Prunus avium (sweet cherry): 110753852
Help
Entry
110753852 CDS
T05161
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
pavi
Prunus avium (sweet cherry)
Pathway
pavi03015
mRNA surveillance pathway
pavi03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pavi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
110753852
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
110753852
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pavi03041
]
110753852
Spliceosome [BR:
pavi03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
110753852
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110753852
NCBI-ProteinID:
XP_021810524
UniProt:
A0A6P5S4E0
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
474 aa
AA seq
DB search
MAGMYGQEGGDGAPPPYGSSGSGGYGGSGGYGSGGGGYGGGGGSGGYGGGSGGGYGGKGG
DGGGYGSGGRGGRGGGGYGGGGGRGGGYQGGDRGGRGADRGGGGRGGRGGSGRDGDWLCP
NPGCGNLNFARRVECNKCGTPSPAGGGGDRGGGSGGSGGYNRGGSGGGYGGNRGGRGGNY
DGGRSSNYEGGKSSSYDGGRGGNFDGRGGGGSRGGSYGSNQGRDDGGYGQVPPHAPPSYG
AAGGNYPPSYNASYGTDAVPPPTSYTGGPTSYPPSYGGPAGGYGGDGLGDARSGGRGGPP
AKYDGGYGAGGRGGYGGAATEAPAKVKQCDQNCGETCDNARIYISNLPPDVTVDELQQLF
GGIGQVGRIKQKRGYKDQWPYNIKIYTDESGKNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNDYELR
GYKINVAMAERSAPRAPLDQGGGRGGYGGGGRRDNYRDGGPDRHQHGGNRARPY
NT seq
1425 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgggatgtacggtcaagagggtggcgatggcgcccctccgccatatggatctagc
ggcagtggaggctacggtggctctggaggctacggaagcggtggtggaggctatggaggt
ggtggtggaagtggaggatatggaggaggtagtggtggtggttatggaggtaaaggcggc
gatggaggtggttacggcagtggaggccgtggtggacgaggtggtggaggttatggcggc
ggtggtggtcgaggcggaggatatcaaggaggagatcgcggtggccgaggtgccgaccgt
ggtggtggtggcagaggtggccgcggtggcagcggaagagatggtgattggctttgccct
aacccaggctgtgggaatttgaactttgcaagaagagttgagtgtaacaagtgtggcacg
ccctctcctgcgggtggcggtggtgatcgtggcggcggcagtggtggcagtggcggttat
aataggggaggaagtggaggaggctacggtggtaatcgtggtggtagaggtggtaattat
gatgggggtcgaagtagtaactatgaaggaggaaaaagtagcagttatgatggaggtaga
gggggtaattttgatggtagaggtggaggtggtagtagaggtggttcttatggcagtaac
caaggaagagatgatggtgggtacggtcaggttcctccacatgcgccgccatcctatggt
gcagctggaggcaattacccaccatcttacaatgctagttatggaacagatgcagttcct
cctcctacaagctatactggtgggcctacatcatatcccccatcctatggtggtcctgcg
ggtggttatggtggtgatggtctgggtgatgcaaggagtggtggccgaggtggccctcct
gctaaatatgatggtgggtatggtgccggtggtcgaggtggatatggtggtgctgctacg
gaagccccagctaaggtgaagcaatgcgaccagaattgtggtgaaacttgtgacaatgct
agaatctacatatcaaacttgccaccagatgttactgttgacgaactgcagcagcttttt
ggaggcattggacaagtgggaagaatcaagcaaaaacgtggctataaggaccaatggcca
tacaatatcaaaatatacacagatgaatcgggaaaaaacaaaggtgatgcatgtttagca
tatgaagatccgtctgctgcacattcagctggtggattttacaatgattacgagttaagg
ggctataagatcaatgttgcgatggcagagaggtcggcacctagggctccgcttgaccag
ggtggtggtagaggtggatatgggggcggtgggcgcagggataattatagagatggtgga
cctgatagacatcaacatggcggaaaccgtgcacggccttattga
DBGET
integrated database retrieval system
