Plasmodium berghei: PBANKA_0901900
Help
Entry
PBANKA_0901900 CDS
T01111
Name
(RefSeq) tubulin--tyrosine ligase, putative
Organism
pbe
Plasmodium berghei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TTL
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55149472
NCBI-ProteinID:
XP_034421370
UniProt:
A0A509AJN2
LinkDB
All DBs
Position
9:complement(53283..61823)
Genome browser
AA seq
2846 aa
AA seq
DB search
MNKFSKLFISKNNNDVNNSQKNGELSNVIMSTMLKINSTDEFKNIELKNLTENNIEMNKT
VIQNINGNGNRNILLLNELNNFSHITNNSSMKHDKKASSVHGLMKNNYNSRYVKNINSVY
NDPYCISNSYHLNNPYTIQNGKYGGNTHSANEYNSYNCPIEKEHFRKVINNAEENIINTK
QKYIGNNYLPGNNTNLTRQLPQKGGLYRDNNRNNYDNEYHTDENNMPIIKKNNEHKIGNN
NFEKNTLGLLPRVYVVKKNEEVYNNLMKNGKTSRSLSQINHNEIKNGDPNMNVNSLHYID
QSNRNLVDIVKKESSEKSMHHDKTGSIKNSFERKQCSNIIPNNTSPVQIMKTRENFLEPN
SDKSSLNENRNFFIRTISHKNNRNMKVMETEKSNKNCLVMTINDQNLKNCLSKETGENMH
VVRNGLKNYNIENRRNIKNNVNGKNGCGIISNKGNESHASNVSNMKCANIYGDKNQLPRG
NLLMKHVGNRILNENDNNDFNKINKSNFFNNQSDKSSKFKGGFTNKKMLYIEPIKDEIIY
VNNLTNINVPHLNNLYETEEIENSKIKCNNSSVVEILNEKKNIDKKNDIIDERNSGKNME
NKKENVDKRMNNDIINDKTSKGKYISNANELNHTVLLSDNLKSKDCKSFASNMHYHGNDA
EKNFLCKNYVGCANRDLKNGNIETSNRSQNLDMQHCYTYSTFVDKINGNYNYYKTGKLNQ
EVNNSNAYEKGENLNNNFYKENCNDGVKNENMNEYENKSVSKDSAKKINYNGENDANKPN
NEFIKVKDYLNIQHVPTNYNEQIIKQNYKLNFHSTEDNVHLKGYYYDSNKGVYLMNSSMN
FVKPQDTRSFISASHVYNNIDENYNKINYNIRNVNHNTISVSDKFKGYQKKNANKPNSDI
IGIKHSHLNRKYLNNPYINYNTKKLSILESQPYNKWNYINYDNNKDIRHITCANNINYSN
GNYKELIKNNNEENIYKVIDDSLRLKEKTHELLHLNCDKIFVCSGDINKIKNEGKENRSI
EMDGHDEYEINNTIMGKDKIIESGSTQNNVFLENENINIYHNSNVDIDKIIKNKKLSYNE
ANNGDKLCNTVLNDCQNERYSIGTKEEKNFNISQIKKNGKEALTDSYNYHLNNMKEIENS
KNDKKGKLKINKWTSNENNYDLYLNGANKNNLRNINTKIEDPKDTEESEKEENGIEHKGN
ELEIEKGKNMIILNKKFNYPFNDELYTSSIDNNKAEHESDIINVKCISYSKEIIYKKDGN
ILIKEVQNKRNENNICLEENVEIKKKEKAFNKQTNNNISGYSSSLDSKENYPKNSNMESF
YKNRKKENGNDVLEYNKTFNGQYMENIKNDSCSRDSNDSSSNSGSEVDKTGKDTDGNNSD
SNQSDENGVYNCRSSDSNKCSNIFLSTNNVGIESENGEVSEKICSKKDIKINSLKKKNKF
PWNKDNIVKLNSKGKLLKMKNVTMNTKLARYERVLIHTCINKLNWKKCIDNTNKGILYWI
GYNINDFDHYNYMKKKKIINRIPSLYMYTKKKALTFLLSHLSLIFPSLYDFYPNTFVLPE
NKEIIKYILNGNNKDYYIMKPDCGSMGIGVKIINKYSDININILNGHNCYIIQRYIDNPL
LMYKKKFDFRIYILLLPGKNYPKIYISRVGFARLCTEEYKKKKQYICNTFVHLTNYSINK
DNDKYVRKNNIHDKNNNKQLLSDVFIYLKNNGYDIDDIWKQIKKITCLTSLAIYSYIKEK
IKNNFNNNFYFYQLIGLDILLDANGKAWLLEVNSNPSLRIDYIDPGYADFEIQLESMFDR
YVKEPVISEMFLIIYKKIYQKYLRKRSKKGITNAGNTISAITTNNNNNNKVEKKDKQSIT
FNNNGSNNKKRGVKVNPQNSLPNNSIFSFHDKIIKGLAENKKRCGNKIINNYSHKEKFKF
LLARSNKKKNNNNYEILKSEISTTKHLPILGKSYIKSEYSIISNSNRDNLEVENANSRLE
NRNLTNINNFIKKKNGAKKKKKLFLKKEIMSNVETCVDENDIDSFSLSSNVKNDLNRNEN
LIKEDKAEMVNVGEKRVGKKEYGDSRIIKTNELNKNEQMKNGWDKNKNDNESIINDKGCG
RDDILRKSIGCIKAQIKDKNNSYDGSEEYNKDNYTINFPDDNREQNAKIINSGDGKLSHH
NCKENSNNNIPISKEIKRNDNSGDNLYHNYNNSCFCINEINASINNSDEVENNEIIENSV
NGDITGNISYVMINNSGASYTSVDHGKLDSEKMVKKDALIESNILNNETYVQIDNQEDIQ
LDKFLNNDIEMCKSIYRNISDSIYKKKIENFIMIRSSLYKYMNCLNVLGIRYINNNEIRN
FDEMYNKNVPLDFKKTYTKVRKDILHPLKNNILEKNIYINLKKETSSYYKEMKLYNDCYI
LFDFILKKYDNNAKKCNKRVEYYIDKNTFLCMCADIKINKIIENIEIPASTFNSLFEGNK
SSHENEMHQIVSKIFKSKNADVDKLKREKEEDGHFNIQKNCSNNSRFSNPNDDENDNSLE
YYYKQNCKKEETKTSKFSLLRSKREILTKNNKSTKNCEKIGCKKNNTNKKTKSNKRSSNY
NSFISDDNNQSSTVNNNNDNTYYSSIFCPFSLVSTSTNLINFNMIGHNSMKYKSKKKKKM
NIYDLEYLYTRQVFFSKYINKNQGLTLIDFFLLMQQIALLIFPYISHDYACNGIQPYNCI
LFDELNNGENNISGNETNVKGLNNIKKDGKNIKKKGENDQDNNNYLKKGNKGHIINLPKN
STKDDQEKAQIINEHLKEENNKINHNYNPTHMEDKKKHNYTWHKNVCTNIYNLYGYVQIN
INPAIKNMCMETFLNFVFNKYSISYS
NT seq
8541 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagtttagtaaactgtttataagcaagaataacaatgatgtaaataattcgcaa
aaaaatggagaactatcaaacgttattatgtccacaatgttaaagatcaattctactgac
gaatttaagaatatcgaattaaaaaatctaacggaaaataatattgaaatgaacaaaacg
gtgatacaaaatataaatggaaatggaaatagaaatatattattattaaatgagctaaac
aattttagtcatattactaataatagttctatgaagcatgacaaaaaagctagttcggtt
catgggttaatgaaaaataattataatagcagatatgtaaagaacattaatagtgtatat
aatgatccttattgtataagcaattcataccatttgaataatccttatacgattcaaaat
ggaaaatatgggggaaatacgcattcggcaaatgagtataattcatataattgtcctata
gaaaaagagcattttcgaaaggtaataaataatgcagaagaaaatattataaacaccaaa
cagaaatatattggaaacaattatttaccaggaaataatacaaatttaactaggcaattg
ccacaaaagggaggattatatcgtgacaataataggaacaattatgacaatgaatatcat
actgatgaaaataatatgcctattataaaaaaaaataatgaacataaaattgggaacaat
aattttgaaaagaatacattaggtttattacctcgtgtttatgttgtaaagaaaaacgaa
gaagtgtataataatcttatgaaaaatggaaaaacgagtagatcactaagccaaattaat
cataatgaaataaaaaatggagatccaaacatgaatgtaaatagtttacactacatagat
caatcaaatagaaatttagttgatattgtaaaaaaggaaagtagcgaaaaaagcatgcac
catgataaaactgggagtattaaaaattcatttgaaagaaaacaatgtagtaacataatt
cccaataatacatccccagtacaaattatgaaaacgagagaaaattttttggaacccaat
tctgataagtctagtttaaatgaaaaccgcaatttttttattagaactatttcacataaa
aataatagaaatatgaaagttatggaaaccgaaaaaagtaataaaaattgcttagtaatg
actattaatgatcaaaatttaaaaaactgtttatccaaagaaactggagaaaatatgcac
gtagttcggaacgggttaaaaaactataacatagaaaatcgaagaaacataaaaaataat
gtcaatggaaaaaacggttgtggtattatatcaaataaaggaaatgaaagtcatgcatca
aatgttagtaatatgaaatgtgctaatatatatggtgataaaaatcaattacctagaggt
aatttgttaatgaagcatgtgggaaataggatattaaatgaaaatgataataatgatttt
aataaaataaataagagtaattttttcaacaatcagagcgataaaagtagtaaatttaaa
ggtggatttaccaataagaagatgctgtatattgagccaataaaagatgaaataatttat
gttaataatttaacaaatattaatgtgccgcatttgaataatttatatgaaactgaagaa
atagaaaatagcaaaataaagtgtaacaacagtagtgttgtggaaatattaaacgagaaa
aaaaatatcgacaaaaaaaatgatataattgacgaaagaaattcaggaaaaaatatggaa
aataaaaaagaaaatgtagataaacgaatgaataatgatattattaatgacaaaactagt
aaaggtaagtatattagcaatgcaaatgagctgaatcatacggttctattgtctgataat
ttaaaatcaaaagattgtaaaagtttcgcctcaaatatgcattaccatggaaatgatgcc
gaaaaaaattttctatgtaaaaattatgtaggttgtgcaaaccgagacttaaaaaatggt
aatatagaaacaagtaaccgttctcaaaatttggatatgcaacattgttatacttactct
acttttgtcgataaaataaatggtaattataattactataaaactggaaaattaaatcag
gaagtaaataatagtaatgcttacgaaaagggggaaaatttaaataataacttttacaaa
gaaaactgcaatgatggtgtgaaaaatgaaaacatgaatgagtatgaaaataaaagtgtg
agtaaggatagtgctaagaaaattaattacaacggagaaaatgatgcgaataagccgaat
aatgaatttattaaagtaaaagattatttgaatattcagcatgttccaactaattataat
gagcaaatcataaagcaaaattataaacttaattttcatagtacggaagataatgtgcat
cttaaaggttattattatgatagcaataaaggggtgtatttaatgaactcatctatgaat
tttgtaaaaccacaagatactcgtagttttataagcgcttcgcatgtatataataacata
gatgaaaattataataaaattaactataatattagaaatgtaaatcataacacaataagt
gtatcagataaatttaaaggttaccaaaaaaaaaacgctaataaacctaattctgatatt
attggaataaaacattctcatttaaataggaaatatttgaataacccttatataaattat
aatacaaaaaagttaagcatattagagtcacaaccatacaataaatggaattatataaat
tatgacaataataaagatataagacatattacatgtgctaataatattaattattctaat
ggaaactataaggaattaataaaaaataataatgaagaaaatatttataaggtaatagat
gatagtcttagattaaaggaaaagacgcatgaattattgcatctaaattgtgataaaatt
tttgtgtgcagtggagatattaataagattaaaaacgaagggaaagaaaatcgaagtatt
gaaatggatgggcatgatgaatatgaaataaataatacaataatgggcaaagataaaatt
atcgaatctggctcaacccaaaataatgtctttctagaaaatgaaaacataaatatatac
cataatagtaatgttgatattgataaaattataaaaaataaaaaattatcatataatgaa
gctaataatggagacaaattatgtaatacagtattaaatgattgccaaaatgaaagatat
tccataggtacaaaagaggaaaagaattttaatattagtcaaataaagaaaaatggcaaa
gaagcactaaccgattcctataattatcatttaaataacatgaaagaaatcgaaaattcg
aaaaatgataaaaaaggaaaactaaaaattaataaatggacctcaaatgaaaataattat
gatttgtatttaaatggagcaaataaaaataatttaagaaatataaatacaaaaatagag
gaccctaaagacacagaagaaagtgaaaaagaagaaaacggaattgaacataaaggaaat
gaattggaaatcgaaaaaggtaaaaatatgataattttaaacaaaaagtttaattacccg
tttaatgatgaattatatacatccagcatcgacaacaataaagcagaacatgaaagtgat
attattaatgtgaaatgcatttcctattctaaagaaataatatataaaaaagatggaaat
attttaattaaggaggtgcaaaataaaagaaacgaaaacaacatatgtttggaggaaaat
gtagaaataaaaaaaaaagagaaagcttttaataagcaaacaaacaataatataagcgga
tatagttcttcattagattctaaagagaattacccaaagaatagcaacatggagagtttt
tataaaaatagaaaaaaggaaaacggaaatgatgttttagaatacaataaaacgtttaat
ggtcaatatatggagaatattaaaaatgatagttgcagtcgtgatagtaatgatagtagt
agtaatagtggtagtgaagttgacaaaactggtaaagataccgacggaaataatagcgat
agtaaccaatcagatgaaaatggcgtatataactgccgtagtagcgatagcaacaaatgt
agcaatatatttttatccacaaataatgtaggtatcgaaagtgaaaatggtgaagtatca
gaaaaaatatgttctaaaaaggatataaaaataaactcgctaaaaaaaaaaaataaattt
ccttggaataaagataatatagttaaattaaacagtaagggcaaactattgaaaatgaaa
aatgtaacaatgaatacaaaattagctagatatgaaagagtgttaatacacacatgtatt
aataaattaaattggaaaaagtgtattgataatacaaataaaggaatattatattggata
ggatataatataaatgattttgatcattataattatatgaaaaagaaaaaaataataaat
agaataccatctttatacatgtatactaaaaaaaaggcacttacatttttattgtctcat
ttatcacttatttttccaagtttatatgatttttatcctaatacatttgtcttacctgaa
aataaagaaattataaaatatattttgaatgggaataataaagattattacattatgaaa
ccagattgtggaagtatgggaataggggttaaaataatcaataaatatagtgatattaat
atcaatatattaaatggacacaattgttatataatacaaaggtacatagacaatccatta
ttgatgtataaaaagaaatttgactttcgtatatatattttattattgccaggaaaaaat
tatccaaaaatatatatatctagagttgggtttgcaaggctgtgtacagaagaatataaa
aaaaagaaacaatacatttgcaatacatttgtgcatttaacaaattatagcataaataaa
gacaatgataaatatgtaagaaaaaataatatacatgataaaaacaacaataaacaactg
ttaagtgatgtatttatatacttaaaaaataatggttatgatatagatgatatatggaaa
caaataaaaaaaataacatgtttaacttcactagcaatatactcatatattaaggaaaaa
attaaaaataattttaataacaatttttatttctatcaattaattggattggatatactt
ttagacgctaatggaaaggcgtggttattggaagtgaactcaaatccttctttaagaata
gattatatagacccaggatatgccgattttgaaatacaattagaaagtatgtttgatagg
tatgtaaaggagcctgtaataagtgagatgtttttaataatatacaaaaaaatttatcaa
aaatatttaaggaaaagaagtaaaaaagggattacaaatgctggaaatacaatttcagcg
attactaccaataataataataataataaagtagagaaaaaagacaaacagagcattaca
ttcaacaataatggtagtaacaataaaaaacgtggggtaaaagtgaacccacaaaatagt
ctacctaataatagtatatttagtttccatgataaaataataaaagggctagctgaaaat
aaaaaaaggtgtggtaataaaataataaataattattctcataaagaaaaatttaaattt
cttttagcacgcagtaacaaaaaaaaaaataataataactatgaaattttaaaaagcgaa
ataagcacaaccaagcatttacctattcttgggaaaagttacataaaaagtgagtactcg
attatatcaaatagtaatagagataatttggaagttgaaaatgcaaatagtcgattagaa
aatagaaatttaactaatattaataattttattaaaaaaaaaaatggtgcaaaaaaaaaa
aaaaaattatttttaaaaaaggaaatcatgagcaatgttgaaacatgtgtagatgaaaat
gatattgatagttttagcttgtcaagcaatgttaaaaatgatttgaatagaaatgaaaat
ttgataaaagaggataaggcagaaatggtaaatgtgggagaaaaaagagtaggcaaaaaa
gaatatggagatagtagaataataaagactaatgaattgaacaaaaatgaacagatgaaa
aacggatgggataagaataagaatgataatgagagcatcattaatgataagggttgtggt
agagacgatattttaagaaaaagtattggttgcataaaagcacaaataaaagataaaaat
aatagttatgatggatcagaagaatacaataaagataattatactataaattttccggat
gataatagagaacaaaatgctaaaataataaattcaggtgacggtaaattaagtcatcac
aattgcaaggaaaatagtaataataatatacccatatctaaagaaataaaaagaaatgat
aatagtggtgataatttgtatcataattataataatagttgtttttgcattaatgaaatt
aatgcaagtataaataattctgacgaagttgaaaataatgaaatcatagaaaatagtgta
aatggagatataacgggcaacatatcatatgttatgataaataattcaggtgctagttat
accagtgttgatcatgggaaactagattctgagaaaatggttaaaaaggatgcattaatt
gagtcgaatattttaaataatgaaacatatgtacaaattgataatcaagaagatatacaa
ttagataaatttttaaataatgatattgaaatgtgtaaatctatttatagaaatattagt
gatagtatatataaaaagaagatagagaactttattatgataagaagtagtttatataaa
tatatgaattgcttaaatgttcttggaataagatatattaataataatgagatacgcaat
tttgatgaaatgtataataagaatgtaccactagattttaaaaaaacatatacaaaagtt
cgaaaagatattttgcatcctttgaaaaacaatatattagaaaaaaatatatatataaat
ttaaaaaaagaaacaagtagttattataaagaaatgaaattatataatgattgttacatt
ctattcgattttattttaaaaaaatatgacaataacgcaaaaaaatgcaataaaagagtt
gaatactatattgataaaaatacctttctatgcatgtgtgcagatattaaaataaataaa
ataattgaaaacatcgaaatacctgcaagtactttcaatagtttattcgaaggaaataaa
agttctcatgaaaatgaaatgcaccaaattgttagtaaaatttttaaaagtaaaaatgca
gatgtagataaattgaaaagagaaaaagaagaagatggacattttaatattcagaaaaat
tgttcaaataattcccgtttttctaatccaaacgatgacgaaaatgataattcactagaa
tattattataaacaaaattgcaaaaaggaagaaaccaaaacaagcaaattctctttatta
cgttctaagagagagattttgacaaaaaataataaatcaacaaaaaattgtgaaaagatt
ggttgtaagaaaaataacacaaataagaaaaccaaaagcaacaaaagaagtagcaactat
aatagtttcattagtgatgataataatcaaagtagtactgtcaacaataataatgataac
acttattattcgtctatattttgcccattttctttagtctcaacttcaacaaatttgata
aatttcaatatgattgggcataacagcatgaagtataagagcaaaaaaaaaaaaaaaatg
aatatctacgatttggaatatttatatacgaggcaagtgttttttagcaaatatattaac
aaaaatcaaggtttaacattgattgatttttttttattaatgcaacaaatagctctttta
atattcccatatattagccacgattacgcttgtaatggtatacaaccttataactgtata
ctttttgatgaattaaacaatggagaaaataatataagtggaaatgaaactaatgttaaa
ggcctaaataacatcaaaaaagatggcaagaatattaaaaagaaaggagagaatgatcaa
gataataataattatttgaaaaaaggaaataaaggtcatattataaatttaccaaaaaat
agtactaaagatgaccaggaaaaggcccaaataataaatgagcatttaaaagaagaaaac
aataaaataaatcacaattataacccaacacatatggaagacaaaaaaaagcataattat
acatggcacaaaaatgtttgtactaatatatacaatttgtatggatatgttcaaattaat
atcaaccctgctataaaaaatatgtgtatggaaacatttttaaattttgtttttaacaaa
tattcaatatcatattcttaa
DBGET
integrated database retrieval system