Plasmodium berghei: PBANKA_1129400
Help
Entry
PBANKA_1129400 CDS
T01111
Name
(RefSeq) conserved protein, unknown function
KO
K22647
ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3/4 [EC:
3.4.19.12
]
Organism
pbe
Plasmodium berghei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
pbe04121
]
PBANKA_1129400
Enzymes [BR:
pbe01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.19 Omega peptidases
3.4.19.12 ubiquitinyl hydrolase 1
PBANKA_1129400
Ubiquitin system [BR:
pbe04121
]
Deubiquitinating enzyme (DUB)
Ubiquitin-specific proteases (UBPs)
MINDY
PBANKA_1129400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MINDY-3_4_CD
UIM
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55150660
NCBI-ProteinID:
XP_034422501
UniProt:
A0A509APB0
LinkDB
All DBs
Position
11:1118110..1120765
Genome browser
AA seq
807 aa
AA seq
DB search
MQTNEELLRKEEEEISKTIALSLEEYHAFQQRNNQSNLDIDDENDELLQEAIRLSILKCD
TKNPEKEKSDLNDSYYDIAKKNFDKITYYLCNNYETTKNQTDIIDNKLFWKEIYKDYKNI
YVIIKDYINNLHKRNEKLNEGKKNSHYSSNDEYDSDENSSDCSSSSSLSCQSLEQIKKTY
KNINYTTQDYCKWLKKGNRSKSLNDHVYVNYLLTEMKLLEDATNLHNLVFGINNYKYSNK
MDIQKWCNHNISFYDHKNINFGLRQFLSGPCGLISSIQSYIIIVLLFNYKYNFLWENDYF
NVLKTNNDFMNMLFNNTDKNKSAKENKLKTTNICKEDISKDSKNVGQKEGIHYDNTNDVH
KSLGTKQVSEFKNIEPSHNKETYSEKNDEEMNKNDNEILYLVREHIRDLKYYSLVESLAY
ILYQCTDKSYYIIAFLLPECYDLTYFLSKQNSDESIIRDIKKINIYYKEFSSIKDVIRFY
LEHFIIFSSSTGVISFLYSVILTRGINNIKDDMDDINHPLIGIYGHCSQELVNLLLTGRA
CSNVFDNNSIINTFLNNDVDIVSTYENGGNSSCNNSYSVGINNGNDSKNSQNIMDIQNSS
SFNKNNIILKGINKRPLIGLLTDFEAFKYCEVGNFYKYPIYPIWVISSSNHYTVLFSLNI
KNSRCTSEELYLEKLNKVWKKYDKEDNKYILSHFISRFIDDLNIKDEYKNMFQGFVNDLD
ILLYSEFKSFYLQIKQKDIDEQKFSDPPKDKYFYLYDAQEIPEKAITYFFLKGVDYDVSH
NNNLKFFNTRWPNNSVEILNKTRKLSQ
NT seq
2424 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaacaaatgaagaacttttaagaaaagaagaagaagaaatttcaaaaaccatagcc
ttgtcccttgaggaatatcatgcttttcagcaaagaaataaccaatctaacttagatata
gatgatgaaaatgacgaattgctgcaagaagcaataagattgtccattttaaaatgtgat
acaaaaaatccagagaaagaaaaatccgatttaaatgacagttattatgatattgcaaaa
aaaaattttgataaaattacatattatttatgtaataattatgaaacaacaaaaaatcaa
acagatataattgataataaattattttggaaagaaatatataaagattataaaaatata
tatgtaataataaaagattatataaataatttacataaaagaaatgaaaaattaaatgaa
ggaaaaaaaaattcacattattcaagtaatgatgaatatgatagtgacgaaaattcaagc
gattgcagtagctcctcttctttatcgtgccaatccttagaacaaataaaaaaaacatat
aaaaatataaattatacaacacaagattattgtaaatggttaaaaaagggtaatagaagt
aaaagtttaaatgatcatgtatatgtaaattatttattaactgaaatgaagttacttgaa
gatgcaaccaatttacataatctagtttttggtattaataattataaatattcaaataaa
atggatatacaaaaatggtgtaatcataatatatcattttatgatcataaaaatataaac
tttgggcttcgtcaatttttaagtggcccttgtggacttatttcaagtattcagtcatat
atcataatagttttactttttaattataaatataattttttatgggaaaatgattatttc
aatgttctcaaaactaacaatgattttatgaacatgttattcaataataccgataaaaat
aaatcagccaaagaaaacaaactgaaaacaactaatatttgtaaagaagacatatctaag
gattcgaaaaatgtcggacaaaaggaaggtatacattatgataatacaaatgatgtacat
aaaagtttgggtacaaaacaagttagcgaatttaaaaatatagaaccatcacataataag
gaaacatattccgaaaaaaatgatgaagaaatgaataaaaatgataatgaaattttatat
ttagttagagaacatattcgggatttaaaatattattctttagtagaatcactagcatat
atattatatcaatgtactgataagtcatattatattattgcctttctgttaccagaatgt
tatgatttgacatattttttaagcaaacaaaatagtgatgaatctattataagagatata
aaaaaaataaatatatattataaagagtttagtagtataaaagatgttattcgtttttat
ttggaacattttataatattttcaagttcaactggtgtcatatcttttctttactcagtt
atattaactagaggaataaataatataaaagatgatatggatgatataaatcatccatta
ataggtatatatgggcattgctctcaagaattagtaaatcttttattaacaggacgagct
tgttcaaatgtatttgataataatagtatcataaacacattcttaaataacgatgtagat
attgtaagtacatatgaaaacggaggaaatagtagttgtaataattcatattctgttgga
ataaataatggaaatgattcaaaaaattctcaaaatattatggatatacaaaattcttca
tcatttaataaaaataatataatacttaaaggtataaataaaagaccattaataggatta
ttaacagattttgaagcttttaaatattgtgaagttggtaatttttacaaatatccgata
tatccaatttgggttattagcagctctaatcattatactgttttattttcattaaatata
aaaaattcaagatgtacaagtgaagaattatatttagaaaagcttaataaagtgtggaaa
aaatatgataaagaagataataaatatatattatcacattttatatcaagatttattgat
gacttgaatataaaagatgaatataaaaatatgttccaaggttttgtaaatgatttagat
atattattatattcagaatttaaatcattttatttgcagatcaagcaaaaagatattgat
gagcaaaaattttctgatccaccaaaagacaaatatttttatttatatgatgcccaagaa
ataccagaaaaagcgattacttatttttttttaaagggagttgattatgatgtttcacat
aataacaacttgaaattctttaatacaagatggccaaacaactcagtggaaattttgaat
aagaccagaaaattgagccaataa
DBGET
integrated database retrieval system
