Prunus avium (sweet cherry): 110753649
Help
Entry
110753649 CDS
T05161
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At4g22760
Organism
pavi
Prunus avium (sweet cherry)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
TPR_7
RTP1_C1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110753649
NCBI-ProteinID:
XP_021810282
UniProt:
A0A6P5S6X9
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
578 aa
AA seq
DB search
MNPNGPNLVFLLNKSLTLNQLKQIHAPIITNGLNELQSLLLRQVLHSNFTYSRTIAQYVH
QILHNLQNPDDFSWGCAIRFFSLHFQYKTALSLYVQIKRLGLCPTSFAVSSALRACARIV
HKVGGISIHAQVHKYGFCGCVYVQTALVDLYSKLGDMETARKVFDGMTEKNVVSWNSILS
GYLKAGNMEEAQVVFDEIPNKDVVSWNSMVSGYARIGNMDEAFFLFQQMPERSSASWNAM
ISGFADCGRMELARSIFDSMPLRNKVSWIAMISGYSKCGNVESARQLFDQTSEKDVLSFN
AMIACYAQNSQPKEALELFNQMLKPEVNIQPNEMTLASVISASSQLGDLKFGLWIETYMS
KDGIELDDHLATALVDLYTKCGDIERAYKLFQGLKKRDVVAYSAMILGCGINGKAVDATK
MFEEMVNAQIYPNLVTYTGLLTAYNHAGLVEEGYRCFNSMNDHGVVPSGDHYGIMVDLFG
RAGQFDKALELIRSMPMQPQAGVWGALLLACSLHNNVELGEIAARNCFKLEPDKSGYYAL
LANIYASAERWDDARRLRKVMEKKGFTKIPGCSWMQSI
NT seq
1737 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatccaaatggtccgaatcttgtatttttactgaataaaagtctaaccttgaaccaa
ctaaaacaaatccatgcacccattatcaccaatggccttaacgagcttcagagcctcttg
ctccgccaagtcctccactcaaatttcacttactctagaactatagctcagtatgtgcac
caaatccttcacaatttgcaaaacccagatgacttttcatggggttgtgccattcgtttc
ttctctctgcatttccagtacaaaacggctttgtccctttacgttcaaatcaaaaggcta
ggactgtgcccaactagttttgctgtgtcctcagctctaagggcatgtgctaggattgta
cataaggtgggtgggatttcaatccatgcccaggttcataagtatgggttttgcggctgt
gtttatgtacaaactgcccttgtggacttgtattctaaactgggtgacatggaaactgca
cggaaggtgtttgatggaatgacagagaagaatgtggtttcttggaattctatattatct
gggtatttgaaagctgggaatatggaagaggctcaggtggtgtttgatgagattccgaat
aaggatgttgtgtcttggaattcaatggtttcggggtatgcaagaataggaaatatggac
gaggcgtttttcttgtttcaacaaatgccagagaggagttcagcttcttggaatgcaatg
attagtggttttgcggattgtggaagaatggaattggcacgaagcatttttgattccatg
ccattaagaaataaagtttcttggattgccatgattagcgggtactcaaaatgcggcaat
gttgagtctgctcgtcaactctttgatcagacgagtgagaaagatgtgctctcgtttaat
gccatgatagcttgctatgcgcaaaatagtcaaccaaaggaggcccttgagctgttcaac
cagatgcttaaaccggaggtgaatattcaaccgaatgagatgactttggcgagtgttata
tctgctagttcacaactaggagatttgaaatttgggttatggattgagacatatatgagt
aaggatggaattgaattagatgatcatttggctactgctttagttgacttgtacacaaaa
tgcggagacattgaaagggcatataagttgtttcaaggcttgaaaaagagagatgtagtt
gcttattcggcgatgatcttgggttgtggcataaatggtaaggcagttgatgcaaccaag
atgtttgaggagatggtaaacgcccaaatttacccaaatttggtcacatacactgggcta
ctaactgcctataaccatgctggtttggttgaagaaggctaccgatgctttaattcaatg
aatgaccatggagttgtgccttcaggagatcattatgggatcatggtcgaccttttcggc
agggcaggacagtttgacaaagcacttgagctaataaggagcatgcctatgcaacctcaa
gctggggtttggggagctttgcttcttgcttgctcattacacaacaatgttgagcttgga
gagattgctgctcggaattgctttaaattggagcctgataaaagcggttattatgctctt
cttgccaacatttatgcttctgctgagagatgggacgacgcgaggagattgagaaaggtt
atggagaagaaaggatttaccaagattcctgggtgtagctggatgcaatcaatttga
DBGET
integrated database retrieval system