Polaribacter batillariae: JL193_06385
Help
Entry
JL193_06385 CDS
T08207
Name
(GenBank) PD40 domain-containing protein
Organism
pbat
Polaribacter batillariae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PD40
Amidohydro_1
Amidohydro_3
DPPIV_N
DUF5050
DUF6258
ROQ_II
NagA_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTD38879
UniProt:
A0ABX7T1K6
LinkDB
All DBs
Position
1464627..1467893
Genome browser
AA seq
1088 aa
AA seq
DB search
MIKKRIYILLFVISSALIAQEKPAKWDVNNPHENWLYNTFTLNTDEGTWMNLDVSPDGKT
IVFDLLGDIYKMPISGGTTTILRSGLAYEVQPRFSPNGKYISFTSDAEGGNNIWVMRADG
SDAKSITKEKYRLLNNAVWTPDGKSLVARKHFTSTRSVGAGEMWQYPLSGEAGLKLTTRK
NDQQDVNDPSISPDGRYLYYAEDMYPGGYFQYNKDPNKQIYVIKQYDFETGKTKQVTGGP
GGAARPVVSKDGKLLAFVKRVRTKTVLYIHELATGREWPIYYDLSKDQQEAWAVFGVYPH
FSWLPNNKEIIFWSEGKINKINIDSKEVVNIPFEVNQDIKLAKTHRVKRKVFEPNFTSKM
IKDLKTSPNGKVVVFTALGHIYKKELPNGAPIRLTSLEDFEAEPNFSPDGNSVIFVTWND
ENLGAIYKVNLNGTGVTKLTSEKGIYRTPAYNNAGTRIVYRKENGNGDQGYDYTTKAGIY
TAYLDGSGANKISDEGEFPTFSANDERVFFQTGGSFFGGLTKKLKSVNLNGEDVKSHFSS
KLANRLVPSKSNNWVAFIHLHKLYLAPFVMNGSEINLDANTKSFHVESLSENAGINLHWS
SNDQKVHWTLGDEYFSKIVENNTTNPFAKTNLSTVAATSTKIGLTTKSDIPDGRIAFTNA
RLITMDNDKIIENGTIVIHKNKIEKIGTSKEVAVPSNAKVYDLKGKTIMPGIVDVHAHVG
AFRNGLSTQKHWQFYANLAFGVTTAHDPSVNTAAAFTLEELQKSGLMVGPRMFSTGFILY
GAEGDFKAVVNNLEDARFAISRTKAFGAKSVKSYNQPRREQRQQIMQAAREYGVNVVPEG
GSNFYANMSMIFDGHTGIEHNIPVAPLYKDVLTLWKNSKTGYTPTLIVNYGGMNGEFEWY
QKTNVWENKTLLKYTPRYVVDTRSRHRTMVPEEEYKNGHVLVSESATNLSKLGVKVNLGA
HGQLQGLGAHWELWMLQQGGLSNLEALKAATINGAAYIGAADEIGSLQVGKLADLIVMDK
NPLENIRNSNSVIYTMVNGRLYDVNTMNEIGNYNKKRGKFYFENLDYNQGFPVNLKTNSF
TTPTCSCH
NT seq
3267 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaaaacgcatatatatcttattatttgtaatttcttctgccttaattgcacaa
gaaaaaccggcaaaatgggatgtgaataatccgcacgaaaattggttatacaatacattt
actttaaatacagacgagggaacttggatgaatttagatgtaagtccagatggtaaaacc
atcgttttcgatttattaggcgatatttataaaatgccaatttctggcggaactacaact
attttacgttctggtttggcctacgaagtgcaacctaggtttagcccaaatggaaaatac
atttcttttactagtgatgcagaaggaggaaataatatttgggtaatgagagctgatgga
agtgacgcaaaatcgattacaaaagaaaaatacagattgttaaataacgccgtttggacg
ccagatggaaaatctttagtggctagaaaacactttacatctacacgttctgttggtgct
ggagaaatgtggcaatacccactttctggcgaagccggtttaaagttaacaacccgaaaa
aacgaccaacaagatgtaaacgacccttctatttcaccagatggaaggtatttatactat
gcagaagatatgtatcctggagggtattttcaatataacaaagacccaaacaagcagatt
tacgttatcaaacaatacgatttcgaaactggaaaaacaaaacaagttacaggtggtcct
gggggtgctgcaagacctgtagtttctaaagacggtaaattattggcatttgtaaaacgt
gtaagaaccaaaacagttttatacatacacgaattagcaactggacgagaatggcccatt
tattacgatttaagtaaagaccaacaagaagcgtgggctgtttttggtgtgtatccgcat
ttttcgtggttgccaaataacaaagaaattattttttggtcagaaggtaaaatcaacaaa
attaatatcgattctaaagaagtcgtaaacattccttttgaagtgaatcaagatattaaa
ttggcaaagacacatcgtgtaaaaagaaaggtttttgaacctaattttacttcaaaaatg
attaaagacctaaaaacttcgcccaatggtaaggtggttgtttttactgcattagggcat
atttacaaaaaagaattaccaaatggtgcaccaataagattaacttctttagaagatttt
gaagcagaaccaaacttttctcctgacggaaattcagtaatttttgtaacttggaatgac
gagaatttaggcgcaatttataaagttaatttaaatggtactggagttactaaattaact
tcagaaaaaggaatttatagaactcctgcttataataatgcaggaacaagaattgtgtat
cgaaaagaaaacggcaatggagatcaaggttacgattacactacaaaagcaggaatttac
actgcatatttagatggttctggtgcgaataaaataagtgatgaaggagaatttccaaca
ttttctgccaatgacgaacgagtgttttttcaaactggtgggtctttctttggtggttta
acaaaaaaactaaagagtgtaaatttaaatggagaagacgtaaaaagccatttctcgtct
aaattggccaacagattggtaccaagtaaaagtaacaattgggtagcctttattcatctt
cataaattgtatttagcaccatttgtaatgaatggaagtgaaattaatttagatgccaat
accaaatcttttcatgtagaaagtttgtcggaaaatgctggaattaatttgcattggtct
tctaacgaccaaaaagtacattggactttgggtgacgaatatttttcgaaaattgtcgaa
aataacactacaaatccgtttgcaaaaaccaatttatcgacggtagctgcaaccagtaca
aaaattggattgacgacaaaatctgacattcctgatggaagaattgcctttacaaacgct
cgtttaattaccatggataatgataagattattgaaaacggaaccattgttattcataaa
aacaaaatagaaaaaataggtacttctaaagaagttgctgtgccatctaatgcaaaagtg
tacgatctaaaaggcaaaacaattatgccaggaattgtagatgttcacgcacacgtagga
gcttttagaaacggattaagcacccaaaaacactggcaattttatgcaaatttagctttt
ggtgttactactgctcacgatccttctgtaaatacagctgccgcttttactttagaagaa
ctgcaaaaaagcggtttaatggttggcccaagaatgttttctacaggctttattttatat
ggagcagaaggcgattttaaagctgttgttaataacctagaagatgctcgttttgcaatt
tctagaacaaaagcttttggagcaaaatctgtaaaaagttacaatcaaccaagaagagaa
cagcgtcaacaaattatgcaggcagcaagagaatatggtgtaaatgttgtacctgaaggt
ggttctaatttttatgcaaacatgagtatgatttttgatggacatacaggaattgaacac
aacatacctgttgcacctttgtacaaagatgttttaactctttggaaaaatagtaaaact
ggctacacaccaactttaattgtaaattatggaggcatgaatggcgagttcgaatggtat
caaaaaacaaatgtttgggaaaataaaaccttgttaaaatacaccccaagatatgtcgtg
gacacacgttcgagacacagaactatggtgcctgaagaagaatataaaaacggacatgtt
ttagtttctgagtctgctacaaatctttcaaaattgggcgtaaaagtaaatttaggtgca
cacggacaattgcaaggtttaggtgcacattgggagttgtggatgctacaacaaggaggt
ttgtcgaatttagaagccttaaaagcagctaccattaatggtgcagcatacattggtgct
gcagatgaaattggttctttacaagttggtaaattagcagatttaattgtaatggataag
aatcctttagaaaacattcgaaactctaattctgttatttatacgatggttaatggccgt
ttatacgatgtaaataccatgaacgaaattggaaactacaataaaaaaagaggaaagttt
tattttgaaaacctagattacaaccaaggttttcctgtaaatttaaaaacaaatagtttt
acaactcctacttgtagctgtcactag
DBGET
integrated database retrieval system