Plasmodium berghei: PBANKA_1206200
Help
Entry
PBANKA_1206200 CDS
T01111
Name
(RefSeq) histone deacetylase 2, putative
Organism
pbe
Plasmodium berghei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Hist_deacetyl
IPK
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55150912
NCBI-ProteinID:
XP_034422740
LinkDB
All DBs
Position
12:245379..251363
Genome browser
AA seq
1994 aa
AA seq
DB search
MKKTDSSNNEKKQKKNNSIKQNSKTNLNFSKKRITFNNLIVDNFRSINDINNYLRNSSLN
SIETQNKNVINDSFSENYLKDNKKKKPHNYNVDIEFVKKNLTKDSLFNIDNNENIFNNNI
SDIIKRSITNNKNISNDLKRVLKKKGKSIQKERRKKKIKHITYTNNDTNKKKKKKIISII
KKKTKNSNISENISTIATISNNTKKIHKKINFQTSSNNEDEYNSHKHALDKIYGSLKNNN
SSIDPLINNFYIECDNNNIISSDEYSNYYKHGYYKPPSDIYDNDNYIHNKYQVSNIYPNT
KYSYNNFNSFIKKKKVSKKTDKFEQSENDCIGFLCDEEYMCEYLHFDENHVESPDRIRCI
IKALKEKNIINKMIQIKCREALYDEIKECHTRAHINNIFYSLKKKLKYKKQNVIYPFDKH
DTYYTFHTGTVSKRAVGGLLNLCDAILSNKNEKFKYIDFKKSLGYNYNFFKNNFPDNLKK
CIGRNINHSTHLKRSKSDSNLFSLKNSRRNSFLNSNKNPKFNTNSHANNNGNFLIKEGWE
KFPKNKKTSCYSYKAMCENYKNNIDTSYTQNLEHSQEYFPNFNDKPKLYNSDSSNNNNIA
YTDGVGIETHQVEPLNSSRNHLSNESINNNKFKKMRSYSTTICNIKDSESNNINHISEIK
CGFAAIRPPGHHCSRNNPSGFCIFNNISVACKYIYIKYGIKKIFIFDWDVHHNNGTQEIF
YNDKNVLCFSIHRFDSNKKNKKRKSKEINKGKHTKKVSSIYNQKNEKKKKTIHANTTSNI
STAESVATSSNINNYNTTIKRKGNKNNKNIENGIDSYNSSSANSVKNKKKKKKTKKKKEK
KSRIATEENGFYPRTGAKSELGEKNGYKFNINVPLEKGYNNCDVYYVFKYLLLPILQAFQ
PEFIFISSGFDASIKDPLGECNLTHTLYEWMTLQLKKFAKIYCEGRIILVLEGGYNLNYL
PKCTLACLKALIKKNIKIPNQEATRSNNNNDSNNIMLNNHTNEEAKNSKENNSNDDSQES
QLNLEKYDLSDKPFYTFTNDNTNKHVENDSESQLNTTQNNISINNGNTCPLINKTNEINS
TLENEKLIKLKNVSREFSNTYDHENFYKFNNLKNYTKKSDKIFNYYCENPYPSNKKKKKK
KIFTRGKLHYSTYKVIKYFLCILKGEPYYLNINLPPYNKFVKKKGLENDSSSNLGHKINL
YNELYNPSDDNSYGNEILSGCAKKKNKELNMHNQQAKKSTTLSPSSSSSSNISNSDLYFS
NDDLDDTETNSDSNHYSIQKIITLNQLKSRINNTINNNNNRNKKNKNKTQINEMEFPNSI
NNNFEKISEFYDLTKYIDNDFLINMSNKKNKNKSEEKLHNQTIGSNSRNQANYQNHTISK
ISKYNGIHSYINGDLTNLKYSRDQLQNSFAMYTQSKKGYIFFYGSGHKNQWVLPVNKKLT
KIIKLCSKSEAFFYAWLYLCCDKKIPITNTQENYSSILEDNITVEGAKLNKYFSDQEIKL
GKELLKFTVPCYQVFLEENQLMQFGRVEEMYESLDEAERNEMKSENNNSYQYNEHINNTS
GHNASSTNSMNVNKYITYDSQSNSDTKENDTTKEPEFYESKTMMNENINNEKERNYFFDV
IEENKENDEDRAKVNGENREKENGEDREKENGENNYIPINIDNKNDLINDAYENKNNSNS
NSFENNNDYKNLVNKNNDLKKKLYGNELKTAICLRNVLSSMRHPCAMDIKMGIKLYGDNC
DEESIQKKIEKAKNRSCLSHGFHLTSLIGWCKKKKQPFFISKEDAHLIKNDEKFVEAFLS
YFLACDNIQLSVFLLKKVLIILEHMKIFFENQSYFAFCGSSLLFVFDSDPSKSKSEDKNN
DENINNSDNSNIENSNNGNDHDNTLTFEQETDKSESSKEQDDYYQKEEKKTYDEIFNFRD
HIQKQFEESLTTEEKNVYMDSKLNANVLKSASVYIIDFAHASLDKKEQDHGFLLGITSLH
RIIIKTIEKVKSSI
NT seq
5985 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagaccgattcaagcaataatgagaagaaacaaaaaaaaaataattcaatcaag
caaaacagtaaaaccaatttgaatttttcaaagaaaagaataacatttaataacttaatt
gtagacaattttagaagtataaacgatataaataattatttaagaaactcttcattaaat
tcaattgaaactcaaaataaaaatgtgataaatgatagcttctctgaaaattacctcaaa
gataataaaaagaaaaagcctcataattacaatgttgatatagaattcgtcaaaaagaac
ctaactaaagacagtttatttaatattgataataatgaaaatatttttaataataatatt
tctgacattataaagcgcagtattacaaataataaaaatataagtaatgatttgaaaagg
gtattgaaaaaaaaaggaaaatctattcaaaaggagcgacgaaaaaaaaaaatcaagcac
attacatatacgaataatgatacaaataaaaaaaaaaaaaaaaaaataataagcataatt
aaaaaaaaaacgaaaaattctaatatctctgaaaatatttcaacgatagctacaatttct
aataatacaaaaaaaattcacaaaaaaatcaattttcaaacttctagtaataatgaagat
gaatataatagtcataaacatgcattagataaaatatatggatctttgaaaaataataat
agttcaatagatcctttgataaataatttttatattgagtgtgataataataatataatt
tcatctgatgaatactcaaattattataaacatggctattataaaccacctagtgatata
tatgataatgataattatattcataataaatatcaagtttcgaatatatatccgaacaca
aaatatagctacaataattttaattcttttattaaaaaaaaaaaagtttcaaaaaaaacg
gacaaatttgagcaatcagaaaacgattgtataggatttctgtgtgatgaagagtatatg
tgtgaatatctccattttgatgaaaatcatgttgaaagcccagatagaataagatgtata
ataaaagctttaaaagaaaaaaatataattaataaaatgattcagataaaatgcagagaa
gcattgtatgacgaaattaaagaatgccatacaagagctcatattaataatattttttat
tcattaaaaaaaaaattaaaatataaaaaacaaaatgtcatttacccatttgataagcat
gatacgtattacacttttcacactgggactgtttccaaaagagcagttggtggactttta
aatttatgtgatgctatattatcaaataaaaatgaaaaatttaaatacattgattttaaa
aaatcacttggttataattataatttttttaaaaataattttcctgataacttaaagaaa
tgtataggaagaaatattaatcatagcacacatttgaaacggtcaaaatccgatagcaat
ttattctcactgaaaaattcacgacgtaattccttccttaacagtaataaaaatcctaaa
tttaataccaatagccatgctaataataatggtaatttcttaattaaagaaggatgggaa
aaatttccaaaaaacaaaaaaacatcatgttattcatataaggccatgtgtgaaaattat
aagaataatatagacacttcttatacccaaaatttagaacactctcaggaatattttcct
aattttaatgataaaccaaaattatataacagtgattcgagtaataataataatattgca
tatacagatggtgtaggaattgaaacacaccaagtggagccgttaaattcttccagaaat
catctatccaacgaatctataaataataacaaattcaaaaaaatgcgaagttattcaact
acaatatgcaatataaaagatagtgaaagtaataatataaatcatatttctgaaataaaa
tgtggatttgctgctattagaccacctggacatcattgtagcagaaataatccatctgga
ttttgtatttttaataatataagtgttgcttgtaaatatatatatattaaatatggaata
aaaaaaatttttatttttgattgggatgtacaccataataatggaacacaagagatattt
tataatgataaaaatgttttatgtttttctatacatagatttgattcgaacaaaaaaaac
aaaaaaagaaaaagcaaagaaataaataaggggaaacatacaaaaaaagtttcttctata
tataatcaaaaaaacgaaaaaaaaaaaaaaactatccatgcaaacacaactagcaatatt
agtactgctgagagtgttgctacatcttcaaatattaataactataatactactattaaa
agaaaaggaaataaaaataacaaaaatatagaaaatgggatagattcttataattcatca
tctgctaattctgttaaaaataagaaaaagaaaaaaaaaactaaaaaaaaaaaagaaaag
aaatcacgtatagcaactgaagaaaatggattttatccacgaacaggtgctaaaagtgaa
ttaggagaaaaaaatggatataaatttaatattaatgtacctttagaaaaaggttataac
aattgcgatgtatattatgtttttaaatatttattgttgccaatattacaagcatttcaa
cctgaatttatttttatatcttcgggttttgatgcttcaattaaagatccgttaggagaa
tgtaacttaactcatactctatatgaatggatgacacttcaattgaaaaaatttgcaaaa
atttattgtgaaggacgaataatattagttttagaaggaggatataatttaaattatttg
ccaaagtgcacactggcatgtttaaaagctttaattaagaaaaacataaaaataccaaac
caagaagcaacgcgcagtaataataacaatgatagtaataatatcatgcttaataatcat
acaaatgaggaagctaaaaatagcaaagaaaataacagtaatgatgattcacaagaaagt
cagctcaatttagaaaaatatgacctctctgacaagccgttttatacgtttacaaacgat
aataccaataaacatgtagaaaatgatagcgaatctcaattaaatacaactcaaaataat
atttccataaataatggtaacacatgtccattgataaataaaacgaatgaaataaactca
actttggaaaatgaaaaattaataaaattaaaaaatgtttcgagagaattttcaaataca
tatgatcatgaaaatttttataaatttaataatttaaaaaactataccaaaaaaagtgat
aaaatattcaattattattgtgaaaatccgtatcctagtaataaaaaaaaaaaaaaaaaa
aaaatatttactcgaggaaaacttcattattctacttataaagttattaaatatttttta
tgtatattaaaaggtgaaccatattatttaaatattaatttaccaccttataataaattt
gttaaaaaaaaaggattagaaaatgattcttcatcaaaccttggccataaaatcaattta
tacaatgaactatataacccatctgatgataatagttatggtaatgaaattttaagtgga
tgtgcaaagaaaaaaaataaagaattaaacatgcacaatcaacaagccaaaaaatcaacc
acattatcaccatcatcatcatcatcatcgaatatttcaaatagtgacttatatttttca
aatgatgatttagatgacactgaaaccaattcggatagtaatcactacagtattcaaaag
attataacacttaatcagcttaaatcaagaataaacaatactattaataataataacaat
agaaataaaaagaataaaaataaaactcaaataaatgaaatggaatttcccaattctatt
aataataattttgagaaaatcagtgaattttatgacttgacaaaatatattgataacgat
tttttgattaatatgagtaataagaaaaataaaaacaaatcagaagaaaaattgcataat
caaactattggtagtaattcaagaaatcaagctaattatcaaaatcatacaatttcaaaa
atatcaaaatataatgggatacacagttatattaatggcgacttaacaaatcttaaatac
agtcgagatcaattacaaaattcatttgcaatgtatacgcaaagtaaaaagggatatata
tttttttatggaagtggtcataaaaatcaatgggtattgcctgtaaataaaaaattaacc
aaaataataaaattatgctcaaagtcagaagcttttttttatgcatggttatatctatgc
tgtgataaaaaaattcccattacaaacacacaagaaaattattcttcaatattagaagat
aatataactgttgagggagcaaaattaaataaatacttttctgaccaagaaataaaatta
ggtaaagagcttctcaaatttactgttccatgttatcaagtttttttggaagaaaaccaa
ctcatgcaatttggtcgggtagaagaaatgtatgaatctctagatgaggcagaacgaaat
gaaatgaaatcagaaaataataattcataccagtacaatgagcatattaataatactagt
ggtcataatgcttcgagtacaaatagtatgaacgttaataaatatataacatatgattca
caaagcaattctgatacgaaagaaaacgacactacaaaagaaccagaattttatgaatca
aaaacaatgatgaatgaaaatataaataatgaaaaagagagaaattatttttttgatgta
attgaagaaaacaaagaaaatgatgaagatagggcaaaagtaaatggtgaaaatagggaa
aaagaaaatggcgaagatagggaaaaagaaaatggtgagaataattatatccctataaat
attgataacaagaatgatctaataaatgatgcatatgaaaacaaaaataattcaaatagt
aattcatttgaaaataataatgattacaaaaatttagtaaataaaaataatgatctaaaa
aaaaaattatatggaaatgaattaaaaacagctatttgtttacgaaatgtgctaagctct
atgaggcacccatgtgctatggatataaaaatgggaataaaattatatggtgataattgt
gatgaagaatcaatacaaaaaaaaattgaaaaagcaaaaaatagatcttgcttatcacat
ggattccatttaactagcttaataggatggtgtaaaaaaaaaaaacagccattttttata
tcaaaagaagatgcgcatttaataaaaaatgatgagaaatttgtcgaagcttttttatca
tatttcttagcatgcgataatatacaattatccgtatttttattaaaaaaagttcttata
atattagaacacatgaaaatattttttgaaaatcaatcttattttgctttttgtggatca
agcttattgtttgtctttgattcggacccttcaaaaagtaaatctgaagataaaaataat
gacgaaaatattaacaactctgataattcaaatatcgaaaatagcaataatggtaatgat
catgataacactcttacatttgaacaagaaacagataaatcagaaagtagtaaagaacaa
gatgattattatcaaaaagaggaaaaaaaaacatatgacgaaatctttaattttagggat
cacattcaaaaacaatttgaagaatctctaactacagaagaaaaaaatgtttatatggat
tcaaagttaaatgctaatgttttgaaaagtgctagcgtctacataattgattttgcccat
gcaagcctagataagaaggaacaagaccatggatttttattgggaataacttctctccac
cgcataataatcaaaactattgaaaaagtaaaatcctcgatttga
DBGET
integrated database retrieval system