Prunus avium (sweet cherry): 110762459
Help
Entry
110762459 CDS
T05161
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600-like isoform X1
Organism
pavi
Prunus avium (sweet cherry)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
E_motif
PPR_3
Eplus_motif
TPR_17
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110762459
NCBI-ProteinID:
XP_021820794
UniProt:
A0A6P5SWV2
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
810 aa
AA seq
DB search
MKKLIVHLPIRALLRQGLYPEALQASTSTSPLNPFLTNQTYALFLKSGHRLDPFLASAVI
SQFAKLGLFYHALQFLNDTPDPDTVSYNALIAGLARSGRPGPVFDLFDRLRHVGLRPDAF
TLSSLVKACDGLEENEIAHGVCLRLGLGYGGFVVSGLVENYMRNGDVGSAEKCFRECLVV
DNVVWTAMVSGYVWSCEFEKGREVFVEMRGLGLELNEFSLTAVLGALFDEKEGEQVHGVG
VKMGFLWGCSVHLSNAIMNMYSRCGNKQNAAKVFDEITDPDVVSWTERIGAASDGVEALE
LFKILHSGDLKVNEYTIINVLSAIVGLGMLNPGKQIQALCQKLGYLRVVSVGNVLISMYG
KCEQIGDARSIFDDMLCRDSLSWNSLIAGYSENGLVTQALEVLRCMRDISLQPNGYTVAS
LLEVASNLNSPRLATQIHSHVIKIGFMVDDRVVACLIVTYGKCNWIDESKRIFYDINKIN
LVLLNAMATSFVRSGCHADAINLFHISRGLKLEVDSSTFSTVLKACGAITELEQGRVIHS
LALKTGFDQGSFVESAIIDVYCKCGSIGDAEKVFRHASTNNLASWNAMVMGYAQHGFHDE
VSELFNKMSKFGVKPDHITYLGVLTSCCHAGLVKEACSYLNSMFQRDELMPHIEHYACVV
DLLSRLGLLEEAKRTIDQMPICPDAHIWQILLSACTIHKNMDMGRVAAQKLLELEPDNES
AYILLSNLYASAGMWSAVGKVRKEMKEKIVYKEPGSSWLQVGGLLHYFLADDKSHRDSKE
IHTELIRLFRQMSVTSKLENDGPSLMIYDL
NT seq
2433 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaagctcatcgtacacctacctatcagagccttactgcgtcaaggtctctaccca
gaagccctccaagcctccacatcaacttcacctctcaacccatttctaacaaaccaaacc
tacgctctttttcttaagtcgggtcaccgcctggaccccttcctcgcctcagctgtcatt
tcccaatttgccaaattgggtctcttttatcacgcccttcagttcctcaacgacacccct
gacccggatacagtctcttacaacgccctcattgctgggttggcccgctccggcagaccc
ggacccgttttcgatctctttgatcggttgaggcatgtgggtctcaggcctgatgctttt
acattgagttctttggtgaaggcttgtgatggtttggaagagaatgagattgcccatggg
gtttgtttgaggttggggcttggctatggaggttttgtggttagtgggttggttgagaat
tatatgaggaatggggatgttgggtcggctgagaagtgttttagggagtgtttggttgtg
gacaatgtggtttggactgctatggtttctgggtatgtttggagttgtgagtttgaaaag
ggtagagaggtttttgtggagatgaggggtttgggtttggagttgaatgagtttagcttg
actgctgtgcttggtgcattgtttgatgagaaagagggggaacaggttcatggggttggt
gtcaaaatgggatttttatgggggtgttcagttcatttgagtaatgcaattatgaatatg
tattctaggtgtgggaataagcagaatgccgcaaaggttttcgatgaaattactgaccca
gatgttgtttcttggactgaaaggataggagctgcttctgatggtgtggaagctttagaa
ctgttcaaaattttgcactctggggatttgaaggtaaatgaatatacaattataaatgta
ttgtcagccattgtagggctggggatgttaaatcccggtaagcaaatccaagcactttgt
cagaagctggggtatttacgggtggtttctgttggcaacgtgttaatatccatgtatggg
aagtgtgagcagattggtgatgctaggtccatatttgatgatatgctttgccgagattct
ctctcttggaattctttgattgctggatattctgagaatggacttgttactcaggctttg
gaggtacttcgttgcatgcgtgatatctcattacagcctaatgggtatactgtggctagc
cttcttgaagtcgcctccaacttgaattccccaaggctggcaacgcaaatccattcacat
gtgatcaaaattgggttcatggtggatgatcgtgtggtggcttgcttgatagtgacatac
gggaaatgcaattggattgatgaatcaaaaaggatattttatgatattaacaagataaat
ttggtacttcttaatgcaatggcaactagttttgtccgttccggttgtcatgctgatgct
atcaatttgttccatatctcgaggggcttgaaacttgaagtggacagttcaactttcagt
actgtccttaaagcttgtggtgctataactgagttggaacagggaagagtgattcactcc
ctggctcttaaaactggatttgatcaagggagctttgttgaaagcgctattattgacgtt
tattgtaagtgtggaagcataggtgacgcagagaaggtgtttagacatgcttccacaaac
aatttggcttcttggaatgcgatggtgatgggatatgctcaacatggttttcatgatgaa
gtttcggaactattcaacaagatgtctaaatttggagtaaaaccagatcatataacttac
ctgggagttcttacttcatgttgccacgcaggtcttgtcaaagaagcttgtagttactta
aactcaatgtttcagcgtgatgagctaatgccacatatagaacactatgcttgcgtggtc
gacctacttagtcgacttggactcctagaagaagcaaagaggaccattgatcaaatgccc
atttgccctgatgctcatatatggcagattcttctatcggcctgtacaatccataaaaac
atggacatggggagagtcgcagcacagaagcttcttgagttggagcctgacaatgaatct
gcttatattttgctttcaaatctctatgcctcagccggtatgtggagtgctgttggaaaa
gtgagaaaggaaatgaaggaaaaaatagtctacaaagagcctggttctagttggcttcaa
gttggaggattgcttcattactttttagctgacgataaatcacatcgtgatagtaaagaa
atacatacggagctaataaggttgtttcggcaaatgtcagtgacatcaaaattggaaaat
gacggtccaagtttaatgatctatgacttataa
DBGET
integrated database retrieval system
