KEGG   Prunus avium (sweet cherry): 110770574
Entry
110770574         CDS       T05161                                 
Name
(RefSeq) phytochrome A
  KO
K12120  phytochrome A
Organism
pavi  Prunus avium (sweet cherry)
Pathway
pavi04712  Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pavi00001]
 09150 Organismal Systems
  09159 Environmental adaptation
   04712 Circadian rhythm - plant
    110770574
SSDB
Motif
Pfam: PHY PAS PAS_2 GAF HATPase_c HisKA PAS_9 PAS_4
Other DBs
NCBI-GeneID: 110770574
NCBI-ProteinID: XP_021830424
UniProt: A0A6P5TU94
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1124 aa
MSSSRPSDSSTNSGRSRHSARIIAQTTVDAKLHADFEESGSSFDYSNSVRVSGSVGGDQQ
PRSDKVTTAYLHHIQKGKLIQPFGCLLALDEKTFKVIAYSENAPEMLTMVSHAVPSVGDY
PVLGVGTDIRTIFTAPSASALHKALGFGEVSLLNPILVHCKTSGKPFYAITHRVTGSLII
DFEPVKPYEVPMTAAGALQSYKLAAKAIARLQSLPSGSMERLCDTMVQEVFELTGYDRVM
AYKFHDDDHGEVVSEITKPGLEPYLGLHYPSTDIPQASRFLFMKNKVRMIVDCCAKQVKV
LQDEKLPFDLTLCGSTLRAPHSCHLQYMKNMESIASLVMAVVVNEGDDEVASPDSVQPQK
RKRLWGLVVCHNTSPRFVPFPLRYACEFLAQVFAIHVNKEIELEDQMVEKNILRTQTLLC
DMLLRDAPLGIVSQSPNIMDLVKCDGAALLYKSKIWRLGITPSDFQLHDIASWLAEYHMD
STGLSTDSLYDAGFPGALALGDVVCGMAAVRITAKDMLFWFRSHAAAEIRWGGAKHESGE
KDDGWKMHPRSSFKAFLEVVKSRSLPWKDFEMDAIHSLQLILRNAFKDVETVDVNPNAIH
VKLSDLKIEGMQELEAVTSEMVRLIETATVPILAVDVDGLVNGWNTKISELTGLPVDKAI
GKHLLTLVEDSSTKMVKRMLDLALHGKEEQNIQFEIKTHGSRSDLGPISLVVNACASRDI
RENVVGVCFVAQDITGQKTVMDKFTRIEGDYKAIVQNPNPLIPPIFGTDEFGWCSEWNPA
MTKLTGWKREEVIDKMLLGEVFGINMACCPLKSQEAFVNLGIVLNHAMTGQVSEKVPFGF
CARSGKHIECLLCVSKKLDSEGSVTGVFCFLQLASPELQQALHVQRLSEQTAVKRSKELS
YIKRQIRNPLAGMMFSWKMMEGTELGTEQKQLLHTSAQCQHQLNKILDDSDLDTIIDGYL
ELEMVEFTLHEVLLASVSQVMIKSNAKSIRIVHDAAEEIMNETLYGDSLRLQQVLADFLA
VSIYFMPNGGQLTIAANLTKDQLGQSVHLVHLELRITHAGGGIPEGLLNQMFGNDIAISE
EGIGLLVSSRLVKLMNGDVRYLREAGKATFIISVELAAAHKLRS
NT seq 3375 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcttcttcaagacccagcgactcatccaccaattcagggcggtctagacacagtgct
agaattattgctcagacaactgttgatgccaagctgcatgctgattttgaggagtcaggt
agttcctttgactactcgaactcggtgcgcgttagtggttcagttggaggggatcaacaa
cctaggtcagacaaagtgaccactgcttatctccatcacatacagaaaggcaagctgatc
cagccattcggatgcttgctagccttggatgagaaaactttcaaggtcattgcatacagt
gagaatgcccctgaaatgctgactatggtcagtcatgcagtcccaagcgttggggactac
cctgttcttggcgtaggaacagatataagaacaattttcactgcccctagtgcctctgca
ttgcataaggcccttggattcggagaggtttctctcttgaatcccatcttagtccattgc
aagacctctggcaagcctttttatgcaataacccatcgagtaacgggcagtttgatcatt
gacttcgagccggtgaagccttatgaagtccctatgactgctgctggggccctgcagtca
tacaagctggcagctaaagctattgcccgattgcagtctttgcctagtgggagcatggag
aggctttgtgatacaatggtccaagaggtttttgaactcaccggttatgacagggtgatg
gcctataaatttcatgatgatgatcatggggaagtggtctctgagattacgaagcctggc
ctggaaccatatctgggtttgcattatccatccactgacatacctcaggcttcacggttc
ctatttatgaagaataaggtccgaatgattgttgactgttgtgcaaaacaggtgaaggtg
cttcaagatgagaagcttccatttgatctcacattgtgcggttcaaccctaagagcccca
catagttgccatttacaatatatgaagaatatggagtctattgcatctcttgttatggca
gtagtggttaacgagggggatgatgaggtagccagtcctgattctgttcagcctcaaaaa
agaaagagactttggggtttggtagtatgtcataatacaagtccaagatttgttcctttc
cctcttaggtatgcctgtgagtttctagctcaagtatttgccatccatgtcaataaggaa
atagagttggaagatcagatggttgagaagaacatcctgcgcacccaaacgctgttgtgt
gatatgttgttacgagatgcacccttgggtattgtgtcacagagccctaatattatggat
ctagtgaaatgtgatggagctgccctattatacaagagcaagatatggagacttggtata
actccaagtgacttccagcttcatgacatagcctcgtggctcgctgagtaccatatggat
tccacaggtttgagtacggatagtttgtatgacgcagggttcccaggggctcttgctctt
ggtgatgtagtatgtggaatggcagctgtgcggataactgccaaggacatgctcttctgg
tttcgatcccacgctgcggcagaaattcgatggggtggtgcaaaacatgaatctggtgag
aaggatgatggttggaaaatgcaccctagatcatcattcaaggctttccttgaagttgtc
aagtcaaggagcttaccttggaaggactttgaaatggatgcaattcattctttgcagctt
attctgaggaatgcattcaaagatgttgaaactgtggatgtaaaccccaacgcaatccat
gtaaagcttagtgacctaaaaattgaaggcatgcaagaactggaagcagtgacaagcgag
atggtccgtttgattgaaacagccacagttccaattttggcggttgatgttgatgggctg
gttaatgggtggaatacaaaaatttctgagttaactggtcttcctgttgataaagcaatt
ggaaagcatttgctcacgctcgtagaagattcttcaactaaaatggtgaaaaggatgttg
gacttggcgttgcatggcaaagaggaacaaaacatccaatttgagataaaaacacatggc
tctaggagtgaccttggtcccatcagcttagttgtgaatgcttgtgccagcagagacatt
cgtgaaaatgttgtgggggtttgttttgtggcccaggatatcactggtcagaagactgtg
atggacaagttcacccggattgaaggtgattacaaagcaattgtacagaacccaaacccg
ttgatccccccaatatttggtactgatgaatttggctggtgttctgagtggaatccagcg
atgacgaagttaactgggtggaaacgagaggaggtaatagataaaatgctgttgggggag
gtttttgggatcaacatggcctgttgtcctctgaagagtcaagaagctttcgtaaatctt
ggtattgtacttaaccatgccatgacaggtcaggtatccgaaaaggttccttttggtttc
tgtgctcgcagtggaaagcacatagaatgcctgttgtgtgtgagcaagaaattggacagt
gagggctcagtcactggggtgttttgcttcttgcagctggctagcccagagctgcaacaa
gcactccatgtccagcgtttgtcagaacaaactgctgtgaagagatcgaaagaattgtct
tatattaaaaggcagatccggaatcctttagctggtatgatgttttcttggaaaatgatg
gagggtactgagttgggaacagagcagaaacagcttctgcatactagtgcccagtgccag
caccagctcaacaaaatactagatgactcggatcttgataccatcattgacggctacttg
gaactggaaatggtggagttcactttgcatgaagtactgctcgcctcagtcagtcaagtc
atgattaagagcaatgccaagagtatccggattgtccatgacgcagcagaagagatcatg
aatgagaccttgtatggggatagtcttaggcttcaacaagtcttagctgatttcttagcc
gtttcaatttattttatgccaaacggaggccagcttactattgcagccaatttgaccaaa
gatcagttaggacaatccgttcatcttgtgcatttggagctcaggataacacatgcgggt
ggtgggattccggaaggattgctgaaccagatgtttggaaacgacatagccatatctgag
gagggcattggcctgctcgtgagcagtagactggtgaagctcatgaacggagacgtaagg
tatctcagggaagcaggcaaggcaaccttcatcatatccgtggaactcgctgctgcacac
aagttgaggtcctaa

DBGET integrated database retrieval system