinkDB
Position
complement(2383917..2387639)
AA seq 1240 aa
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NT seq 3723 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system