KEGG   Plasmodium berghei: PBANKA_1017100
Entry
PBANKA_1017100    CDS       T01111                                 
Name
(RefSeq) DNA mismatch repair protein MSH2, putative
  KO
K08735  DNA mismatch repair protein MSH2
Organism
pbe  Plasmodium berghei
Pathway
pbe03430  Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pbe00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03430 Mismatch repair
    PBANKA_1017100
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pbe03400]
    PBANKA_1017100
DNA repair and recombination proteins [BR:pbe03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    Mismatch and loop recognition factors
     PBANKA_1017100
SSDB
Motif
Pfam: MutS_V MutS_III MutS_II MutS_IV DUF7309 AAA_27 Tocopherol_cycl
Other DBs
NCBI-GeneID: 55150091
NCBI-ProteinID: XP_034421970
UniProt: A0A509AL67
LinkDB
Position
10:complement(724592..727027)
AA seq 811 aa
MENNETVEINNDEILCLFIDTKKYQKTIGVCFYNYLKCEFLMTEFIDNGYFTALESLFIQ
KRPCKCFFNSTTDLVDEEKVLNLFKMCNIEPILTDKKKYDITNLKEELKLIIPQNDDIRN
YDKHLELENASKCLMVLINYLKFKENEDINYQCSINIYNMNLYMRLDKAAITALNILPNK
KNTHSYNNNTSLLKFLDKCNTSIGSKKLVSWLTQPLTNALEINQRLNIVETFINEDDIRN
SVFCNYLKRIPELDKLNHYLKEINKNNDIRVNSKYNEEMILKDIVKLYYAILDFKQIYFL
LVSINGKHKETLNEILIKPLHDILNKFSKFLDMIEMTIDLKEIEENKVYLISKHFDSELE
QIYNEKSALMKKIKNHKEDVEKDLFSDKHDRRNKKAMREDIKLIECNTNGFLFRVCKKDC
PLVQQQKKKYLPIRMNKNEFLFTTNTLKNLCREYEHCLSIYNTLQSEIVKKTICAVSTYT
PVIEKFMDVVSTLDVLVSFSVVCYNSPFTYVRPALVKNGENVIMKKSRHPLLELQHNISN
FIPNDIHMNKNKSRLIIVTGPNMGGKSTYIRQIAIICILAQIGMFVPCDFCEIPIFTQIM
CRVGASDFQLKGISTFLSEMIEASAIIKNADNNSLIIVDELGRGTSTYEGLGISWSIGKY
ILDNIKCFCLFATHFHEMSNIAYQCEGVINRHIETIIDQKNKKICFLYEIKDGASNKSYG
VNVAEIAKLPKDVIQKAYEKVEELESAENKYYLKEKLNIDTSSSTNEKYKNNISNYVKIK
DEINYIFSSTDESEFIKRFISKKAYLKELTI
NT seq 2436 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaaataacgaaacagttgagataaacaatgatgaaatattatgcttatttatagat
acgaagaagtatcagaaaacgataggtgtttgtttttataattatttaaaatgtgaattt
ttaatgactgaatttattgacaatggatattttactgccttagaatcgttgtttatacag
aaaagaccatgtaagtgtttttttaatagtaccactgatttagttgatgaagagaaagtt
ttaaatttatttaagatgtgtaatatagaacctattttaacagataaaaaaaaatatgat
ataacaaatttaaaagaagaattaaaattaataataccacaaaacgacgacattcgaaat
tacgataaacatttagaattagagaatgcaagtaaatgtttaatggtgttaataaattat
ttaaaatttaaagaaaatgaagatataaattatcaatgcagtattaatatatataatatg
aatttatatatgagattagataaggctgctattactgcattaaatatccttccaaataaa
aaaaatacgcatagttataataataatacaagcttattaaaatttttagataaatgcaac
acttctattggatctaaaaaattagtttcttggttaacccagccattaacaaatgcttta
gaaattaatcaaagattaaatattgttgaaacatttataaacgaagatgatatacgtaat
agcgttttttgtaactatttaaaaaggatacctgaattagataaattaaatcattaccta
aaagaaataaataagaataatgatatcagagtaaattctaaatataatgaagaaatgata
ttaaaagacattgtaaaattatattacgcaattttagattttaaacaaatatatttttta
ttagtatctattaatggaaaacataaagaaacattaaatgaaattcttattaaaccatta
catgatatattaaataaattttcaaaattcttagatatgattgaaatgactattgattta
aaagaaattgaagaaaataaagtttatttaatttcaaaacatttcgattcagaactagaa
caaatatataatgaaaaaagtgcattaatgaaaaaaattaaaaatcataaagaagatgtc
gaaaaagatttattttctgataaacatgatagacgtaataaaaaagcaatgagagaagat
attaaattaatagaatgtaatactaatggattcttatttcgagtatgtaaaaaagattgt
cctttagttcaacaacaaaaaaaaaaatatttaccaatacgtatgaataaaaacgaattt
ttatttacaacaaatactttaaaaaatttatgtagagaatatgaacattgtttaagtatt
tataatacactgcaatcagaaattgtaaaaaaaacaatatgcgctgtatctacatatacc
cctgtaattgaaaaatttatggatgtagtatctacgttagatgtgttagtatcattttct
gttgtttgttataattcaccttttacatatgttagaccagcattagttaaaaatggagaa
aatgttattatgaaaaaatcgaggcatccgttattagaattacaacataatataagtaat
tttatacccaatgatatacatatgaataaaaacaaaagtagattaataatagttacagga
ccaaatatgggaggaaaaagtacatatatcagacaaatagctataatatgtatattagca
caaataggaatgtttgttccatgtgatttttgtgaaataccaatttttactcaaattatg
tgtcgagtaggtgcatctgattttcaattaaaaggaatttcaactttcttatcagaaatg
atagaagcatcagcaattataaaaaatgctgataataattcactaattatcgttgacgaa
ttaggtagaggaacatctacatatgaagggttaggaataagttggtctattggaaaatat
attttagataacataaaatgtttttgtttattcgctactcattttcatgaaatgtcaaac
atagcttatcaatgcgaaggtgtgattaacagacatattgaaacaataattgatcaaaaa
aacaaaaaaatatgctttctatacgaaattaaagatggtgcatccaataaaagttatggt
gtaaatgtagctgaaatagctaaacttcctaaagatgttatacaaaaggcatatgaaaaa
gtagaagaattagaatccgctgaaaataaatactatttaaaagaaaaattaaatattgac
acttcctctagcaccaatgaaaaatataaaaataatatttccaattacgtgaaaattaaa
gatgaaattaattatattttttcttcaacggatgaaagtgagttcatcaaacgatttata
tccaaaaaggcgtatctcaaggagctcaccatttaa

DBGET integrated database retrieval system