Patiriisocius sp. Uisw_017: ABXT67_04995
Help
Entry
ABXT67_04995 CDS
T11559
Name
(GenBank) OmpA family protein
Organism
pati Patiriisocius sp. Uisw_017
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
NCAB1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XOK08057
LinkDB
All DBs
Position
1099082..1100476
Genome browser
AA seq
464 aa
AA seq
DB search
MKHLNSILVAALVFLVVGAANAQDENNPWAIGIGVNAVDTFPAGLRDGQNASDSSNGELF
EEFYNVKDHWNILPSISRLSIGKYLGSGFSLTGVGTVNRISKLGEVRIEDDTYFGLDGEI
KYSFRDMIGGPGGWFDPSLGVGGGYTWIDDIGFGTANGLVSLKIWVAENLAFDVQSGYKH
SFEDYGITHFQHSVGILFKFGGKDTDGDGIYDLEDDCPETFGLAEFNGCPDTDGDGIEDR
QDACPNTPGLAEFNGCADSDGDGIADPQDACPTVAGLASMNGCPDSDSDGITDADDACPN
EAGPKANKGCPWPDTDADSVLDKDDDCPKIPGTVANKGCPEIAAPTPAVMKTLNDYAKTI
LFDTGKASVKDQSKIILNNITAILKEYPNAKFSIDGYTDSVGGNKSNQILSEKRANTVRD
YLVTNGIASDRLSSIGYGEDKPIDSNKTKAGRANNRRVEVILKN
NT seq
1395 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacatcttaacagtattttagttgctgccttggtattcttagtagtaggagcagca
aatgctcaagacgaaaacaacccttgggctatcgggataggtgtcaacgctgttgataca
tttcctgcaggccttagagacggtcaaaatgcctctgactctagtaatggtgagcttttt
gaagaattttacaacgtcaaagatcattggaacatcttaccttctatttctaggttatct
attggaaaatatttaggtagtgggttctctttaacaggtgttggtaccgttaatagaatt
agtaaattaggtgaagttcgtattgaagatgatacttattttggattagatggtgaaatc
aaatacagctttagagatatgattggcggtcctggtggatggtttgatccttctcttgga
gttggtggtggttacacttggattgatgatataggatttggtactgcgaatggtcttgta
agtcttaaaatttgggttgcggaaaaccttgcttttgatgtacaatctggatataagcat
tcattcgaagattatggaattacccattttcaacatagtgttggtattttattcaaattt
ggtggaaaagatacagacggtgatggaatttatgacctagaggacgattgtccagaaact
tttggtttagctgaatttaatggttgccctgatacagacggtgacggtattgaagacaga
caagatgcctgtcctaatacaccaggtttagctgaatttaatggttgtgctgattcagac
ggagatggtattgcagatccacaagatgcttgtcctactgttgctggtttagcttcaatg
aacggttgtccagatagtgatagtgatgggattactgacgctgatgatgcttgccctaac
gaagctggtcctaaagcaaataaaggatgtccatggcctgatacagatgctgactctgtg
ttagacaaggatgatgactgtcctaaaatacctggtactgttgccaacaaaggttgtcca
gaaattgctgctcctactccagccgtaatgaaaactttaaacgactatgcgaaaactata
ttatttgatactggtaaagcgagcgttaaagaccaatcaaaaattatactaaataatatt
actgctattttaaaagaatatcctaatgctaaattctctattgatggttatactgatagt
gtaggaggtaataaatcaaaccaaattctttctgaaaaaagagcgaatacagttagagat
tacttagttactaatggtattgcttctgataggttatcttcaattggttatggtgaagac
aaaccaatagattcgaataaaacgaaagcaggtagagcaaataacagacgtgtagaagtt
attcttaaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
