Polaribacter batillariae: JL193_03625
Help
Entry
JL193_03625 CDS
T08207
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
pbat
Polaribacter batillariae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbat00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pbat02000
]
JL193_03625
Transporters [BR:
pbat02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
JL193_03625
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
SLFN_AlbA_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTD38398
LinkDB
All DBs
Position
complement(801851..803899)
Genome browser
AA seq
682 aa
AA seq
DB search
MFLNRVLFFFFLSATIFSFSQEKVGEKDTVKVNALDEVIVTATRTVRQLSSLPMPVTLIS
KKQIQKSGATRLKDILQEQTGINFVTTHGGFTGIQMQGLAAEYTMIMIDGAPLVGRKSGN
LDLNRISINNIKQIEIVKGPSSSLYGSEALGGVINIITEKPKKETLKGNISYFLSAGSQD
ELDINTNFLYRKKRLGLVAGINLNSSRGFDLSPKTPYKTTEAYQNYTGNLKLTYDFSDKL
KFLISQRYFYESQTKNTLQSDWNAYIELHQKINRVWSINYSFYATKFKTESKFNEELSKY
NQTLFRPEIRVSAKFKNNYLISGVGFNLDALERTFFEGKKTFNAKYVFAQYDFRPFQKIN
TIIGARLDHHNQYKSAFSPKISSTYKINDWLQLKGSVGYGFKAPDFRQLFFNFNNTAGGY
VVLGVKTLHELYGTESNVQATPKDLNPENSIGYNFGFEIKPISNLKISINGFRNNIKDLI
NAVALKGSLPNLNTGTTVFYYENRNQVFTQGIELDLNYKISNNFRFIGGYQFLVAKDKEE
IHKIKSGKIFFRKTPSSPSEVLKPADYFGLSNRSKHTVNAKLFYQNLEHNFSANLRAIFR
GKYALFDTNNSQGIIDVYDDFVAGNTQVNIAMEKTFFNLLNVQFGIDNLFDEKGLSNSEK
FKNNDAVLLLGRNFYTRIRFNL
NT seq
2049 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttctaaatagagttttgtttttcttttttttatcggcaactatttttagtttctcc
caagaaaaagtaggggaaaaagatactgtaaaagtgaatgctttagacgaagtaattgtt
acagcaacaagaactgttaggcaattgtcttctttgccaatgccagtaactttaatatca
aaaaagcaaattcaaaaatcgggtgcaaccaggttaaaagatattctacaggaacaaaca
ggaattaattttgtaactacccatggtggttttacaggaatacaaatgcaaggtttggct
gcagaatatacaatgataatgattgatggagctcctttagtgggtagaaaatcgggcaat
ttagatctaaatagaattagtataaataatattaaacaaatcgaaattgtaaaagggcct
tcttcttctttatatggttcagaagctttaggaggtgttataaatatcattacagaaaag
cctaaaaaggagactttaaaaggtaatattagctattttttaagtgcaggttcgcaagac
gaactagatataaataccaactttttatacagaaaaaaacggcttggtcttgttgcagga
ataaacttaaattcaagcagaggtttcgatttaagtccaaaaacgccttacaaaacaaca
gaagcatatcaaaattatacaggaaatttaaaactaacctacgatttttctgataaatta
aaatttttaatatcgcaaagatatttttatgaatcacaaactaaaaacaccttacaaagc
gattggaatgcttatatagaattgcatcaaaaaataaacagagtttggagtatcaattat
tctttctacgcgaccaaatttaagaccgaaagcaaatttaatgaagaactgtctaaatac
aatcaaactttatttcgtccagaaattagagtttctgcaaaatttaaaaacaattattta
ataagcggagttgggtttaatttagatgctttagagagaactttttttgaaggaaagaaa
acttttaatgccaaatatgtttttgcacaatacgattttcgtccatttcaaaaaataaat
acgattattggtgctcgtttagaccatcacaatcaatacaaatcggcctttagtccaaaa
atttcttcaacctataaaattaacgattggttacaattaaagggctctgtgggatatgga
tttaaagcaccagattttagacaacttttcttcaattttaacaatactgctggtggctac
gtagttttaggagttaaaaccttgcacgaattgtatggtaccgaatctaatgtacaagca
actcccaaagatttaaacccagaaaattcgattggatacaattttggtttcgaaataaaa
cccatttctaacttaaaaatctctataaatggctttagaaataatattaaagatttaatt
aatgcggtagctttaaaaggaagtttgccaaatttaaatacaggaactacagttttttat
tacgaaaacagaaaccaagtttttacacagggaatcgagttggatttgaattataaaatt
tcaaacaattttagatttattggtggttatcaatttttagtagcaaaagataaagaggag
attcataaaattaaatcaggtaaaattttctttcgaaaaacgccatcatcaccttcagag
gtattaaaacctgcagattattttgggttatcgaaccgatctaaacacaccgtaaatgca
aaattattttatcaaaatttagaacataatttttctgcaaacctacgagctatttttaga
ggtaaatacgcgcttttcgacaccaataatagtcaaggtattatagatgtttatgatgat
tttgttgcaggaaacacacaagtaaatatagctatggaaaaaacttttttcaatttattg
aatgtacaatttggaatagataatttatttgatgaaaaaggtttatctaacagcgaaaaa
tttaaaaataacgatgcggttttattattaggaagaaatttttacacacgaatacggttc
aatttatag
DBGET
integrated database retrieval system
