Plasmodium berghei: PBANKA_1140100
Help
Entry
PBANKA_1140100 CDS
T01111
Name
(RefSeq) nucleoporin NUP205
Organism
pbe
Plasmodium berghei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
55150767
NCBI-ProteinID:
XP_034422607
UniProt:
A0A509AT56
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(1515798..1521284)
Genome browser
AA seq
1828 aa
AA seq
DB search
MDVEDNSMDFYSMSNYEDISNNKNTKLNDKEQGIISNKDRPISTNGITDLSCPLEKSCES
FVTVSDAYLSSSSLYKSNFYDDYEDNDAYNINNEVSTLRYSFSKNSSSDISNDSFSDDQY
ETPYINKKNNNINVKNCFNKNSHITYQDENNSNDNKICEGKSLNIENNLKNKISMLKKKT
QDISAFSKRENKTNESDDIYSNRGSNDDLDNSTHIENAKNGNKKTDVSENDSNMGGRKQN
NEHSDKSDQEDKNSKSENSDDDLYSVISGPENYDEIFLRTQKDDYYMNDNIKLKRNIFDE
NQNNSGHTKNIENEDDKNFDDTKTKYTTSTNFIKIIKFSDQLESIKKKNNDGNVFRSYDS
SQIEGGEDEKTIKEKKEKKKQKKNLNDKYNVQKDYEFKKLVRSTINMCHPKIKNIDENED
ILFNMDKISKIVIEDNNKDAYKTDDSENDDDCDTNNSLYDRVDDILDDRNKYIREKRDKY
FSEVKNGLNIGTNNNGDGIRIKNPSDKNGDHLNSVIGTIKNNDAINNCLKTENNKNNEEQ
YIKTNMANSVYYLNHDMIEINENVLKLYSGMCNYVERNNCTKNIVRIVPHLNNIYDNKKL
CYIKDSPSFSEIYKVIPEWKDSFELLNKKAQTDTEDMKNILKRIENIKNDLNILNKDLVD
DKKEFENIKFETIQHESMISNFEKKNKTYIKGVLKLDNMSFKLKKIHKINTNNLNNFNIT
ENVNRLLKYVDNAMTDYSQLFNEEKSIEILRFQQLDNTFNILTNTDDEYSFLMNLLKDEL
KEMICEKKEQLQNIIRRTMLYKAFDTTSFKDQITNTLNKQTLLINQIKYNLQCNVLLLFD
MYKKFSKKNIKIIQIPENYVKDYTNEVIKKSYIIKTFNDTKKNVSKYFNCVHFTRNRPIT
HPFFIHFCLGEKFLYHFINFVLYPLSEENQKKFMQYCSIPGFNSFLFVDKVLKLHKEEQQ
FPSTDLTYDFSSAYDRIGKTDYNDTSLINQYMQKWNELNPYLLALRNASEFCFQPSSNDI
NDNNDDYTSYTLMDSKKNVFDLINHIPDSIIGMSNAATAAAAIASSSGICNNINPSLGFS
SSFDNMNKLNSTFSLLNNQMSNNTNTMFNNITGVGTNISGLNSGNSFASNNNLFANNSGS
NLFGSTFNNSTNTTMRNNSTSYGTTNNNLLSGGNSSQSMFNTNFPKSSTSSIFGNASSTS
SFMGSGINNTPNVSVGGSTSLFGGSANLGNNMLNTNNRNPLENNSAVGIFGSSNYSTSAN
NNTLTVSTPFGTTNNDLLSGGNSSQSMFNTNFPKSFASSIFGNTSSTSNFMGSGINNTPN
VSVGGSTSIFGGSTNLGNNILNTNNRSNNILNIPNTPTMGNQQNSLLINNNATGNNNSGL
FNKSTLGSSSLFNSSMNNNANSQFNRTTLNTASSSLFANSITPNNNNILGSNVGMNNNTS
SIFSGLNNNKTAMLSNNNMFGNNLNNNTNSSGLNTGLFSLSSDTNKIGNNNNSNMSNSLF
TNSSGMSRINTNNNNNNNNSLFSNVNNYGASSNKNMVNTSSFNRGINMGSNNTISSYDLG
GNTNFGSFMGGNTSGNNSTFSGNNNYGGLFGGNNAQQGASSSIFNNNNTSMFSNNTRDTN
IFNNSNNSPSKNMFNNRMSYNSTNNITSNNSSTFGNKTGFSGSNNLNQFSTTLNNSSNTS
GNNSSNTSGNNSMFLSNNNMMRNKSSFPLSNNNYMSSSNLSNNNSLFQKNTFSSTQNNRD
SLSGFNTLNNNSSSNNFGNKFQQNVGNTFGSTFGNTSNNNMFSNNNSSSFGANTNTGLGA
NNNSVFQQTNSNFQYNFKPQNNSSLFSR
NT seq
5487 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgtagaggataattcaatggatttctatagtatgagcaattatgaagacatttca
aataataaaaatacaaaattaaatgataaggaacaaggtattatatcgaacaaagatcgt
ccaatctccacaaatggtataactgatttaagttgcccacttgaaaaatcttgtgaaagt
tttgtaaccgtttcagatgcatatttatcttctagttctctttataaaagtaatttttat
gatgattatgaagataatgatgcttataatattaacaatgaagttagcacattaagatat
agttttagtaaaaatagctcgagtgatatttcaaatgactctttttccgatgatcagtat
gaaactccatatataaataaaaaaaataataatattaatgtaaaaaattgttttaataaa
aattctcacataacttatcaagatgaaaataattctaatgataataaaatttgcgaagga
aaatctctaaatatagagaacaacttaaaaaacaaaatatcaatgctgaaaaaaaaaaca
caagatatttccgcgtttagtaaaagagaaaataaaacaaatgaaagtgatgacatatat
tcgaaccggggatctaatgatgatttagacaattccactcatatagagaatgcaaaaaat
ggtaataaaaaaacagatgtttctgaaaatgatagtaatatggggggtaggaaacaaaac
aatgaacattcggataaatcagatcaggaggataaaaacagtaaaagtgaaaatagtgat
gatgatctttattctgttataagtgggccagaaaattatgatgaaatatttttgagaacc
caaaaagatgattattatatgaacgataatataaaattgaaaagaaatatctttgatgag
aatcaaaataatagtggccatactaagaatattgaaaatgaagatgacaaaaattttgac
gatactaaaactaaatatacaacatctacaaatttcataaaaataataaaattttcggat
caattagaatctataaaaaaaaaaaataacgatggaaatgtatttagatcgtatgatagt
agccagatagaaggaggtgaagacgaaaaaacgataaaggaaaaaaaagaaaaaaaaaaa
caaaaaaaaaacctaaatgataaatataatgtacaaaaagattacgaatttaagaaacta
gtaagatctacaattaatatgtgccaccccaaaataaaaaatatagatgaaaatgaagat
atattatttaacatggataaaatatcaaaaattgttattgaagataataataaagacgca
tataaaactgatgatagtgaaaatgatgatgattgcgatacaaacaatagcttatatgac
agggtcgatgatatattagatgatagaaataaatatattagggaaaaaagagataaatat
ttttcagaagttaagaatggattaaacattggaactaataataatggtgatgggataagg
ataaaaaatccgagtgataaaaatggggaccatttaaatagtgtaattggaactataaaa
aataatgatgcaataaataattgtttaaaaacggagaataataaaaataacgaagaacaa
tatattaaaacaaatatggcaaattcagtatattatttaaatcatgatatgattgaaatt
aacgaaaatgtattaaaattatatagtggaatgtgtaattatgttgaaagaaacaactgc
acaaaaaatattgtaaggattgtaccacatttaaataatatatatgataataaaaaatta
tgttatattaaagattctcctagttttagcgaaatttataaagtgattcctgaatggaaa
gattcatttgagctactaaataaaaaagcacaaacagatacagaagatatgaaaaatata
ttaaaaaggattgagaatattaaaaatgatttaaatattttaaataaagatttagtagat
gataaaaaagaatttgaaaatataaaatttgaaactatccaacatgagtctatgatatca
aactttgaaaaaaaaaataaaacatatataaaaggggtattaaaattagataatatgtca
tttaaactaaaaaaaatacataaaattaatacaaataatttaaataattttaatataaca
gaaaatgtaaatagattattaaaatatgtagataatgcaatgacagattattctcaatta
tttaacgaagaaaaaagtatagaaattttgcgttttcagcagttagataatactttcaat
atattaacaaatactgatgatgaatactcttttcttatgaacttattaaaggatgaacta
aaagaaatgatatgtgaaaaaaaagagcaattacaaaatattattagaagaacaatgtta
tataaagcatttgatactacctcttttaaagatcaaataactaacacactaaataaacag
actttattaattaaccaaataaaatataatttacaatgtaatgtattattattatttgat
atgtataaaaaattttcaaaaaaaaatataaaaataatacaaatacctgaaaattatgta
aaagattatactaatgaagttattaaaaaaagttatattattaaaacatttaatgataca
aaaaaaaatgtatctaaatattttaattgtgtccattttacaagaaatagaccaatcaca
cacccattttttatacatttttgtttgggtgaaaaattcttatatcattttatcaacttt
gttttatatccattatcagaagaaaatcaaaaaaaatttatgcaatattgttcaatacct
ggatttaattcatttctatttgtcgataaagttttgaaattacacaaagaagagcagcaa
tttcctagtaccgatttaacttatgatttttcttctgcttatgatagaattggaaaaaca
gattataatgatacatctttaataaaccagtatatgcaaaaatggaatgaactaaatcca
tatttacttgctttgagaaatgcatctgagttttgtttccagcccagttccaatgatatt
aatgacaataatgatgactatactagttatacacttatggattcaaaaaaaaatgtgttt
gatttaataaatcatattccagattcaataataggaatgtccaatgcagcaactgcagct
gctgcaatagcttcatcttcaggaatttgcaataatattaatccatcattaggattttcg
tcatcttttgacaatatgaacaagcttaacagcacattttcacttttaaataatcaaatg
tcaaataatacaaataccatgtttaataatattacaggagttggcactaatatttcgggt
cttaatagcggcaactcatttgcttcaaataataatttatttgcaaataattcaggaagt
aatttatttggttctacttttaataattctacaaacacaactatgaggaataatagcact
tcttatggaactacaaataataatttattatctggaggaaattcttcccaaagtatgttt
aatactaattttcccaaaagttctacatctagtatttttggtaatgcatcttctactagc
agttttatgggttcaggaataaataatacgcctaatgtgtctgtaggtggatcgaccagc
ttatttggtggcagtgccaaccttggaaataatatgcttaatacaaataatagaaaccca
ttggaaaataactcagctgttggaatatttggatcatcaaattattctacttccgctaat
aataatacgttaactgtttcgactccttttggaactacaaacaatgatttattatctgga
ggaaattcttcccaaagtatgtttaatactaattttccaaaaagctttgcatctagtatt
tttggtaatacatcttctactagcaattttatgggttcaggaataaataatacgcctaat
gtgtctgtaggtggatcgaccagcatatttggtggcagtaccaaccttggaaataatata
cttaatacaaataatcgaagtaataacattttaaatattcccaacacacctacaatgggc
aatcaacaaaatagtttgttaataaataacaatgcaacgggtaataataatagtgggtta
tttaataaaagtacacttggttcttcgagtctttttaattcttctatgaataataatgca
aattcgcaatttaatagaaccacattaaatacagcatcaagtagtttatttgccaattca
atcacaccaaataataataacatattaggctcaaatgtaggaatgaataataatacaagt
agtatcttttcagggctaaataataacaaaactgctatgctttcaaacaataacatgttt
ggaaataatttgaataacaatacaaattcttcagggttaaatactgggctgttttcatta
tcttctgatacaaacaaaattggaaataataataatagtaatatgtcaaattctctattt
acaaactctagtggtatgtcaagaattaatacaaataataataataataataataatagt
ttattttctaacgtgaataattatggagcatcgagtaataaaaatatggtaaatacaagt
tcatttaatagaggtataaatatgggaagtaataatactatatcatcatatgatttgggt
ggaaataccaacttcggtagtttcatgggtgggaatactagtggtaataatagcacattt
tctggaaacaataattatggggggttattcggagggaataatgcacaacagggagcaagt
agcagcatatttaataataacaacacaagtatgttttcaaataatactagagatactaat
atatttaataattcaaataattcgccatcaaaaaatatgttcaataatagaatgtcatat
aatagcactaacaatattactagtaataatagcagcacatttggaaataaaaccggattt
tctgggtctaataacttaaaccagttttcaacaaccctcaacaatagtagtaatactagt
ggcaacaatagtagtaatactagtggcaacaatagtatgtttttatccaataataatatg
atgcgaaataagtcttcttttccactttcaaataataactatatgtctagttcaaattta
tcaaataataacagcttatttcaaaaaaacacattttcatcaactcagaataatagagat
tccttatcaggctttaatacactaaataataatagtagtagtaataattttggaaataag
tttcaacagaatgtaggaaacacctttggaagtacttttggaaacaccagcaataataac
atgttttcaaataacaatagttcttcttttggtgctaatactaatacaggtttgggtgcc
aataataactcagtatttcagcaaacaaattcaaactttcaatacaattttaagccccaa
aataatagtagcttattttcgagataa
DBGET
integrated database retrieval system
