Plasmodium berghei: PBANKA_1015300
Help
Entry
PBANKA_1015300 CDS
T01111
Name
(RefSeq) rRNA (adenosine-2'-O-)-methyltransferase, putative
KO
K15333
tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase [EC:
2.1.1.34
]
Organism
pbe
Plasmodium berghei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
pbe03016
]
PBANKA_1015300
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
pbe03036
]
PBANKA_1015300
Enzymes [BR:
pbe01000
]
2. Transferases
2.1 Transferring one-carbon groups
2.1.1 Methyltransferases
2.1.1.34 tRNA (guanosine18-2'-O)-methyltransferase
PBANKA_1015300
Transfer RNA biogenesis [BR:
pbe03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Methyltransferases
PBANKA_1015300
Chromosome and associated proteins [BR:
pbe03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
RISC (RNA-induced silencing complex)
PBANKA_1015300
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpoU_methylase
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55150073
NCBI-ProteinID:
XP_034421952
UniProt:
A0A509AKS3
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(665274..672194)
Genome browser
AA seq
2306 aa
AA seq
DB search
MEQKPEENIINLLISFANKHLKKKDIINENSRMIKDMFSSIILVLINNIDKYSLANCINN
YILNELKSIRFEAIQDLSKKKKKKNSENSEIYKRINIFIIFLECIFTKFDDINFLSIDIS
WIYKLISYKEDFNYSSFLNILKTILLFIEKEENKDIVSLDKNTNNTQFGKKKKKLCVVYI
LLNRIKTEIENHVKEIKENYIFYKNKIKQLGVIHKNSGNLYDPLCKNQNYNEKEKTLENQ
NHINIINNISLCFKDTCDLFINIIEDKTEIDQCSIEWENEIKEIGKELMLLTPFINDKDI
RNYLINTFFFTIKRYIFNKKEYEELCLIVIKVMYLFIRNDVKSEINSNYNFNEKKELFIN
NCDGIENKSYDEKYILYIYKEINSNFCTFNNNDVVLNGLVTNLKKDEPVDKNYLNSIYNF
LVINIDDLYNIEFVKYAFIDDVRYYLLLYSESYKDEWILKKIIYIFNKIINIYKDTSMDN
FRDCSTFLEAWERYECILKCIENFSIHLLKTNWQKVIDLINMGNQIRKKYELFCDSSFKE
KKNIKKIKNPKNCENEQNEKYYDYNKNKNMGINILSYNLKNFQKNNFLFYDSHDYNVFNF
CVKKKRENKQFTCTTFGNYSDYIILVLIEYLIWKLLIHDNNTVTRFSLCALIEQKENYTK
TDNTQNMDYSDENVDKKSEEIGGIEISILLNSINDIFFFNIFFPECVKPTLFIKGDIPFY
EFRIKNLIVSKILNRKNSIEYIQNFIISLNKINLFYANARIILEAIIQAIKIIENSKSYN
FFLKYFDKKINGINECIDTENEDIELNNVMSKIILNIIHKIKNVSISRRKDLQIFVLKIV
IKMNESLNLFSTIKSYSSFLQIFEEDFFFHALEYFEILTNKKINFVNTLDSNFTNLPEQV
RLYVWLENNANIFLNNFIEKFNKVIDLNQYMYFYGYLRLFYLLLHITIKRNKKMNEDYKN
IILRIQKDDNFYLVYHLVLYFFKNNLSHIFLKNDIKQFLVKNIGNLRNFIKGNVYEKKKE
SLFPCQNEKLNEHILNNSERSEIIATFSEHCFDYKMLRKLFIFTDIVEYCGDITAYFLNN
KINYYNTSYSYKEKNMDTSGLEKSLIIRDNAPEETDIDVCRDSKNLYIECVNFLKNFTQT
NIKNKDDENYNNLRVILALAYVSNTCTIFGKIEDEENLNKQILLMQMKNIYNDSSNMPKD
AHIPVGNNNIINSLCGYGNYFCKNFNFYRYKYLYKYFSAHNTFKEYIFDNKIIFSETIVN
DIEVSKEELVYVYFIIKLYIIPCTFSCKIKNKKNYIDNSIIQFRIKILNLLIKQSKMLID
RFSEYKFPTHLLELAFLTLFHPLIVKFEIELYSNENYKAIEDMKEYGYISFKLLNFVKNI
LKIGQNKLSICRSVVIPFLTSYFFSIIEYGNIIINISNEYLDKFVEIIVDILMHKECVLY
DCQKSFTNDLFKIKKGNLNFNNFINENICSYFLNKIENNQHIIFPSKFFEIYHTSIFLRL
LTLIFLINLFKILENKYICVMKIGIHNKTEHISNDEMLDSPKEKKLKEKKEEFYKKRNII
LCIYEKLIIHILKRVDNKNVLRENLKNKCNDNESKQKNNKKDGQNITPLPFSYGHNIQIR
GLQALCILSRYFKYIKKGKRKNIIFYVNTLLQYDNLSTTRQYLELFCSSICNSSFILLYP
HLIKNILRNNGENAQLTISSLIISAHIFLKSKFSYYSFVKLNYNSFSGLTVDQQKYATNI
FVKKQKNVKASQKLKGKKIKNIIRQILEKNKGETTEIAKDVDKTIANIKKKKIQYGKQWK
LNEKDNDKQIGKNRKKWDNYQKEQNKLHEYENKEGSNFQRNKNVISIKDDNIEKEKKDKV
YEMENKIWDTENITSKDNPQNGYFYSPYISKILTKLLLKIVLLCSSHSALIRSISQYILY
NFLKKRKEMLLIPFLSKIYLFIKNNKDCKRIRDKLKKEFKNWDTSIIEQKNNICMLLPTY
NHSFNFFDEDINCENTNTFTHILYNNELVSSYTFIDSIKKIVQQEMTSIMYNIQLEKEKK
DGISIYKYNNEQKLLTLNQFYHGKNVDEISSTIDDKRDTKILASENGQEKKKKTTSQIIN
GEACFNKSSENIDYDKNFENFLKQTKKNYQKKFDPIDNIIEINNEFRKKYQLRKKNNLIV
IASLIDKVPNLAGLCRTCEIFNVKKLLLSNINIVKDFQFQKISSTANKWMNIQELKKKDI
IKYLIKKKKKYSIIGLEQTNDSKRLNDFIFPENCILILGDEKEGLPSSILLLLHHCVEIP
GHGIIRSLNVHVSAAITIYEYFKQHL
NT seq
6921 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagcaaaagccagaggaaaatattataaacttgttaattagtttcgcaaataaacat
ttaaagaaaaaagatatcataaatgaaaacagtagaatgattaaggatatgttttcttct
atcatattagttctaataaataatatcgataaatatagtttagcaaattgtattaataac
tatatattaaatgagttaaagagtatcagatttgaagccattcaagatttgtcaaaaaaa
aaaaaaaaaaaaaatagtgaaaatagtgaaatatataaaagaataaacatatttatcatt
tttttagaatgcatatttactaaatttgatgatataaactttttaagcatagacatatct
tggatttataaacttatttcttataaagaagattttaattattcgtcttttttgaatatt
ttaaaaacaatattattatttattgaaaaagaagaaaataaagatattgtatcattagat
aaaaatacgaataatactcaatttggaaaaaaaaaaaaaaaattgtgtgttgtatatatt
ttattaaatcgtataaaaacagaaatagaaaatcatgttaaagaaataaaggagaattat
attttttacaaaaataaaataaagcaattaggagttatacacaagaactctggtaattta
tatgatcctttgtgtaaaaatcagaattataatgaaaaagaaaagacattggaaaatcaa
aaccacataaacataataaataacatatcattatgttttaaagatacatgtgatttattt
attaatataatagaggataaaacagagatagatcaatgtagtattgaatgggaaaatgaa
ataaaagaaataggaaaagaattaatgcttttaacaccattcattaatgataaagatata
agaaattatttaataaatacatttttttttacaattaaaagatatatatttaacaaaaag
gaatatgaagaattatgtctgatagttattaaagtaatgtatttgttcataagaaatgat
gttaaatctgaaattaattcaaattataattttaatgaaaaaaaagaactttttataaac
aattgtgatggaatagaaaataaaagttatgatgaaaaatatattttatacatatataaa
gaaattaactcaaatttttgtacatttaataataatgatgttgtattaaatggcttagtt
acgaacctaaaaaaagatgaacccgtagataaaaattatctgaacagtatatataatttt
cttgttataaatatagatgatttatataatattgaatttgtaaaatacgcatttattgat
gatgtacgatattatttgttattatatagtgaatcatataaagatgaatggatattaaaa
aaaataatatatatatttaacaaaataataaatatatataaagatacaagtatggacaat
tttagagattgctctacttttttagaggcatgggaaagatatgaatgtatattaaaatgt
attgaaaatttttctatacatttattaaaaaccaattggcaaaaagttatcgatttaata
aatatgggaaatcaaataagaaaaaaatatgaactattttgtgattcatcatttaaagaa
aaaaaaaatattaaaaaaataaaaaatccaaaaaattgtgaaaacgaacaaaatgaaaaa
tattacgattataataaaaacaaaaatatgggtattaatatattatcatataatctgaaa
aattttcaaaaaaataattttttattttatgatagccatgattataatgtctttaatttt
tgtgtaaaaaaaaaaagagaaaataaacaattcacatgtacaacatttggaaattattca
gattatataatattagtattaattgaatatttaatttggaaattgttgatacatgataat
aacacagtaactcgtttttctttgtgtgcattaatagaacaaaaggaaaactacacaaaa
acagataatacacaaaatatggattatagtgatgaaaatgttgacaaaaaaagtgaagaa
attggtggaatcgaaataagcatactgctcaatagtataaatgatatttttttttttaac
atattttttccagaatgtgtaaaacctacactatttataaaaggtgatattcctttttat
gaatttcggattaaaaatttaatagtttctaaaattttaaatagaaaaaattcgattgaa
tatatccaaaattttattatttcgttaaataaaattaatttgttttatgctaatgccaga
ataatacttgaagcgataattcaagctatcaaaataattgaaaattctaaaagttataat
ttttttttgaaatattttgataaaaaaataaacggcatcaacgaatgtatagacacggag
aatgaagatatagagttaaataatgttatgagtaaaataattttgaatattattcataaa
ataaaaaatgtatctataagtagaagaaaagatttgcaaatatttgttttaaaaatcgtt
ataaaaatgaatgaaagtttaaatctatttagtactataaaaagttattcctcatttttg
caaatttttgaagaagacttttttttccatgctttggaatatttcgaaattttgacaaat
aaaaaaattaattttgttaatactttagacagtaattttacgaatttacctgaacaagtc
agattatatgtttggctagaaaataatgcaaatatttttttgaacaattttattgaaaaa
tttaataaagtaattgatttaaatcaatacatgtatttttatggatatttgaggttattt
tatttattgctacacataacaataaaaagaaataaaaaaatgaatgaggattataaaaat
attattttacgtattcaaaaagatgataacttttatttggtttatcatttagttttatac
ttttttaaaaacaatttaagtcatatatttttaaaaaatgatattaaacaatttttagtt
aaaaatattggaaatttaagaaattttattaaaggtaacgtatatgagaaaaaaaaagag
tctttgtttccttgtcaaaatgaaaaattaaatgagcatatcttaaataattctgaacgt
tcagaaataattgcaacattttctgagcattgttttgattataaaatgctgagaaaattg
tttatatttacagatattgtagaatattgtggagatataactgcatattttttgaacaat
aaaataaattattataacacgtcttattcatataaagaaaaaaatatggatacatctggt
ctcgaaaagtcgctaataatacgtgataatgcacctgaagaaacggatattgatgtgtgt
cgagatagtaaaaatttgtatatagaatgcgttaattttttgaaaaattttactcaaaca
aatattaaaaataaagatgatgaaaattataacaatttgagagtaatattggcacttgca
tatgtttctaatacatgtacaatctttgggaaaatagaggatgaagaaaatttaaataaa
caaattttgttaatgcaaatgaaaaatatatacaatgatagctcaaatatgccaaaagac
gcacacataccagtaggaaacaataatataattaatagtctatgtggttatggaaattat
ttttgtaaaaattttaatttttatagatataaatacttatataaatatttttctgcacac
aatacctttaaagaatatatttttgataataaaataatattttcagaaactatagttaat
gacattgaagtaagtaaagaggagttggtttatgtttattttattataaaactatatata
ataccttgtactttttcttgtaaaataaaaaataaaaaaaattatatagataattctata
atacaatttagaataaaaattttaaaccttttaataaaacaaagcaaaatgctgatagat
agattttctgaatataaatttccaacacacttacttgaattggcttttcttactttattt
catcctttaattgtaaaatttgaaattgaattatatagtaatgaaaattataaagcaatc
gaggatatgaaagaatatggatatatatcttttaaactattaaattttgtaaaaaatatt
ttgaaaattggacagaataaattgtctatatgtagaagtgttgttattccatttttaact
tcctatttttttagtataattgaatatggaaatattataataaatataagcaatgaatat
ttagataagtttgtggaaattattgttgacattcttatgcataaagaatgtgtattatat
gattgtcaaaaaagttttactaacgatttatttaaaataaaaaaagggaatttaaatttt
aataattttattaatgaaaatatttgctcatactttttaaacaaaatagaaaacaaccaa
catattatattcccttcaaaattttttgaaatatatcatacatcaatttttttaagactt
ttaacattgatatttttaataaatctatttaaaattttagaaaataaatatatttgcgta
atgaaaatagggatacataataaaactgagcatatttcaaatgatgagatgttggattct
ccaaaggaaaaaaaactaaaggaaaaaaaagaagaattttataaaaaaagaaatataata
ttatgtatttatgaaaagcttattattcatattttaaaaagagttgataacaaaaatgtg
cttcgcgaaaatttaaaaaataaatgtaatgataatgaaagtaaacaaaaaaataataaa
aaagatggtcaaaatattaccccattacctttttcgtatggtcataatattcaaataaga
ggattacaagcattatgtatcctttcaagatattttaaatatataaaaaaaggaaaaaga
aaaaatataattttttatgttaatacacttttacaatatgataatcttagtacaactcgt
caatatttagaattgttttgttcatcaatttgtaattcttctttcattttattatatccc
catttaattaaaaatatattaagaaataatggtgaaaatgcacaattaactattagctct
ttaattatatctgcacacatttttttaaaatctaaatttagttactattcttttgtaaaa
cttaattataattccttttctggattgacagttgatcagcaaaaatatgccacaaatata
tttgtaaaaaaacaaaaaaatgttaaagcatcacaaaaattaaaaggaaaaaaaatcaaa
aatattattaggcaaatcttagaaaaaaataaaggtgaaacaacagaaattgccaaagat
gtggataagacaattgcaaatataaagaaaaaaaaaattcaatatggtaaacaatggaaa
ctaaacgagaaagataatgataaacaaataggaaaaaatagaaagaaatgggataattat
caaaaggagcaaaataaattacatgaatatgaaaataaagaaggatcaaattttcaaaga
aataaaaatgttatttctataaaggatgataatattgaaaaagaaaaaaaagataaagtt
tatgaaatggaaaataaaatatgggatacagaaaatataactagtaaagacaatccacaa
aatggttatttttattcaccatatatttccaaaatattaacaaaattattattaaaaata
gtacttttatgttcctctcactcagctttaattagaagtatttcacaatatatattatac
aattttttaaaaaaaagaaaagaaatgctattaattccatttttatcgaaaatatattta
tttattaaaaataataaagattgtaaaagaataagagataaattaaaaaaagaatttaaa
aattgggatacttcaattatcgaacaaaaaaataatatatgtatgctattaccaacttat
aatcattcatttaatttttttgatgaagatataaattgtgaaaatacaaacacatttaca
cacattttatataataacgaattggtgagttcctatacatttatagatagtattaaaaaa
attgtccaacaagaaatgacttctataatgtataatatacagttagaaaaagaaaaaaaa
gatggaatttctatttataaatataataatgaacaaaaattgttaacgttaaatcagttt
tatcatgggaagaatgtagatgaaatatcttctacaattgacgataagagagatacaaaa
attttagctagcgaaaatgggcaagaaaaaaaaaaaaaaacaactagccaaataattaac
ggagaagcatgctttaataaaagcagtgaaaatattgactatgataaaaactttgaaaat
tttttaaaacaaaccaaaaaaaattatcaaaaaaaattcgatccaatcgataatataata
gaaattaataacgaatttcgaaaaaaatatcaattaagaaaaaaaaataatttaatcgtc
attgcttccctaattgacaaagtcccaaatttagctggcttgtgcaggacatgtgaaatt
tttaatgttaaaaaattattgctcagcaatataaatattgttaaagattttcaatttcaa
aaaatttcttccactgctaataaatggatgaatatacaagagttaaaaaaaaaagatatt
ataaaatatttaatcaaaaaaaaaaagaaatattctattattggcttagagcaaacaaat
gatagcaaacgattgaacgattttattttcccagaaaattgtatactaatattaggagac
gaaaaagagggtttaccatcttctattcttttacttttacaccattgtgtggaaatacct
ggacatggaattatcagatctttgaatgttcatgtttctgcagcgattactatttatgaa
tatttcaagcaacacctttag
DBGET
integrated database retrieval system