Plasmodium berghei: PBANKA_0707300
Help
Entry
PBANKA_0707300 CDS
T01111
Name
(RefSeq) histone acetyltransferase GCN5, putative
KO
K06062
histone acetyltransferase [EC:
2.3.1.48
]
Organism
pbe
Plasmodium berghei
Pathway
pbe03250
Viral life cycle - HIV-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbe00001
]
09120 Genetic Information Processing
09125 Information processing in viruses
03250 Viral life cycle - HIV-1
PBANKA_0707300
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
pbe03021
]
PBANKA_0707300
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
pbe03036
]
PBANKA_0707300
Enzymes [BR:
pbe01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.1 Transferring groups other than aminoacyl groups
2.3.1.48 histone acetyltransferase
PBANKA_0707300
Transcription machinery [BR:
pbe03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Coactivators
SAGA/TFTC/STAGA complex
PBANKA_0707300
Chromosome and associated proteins [BR:
pbe03036
]
Eukaryotic type
Histone modification proteins
HATs (histone acetyltransferases)
PBANKA_0707300
HAT complexes
PCAF complex
PBANKA_0707300
STAGA complex
PBANKA_0707300
TFTC complex
PBANKA_0707300
SAGA complex
PBANKA_0707300
SLIK complex
PBANKA_0707300
ADA-HAT complex
PBANKA_0707300
HAT-A2 complex
PBANKA_0707300
ATAC complex
PBANKA_0707300
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Bromodomain
Acetyltransf_1
Acetyltransf_7
Acetyltransf_10
IDM1_C
FR47
Acetyltransf_9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55148905
NCBI-ProteinID:
XP_034420819
UniProt:
A0A509AHP2
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(301494..305672)
Genome browser
AA seq
1304 aa
AA seq
DB search
MECIVTNENSRFPPYHNFFKSENIYNYIDLIQIIGNIYYIYTEINDIANQVYIERINLLN
YVKNVKGNNPNFENFQINSNRKHAYPLSIYMQYILSITSINNNSISTWENDKSSINCQIK
KNKNHQYEKYSQKNDKTIGNMFLERNTFLTIINKKYFEQNTQQLLRYTDEIRMCSCENGN
EKNGNEKNGNEKNGNEKNGNEKNGNEKNGNEKNGNEENGNEENGNGEDGNDGNGWKDKKK
CGNDEDEKKNENEKLRNENNNNDENVNTNDEIKDSLNGINNVNDFRNINVGDVKNEMNNL
SKLFYDEKIKNIIEINTKNDNIIGNSNVTNKTNNIIGNIDGNNIKYDVFQGDDKMIISGN
YVNNNMNNPFNINKNLIMGPKNFNLTTSGKIYRGNKINESGKAGNGIMIKENEEEYRNDN
VNNNNNNNGISNDGKKDFTKTDGVDINNMSNIGNNPNVYNKIMASHINRINNNNNVMIMK
NMNNFNSMNFPMNSHNFNMIPSYNNIGNIINNNMTNIPNISNNFMINTQINGINNNSLND
INITNPSSAIIGILGNSPYNNNNVIPNNIDGNLNKKKSLISIDKEKSNKDNEGNENTKKN
NIKSSNNKNINNIEGENNNNNKNTIKNIRMENLKFNDNIDLKNVDGIDLSSYFVNGKYCS
KLANHEKIYNIIYYIVKNSLHEYLTDFYNNEDLGYKEKEDDNVSNLLKNETTNYRETNTI
DSDKNPKGEHDILLECSEKIIEKEENNKNKRNSDDIDGKEIDQDDGNDDNIIQKKKKKKI
ENEGNENIEIDQDVNINNTEKSMNNNSLRQKMNDNENNYILSEITKSICSILNLQQLMPV
NTRLSNPGLIYDPNYETIYSKWKLFLKKEQSSGNIISKCFSRDFLHTVLLCNYDSIIEDL
KKTAVKKKIKYFFLHICLESDIPINVALMLFLNATKQSDKLQSLLPSETGLGYLHRDAGG
AKEENMGIITFECITNDREPDHLIKLITLKNIFSRQLPKMPREYIVRLVFDRNHYTFCLL
KKNTVIGGVCFRPYFEQKFAEIAFLAVTSTEQVKGYGTRLMNHLKEHVKKFGIEYFLTYA
DNFAIGYFRKQGFSQKISMPKERWFGYIKDYDGGTLMECYIFPNINYLRLSEMLYEQKKT
VKKAIHFIKPQIIFKGLNYFTENKGGNLHPNNIPGLLEIGWKKEYKDMTTKKTHHKEIQL
KDQIINVLDYLEKQQSAWPFLKPVSLSEAPDYYDIIKEPTDILTMRRKARHGEYKTKEDF
GIELKRMFDNCRLYNAPTTIYFKYANELQALIWPKYEEISEMAK
NT seq
3915 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatgtattgtgaccaatgaaaacagtaggtttcccccttatcataatttttttaaa
agtgaaaatatttacaattatatagatttgattcaaattattgggaatatttattatata
tatacagaaataaatgatattgctaatcaggtatatatagagagaataaatctgttaaat
tatgtcaaaaatgtgaaaggaaataatccaaacttcgaaaattttcaaataaattcgaac
aggaaacatgcatatccactatctatatatatgcaatatatcctatctattacatctata
aataataattctataagtacttgggaaaatgataaatctagtataaattgccaaataaaa
aaaaacaaaaatcatcagtatgaaaagtatagccaaaaaaacgataaaacaattgggaat
atgtttttggagaggaatacatttttaactataataaataaaaaatatttcgaacaaaat
acgcaacaattgttaagatatactgatgaaattcgaatgtgtagttgtgaaaatggaaat
gaaaaaaatggaaatgaaaaaaatggaaatgaaaaaaatggaaatgaaaaaaatggaaat
gaaaaaaatggaaatgaaaaaaatggaaatgaaaaaaatggaaatgaagaaaatggaaat
gaagaaaatgggaatggagaagatggaaatgacggtaatggatggaaagataaaaaaaag
tgtggtaatgatgaagacgaaaaaaaaaatgaaaatgaaaaattgagaaatgaaaataat
aataatgatgaaaatgtgaatacaaatgatgaaataaaggatagtttaaatggaataaat
aatgtaaatgatttcagaaatataaatgttggggatgtaaaaaatgaaatgaataactta
tcaaaactattttatgatgaaaaaattaaaaatataatagaaataaatacaaaaaatgat
aatataattgggaatagtaatgtgacaaataaaactaataatataattggaaatatagat
ggaaataatatcaaatatgatgtattccaaggagatgataaaatgataataagtggaaat
tatgttaataataatatgaacaatccttttaatattaataaaaatttaataatgggacct
aaaaattttaatttaactacatcaggaaaaatatatagaggaaataaaataaatgaatca
ggaaaagcaggaaatggaattatgattaaagaaaatgaagaagaatatcgaaatgataat
gtaaataataataataacaacaatggaatttcaaatgatggaaaaaaagattttacaaaa
acagacggagtggatataaataacatgagcaatattggaaacaatccaaatgtttataac
aaaataatggctagtcatataaatcgtattaataataataataatgtaatgataatgaaa
aatatgaataattttaattccatgaatttccctatgaattcacataactttaatatgata
ccatcatataataatataggaaatataataaataataacatgacaaacatcccgaatatt
tcaaacaattttatgataaatacacaaataaatggaattaataataattccttaaatgat
ataaatattacaaatccatctagtgctataattggtattttaggaaattcaccttataat
aataataatgtaattccaaataatatagatggaaatttaaataaaaaaaaatcgttgata
tctattgataaagaaaaaagtaataaagataatgaaggtaatgaaaatacaaaaaaaaat
aatattaaaagttcaaataataaaaatataaataatattgagggagaaaataataataat
aataaaaatacaataaaaaatattcgtatggaaaacttaaaatttaatgataatatagat
ttaaagaatgtagatggaatagatttaagttcatattttgtaaatggaaaatattgctct
aaattagctaatcatgaaaaaatatataatataatttattatattgttaaaaattcatta
catgaatacttaactgatttttataataatgaagatttaggatataaagaaaaagaagac
gataatgtttcaaatttgttaaaaaatgaaactacaaattatcgagaaacaaacacaata
gattcagataaaaatccaaaaggagagcacgatatattattagaatgttctgaaaaaata
attgaaaaagaagaaaacaacaaaaataaaagaaatagtgatgatattgatgggaaagaa
attgatcaagatgatggaaatgatgataatataatacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatt
gaaaatgaaggaaatgaaaatattgaaatagatcaagatgttaacataaataatacagaa
aaatctatgaataataatagtttgagacaaaaaatgaatgataatgaaaataattatata
ttaagtgaaataacaaaaagtatttgttctatattaaatttacaacaactaatgccagta
aatacaagattaagtaatccaggtttaatttatgatcctaattatgaaacaatatattca
aaatggaaattatttttaaaaaaagaacaatcaagtggaaatattataagcaaatgtttt
tcacgggattttttacatactgttttattatgtaattatgatagtataattgaagacttg
aaaaaaacagcagtgaaaaaaaaaataaaatatttttttcttcatatttgcttggaatca
gatattcctatcaatgttgcattgatgctctttttgaatgcaacaaagcaaagcgacaag
ctgcagtccctattaccatcagaaactggattgggatatttgcatcgagacgctggagga
gcaaaagaagaaaacatgggaattataacttttgaatgtataacaaatgacagagagcca
gatcatttaattaaattaataacattaaaaaatatattttcaagacaattacctaaaatg
cctagagagtatattgtcagattggtatttgataggaaccattatacattttgtttactt
aaaaaaaatacagtaattggtggtgtttgttttagaccatattttgaacagaagtttgct
gaaattgcatttttagcagttacatcaacagagcaagttaaaggatatggaactcgactt
atgaatcatttaaaagagcatgttaaaaaatttggaattgaatattttctaacatatgca
gataactttgccatagggtattttagaaaacaaggattttctcaaaaaatttcgatgcca
aaagaaagatggtttggatatataaaagattatgatggagggacattaatggaatgctat
atatttccaaatataaattatttaagattatctgaaatgttatatgaacaaaaaaaaaca
gtaaaaaaggcaatacattttataaagccacaaattatatttaaagggttaaattatttt
actgaaaacaaaggagggaatttacaccctaataatattccaggtttattggaaattgga
tggaaaaaagaatataaagatatgacaacaaaaaaaacgcatcataaagaaattcaatta
aaagatcaaattataaatgttcttgattatttggaaaaacagcaatctgcttggcctttt
ttaaaaccagttagtctttctgaagccccagattattatgatatcattaaagaacccact
gatatcttaacgatgcgaaggaaagctcgtcatggtgaatataagacgaaagaggacttt
ggaattgagctaaagaggatgtttgataactgtcgattatacaatgctccgacaacgata
tactttaaatatgcaaatgaattacaagctttaatctggcccaaatatgaagaaattagc
gaaatggcaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
