Plasmodium berghei: 55149135
Help
Entry
55149135 CDS
T01111
Name
(RefSeq) cleavage and polyadenylation specificity factor, putative
KO
K13148
integrator complex subunit 11 [EC:3.1.27.-]
Organism
pbe
Plasmodium berghei
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
55149135
NCBI-ProteinID:
XP_034421036
LinkDB
All DBs
Position
8:<310793..>313696
Genome browser
AA seq
967 aa
AA seq
DB search
MVNYYNQTTVYIKVLGAGQTVGRSCVIVELENRRIMFDCGSHVGYKDERKYPNFNLLVGN
SNLEGAPKIDEENNLNVEVNISIVNSNIADKEKLINNLKKINEMIDCVIISHFHMDHIGA
LPFFTEILQYKGTIIMSYPTKALSPVLLLDGCKISDMKWEKKNLEKQIKMLNEKSDDLLN
YNINCLKKDPWNITEENIYNCINKVVGLQVNETYELGDISITPYYAGHVLGACMYRLEVN
NISVIYTGDYNTIPDKHLGSTKIPVLTPEIFISESTYASYVRPTRKSSELELCNLVNECV
HKGGKVLIPVFAIGRAQELSILLEEYWEKMKINCPIYFGCGLTENANKYYKIYSSWISNN
CVSTEVKNLFDFSNISQFSNNYLNENRPMVLFATPGMLHTGLALKAFKAWASNPNNLIIL
PGYCVQGTIGHKLIMGEKKILLDGSTYIYVNCKIIYLSFSAHADSNGIQQLIKHVMPKNV
IFVHGDKNGMEKLSKHISNQYHINSICPYMGQNCQFNFCKYNINYVYLDRNIYNNIIQKV
ELNKKKTSKGLYKNARQIKGAQVNILSSNGNIKIPFIAYILYRSINEKPLFFFLSESLLF
KYLKKKHVPMIIWREGKYFDFDYMFDTKKKKKMNKINEKKENIKNVTDIIIEHYNATEEG
NSNQQNENDNPNDIGDNNILLKNKSIMFNNYIQSDINIIENDKNSANDLSSSTEVRKRKF
NEIREANSLSEEQYEHISINFSKVLKIAEHEEKYNNNINQENFENEHIKQPINNILLADN
NKIKSSKMDCCDSKSFSILSNEDEKNITGELKGCLKSETNINFRNSFCFNIENIYNDSDK
GNINDKEKKKQHVYIKDKENINLPLINLRFKEEINIAYHRFYNFVITFFQEIVKTENKNN
ICFLGKNIIVKNVKIHQNCFFFLSFHSLRAIHDGNNSLLMQWSYVDDAKSSVVRKFINCV
IKYAQEE
NT seq
2904 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaactattacaatcaaaccactgtttacataaaagttcttggggcggggcaaaca
gtgggaagatcatgtgtgatagtagaactcgaaaacagacgaattatgtttgattgtggt
tcacatgtaggatataaagatgaaagaaaatatcccaactttaatttattggttgggaat
agtaatttggaaggagcacccaaaattgatgaagagaacaatttgaatgtcgaagtaaat
ataagtatagttaatagtaacatagctgataaagaaaaattaataaataacttgaaaaaa
attaatgaaatgattgattgtgtaataataagtcattttcatatggatcatataggagct
ttaccatttttcacagaaatattacaatataaagggacgataattatgagttatccaaca
aaagctcttagtccagttttattattagatggttgtaaaattagtgatatgaaatgggaa
aaaaaaaatttagaaaagcaaataaaaatgcttaatgaaaaatcggatgatttattaaac
tataatattaattgtttaaaaaaagatccttggaatattactgaagaaaatatatataat
tgcataaataaagtagttggcttacaagttaatgaaacttatgaattaggtgatatatct
attacaccatattatgcggggcatgttttaggggcttgtatgtacagattagaagtaaac
aatattagtgttatatatacaggtgactataatactatacctgacaaacacttaggtagt
actaaaatcccagtcttaacacctgaaatatttatatctgaatctacatatgcttcttat
gttagaccaactagaaaatcatctgagctagaattatgtaacctagtaaatgaatgtgta
cataaaggtggtaaagttttaattcctgtatttgctattggtagagcccaagaattatct
atattattagaagaatattgggaaaaaatgaaaataaattgccctatatattttggatgt
ggtttaacagaaaatgcaaataaatattataagatttattcttcatggattagtaataat
tgtgtatcgacggaagtaaaaaatttatttgatttttcaaacatttcacaattttcaaat
aattatttaaatgaaaatagacctatggttttatttgctacaccggggatgttgcataca
ggcttagcattaaaagcttttaaagcatgggccagtaatcccaacaatttaataattttg
cctggttattgtgtgcaaggtactattgggcataaattaattatgggagagaaaaaaata
ttattagatggaagcacatatatatatgttaattgtaaaataatttatttatctttttct
gcgcatgcagattctaatggcatacaacaattaataaagcatgttatgccaaaaaatgtt
atatttgtacatggagataaaaatggaatggaaaaattatcaaaacatatatctaatcaa
tatcatattaattctatatgcccatatatgggacaaaattgccaattcaatttttgtaaa
tataatataaattatgtttatttggatagaaacatatataataatattattcaaaaagtt
gaattaaataagaaaaaaacatcaaagggcttatataaaaatgctagacaaattaaaggt
gctcaagttaatattttatcatccaatggaaatataaaaattccctttattgcttacata
ttatatcgttctattaatgaaaagccattatttttttttctttctgaatctcttttattc
aaatatttgaagaaaaaacatgttccaatgattatttggcgtgaaggcaaatactttgac
tttgattatatgtttgatacaaaaaaaaaaaaaaaaatgaacaaaattaatgaaaaaaaa
gaaaatataaaaaatgttaccgatattataattgaacactacaacgcaacagaagaaggg
aatagtaaccaacaaaacgaaaacgataatcctaacgatattggtgataataatatttta
ttgaaaaacaaatctattatgtttaataattatatacaatctgatattaacattatcgaa
aatgataaaaatagcgctaacgatttatcatcttcaactgaagtacgaaaaagaaagttt
aatgaaattagagaagcaaatagtttgtcggaagagcagtatgaacatatttctataaat
ttttcaaaagtgttaaaaatcgcagaacatgaagaaaaatacaataataatataaatcag
gaaaattttgaaaatgaacacataaaacaacctattaataatatacttttagctgataat
aacaaaattaaaagctcaaaaatggattgttgtgattctaaaagttttagtattctttct
aatgaagatgagaagaatattacaggggagttgaaaggatgtttaaaaagtgaaactaac
ataaattttcggaatagtttctgtttcaatatagaaaatatttataatgatagtgataaa
ggcaatattaatgataaggagaaaaaaaaacagcatgtatatataaaggataaagaaaat
ataaatttgcctctaataaatttaagatttaaagaagaaattaatatagcttatcatcgt
ttttacaatttcgttattacattttttcaagaaattgtaaaaactgaaaataaaaataac
atatgttttttagggaaaaatattattgttaaaaatgttaaaattcatcaaaattgtttt
ttctttttgtcctttcattcattaagagcaattcatgatggaaacaattccctactaatg
caatggtcatatgttgatgatgccaaatcgtcagtggttaggaaatttataaattgtgtt
ataaagtatgctcaagaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system