KEGG   Plasmodium berghei: PBANKA_0508100
Entry
PBANKA_0508100    CDS       T01111                                 
Name
(RefSeq) SNF2 helicase, putative
  KO
K11367  chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1 [EC:5.6.2.-]
Organism
pbe  Plasmodium berghei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pbe00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:pbe03021]
    PBANKA_0508100
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:pbe03036]
    PBANKA_0508100
Transcription machinery [BR:pbe03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Coactivators
    SAGA/TFTC/STAGA complex
     PBANKA_0508100
Chromosome and associated proteins [BR:pbe03036]
 Eukaryotic type
  Histone modification proteins
   HAT complexes
    SAGA complex
     PBANKA_0508100
    SLIK complex
     PBANKA_0508100
SSDB
Motif
Pfam: SNF2-rel_dom Helicase_C Chromo ResIII DEAD HTH_Hrp3 Myb_DNA-binding CDH1_2_SANT_HL1
Other DBs
NCBI-GeneID: 55148385
NCBI-ProteinID: XP_034420322
UniProt: A0A509AG56
LinkDB
Position
5:complement(335539..343560)
AA seq 2673 aa
MTMMNNNNIVNNDNGTISITSSLLSNNDKNMNIKSKLGINKNGNVGGGLHESYQKSMLSS
YNMSNVPMPSINYHANNNVMNRYNPMNYSLQEMNPNMQMTNNSMKQNSMQSNDLLLKQNN
KDQNYMYYQRNNSNNFNNMHGNFYPYMNNGFYGMSSANCFKPNSTNITNNNNNTNNPSMN
NFNQINGSFPYDNTIRSGVGPSTTSGGINNTISSNSNNNNPNFLNTLNPVNYGDNINCNS
MNNIPNKDSENLDKSSQIKSLSNNMNANNLNMSHYVNNTAVTSGTNNNSNNNGINSNVKD
NMSKMTNNNFKGIGSICNNIPPYRLNSDPQLDKQHNSIDDMNNNNNNNNTRSHPMNMYNR
MEYGYDNFKDENILDKDKANIDKSSNSNNSNLLGENKTNPSISKIRKGNNKDGVISDNNS
NNGNPNGLISNDSDTYKKYKNEVDTNHNKMKDGADGMIKDPKLNDSVNSNANNSYAMFPN
YNLKYPMNMNMFNNMNNFNMNNKSGINNIGSVSNMNVEGSNMGGNYQNFNLINNMSDLNN
AYNNMSKLPNVNNYNMMNIYGDNRYNSNNTNMNVGVNNNIMNMNNYNNMNYMNMRLLNGR
NTPNNMNNGDLSTNYMTDGMGNRIVNHDLNNNITMNDGSLNNGNKYVRKTAIGKQYASNN
VVSGSMKKKSETQKDKKKKRKKKNENNLAESDDEEDNDLYINSYVKKSAPKSSNGSKSWL
QYDSVEDKYTEKMKRHEKNDIFISPNIGAVGGRTNLRERKRVYNYAQIDNYYETDEEDKK
VDEEKNLLRQEKQSMGGIDRVIHHRKIKDWDIINSIKNNPFLFINRKKPEEGENGDDDDN
KKNENLIGSTEISSDSLNATETAGTDGALDVSCHKILGGVENIEDPALDDFYEEEDIVDI
NEVEFLVKWIGKSHIHNFFCTYEYLRYFNGVKKVDNYIKKIRLSFQKRKYMTADEIEQEK
IYSEIKKQIEMDSIHAERIITHRTCEITNEQLFLVKWTSCAYDQCTEETKQTLLDHNFGK
LIEEYFDRESKIYGAKALSSIWNRGPLTATKFDPYNETPSYLHGKKLRAYQLTGLNWMVS
RMKRNLSVLLADEMGLGKTVQTIAVVGHMLYKEKLIGPYLVLVPQSTVDNWLNEFKNWLP
QANVVCYHGNAVSRELIRTYELKKVYVPNRGYRYKFDVCITTPSILNSVSDVELLKRIPW
QLMVVDEAHQLKNRQSKRFIELKQFMAESKLLLSGTPLHNNLEELWTLLHFLNPQQYTYY
EAFQKKYNEIENTSLIGEAKQKQLMQLQHELHEVILRRVKKDVEKSLPNKVERILRVELS
PIQIEYYKNILTKNYEQLAKASGGAKNSLQNICMELKKVCNHPFLCCEPIDKDEYRERLV
YSSGKICLLEKLLIRLKERGNRVLIFSQMVKMLNILSEYLTLRGFKHQRLDGTMTKEMRK
KAMNHFNSKNSDDFVFLLSTKAGGLGINLTSADTVIIYDSDWNPQNDLQAGARAHRIGQT
KTVQIYRLVTKDSIEQTILERAKVKMVLDTLVVQGLNKKQNDNVNFIGGEGSNSSNGFTR
EELSKILKFGSQKLWEKNSSKYSPQDGEDGKHIIKGVDVDLDKILEEAEANENTNNANKD
INSELNSLQNGAGSSFFNSNSNLFGNGVGGNVVNNIGGGGIADDLLSSYNNITEFKYEPP
ENLKSNILYNDSTKQGELDVEENDKDFWDKTIPLEERLKLKKMKEEELLVHGPRKTRTRD
ARYNQGLYYDGGANNNNSDGDDSDEFTIKYTDKYNKNLNKKKRKRRTSTHITEKDKFRLY
RSLLKFGNPTLRLDDIQFDSKLMKVDRNVILTELNIIVDTCKEIVERVTKEGNNNGQPGL
ATQNIKTDNDDQNEYNNEECNKNDTNSLNVKSNDMSVEAKGENDQQTEDINDENDKNKRV
KRSVRATTISSTGENVEATEDSKKEEDNNNSGGGDGFFSKFMKFTKGSTGAKREDGIEGK
GIKTKAEDDTVKDELDDDIVKDELNDESDNNNKTKGERGRKIDAYTFYIGTNKANALDLC
HRLQLFKSLHDFIKEQNNDNEYSFRLPLKPPQNSANNEVVNNDGVVEKVGVNNKSVVKND
KTKNKKDDVEAAVTTTADVEGEGETAMNSTITSGTKQEGKTFNGYEATESSMLADGNPSD
DYLKLKLPNYIFDHLRDLSTKDVKAWTKEDDENLIKGIYIYGFGSFNEICVDVNLNLEHM
KNIKWDKIKMRCIKILKMIEEYTSNNKEGTPGKKRRRARGKNKNPDEIKEEYDNGGNNNT
SIKSEGTGGVNKSNNINARHTTINNYGRRSSERVKAIYSQEDKETGGILKKRVVSSRKGE
RDNKNSNHLGSNGTTSKLENIYDINNKGGKGTLLSSSTLDKRRRGISSKYSNVTLRNEKT
NSKCIIESSECSSSNEHKSNGSDEDEDDEINTNIVKRSCRSGSNRSSRMNSYENYKLTRR
RSTRTRRGGGNGSIVGSECINSIDPDGDDEYHNDRKKLKKKKKKKDKKKKLTDEEIIEII
KNSNLREMDQHSINKLTKKPLKKYKKLLKIVKKVLSSKTNELGQVEEEVSDDIRKKTDEL
IFYIGDYFGKFCDHCADSECKDILNNSGWEYISNFMNETSEDLRAKYEKFKSSNLKDSDN
ADITEENIISFFYSKKCSGLLYPEGDLDDGMDE
NT seq 8022 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaccatgatgaataataataatattgttaataatgacaatgggactataagtataaca
agcagtttattaagtaacaatgataaaaatatgaatataaaatctaaattgggaataaat
aaaaatggcaatgttggtggtggattgcatgaatcttatcagaagtcaatgttatcttca
tataatatgagcaatgttccaatgccatcaattaattatcatgctaataataatgtaatg
aatagatataaccctatgaattattcattacaagaaatgaatccaaatatgcaaatgacc
aataatagcatgaaacaaaattctatgcaaagtaatgatttgttattaaaacaaaataat
aaagatcaaaattatatgtattatcaaaggaataattcaaataattttaataatatgcat
ggaaatttttatccatacatgaataatggattttatggaatgtcatcagcaaactgcttt
aagccaaattctaccaatataacaaataataacaataatacaaataatccatctatgaat
aattttaatcaaataaatggatcttttccatatgataatacaataagaagtggtgttggc
cccagtacaacttctggtggcattaacaatactatttctagtaacagtaataataataat
ccaaattttctgaatacattaaacccagtaaactatggtgataatataaattgtaattca
atgaataatataccaaataaagactctgagaatttggataaatcatctcaaataaaatct
ttatcaaataacatgaatgctaataatttaaatatgtcacattatgttaacaatactgct
gttacgagcggtacaaataacaacagtaataataacggaattaattccaatgttaaagat
aatatgagcaaaatgacaaataataattttaaaggcataggaagtatatgtaacaatatt
cctccataccgattaaacagtgatccacaattagataaacaacacaattctatagatgat
atgaataataataataataataataatacacgatctcatcctatgaatatgtataatagg
atggaatatggttatgataattttaaagacgaaaatatattagataaggataaagctaat
atagataaatcaagtaatagtaataactcaaatttattaggtgaaaataaaacaaatccc
tctatttctaaaattagaaaggggaataataaagatggtgtgatatcagataataatagt
aataatggtaatcccaatggattgataagcaatgattctgatacttataaaaaatataaa
aatgaggtagatacaaatcataataaaatgaaagatggggcagatggtatgataaaagat
cccaaattaaatgattctgttaatagtaatgctaataattcatatgcaatgtttccaaat
tataacttaaaatatccaatgaatatgaatatgtttaataatatgaataattttaatatg
aacaataagagtggtataaataatattggaagtgtgtctaacatgaatgtagaaggtagt
aatatgggtggaaattatcaaaattttaatttaattaataatatgagcgatttgaataat
gcatacaataatatgagcaaattgccaaatgtgaataattataatatgatgaatatatat
ggtgataatcgatataacagcaataacactaacatgaatgttggtgttaataataatatt
atgaatatgaacaattataataatatgaattatatgaatatgagattattaaatggtcga
aatactccgaacaatatgaataatggtgatttaagcacaaattacatgacagatggaatg
ggtaatcgaattgttaatcatgatttaaataacaatataactatgaatgatggaagttta
aacaatggtaataaatatgttagaaaaactgctattggaaaacaatatgcgagtaataat
gttgtttctggttctatgaagaagaaaagtgaaacacaaaaagataagaagaaaaaaaga
aaaaagaaaaatgaaaataatttagctgaatcagatgatgaagaagataacgatttatat
atcaattcttatgttaaaaaatcagcacctaaaagtagtaatggtagtaaaagttggtta
caatatgatagtgttgaagataaatatactgaaaaaatgaaacgccatgaaaaaaatgat
atttttatttcaccaaatattggcgcagtagggggtagaaccaatttaagagaaaggaaa
agagtttataattatgcacaaatagataattattacgaaacagacgaagaagataaaaaa
gttgatgaagaaaaaaatttacttaggcaagaaaaacaaagtatgggaggtattgatcgt
gttattcatcatagaaaaataaaagattgggatattattaatagtattaaaaataatcca
tttttgtttataaatagaaagaagcctgaagaaggtgaaaatggtgatgatgatgataat
aaaaaaaatgaaaatttaataggatcaactgaaatatcatctgattcattaaatgctaca
gaaacagctggaacagatggtgctcttgatgttagttgtcataaaatattaggaggtgtt
gaaaatattgaggatccagcattggatgatttttatgaagaagaggatattgtagatata
aatgaagttgagtttttagtaaaatggataggcaaatctcatattcataattttttttgt
acttatgaatatttaagatattttaatggtgtaaagaaagttgataattatattaaaaag
attcgattatcatttcaaaaaagaaaatatatgacagcagatgagattgagcaagaaaaa
atatattctgaaataaaaaaacaaatagaaatggattcgatacatgccgaaaggataata
actcataggacatgtgaaattacaaatgaacaattatttttagtaaagtggacaagttgt
gcatatgatcaatgtacagaggaaacaaaacaaacattattagatcataattttgggaaa
ttaatagaagaatattttgatagagaaagtaaaatatatggtgctaaagcattgtcaagt
atatggaatagaggcccattaactgcaacaaaatttgatccatataatgagacgccaagt
tatttacatggaaaaaaactaagagcttatcaattgacaggtttaaattggatggttagt
agaatgaaaagaaatttaagtgttttattagcagatgaaatgggattaggtaaaacggtt
caaacaattgcagtagttggtcatatgctatataaagaaaaattaataggaccttattta
gtattagtaccccaatcaactgtagataattggttaaatgaatttaaaaattggttgcct
caagctaatgtggtatgttatcatggtaatgcagtaagtagagaattgataagaacgtat
gaattaaaaaaagtatatgtaccaaatagagggtatcgatataaatttgatgtgtgtata
acaactccatcgatacttaatagtgtaagtgatgttgaactattgaaaaggataccatgg
cagttaatggtcgttgatgaagcacatcaattaaaaaatcgtcaatcgaaaagatttata
gaattgaaacaatttatggctgaatctaaattattacttagtggtacaccattacataat
aatttggaagaactatggactttactacatttcttaaatccacaacaatatacatattat
gaggcatttcaaaaaaaatataatgaaattgagaatactagtttaattggtgaagctaaa
caaaagcaattgatgcaattacagcatgaattacatgaagtaattttaagaagagtaaaa
aaagatgttgaaaaatctcttccaaataaagttgaaagaattttacgagttgaattatca
cctatacagatagaatattacaaaaacattttaacaaaaaattatgagcaactagctaaa
gcatcgggtggtgcaaagaattcgttacaaaatatatgtatggaattaaaaaaggtgtgt
aatcatccatttttatgttgtgagccaattgataaagatgaatacagggagcgattagta
tattcaagcggaaaaatatgtttattggaaaaattattaataagattaaaagaacgaggg
aatcgtgttttaatcttttctcaaatggtgaaaatgttaaatatattaagtgaatattta
actttaagaggttttaaacatcaaagattagatggtacaatgacaaaagaaatgagaaaa
aaagctatgaatcattttaacagtaaaaattctgatgattttgtatttttattatctaca
aaagctggaggattaggaattaatttaacatctgctgatacagttattatatatgattct
gattggaatccccaaaatgatttacaagcaggcgctagagcacatcgtatagggcaaaca
aaaacggtgcaaatatatcgtttagtaacaaaagattctatagagcaaaccattttagaa
agagcaaaagtgaaaatggttttagatacattagttgttcaaggattaaataaaaaacaa
aatgataatgtcaattttattggaggagaaggtagtaattcttctaatggttttacaaga
gaagaattatcaaaaattcttaaatttggttctcaaaaattatgggaaaaaaatagctca
aaatattcaccacaagatggggaagatggaaaacatattataaaaggtgtcgatgtcgat
ttagataagattttggaagaagcagaagctaatgagaacactaataatgcgaataaagat
ataaattctgaattaaatagtttgcaaaatggtgctggtagtagtttttttaatagtaat
agcaatttgtttggtaatggagttggtggtaatgtcgtaaataatattggtggtggagga
attgctgatgatttattaagttcatataataatattactgagtttaaatatgagcctcct
gaaaatttaaaaagcaatatattatataatgattctacaaagcaaggtgaattagatgta
gaggagaatgataaagatttttgggataaaacaatacctttagaagaacgattgaaatta
aaaaaaatgaaagaagaagaattgttagtgcatggtcctagaaaaactagaacccgagat
gctagatataatcaagggttatattatgatggtggggcaaataataataatagtgatgga
gatgatagtgatgaatttactattaaatatactgacaaatataacaaaaatttaaataaa
aaaaaacgaaaaagaagaacctctacacatattacagaaaaagataaatttcgtttgtat
agatctttattaaaatttggtaatccaacattgcgtttagatgatatacaatttgattcc
aaattaatgaaagtcgatagaaatgtgattttaactgagttaaatattattgtagataca
tgtaaagaaatagtagaaagagtaacaaaagaaggtaataataatggtcaaccaggttta
gctacccagaatataaaaactgataatgacgatcaaaatgaatataataatgaagaatgt
aataagaatgatacaaattcgttaaatgtaaagagtaatgatatgagcgtggaggcaaag
ggagagaacgatcaacaaactgaagatattaatgatgaaaatgataaaaataaaagagta
aaaaggagtgttcgagccactacaatttcatctactggtgaaaatgtagaagcgactgaa
gattctaagaaggaggaagataataataatagtggtggtggtgatggatttttttcaaaa
tttatgaaatttacaaaaggtagcactggagctaagagagaagatggaatagaaggaaag
ggaataaaaactaaggcagaagatgatacagttaaagatgagttagatgatgatatagta
aaagatgaattaaatgatgaaagtgataataataataaaacaaaaggtgaaagaggaaga
aaaatagatgcatatacattttatattggtactaataaagctaatgctttagatttatgt
catagattacagttatttaaaagtttacacgattttataaaggaacaaaataatgataat
gaatatagttttaggttaccattaaaacctcctcaaaatagtgcgaataatgaagttgta
aataatgatggtgtggtagaaaaagtgggagtcaataataaaagcgttgtaaagaatgat
aaaacaaaaaataaaaaagatgacgtcgaagcagctgttactactactgcagatgtagaa
ggggaaggagaaacagcaatgaattcaacaattacatcaggaacaaaacaagaaggaaaa
acttttaatggatatgaagctacagaatcatctatgcttgcagatggtaatccttctgat
gattatttaaaattaaaattaccaaattatatatttgaccatttgagagatttatctaca
aaagatgtaaaagcatggactaaagaagatgatgagaatttaataaagggtatttatata
tatggttttggttcattcaatgaaatatgtgtagatgttaatttaaatttagagcatatg
aaaaatataaaatgggataaaataaaaatgagatgtataaaaatattgaaaatgatagag
gagtacacatctaataataaggaaggtacacctggtaaaaaacgaagacgagctagagga
aaaaataaaaaccctgatgaaataaaagaagaatatgataatggtggtaataataataca
tcaattaaatcagagggaactggtggagtaaataagagcaataatataaacgctcgacat
actactattaataattatgggcgaaggagtagtgaacgagttaaagctatttattcacaa
gaagataaagaaactggagggatattaaagaaaagagtagtatcttctagaaagggagaa
agagataataaaaatagcaatcatctcggaagtaatggaacaacttctaaattagagaat
atatatgatattaataataaaggaggaaaaggcacattattgtcatcatcaacacttgat
aaaagaagaagaggtatttcatcaaaatattcaaatgtaacattaagaaatgaaaaaaca
aatagtaaatgtattattgaatcatctgaatgttcatcttcaaacgaacataaaagtaat
ggaagtgatgaagatgaagatgatgagatcaatactaatattgtaaaaagatcttgtcgt
agtggaagtaacagaagtagtagaatgaattcatatgaaaactataaattaacaagacgt
agaagtactagaactcggagaggaggaggtaatggttccattgtgggaagtgaatgtata
aactcaattgatcctgatggagatgatgaatatcataatgatcgaaaaaaattaaaaaaa
aaaaaaaaaaaaaaagataaaaaaaaaaagttaacagatgaagaaattatagaaataatt
aaaaatagcaatttaagagaaatggatcaacatagtataaataaattaacaaaaaagcct
ttgaaaaaatataaaaaattattaaaaatagtaaaaaaagtattatcttcaaaaacaaat
gaattgggacaagttgaggaagaagtatctgatgatattcgcaaaaaaacggatgaactt
attttctatattggggattattttggtaaattttgtgatcactgtgcagatagtgaatgt
aaagatatattaaataattctggttgggaatatatatctaattttatgaacgaaacaagt
gaagatttaagggcaaaatatgagaaatttaaatcctcaaacttaaaagatagtgataat
gctgatataacagaggaaaatattatctcatttttttattccaaaaaatgttcgggctta
ctttatcctgaaggtgatctagacgatggaatggatgaataa

DBGET integrated database retrieval system