Polaribacter batillariae: JL193_10745
Help
Entry
JL193_10745 CDS
T08207
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
pbat
Polaribacter batillariae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
DUF2613
DUF2098
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTD36619
LinkDB
All DBs
Position
2440781..2444044
Genome browser
AA seq
1087 aa
AA seq
DB search
MKKIITYFIKYHVAVNVMVFAFFVFGILGALNMKSSFFPLVDSQLIRITLAYPGASPAEM
EEGVVLKIEDNLKGIVGVERVTSVSRENAATVNVEVEKGKNIDLVLTDVKNAVDRVPSFP
SGMEPPVIAKVESIRPTISFTISGDHVSLKSLKQYARNVENDIRGIEGISQVEISGFPEE
EIEIAVRENDLRAYNMSFTEVANAVRNSNILITGGNIKTADEDYLIRASNRSYYGVELQN
LIVRTQTNGNIIRLKDIAEIRDTWSENPDRLYYNGNLAIDITVSNTNNEDLISSADKIKE
YIHKYNQQQQNVQLSVTSDRSITLNGRTKLLVENGIVGILLVLFFLALFLNLRLAIWVAF
GLPVAFLGMFIFAGQFDVTINVLSLFGMIIVIGILVDDGIVIGENIYHHYYDLGKTKVQA
AIDGTMEVIPPIVSAILTTLIAFSTFFFVDGRIGSFFGEVSTIVILTLTVSLIEALVILP
AHIAHSKALDRKKLENGDAKKTNKIDAFFTKINRGADTYLGKFRDHYYLPFLKFSLNNKI
FIFCLFIATLSISFSALKGGIIKSSFFPRIASDRVQITLNMPQGTNERITDSVISLIEEK
VWMVNKEFSAKQSGNLEVVENVIKRVGPGSANATLSVNLLPGETRDFSSPEITNAIQKLV
GKVYGVESLVFGSGGNFGGSPVAVSLLGNNITELKAVKDELKQTLENNPLLKDVTDNDPA
GIKEVRIKLKDNAYLLGLNLQSVMSQVRFGFFGFQAQRFQRGQDEIKVWVRYDKQDRSSI
NDLDDMRIITPTGTRVPFSEIANYTIERGDIAINHLEGKREIQISADLKDLETSETEILD
NIKNNIMPEILSKYPTVSPLYEGQNREAKKTTDSLNLVGPIILLLIYIVIAFTFRSYSQP
ILLIIMIPFSMIGVIWGHYIHNFSIGILSFLGIIALIGIMVNDGLVLIGKFNSYLKEGLK
YDDALIKAGQSRFRAIFLTSLTTIAGLAPLIFEKSRQAQFLIPMAISIAYGIAIATVLTL
VMLPMMLATSNAIKVKIKWLKTNRDVTKEEVERAIIESKYDDGNTTEIESKEAKKSLESN
FKKDENE
NT seq
3264 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagataattacttattttataaaatatcacgttgcagtaaacgtaatggtcttt
gcattttttgtattcggtattttgggtgcattaaatatgaaatcttccttttttccattg
gtagattcgcaattaattagaattactttagcatatcctggagcttcaccagcagaaatg
gaagaaggtgttgtgctaaaaatagaagacaatttaaaaggaattgttggagtagaaagg
gtaacttctgtttccagagaaaatgctgcaactgtaaatgtagaggtagaaaaaggcaaa
aatatagaccttgttttaacggacgttaaaaatgcagtagatagagtgccttcttttcct
tctggaatggaaccaccagtaattgcaaaagtagaaagtataagacccaccattagtttt
accattagtggagaccatgtttctttaaaatcgttaaaacaatatgcaagaaatgtagaa
aacgacattcgtggtatcgaaggaatttcgcaagtagaaatttctggttttcctgaagaa
gaaatcgaaattgcagttcgcgaaaacgatttacgtgcctacaatatgtcttttacagaa
gttgcaaacgcagttagaaactcgaatattttaattacgggtggaaacataaaaacagcc
gacgaagattatttaattcgtgccagtaatagatcttattacggagttgaactgcaaaat
ttaattgttagaactcaaacaaacggaaacattattcgtttaaaagacattgcagaaatt
agagatacttggtccgaaaacccagatagattgtactataatggaaatttagccatcgat
attacagtaagtaataccaataacgaagacttaatttcttctgcagataaaattaaagag
tatattcataaatacaaccaacaacaacaaaatgttcagttaagtgttactagcgataga
agtatcaccttaaatggaagaacaaaattattggtagaaaacggaattgttggtattctc
ttagtactcttctttttagcacttttcttaaaccttcgtttggcaatttgggtggcattt
ggtttgccagttgcctttttaggaatgtttatttttgcgggtcaatttgatgttaccatt
aacgttttatcgttatttggaatgattatcgtaattggtattttggtagatgatggaatt
gttattggagaaaacatatatcatcattattacgatttaggaaaaacaaaagtacaagca
gcaatcgatggaaccatggaggtaattccgccaatagtctctgcgattttaacaacactc
attgccttttctaccttcttttttgtagatggtagaattggaagtttctttggagaagtc
tctacaattgtaattttaactttaactgtttctttaattgaagccttggttattttacca
gcacacattgcacattcgaaggctctagatagaaaaaagttagaaaatggcgacgcgaaa
aaaaccaataaaatagatgctttttttaccaaaataaacagaggtgcagatacgtattta
ggaaaatttagagaccattattatctgccgtttttaaaattctctttaaataacaagatt
tttattttctgcctatttatagccactttatcaattagtttttctgcattaaaaggaggg
attataaaaagttctttttttccaagaattgctagtgatagagttcaaattacattaaac
atgccacaaggaaccaatgagagaattacagattctgtaatttctttaatagaagaaaaa
gtgtggatggttaataaagagttttctgcaaaacaaagtggaaatttagaggtggtagaa
aatgtcattaaaagagtaggaccaggaagtgccaatgccaccttaagcgtaaatctttta
ccaggagaaacacgagatttttcttccccagaaattaccaatgcaattcaaaaattggta
ggaaaagtatatggagtagaaagtctggtttttggttctggaggtaattttggaggaagc
cctgttgcagtttctttattaggaaacaacattacagaattaaaagcggtaaaagacgag
ctaaaacaaaccttagaaaacaatccattattaaaagatgtaacagacaacgatcctgca
ggaataaaagaagtacgtataaaattaaaagacaatgcgtatttgttaggcttaaattta
caatcggtaatgtcgcaagttcgttttggatttttcggttttcaggcacaacgttttcaa
agaggacaagacgaaattaaagtttgggttcgttacgataaacaagacagatcttcgatt
aacgatttagacgatatgcgaataattacgccaacaggaacgcgtgttccgttttcggaa
atcgcaaattataccatagaaagaggagatattgccattaatcatttagaaggaaaacgc
gaaatacaaatttcggcagatttaaaagatttagaaaccagtgaaaccgagattttagac
aatattaaaaataatattatgccagaaatcttgtctaaatacccaacagtttcaccttta
tacgaagggcaaaatagagaagccaaaaaaaccacagattctttaaacttggtgggacct
attattttattgttaatttatatcgtaatcgcattcacattccgttcttacagccagcca
attttattaataattatgataccatttagtatgattggtgttatttgggggcattatatt
cataatttttccatcggaattttatcctttttaggaatcattgcccttattggaattatg
gtaaatgatggtttggtgttgataggaaaattcaacagttacttaaaagaaggcctaaaa
tacgatgatgctttaataaaagcaggccaatctcgttttagagccattttcttaacctct
ttaacaaccattgctggtttggcgcctttaattttcgaaaaaagtaggcaagcacaattt
ttaattcccatggcaatttcaatagcctatggaattgctattgcaactgttttaacattg
gtaatgttgcctatgatgttagcaacttctaacgcaataaaagtaaaaataaaatggtta
aaaacaaatagagatgttaccaaagaagaagtagaaagagccattatagaatcgaaatac
gacgatggaaacacgactgaaatcgaatctaaagaagcaaaaaaaagcttagagtctaac
tttaaaaaagacgaaaatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system