Plasmodium berghei: PBANKA_0939600
Help
Entry
PBANKA_0939600 CDS
T01111
Name
(RefSeq) polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, putative
Organism
pbe
Plasmodium berghei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MIF4G
MA3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55149856
NCBI-ProteinID:
XP_034421748
UniProt:
A0A509AJ49
LinkDB
All DBs
Position
9:1431367..1441257
Genome browser
AA seq
3296 aa
AA seq
DB search
MLNTLLNIASSYSSSECKEKTILNNKVCFKETYNKEEEDNRKKSANNFNINNTNNNICES
KFQANNNENNNNNNNSSSIIPNSIKNNLARNFNYNNMQNRQFEKSSNSAKCMAYNFQAKE
VNNTIGNDTNNNNSSNNGSKNNSSSSNNNNNCDDNTNKNEALNKFEKKENDTIMNMSLPG
KNDVVDFEKGSDNNNNSNDNFTINSNRSNNIGDLKKSEHVNNSQDNDNNFIKNHNPVNNS
TFKIQGTSSTCNVNETLPIIAVNNTSSFLHKGDNNNNSNCSSNCEIISEMDYSQCTVKNA
FCVVNPSHILPKSCNDYNKIEISDEKCDNVNNNSHIIQESKITQISGITKINESTVHDKI
NNCTTSNNNAAENNDNKNSYGNSSGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKG
GSENRPGNNSNTGNSNGGGNGTDPDGNDNKDDNNENDKDKNNSSNANDNNNNNNNDKIKK
KENNNKNGDSNVKKTSKNVNGNDNIETKKLNTKSLISNTNSSSTISGSSLNADAPEFVPS
TKSVQGNLQFNNLMWGNYYHDIPNNSFGNMQNVNLLNMNGLGNNNNIMIQTSLIDNITNI
NNDAAGNNLLGIQNSSNNNNNNNNPGTVIDSNLNAYNNKTGGIAGSNSVVNKNNTNAGNT
NTPLGGQFNGVDGNEKFTDKNNNNLIPISGNNSKVNSNNIHSVNTEDNNNTTGLGNKNLG
GTRPLDSAYLNHNMLEGGKNSRPNNFMNNSENSNGFDNTDMHNTSNNNNNNNNAHQNFPG
NNSMMHHHPHHHNFYLNPPYLINSHPNGLSGHQTIFTPIPYGGGGVAGTNNGDIHHELPF
PQPPVYNHFGNNSMNVQKNGNLNMNPYNFISCGLPGAGPLGTGGPINMASHHHIDPHFLN
NTDNVPMKLPYNHMSQTNRRNNMFGHFGNNVNLHGPNNINDNNYDINSNNSNINPLLSAN
IGGPGYVFNSSYNTMQAGVMRLNTDGNTSTNSNNTSNNTNTNTVNSNSPSNGNNNNNSLN
ITGNVIAINPPIINPGVNVPIPHHHIDNINNSMHINGIHMNHGLLLNNANMNNMHSMSNH
VPMGNVGNMGSGIVGLVGLGGIGGMNTTGNISKQQKRQNGYNDRTGGMNNNNHNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNDNNNNNNNNNTENVGTNNNNNTTS
GSANNKQYNNNYKENKNTMKNNIGNGNEVLNSYNYGMKHENNKKNNSRYNLMNNTGDNFN
TNYNYNGSNTMKNNSATAKGSYNNKGGKEESNSITGGNNFYNRNGGNTSTTGGGSITSTI
GNTTNNVNTSNDNTKESGPSGDATKEVVSDLNESNNTKTNNNKDNLQYGNYKGKNNYYLN
SSNDKNSKGHNNTIANQNGVTTSNNKDDYKSGRNYGSNKIVDDKNGGSASKKDAGKDNTN
NNNNSGRYGKQGDNWIKKGYGANNSNTSNNINSRINNSTTKHGSYSNSKYSTGSDRRSSN
NRYDEGANKTEKLGYKTNDKKGKSEEDKHTKENKINNSNNAGINNNQTNEAGNKNSNTNP
SNEENNTTGYNANNKVGYNNLKNVKNGDKKNMEFSSWVKIAKMNPNNKKKNEKINLPSSQ
PDNTNPAASSSSSVKNGNTEDTNHNYSNSRNYNKGSGYGKGFHGEVPQVNEENETPLLPT
NKESKKNTEIKEDAKKESHILNSTTHTNQRYDSHNKGLKKSGGVDDKIKGKAIGNYFGNK
NYINEEVRNKDSNRSKVVDNKNKNSNSNNNSNSVSNNGNKIIDYNDKKNLSNNLSGNNNS
YSHRQREKLKIKNVEIKQIGEKIVPNFSSASARNSSSGHNRGMKYNENEDKNDVEKNKKN
STHSSDNNINQKKETEEITKDEIKQTANKNDKNYVDEENADNKDLVKKNESNNVNSNVNK
NKEIGKDEVQINSQTNNLDDNTKGKKSNIFNQTKSSYKYSTEGENNPNTNTSNENNNKTG
SSNYKGSLWNGKISFAEMAKRRPKKDSKEISKEWTGNNNKPGQTEKKGSNLNKNGKVLRR
TDDSHMKQEQTDHVTYDNKSEINEEELTKEDDKDEIKREDEIENVEREETEEKKNKEIDS
NNNDDDIEIFNELANEEKEIISTSNKDAGNRETEELGGIKNKINKIEIEEKEIKQNKLAS
KDVSQNKINIDDNKITMNASEDEKKKMGKDEIIAKTNNDEKSVENKLNNKEKEKEKTEEL
NSVKSKKNDDETENKEKNDNKNTESEERNDKNILDIDNDKLNDENKNVLDPKQKEKQKKI
EKWQSEKRFTKIDLLEIYLGHNWSLRGENFNFVLSKDNTTDTHYKGNNYIHNNINSNEDN
NNNNNNNNSNTSNIYMNDGKVSNTYNNKRYNNSGYNHGNNMNNSQLNQYSIHNSGNNIGN
NSNNIGGNNNNYEKNMQSNQNSNNGKGGDDGWRHSYSKNMQNSMHINGGNNNINYMNGNH
NDPNSLNINNNIGNNHGGKNGQGNTFEWRKGDGDKLKGFFDSTRAVESPDAWRNNNTGQQ
NGNGNNSKPTISENSWLVKQSQLKADKYTCLMRKLRGILNKLTFEKFDLLYEQIILVDIS
KLEEIIGLMKLVFEKAVTQHHFVQMYVQLCKKLNIHFHSMKLEDGSVVQFKKILINQCQD
SFENNLKPIEFPSHLNDDEKFEFEQMHKNKVRGNMLFVGELVKSGIISIPIVFVCINQLL
EKRDSYISQKNDTNEGNLHLEALCMFLNTVGEILDTHEKSNQEEVKNLYNKLNEIVNDES
ILFRVRCLIKDVIDNRNEKWNKKFAHKLEGPTTLSVLHDKILKETIDQNNRIFSTNNSNN
YHENKMNSSLNNMRNNLLRNSNYGMNNNSGSGGMGNNNNNNMPFGMNNQMNMRGMGNTGM
KNMDPNKNMKKMTMNIMKNKNTSSKMMPDDMKFGQNSGTHFGDGTGPFVTDNTSGGNYYE
NTSKNNMPYKNQPFMGNDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSGTGGSSSSSLNNNTN
SNNGIFSNLSSMFTNKENKNEGNFFSRVFNLKKNQNNNNSGPGQDLPFRGDVDGNINKTN
ENKINGNENKANANNNMSNNISNVNENGQNDYSYVEDYLPKINEIMELSTNVNEWDELTK
KFEELNIPSKYNEKLQNTILKLTLKKYACNKYLERSESYFNWLITIVLANKIDSVSFKSC
WKSFFLENDENSYEYTKEDYPLLPFIAKNFIKAVEQHDTDHILYDIDALNEIKNVV
NT seq
9891 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaacacacttttaaatatcgcatcatcctatagctcttcggaatgtaaagagaaa
actattttaaataataaggtttgttttaaagaaacatataataaagaagaagaggataat
agaaaaaagagcgcaaacaattttaatattaataatacaaataataatatttgtgaatct
aaattccaggctaataataatgaaaataataataataataataatagttcatcaattatt
ccaaattcaataaaaaataatttagctagaaattttaattataataacatgcaaaatagg
caattcgaaaaatcgagtaacagtgccaaatgcatggcttataattttcaagctaaagag
gttaataatacgatagggaatgatactaataataataatagtagcaataatggtagtaaa
aataatagtagtagtagtaacaataataataactgtgatgataatacaaataaaaatgag
gctttaaataaatttgaaaagaaggaaaatgatactataatgaacatgtcattgccaggt
aaaaatgatgtagtggacttcgaaaagggtagtgataacaataataacagtaatgataat
tttactattaatagtaacagaagtaataatattggtgatttgaaaaagtctgaacatgtt
aataattcacaagataatgataataattttattaaaaatcataatcctgttaataactca
acttttaagattcagggtacatctagtacttgcaatgtaaatgaaacattaccaattatt
gctgttaataacacatcttcattccttcataagggagataataataataatagtaattgt
agtagcaattgtgagataatatctgaaatggattacagtcaatgtactgtaaaaaatgca
ttttgtgttgtcaatccctcccatatattgcctaagtcttgtaatgattataataaaatt
gaaataagtgatgaaaaatgtgataatgtaaataataatagtcatattattcaagaatcg
aaaataactcaaattagtggaattacaaaaattaacgagtccactgttcatgataaaata
aacaattgcactactagtaataataatgctgcggaaaacaatgataataaaaatagttat
gggaatagctcagggaataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataacaaagga
ggttctgagaatagaccaggaaataatagcaatacaggtaatagtaatgggggcgggaat
ggaactgaccccgatggaaatgataataaggatgacaataatgaaaatgataaagacaaa
aacaatagtagcaatgcaaatgataataataataataataataatgataaaataaaaaaa
aaagaaaataataacaaaaatggggattcaaatgtaaaaaaaacgagtaaaaatgtaaat
ggtaatgataatattgaaacaaaaaaattgaacacaaaatctctgattagtaacacaaac
agtagcagtacaatttctggaagttcattaaatgctgatgcacctgaatttgtaccatct
actaaatctgttcaaggtaatttacaatttaataatttaatgtggggtaattattatcat
gatattccaaataactcttttggtaatatgcaaaatgttaatttgttaaatatgaatgga
ttagggaataataataacattatgattcaaacttcattaatagataatataacaaatata
aataatgatgcagcaggtaataatttattaggaattcaaaattctagtaataataacaat
aacaataataatcctggtacagttattgattcgaatttaaatgcatataataataagact
gggggtattgcaggttctaattctgttgttaataaaaataatacaaatgctgggaataca
aatacaccccttgggggacaatttaatggtgtagatggaaatgaaaaatttactgataaa
aataataataatctaattcctatatctggaaataattccaaagtaaatagcaataatatt
catagtgttaatacagaagataataataatacaactggtctaggcaataaaaatttagga
ggaacaaggcccttagattcagcatatttaaatcataatatgctagaaggagggaaaaat
tcaaggcctaataattttatgaacaattcagaaaattctaatggatttgataatacagat
atgcataacacaagtaacaataataacaataataataatgcacatcaaaatttcccaggt
aataattcaatgatgcatcatcatccacatcatcataatttttatttgaaccctccatat
ttaattaatagccatccaaatggtttatctggccaccaaacaatttttactccaatacca
tatggaggtggaggggttgctggtacaaataatggagatatacatcatgagctacctttt
ccacaacctccagtttataatcattttggtaataattcaatgaatgttcaaaaaaatgga
aatttaaatatgaatccatacaattttatatcttgtggtttacccggtgcagggccttta
ggcacgggtgggcccataaatatggctagtcatcatcatatagatcctcattttttaaat
aatactgacaatgttccaatgaaattaccttataatcatatgagccaaacaaacagaaga
aataatatgtttggtcattttggtaataatgttaatttacatggccctaataatattaat
gataataattatgatataaattcaaataatagcaatattaatccgctactttctgctaat
attggaggacctggatatgttttcaattcttcatataatactatgcaggctggtgttatg
agattaaatacagatggtaatacatcaactaattctaataatacatctaataatacaaat
actaatactgtaaatagcaattctccttctaatggtaataataataataatagtttaaat
attaccggaaatgttatagccataaaccctcccatcattaatccaggagtaaatgttcct
atccctcatcatcatatagataatataaataactcaatgcatataaatggtatacatatg
aatcatgggcttttattaaacaacgcaaatatgaataatatgcatagcatgagtaatcat
gttcctatgggaaatgtagggaatatgggtagtggaattgtagggcttgttggacttggg
ggtatagggggaatgaatactactggaaatataagcaaacaacaaaaaagacaaaatggt
tacaatgatagaactggaggaatgaataataataatcacaataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataacaataataataataataataataatgataataataat
aataataataataataacactgaaaatgttggaacaaataataataataatacaactagt
ggtagtgcaaacaataagcaatataataataattacaaagaaaataaaaatacaatgaaa
aataatattgggaatggaaatgaggtattaaatagttataattatggaatgaaacatgaa
aataataaaaaaaataatagtagatataatttgatgaataatacaggtgataattttaat
actaactacaattacaatggaagtaatacaatgaaaaataattcagctactgcaaaaggt
tcatataataataaaggaggaaaagaagaatcaaatagcataacaggtggtaataatttt
tataataggaatggtggaaatacttctactactggtggaggttctattacatctacaatt
ggaaatactactaataatgttaatacatctaacgataatactaaagaatcaggaccatct
ggagatgcaacgaaggaagtggtatctgatttaaacgaaagcaacaatacaaaaacgaat
aataacaaagataatttgcaatatgggaattataagggaaaaaacaattattatttaaat
agctcaaacgataaaaatagtaaagggcacaataatactatagcaaatcaaaatggtgtt
accactagtaacaataaagatgattataaaagtggtagaaattatggaagcaacaaaatt
gttgatgataaaaatggaggcagtgcatctaaaaaagatgcaggaaaggataatacaaat
aacaacaataatagtggtagatatggaaaacaaggtgataattggattaaaaaaggatat
ggtgcaaataatagcaacacatctaacaacattaattcaagaatcaataatagtacaacc
aaacatggaagttattcgaatagtaaatatagcacgggttctgacagaagaagtagtaat
aatagatatgatgaaggtgctaataaaacagagaaattaggttataaaacaaatgataaa
aaagggaaatctgaagaagataaacatacaaaggaaaacaaaatcaataatagtaacaat
gcaggaataaataataaccaaactaatgaagctggaaataaaaattctaataccaatccg
agtaatgaagaaaataatacaactggatataacgcaaataataaagtaggatataataat
ttaaagaatgtaaagaatggtgataaaaagaatatggaattttcatcctgggtaaaaata
gctaaaatgaatcctaataataaaaaaaaaaatgaaaagataaatttaccaagttcacaa
ccagataatactaacccagcagcttcatcgtcatcttctgtaaaaaatggaaatacagaa
gatacaaatcataattatagtaatagtcgaaattacaacaaagggtctggatatggaaag
ggatttcatggagaagtaccacaagtaaatgaagaaaatgaaacaccattattacccaca
aataaagaatctaaaaaaaatactgaaatcaaagaagatgcaaaaaaagaatcacatata
ttaaatagtacaacccataccaaccaacgttatgatagtcataataaaggattgaaaaag
agtggtggagttgatgataaaataaaaggaaaggcaattggaaactattttggtaataaa
aattacattaacgaagaagttcgaaataaggattctaatagatcaaaggttgttgataat
aaaaacaaaaatagtaatagcaataacaatagtaatagtgtaagcaataatggtaataaa
ataatagactataacgataaaaaaaatctgtcaaataatttgagtggaaataataatagc
tattcacatagacaaagagaaaaattaaaaataaaaaatgttgagataaaacaaatcgga
gaaaaaatagttccaaatttttcatctgcttctgctagaaatagtagtagtggtcataat
agaggaatgaaatataatgaaaatgaagataagaatgatgttgaaaaaaacaaaaaaaat
agtacccatagtagtgataataatataaatcaaaaaaaagaaactgaagaaattacaaaa
gatgaaataaaacaaactgctaataaaaatgacaaaaattatgtggatgaggaaaatgca
gataacaaagatttagtgaaaaaaaatgaatctaataatgttaatagtaatgtaaataaa
aataaagaaattggaaaagatgaagtacaaattaatagtcaaacaaataatttagatgat
aatacaaaaggaaaaaaaagtaatatatttaatcaaacaaaaagtagttataaatattca
acagaaggagaaaataatcccaatacaaatacatctaatgaaaataataataaaacgggg
tctagtaattataaaggaagcttatggaatggaaaaatatcttttgctgaaatggcaaaa
cgtcgacctaaaaaagattcaaaagaaatttcaaaggaatggactggtaataataataaa
ccaggtcaaactgagaaaaagggaagtaatcttaataaaaatggtaaagtattaagaaga
actgatgatagtcatatgaaacaggaacaaactgatcatgtaacttatgataataaaagt
gaaataaatgaagaggaattaacaaaagaagatgataaagatgaaataaaaagagaagat
gaaattgagaatgtagaaagagaagaaactgaagagaaaaaaaataaagaaatcgatagc
aataataatgacgatgatatagaaatttttaatgagctagcgaacgaagaaaaagagata
ataagtacatctaataaagatgcaggaaatagagaaactgaagaacttggtggtattaaa
aataaaattaataaaattgaaattgaagaaaaagaaataaaacaaaacaagcttgcctca
aaagatgtatcacaaaataaaataaatattgatgataataaaataactatgaatgctagc
gaagatgaaaaaaaaaaaatgggaaaggatgaaattatcgctaagactaataatgatgaa
aagagcgtagaaaataagttgaataataaagaaaaagaaaaagaaaaaacagaagaatta
aattctgttaaatctaaaaaaaatgatgatgaaactgaaaataaggaaaaaaatgataat
aaaaatacagaatcagaagaaagaaatgataaaaatattttagatatagataacgataaa
ttaaatgatgaaaataaaaatgtgttagatccaaaacaaaaagaaaaacaaaaaaaaatc
gaaaaatggcaatcagaaaaaaggtttacaaaaattgatttattagaaatatatttaggt
cataattggagcttaagaggtgaaaattttaattttgttttatccaaagataatacaaca
gatacacattataaaggaaataattatatacacaataatataaattcaaatgaagataat
aataataataataataacaataattctaatacgagtaacatctatatgaatgatggaaaa
gtttctaatacatataataataaaagatataacaattcaggatataatcatggaaataat
atgaataattcccaattgaatcaatacagcattcataattctggaaataatattggaaac
aattctaataatataggaggaaataataataactatgaaaaaaatatgcaaagcaatcaa
aattcaaacaatggcaaaggtggagacgacggttggaggcattcatattctaaaaatatg
caaaatagtatgcatataaatggtggaaataacaatattaactatatgaatggaaatcat
aatgatcctaatagtttgaatataaataataatattggaaataatcatgggggaaagaat
gggcaaggcaacacttttgaatggagaaaaggagatggtgataaattaaaaggatttttt
gattctacaagagcagtagaatcaccagatgcatggagaaataataatacaggacaacaa
aatggtaatggtaataattctaaacctacaatatcagaaaatagttggctagtaaaacaa
agtcaactaaaagctgataaatatacatgcttaatgaggaaattaagaggtattttaaat
aaattaacatttgaaaaatttgatttattatatgaacaaataatattagtagatatatca
aagcttgaagaaataattggattaatgaaattggtttttgaaaaggcagtaactcaacac
cattttgtgcaaatgtatgtacaattatgtaaaaaattaaacatacattttcatagtatg
aaattagaagatggatcagttgttcaatttaaaaaaattttaataaatcaatgtcaagat
agttttgaaaataatttaaaacctatagaatttcctagtcatttaaatgatgatgaaaaa
tttgaatttgaacaaatgcataaaaataaagtaagaggaaatatgttatttgttggagag
ttagttaaatctggaattatttctatacctattgtttttgtatgtattaatcaattgtta
gaaaaaagagatagttatatttctcaaaaaaatgatactaatgaaggaaatctacattta
gaagcattatgcatgtttttaaatacggttggtgaaatattagatacacatgaaaaatca
aatcaagaagaagtgaaaaatttatataataaattaaatgaaattgtaaatgatgaaagt
atattattccgtgttagatgtttaattaaagatgttatagacaatagaaatgaaaaatgg
aataaaaaatttgctcacaaattagagggcccaacaactttaagtgtattacatgacaaa
atattaaaagaaacgattgatcaaaataatcgaattttttctactaataactcaaacaat
tatcatgaaaataaaatgaatagtagtttgaataatatgcgaaataatttgcttagaaat
tccaactatggtatgaataataatagtggaagtggaggtatgggcaataataataataat
aatatgccatttggaatgaacaatcaaatgaatatgagaggaatggggaatactggaatg
aaaaatatggatccaaataagaatatgaaaaaaatgacaatgaatattatgaagaataaa
aatacatcttctaaaatgatgcctgatgatatgaaattcggacaaaattctggtactcat
tttggtgatggaactggaccatttgttactgacaatacttctggtggtaattattatgaa
aatacttcaaaaaataatatgccatataaaaatcaaccatttatgggaaatgataataac
aataataataataacaataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataattcaggtactggaggaagttcgtcaagctccctcaacaataatacaaat
tccaataatggtatttttagcaatttgagttcaatgtttacgaacaaagaaaacaaaaat
gaaggcaattttttttcaagagtttttaatttaaaaaaaaatcaaaataataataatagt
gggccaggacaagatttgccatttagaggagatgtagatggaaatataaataaaactaat
gaaaataagataaatggaaatgaaaataaagcaaacgcaaataataatatgtcaaataat
atttctaatgtaaatgaaaatggacaaaatgattattcatatgttgaggattatctccct
aaaattaatgaaataatggaattatctacaaatgtaaatgaatgggatgaattaacaaaa
aaatttgaagaattaaatattccttcaaaatataatgaaaaacttcagaataccatttta
aaattaactttaaaaaaatatgcatgtaataaatatttagaaagaagtgaaagttatttt
aattggctaattacaatagttttggcaaataaaatagattcagtatcatttaaatcgtgt
tggaaatctttctttttagaaaatgatgaaaatagttatgaatatacaaaagaagattat
ccattgttgccatttatagccaaaaattttataaaagcagttgaacaacatgacactgat
catattctttatgatatagatgcattgaatgaaataaaaaatgttgtataa
DBGET
integrated database retrieval system