'Prunus avium' virescence phytoplasma: JNO41_01090
Help
Entry
JNO41_01090 CDS
T11567
Symbol
fusA
Name
(GenBank) elongation factor G
Organism
pavv 'Prunus avium' virescence phytoplasma
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GTP_EFTU
EFG_IV
EFG_III
EFG_C
EF-G_D2
GTP_EFTU_D2
RF3_C
MMR_HSR1
FeoB_N
GTP_EFTU_D4
GNT-I
AIG1
SRPRB
Sdh5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XVJ85048
LinkDB
All DBs
Position
228321..230390
Genome browser
AA seq
689 aa
AA seq
DB search
MGRQFKIDKIRNIGIMAHIDAGKTTTTERILFHTGKIHKIGETHEGASQMDWMEQEQERG
ITITSAATTIFWKDNKIQIIDTPGHVDFTVEVSRSLRVLDGAVVVIDAQAGVEPQTETVW
RQATEYKVPRIVFVNKMDKVGADFEYAIGTLKQRLGVKVAAIQWPIGKESNFIGIIDLLE
MTAFKYNNNSFSEDGEFIDIPQDLLEIATQKRQELIELLSEFDDDLMELFFQNKEISADV
LKKVIRKATLTVNFFPVLCGSAFKNKGVLKILDAMIDYLPSPIDVPAIIGLDVNDNEVIR
KASDDEPFTALAFKIMTDPFVGRLTFLRIYSGVLKTGIYVKNASKNFKERIGRLLQMHAN
KREEIQEATAGDIVAVIGLKNTTTGNTLTSENDFVILESMNFPEPVIEIALEPKTKNDQD
KISIALSKLAEEDPTFKVYINHETGQTIIAGMGELHLDIIMDRLKREFKIQANVAKPQVA
YRETLTQVTETEGKFIRQSGGRGQYGHVCIRFEPNEGKGFEFVNKIVGGSVPREYIPAVK
KGLEESLSNGIIAGFPFIDVKAILFDGSYHDVDSSEIAFKIAASIALKETKKNGGLVLLE
PIMDVEVITPDNYVGNVIGDLTSRRGKLENQENRGNAVVIRAFVPLSEMFGYVTNLRSNT
QGRASFVMQFARYAKTPNNITENIIKERN
NT seq
2070 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggacgccaattcaaaattgataaaatacgtaatataggcattatggcgcatattgat
gccggaaaaacaactacaacagaaagaattttatttcatactggtaaaatacataaaata
ggcgaaactcatgaaggcgcttcacaaatggattggatggaacaagagcaagaaagagga
attacaattacttccgcagctacaactattttttggaaagataataaaattcaaattatt
gatactcctggccatgtagattttacagttgaagtttcacgttctttaagagttttagat
ggagcagtagttgttatagatgctcaagcaggagtcgaaccacaaacagaaactgtttgg
cgacaagcaacagaatacaaagtccctagaattgtttttgtcaataagatggacaaggta
ggagcagattttgaatacgctattggtactttaaaacaaagattaggtgtcaaagtagcc
gctattcaatggcctatcggaaaagaaagtaattttattggtattattgatttattggaa
atgactgcttttaaatataataataattctttttcagaagatggcgaatttatagatata
cctcaagatttattagaaatagctactcaaaaaagacaagaattaatagaattattatct
gaatttgatgatgatttaatggaacttttttttcaaaataaagaaattagcgccgatgtt
ttaaagaaagttattagaaaagctactttaactgttaatttttttcctgttttatgtggt
tctgcttttaaaaataaaggagttttgaaaatcttagatgctatgattgattatcttcct
tctcctatcgatgtcccagccataataggtttagatgttaatgataatgaagtaattcgt
aaagcttctgatgacgaaccctttactgctttagcttttaaaattatgactgatccattt
gtaggacgtttgacttttttaagaatttattctggtgttttaaaaactggaatttatgtt
aaaaatgcatcaaaaaattttaaagagcgtataggacgtttattacaaatgcatgccaac
aaaagagaagaaattcaggaagctacggctggagatatcgtagctgttataggtttaaaa
aatactactactggaaatactttaacttcagaaaatgattttgttattttagaatctatg
aattttcctgaaccagttatagaaattgctttagaacctaaaactaaaaatgatcaagat
aaaatttctattgctttaagtaaattagcggaagaagatcctacttttaaggtttatatt
aaccatgaaacagggcaaactattattgctggaatgggcgagttacatcttgatattatt
atggatcgtttaaaacgagaattcaaaatacaagctaatgtagctaaaccacaagtagct
tatagagaaactttaactcaagttacagagacagaaggaaaatttatacgtcaatctgga
ggacgaggtcaatacggtcatgtttgtattcgttttgagcctaacgaaggtaagggattt
gaatttgtaaataaaattgttggtggttctgttcctcgtgaatatattcctgctgtaaaa
aaagggttagaagaatctttaagtaatggtattattgctggatttccttttatagatgta
aaagcgattttatttgatggttcttatcatgatgtcgattcatcagaaattgcttttaaa
attgcagcttctatcgctttaaaagaaacaaaaaaaaatggtggtttagttcttttagaa
cctattatggatgtagaagtgataactcctgataattatgtagggaatgttattggcgat
ttaacatctagaagaggaaaattagaaaatcaagaaaatcgcggaaatgcagttgttatt
agagctttcgtccctttatctgaaatgtttggatatgtgactaatttacgttctaataca
caaggcagagcgagttttgttatgcagttcgctagatatgctaaaacgccaaataatatt
actgaaaatattattaaagagcgtaattaa
DBGET
integrated database retrieval system