Plasmodium berghei: 55147703
Help
Entry
55147703 CDS
T01111
Name
(RefSeq) conserved Plasmodium protein, unknown function
KO
K15201
general transcription factor 3C polypeptide 3 (transcription factor C subunit 4)
Organism
pbe
Plasmodium berghei
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
55147703
NCBI-ProteinID:
XP_034419684
LinkDB
All DBs
Position
1:<347207..>352450
Genome browser
AA seq
1747 aa
AA seq
DB search
MDNRSTENKRQQYETGSNYGKESINVDSGSSDSLLENLLNLNKNNNLNVSENIDDMFYSS
IPMNDKLKNKKKNKQFEKDEWTELDLHHRYKYDQSSYMDEEENESDEYNDKNEEEENESD
EYNDKNEEESEYSNLGSDDDVLKYYNMVKSNKRNDENLQNKINKLLNPKKKIETYEEKQK
NILLNSVNDDDIDTLLYDNEEDKICLSYFMDDINKFKKKTLIECENVENAKNVDNGGTSI
SQEQSDIAMDKKIEKNENEKGERKDKIFNSINNRNIIIGEERLLDINNINLNNILYFYFY
SNQSYILNLGNGNKNIYTYDSYIFENSDELTNLKLDNSSNTSISDEELLLLKHNNEESDN
DIFEDENVYTEKQKSSKKKERKKKGRNKKGKTEKMITSTEPSKMNKEVENLINKANNSYI
NKNYEECIKLLEQVIKISPDLHDPYHLLGLIYEREYDNLKKAINYYLIAAHLTRNDFLTW
YNISNLCKIEKEYNILLYCLYKAMRLYKRKKGKLQKKNNNNKKKNLIDENSQNEYSLYVD
EMENDKFSNCNEDESQINFKEKSEINYDNFDKKELFDNFMNHLYFNIAFTYILIEDYKNC
LKNLLIIKENNNIDSYEIIVDIYICICLVIINRPYECYSFLKDMYIKVMKKKSHYNFGYH
EKNIICLFMQSQILNNKYNECIFVYKKLTKNCEHVHIDIFAQFIKSIISVVNFKSKYLIN
TFFFQVLKKNYILYEDIIFNIAESYYAKGMYTCAIFFYQLIYKQDRQTKCNDIIGINDNE
NDTFLDYTNAEKNTSINEIISFDNKINVTNFVYKMVKSYYYIGNYIKGEEIILKILNDEN
IEKDNIEIDIKTLYINILYKLKKYNKSINILLSIKEKKLRSTFSIPKPLSNKEREILLLK
IFRKKNKLLLYTSHNKYILHIFYIYPQKKQNFDKTFSHNNSVYYMYDNYVSHKNINNIIK
INSNICFCYFCIKYNLPILNYFYLFNILDIIDCKNKEIKQMGITHITELYKYREYLLYLS
YSFNIFKNKNKKENYSTIVYKNLKIEENKLYYKDVMIVDISEFIRKNDSYKNEVFNYNKK
NELSNTFCNINNALKEFYSRIYKYKYNVESEILNNRVVMKFYKFSYTLFYFLYELEHDFS
RIYACMEKETFYFRKLKKDNHKNGKTNRDNIIFSSYSGIDYDGVLMKLKKKYIIDKDYEN
KQNSINKIDEIKEKKKKKSVSFLHTKKKMNFFSFESYLGLYFSILFLEECFFLVSIMNLY
DDSIHMLNLYLKNRKTNKIKLLTYINFIKSEFKKRHDTNIFSNIHYYFFDNIYTNSIKEN
INKYYSKIIKNSNNVKNRDCKYYIFRINLLLNRLYISSGNYEKQVRYLNDLYIFNKKKKN
EYRILKYYTDIVLTGKFSQNFLVSVSRSRYKNILIIFRLFLVRSIHFDKTNPFLIYLIAN
VCNISSMVIHAIHEFTRAYTFLLKSRRENIRILNKDNIDNVKIKNKMEKININNLNEGIR
EWRDSAPTQSVDSEIEMNEINETKVEKCVYMKNKLENKFEKISDNVNFLFSLMASYFNYS
GAYKVENRESVIMTSFCILNEYILKRYEQKIKKKKKKYIKYSQFYKIYKYIYLAEILYNL
GRALHYLSYFNECIKLYLNVITLIKKADKEIKKLLKLNEKFIYDYVINMKKCMCYTCLNY
PFIYEKTDLIKIVNYYRNLNTKYSNFYLLFFDKKHLLFSASYNLSAIFRKLGRFEQAKYF
LRYIVWD
NT seq
5244 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataatcgtagcacagaaaataaacgacagcaatatgaaacaggttctaattatgga
aaagaaagcataaatgtagacagtggatcctcggattcactcttagaaaatttacttaat
ttaaataaaaataataatttgaatgtatctgaaaatatagatgatatgttttattcatct
attccaatgaacgataagctcaaaaacaaaaaaaaaaataaacagtttgaaaaagatgaa
tggacagagttagatttacatcatagatataagtatgaccaaagtagctatatggatgaa
gaggaaaatgaaagtgacgaatataatgataaaaatgaagaagaggaaaatgaaagtgac
gaatataatgataaaaatgaagaagaaagtgaatattcaaatttgggaagtgatgatgat
gttttgaaatattataatatggttaaaagtaacaaaagaaatgatgaaaatttacaaaat
aaaattaacaaattattaaatccgaagaaaaaaattgaaacatatgaagaaaaacaaaaa
aatatattattaaattcggtaaacgatgatgatattgatactttattatatgacaatgag
gaagataaaatatgtctttcttattttatggatgatataaataaatttaaaaaaaaaacg
ttaattgagtgtgaaaatgtagaaaatgcaaaaaatgtagataatgggggaacaagtatt
tcccaagaacaaagtgatatagcaatggataaaaaaatagaaaaaaatgaaaatgaaaaa
ggagaaagaaaagataaaatatttaattctattaataatagaaatataataataggcgaa
gaaaggttattagatattaataatataaacttaaataatattttatatttttatttttat
tcaaatcagtcttatatattaaatttggggaatggaaataaaaatatatatacatatgat
tcatatatatttgaaaattctgatgagttaactaacttaaaattagacaatagttcaaat
acgagtataagtgatgaagaattattattattaaaacataacaatgaagaaagtgataat
gatatttttgaggatgaaaatgtatacacagagaagcaaaagagttcgaaaaaaaaagaa
agaaaaaaaaaaggaagaaataaaaaaggaaaaacagaaaaaatgataacatctactgaa
ccatcaaaaatgaataaagaagttgaaaatttaataaataaagctaataatagttatatt
aataaaaattatgaggaatgtataaaattattagaacaagttataaaaatatctccagat
ttacatgacccttatcatttattaggtttaatatatgaaagagagtatgataatttgaaa
aaagcgattaattattatttgatagcagcacatttaactcgtaatgattttttaacttgg
tataatatttctaatttatgtaaaattgaaaaagaatataatatattgttatattgctta
tataaagcaatgagattatataaaagaaaaaagggaaaattacaaaaaaaaaataataat
aacaaaaaaaaaaatttaatagatgaaaatagtcagaatgaatattcgttgtatgtggat
gaaatggaaaatgataaattttcaaattgcaatgaagatgaatctcaaataaatttcaaa
gaaaaaagtgaaataaattatgacaattttgataaaaaagaattatttgataattttatg
aatcatttatattttaatatcgcatttacatatatattaatagaagactataaaaattgt
ctaaaaaatttattaataataaaagaaaataataatatagattcatatgaaataattgtg
gatatatatatatgcatatgcttagtaattataaatcgcccatatgaatgttatagcttt
ttaaaagacatgtacataaaagtaatgaaaaaaaaatctcattataattttggatatcac
gaaaaaaatataatttgtttatttatgcaatcacagatattaaataataaatacaatgaa
tgcatatttgtttataaaaaattaacaaaaaattgtgagcatgtacatattgacatattt
gcacaattcataaaatccataataagtgttgtaaattttaaatctaagtatttaattaat
acatttttttttcaagtattaaaaaaaaattatattttatatgaggatataatttttaat
attgccgaatcatattatgctaaaggaatgtatacatgtgcaatatttttttatcaatta
atttataaacaagatagacaaacaaaatgtaatgatataattggaataaatgacaatgaa
aatgacacttttcttgattacacaaatgcagaaaaaaacacttcaataaatgaaataata
tcttttgacaataaaataaatgttacaaactttgtatataaaatggtaaaaagttattat
tatataggaaattatataaaaggagaagaaataatattaaaaatattaaatgatgaaaat
attgaaaaagataatatagaaatagatataaaaacattatatattaatattttgtataaa
ttaaaaaaatataataaatcaattaatatactattgagtataaaagaaaaaaaattaaga
tcaacattttctatacctaaaccacttagtaataaagaaagagaaatattattattaaaa
atatttagaaaaaaaaataaattattattatacacatcacataataaatatattttacac
atattttatatatatccccaaaaaaaacaaaattttgataaaacttttagtcacaataat
agtgtttattatatgtatgataattatgtatctcataagaatattaataatattattaaa
ataaattcgaatatatgtttttgttatttttgtataaaatataatttaccaatcttaaat
tatttttatttgtttaacattttagatataatagattgtaaaaataaagagataaaacaa
atggggataacccatattacagaattatacaaatatcgtgaatatttgctttatttaagt
tattcctttaatatatttaaaaacaaaaacaaaaaagaaaactatagtactattgtttat
aaaaatttgaaaatagaggaaaacaaattatattataaagacgttatgatagttgatatt
agcgagtttattcgaaaaaatgattcatataaaaatgaagtatttaattataataaaaaa
aacgaattatcaaacacattttgtaacatcaataatgcactcaaagagttttattctaga
atttacaaatataagtataatgttgaatcagaaatattaaataatagagttgttatgaag
ttttacaaatttagttatactcttttttattttttatacgaattggaacatgattttagc
agaatatatgcatgtatggaaaaagaaactttttattttagaaaattaaaaaaagacaat
cataaaaatggcaaaacaaatcgtgataatataattttttcatcatattctggtattgat
tatgatggcgttcttatgaaattaaaaaaaaaatatataattgataaggattatgaaaac
aaacaaaattcaattaataaaatcgatgaaataaaagaaaaaaaaaaaaaaaaaagtgtt
tcatttttgcacacaaaaaaaaaaatgaattttttttctttcgaaagctacttaggactt
tattttagtattttatttttagaagaatgtttttttttagtaagtataatgaatttatat
gatgattctattcatatgttaaatttatatttaaagaataggaaaacaaataaaataaaa
ttactaacatatataaattttataaaaagcgaatttaaaaaaagacatgatacaaatata
ttttctaatatccattattatttttttgacaatatatatactaatagtataaaggaaaat
attaataaatattatagtaaaatcataaaaaatagtaataatgtaaaaaatcgagattgc
aaatattatatttttcgaattaatttattacttaatagattgtatatatccagtgggaat
tatgaaaagcaagttagatacttaaacgatttgtatatatttaataaaaaaaaaaaaaat
gaatatagaattttaaaatattatactgatatagttttaacaggaaaattttctcaaaat
tttttagtatcagtatcaagatcaagatataaaaatattttaattatatttagacttttc
ctagttagaagtatacattttgataaaacaaatccatttcttatttatttaattgcaaat
gtttgtaatatatcatctatggttattcatgcaattcatgagtttacaagggcttatact
ttcttgttaaaatcaagacgtgaaaatattcgtatattgaataaggataatatagataat
gttaaaattaaaaacaaaatggaaaaaataaacataaataatttgaatgaggggataaga
gaatggcgtgatagtgcacctactcaaagtgtagattcagaaatcgaaatgaatgaaata
aatgaaacaaaagttgaaaaatgtgtctatatgaaaaataaattagaaaacaagtttgaa
aaaatatctgataatgtaaattttttgtttagtttgatggcatcgtacttcaattactca
ggggcatataaagtagagaatagagaatctgttattatgacttctttttgtatattaaat
gaatatatattaaaaagatatgaacaaaaaataaaaaaaaaaaaaaaaaaatatataaaa
tattctcaattttataaaatttataaatatatatatttagctgaaatattatataattta
ggaagagccttacactatttatcttattttaatgaatgtataaaattatatttaaatgtt
ataacacttataaaaaaagcagataaagaaataaaaaaattattaaaattgaacgaaaaa
tttatatatgactatgttattaatatgaaaaagtgtatgtgttacacttgtcttaattat
ccatttatttatgaaaaaacagatttaataaaaatagtaaattattacagaaatttaaat
acaaaatattcgaatttttatctccttttttttgataaaaaacatcttcttttttccgca
tcatataaccttagtgccatttttagaaaacttggtagatttgaacaagcaaaatatttt
cttcgttacattgtatgggattag
DBGET
integrated database retrieval system