'Prunus avium' virescence phytoplasma: JNO41_00245
Help
Entry
JNO41_00245 CDS
T11567
Name
(GenBank) translation initiation factor IF-2
Organism
pavv 'Prunus avium' virescence phytoplasma
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GTP_EFTU
IF-2
EF-G_D2
MMR_HSR1
IF2_N
PduV-EutP
Ras
FeoB_N
Arf
Roc
GTP_EFTU_D4
SpoIIID
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XVJ84924
LinkDB
All DBs
Position
44279..46087
Genome browser
AA seq
602 aa
AA seq
DB search
MNKKQKDDDNISKEKIKVKSYLFNPKHTIKDLANILEISNITLIKKFIEAGIKTNINQFV
TKEIAEMLSMILDIEVIFESTSKESLNEDIKKEMIDSNLTKRVPIVTIMGHVDHGKTTLL
DVIRQTRLVDKEFGGITQHIGAYEIVYDNQKITFIDSPGHEAFSQMRSLGAKVTDICLLV
IAADDGVKPQTIESVKHAQEAEVEIIVVINKIDKTNNKKESIMNDLSNLGLTPEEWGGTT
AYIDISALKKEGIDELLKLILLISEMKNIQTDLTKMVKGVVLEASLNKNKGPSATLITSQ
GVLKIGDVIVVGDNTYGKIRSIEDDLKNSLKEIYPSQPVLITGLDSVPKAGDLFATVSDI
KTAKQIIENKKSSLKEQNQSNSNSNNHIYNNVLISNKDEEKKRLNIILKADTQGSLEAIV
EVLEKLNIQDIKVNIIKATVGMVTLNDIVLAQTFNSCLINFNTVINNTLQKNAKNLKVDM
QNYNILYKIIEDVENKLKNLLDPVLEEKATGQAEIKKIFTISSIGSIAGCYVTKGTIFNN
SIAKVIRNNKVIFQGKIVSLKHLKQNINSANQGHECGILLDNFNNFQIDDIIESLKIEKV
II
NT seq
1809 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaacaaaaggatgatgataatatttctaaagaaaaaattaaagtcaaaagt
tatttatttaatcctaaacatactattaaagatttagctaatattttagaaatttctaat
attactttaattaaaaaatttatagaagcagggattaaaacaaatattaatcaatttgtc
actaaagaaattgctgaaatgttaagtatgattttagatatcgaagttatttttgaatcc
acatctaaagaatctttaaatgaagatattaaaaaagaaatgatagattctaatttaact
aaaagagttcctattgtaactattatggggcacgttgatcatggaaaaactactttgtta
gatgtaattagacaaactcgtttagtagataaagagtttggaggtattacacaacatatc
ggagcttacgaaattgtttatgataatcaaaaaataactttcatagatagtccaggtcat
gaagctttttctcaaatgcgttctctaggagctaaagtaactgatatttgtcttttagta
attgctgctgatgatggagtaaaacctcaaacaattgaatctgttaaacatgctcaagaa
gctgaagtcgaaattattgttgttattaataaaatagataaaactaataataaaaaagaa
agtattatgaatgatttatctaatttaggtttaactcctgaagaatggggcggaacaact
gcatatatagatatttcagctttaaaaaaagaaggaatagatgaattactaaaacttatt
ttattaattagcgaaatgaaaaatattcaaactgatttaactaaaatggttaaaggagtt
gtgttagaagctagtttaaataaaaataaaggtccttcggctactttaatcacttctcaa
ggggttttaaaaataggcgatgtaatagtagtaggcgataatacttatggtaaaattcgt
tctatcgaagatgatttaaaaaatagtttaaaagaaatttacccttcacaacctgtatta
ataacaggtttagattctgtacctaaagcaggtgatttatttgcgactgtttctgatata
aagacagcgaagcaaattatcgaaaataaaaaaagttctttaaaagaacaaaatcaatct
aattcgaattctaataatcatatttataataatgtgttaatatcaaacaaagacgaagaa
aagaaacgtttaaatattattttaaaagcagatactcaaggtagtttagaagctattgtt
gaagttttagaaaaattaaacattcaagacattaaagtaaatattattaaagctactgtt
ggaatggtgactttaaacgatattgtattagcgcaaacctttaattcttgcttaattaac
tttaatacagttattaacaatactttacaaaagaatgctaaaaatttgaaagtagatatg
caaaactataatattctttataaaataatcgaagatgtagaaaataaattaaaaaattta
ttagatcctgttttagaagaaaaagctactggccaagctgagattaaaaaaatctttact
attagttctataggaagcatcgcaggttgttatgttactaaaggaacaatttttaataat
tctatagcgaaagtaattagaaacaataaagttatttttcaaggtaaaattgtttcttta
aaacatttaaaacaaaatattaatagtgctaatcaaggacatgaatgtggtattttgtta
gataattttaataattttcaaattgatgatataatagaatcattaaaaatagagaaagtg
atcatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
