Prunus avium (sweet cherry): 110745732
Help
Entry
110745732 CDS
T05161
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
pavi
Prunus avium (sweet cherry)
Pathway
pavi03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pavi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
110745732
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pavi03019
]
110745732
Messenger RNA biogenesis [BR:
pavi03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
110745732
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
S1CSD-TOTE-2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110745732
NCBI-ProteinID:
XP_021801551
UniProt:
A0A6P5RL05
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
467 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKEYFSNYGDVLQTVVMRDKVTGRPRGFGFVVFVDPAVL
DRVLQDKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTTGRVGNANPTRSAGNGGNIRTKKIFVGGLPPT
LSEEGFREYFETYGNVTDVVVMYDQSTGRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGGGRSMGGGQGGGGAAGGGYQGYGASGGNPNAYDGRMDSNRYMQSQS
TGGGFPPYGSSGYSAPSYGYGPTSNGIGYGGYGSYGGTNTGYGGPAAAAYGNPNAPNAGY
ASGPPGAPRSSWSSQAPSGYGAMGYGNTAPWGVSGGSAGAGSGGPGSAPAGQSPSAAAGY
GAQGYGYGGYSGSDASYANPSGYGAVGGRSGSVPNNNVGGAGGEQGSGGGYVGSGYGDSN
GNTGYGNAGWRSDPSQASGNYGGQANGGQVGYGGGYGSAQARQSQQQ
NT seq
1404 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaaggcaagctttttattggtgggatttcatgggaaacctcggaggat
aagctgaaggagtacttcagcaactacggcgacgttttgcaaacagtggttatgagggac
aaagtcacgggacgccctagaggttttgggtttgtagtttttgtagatcctgctgttctt
gatagggttcttcaggataagcacaccatcgatggtagaacggttgaggctaagagggcc
ctatcgagagaggagcagcaaaccactggcagagttggaaatgctaaccctactagaagt
gccggaaatggtggaaatattaggaccaagaagatatttgttggagggttgcctcccact
cttagcgaagaaggattccgtgagtattttgaaacttatggcaatgtaactgatgtagta
gtaatgtatgaccaaagtaccggacgtcctcgtggatttggatttatttcatttgatact
gaagaagcagttgacagggttttgcacaaaacatttcatgatttaaatggtaagcaagtg
gaagttaagagggctcttcccaaagatgccaatcccggtgggggtggccgtagcatgggg
ggtggtcaaggtggcggtggtgcagctggtggtggttatcaaggatatggcgcatctggt
ggcaacccaaatgcatatgatggtagaatggactccaacaggtacatgcaatctcagagt
actggaggtggatttccaccttatggttcttctgggtatagtgcacccagttatgggtat
ggtcctaccagtaatggaattggttatggcggttatggaagttacggtggcactaatact
ggctatggaggtccagcagctgctgcctacggaaaccctaatgccccaaatgctggctat
gctagtggtccaccaggtgcccctagaagttcatggagttctcaagccccctctggatat
ggtgctatgggatacgggaatactgctccttggggtgtttcaggtggcagtgcaggtgca
ggcagtggcggccctggttctgcacctgctggtcaatcacctagtgcagcggctgggtat
ggagctcaaggttatggttatggtgggtacagtggaagtgatgcgtcctatgcaaatccg
tctggttatggtgctgttggagggcgttcagggagtgtcccaaataacaatgttggtggc
gcaggtggggagcaaggtagtggtggtggctatgttgggagtggctatggcgattcaaat
ggaaatacaggttatggaaatgctggttggagatctgatccatcccaggcttcaggaaac
tatggtggtcaggcaaatggtggacaagttggttatggtggtgggtatggcagtgctcag
gcacgacaatcccaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
