Plasmodium berghei: PBANKA_1238800
Help
Entry
PBANKA_1238800 CDS
T01111
Name
(RefSeq) karyopherin beta, putative
KO
K20222
importin-5
Organism
pbe
Plasmodium berghei
Pathway
pbe03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbe00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
PBANKA_1238800
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pbe03009
]
PBANKA_1238800
Ribosome biogenesis [BR:
pbe03009
]
Eukaryotic type
Pre-40S particles
Export and cytoplasmic maturation factors
PBANKA_1238800
Pre-60S particles
PBANKA_1238800
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HEAT
HEAT_EZ
Importin_rep_4
Vac14_Fab1_bd
Importin_rep_6
HEAT_2
TOR1L1_N
HEAT_EF3_N
CEP104-like_TOG
Arm
mTOR_dom
IFRD
RIX1
UTP20
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55151237
NCBI-ProteinID:
XP_034423062
UniProt:
A0A509ANR0
LinkDB
All DBs
Position
12:1489931..1493311
Genome browser
AA seq
1126 aa
AA seq
DB search
MEKIVEIIEGLSNPDSRIRTECENTLNYYKKNDLNNTVLSILKLLKSHKNSQVRLQCAIL
VRNLFRGYIKSSTGDIMDKDKTDDNSLLNGEEENYWDLLSNNLKNIVKSELISNIGIETD
KMVRSNLCSNIIDLSSKLLLNNEWPELLSVTFEFCNSNNNNDVLISGYKILGGILNCISD
ELHGKNEMISSICMKGLNSPSVQVRSECINLISCIVEDNNSPLIKCVQPCIPLILQSLSL
MVKNSVSDVAVLDECEKVLQSIGKMIDYNAKFFSKYISNLCDILFDICMKNENELNYDFD
NSLKSLSIEALITIPERRPKTALSVPHFLEKIINVSLLFMLDINNDCFNEWMNSLKESKD
ENQELYDIGEESLDRVGKAYSELSDGPEFIHILYNKVSEYLMKNTWEHKYVAIMAIAQTI
EYLPEEEIEEQLENVIKMLLQVLLDQDVRVRYAACQAIGQISLDHQPYVQKEYPRQVITS
LISTMNDVHLRVQSHATAAFVNFAEELEKSALLPFSDMIIEILLQKLNTTNYLLVREQAV
TAIAVIAGVIEEDFLKYYPTVVPLMKEIIQKAVSEEERTCRGKAIECISIIGLSVGKEIF
IEDAKECMSALLQISSTKMDPDDTVKEYIQEAIGRICRALGNDFYPYLSSIVPTILSLLS
ISPTPLVDDDDDLTITMVSNGQYVGLKTSLLEDQEKALDLLIIIIEVLKENYKEYIEATA
SAILPMLDYELSDEIKQKALSAISELIEAARIISDQTDNNKSMLLAILTTSAEKVLKSLS
DTKLDDNYEYVLDIMIIESNGLYMCLQKAGANILPNNTLKMFFNEIFKLLQYSTDRRVIY
NQKKNNEDVDDDELLIIDREEELEQTYRTNLLDILGVLIKHHTNQFLSTCCDICITFINN
YLNSPHAEDIALALYVCDDLLEFLQDNSVCLWEYFMNPLLLNINHTDHKVKQAACYGVIQ
ANKIEAFGKYANLAIEYLLKLLHQTPPSKKPKEYISAIDNAVAALGDVVLMHTSKFNNSE
ELIKLWLNNLPIKEDESEGRRVHKNLIDLVSQNHPLLFGKDNSNIGKIIEIFLSIYETEF
SDSDCNKKIVSLISSLDQSYLSNLASTSLTNKQSKKLNHIMNASRK
NT seq
3381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaaattgtggagattatcgaagggctgagcaaccctgatagtcgtatacgaact
gaatgcgaaaataccctaaattattacaaaaagaatgatttaaataatacagtattatca
atattgaaattattaaaaagccacaaaaacagccaagtaagattacaatgtgcaatatta
gtacgtaatttgtttcgaggatatataaaatcttcaactggtgatataatggataaagat
aaaactgatgataattcattattaaatggtgaagaagaaaattattgggatttattatct
aacaatttaaaaaatatagttaagtctgaacttattagtaatataggtattgaaactgac
aaaatggtgaggagtaatttgtgtagtaatataatagatctttcatcaaaattgctttta
aataacgaatggccagaattattgtctgttacttttgaattttgtaactcaaataataat
aatgacgtattaataagtgggtataaaatattaggaggtatactaaattgtatatctgat
gaattgcatggtaaaaatgaaatgatatcttcaatttgtatgaaagggctcaattcacca
agtgtacaagttcgaagcgaatgtattaatttaatttcatgtatagttgaagataacaat
tctccattaattaaatgcgtacaaccatgtattcctttaattttacaatctctaagttta
atggttaaaaatagtgtttcagatgttgctgttttagatgaatgtgaaaaagttttgcaa
tcaataggaaaaatgatagattataatgccaaatttttttctaaatatatttcaaattta
tgtgatattttattcgatatatgtatgaaaaatgagaatgaattgaactacgattttgat
aacagtttaaaatctttaagtattgaagcacttataactataccagaaagaagaccaaaa
acagctttatcagttcctcattttttagaaaaaattattaatgtatcattattatttatg
cttgatattaacaatgattgttttaacgaatggatgaattcactaaaagaaagtaaagac
gaaaatcaagaattatatgatataggtgaagaatcattagatcgagttggtaaggcatat
agtgaattatcagatggtcccgaatttattcatatattatataataaagtatctgaatat
ttaatgaaaaatacatgggaacataaatatgttgcaataatggctatagcacaaactatt
gagtatttaccagaagaagaaatagaagaacaattagaaaatgttattaaaatgttatta
caagttttattagatcaagatgttagagttagatatgctgcatgccaagcaattggacaa
atatctttagaccaccaaccatatgttcaaaaagaatatccaagacaagttattacttca
ttaatttcaactatgaatgatgttcatttaagagtacaatctcatgcaacagcagcattt
gtaaattttgcagaagaattagaaaaaagtgcattattaccattttctgacatgattata
gaaattcttttacaaaaattaaacactacaaattatttattagttcgtgagcaagcagtt
acagctatagcagttattgctggtgtaatagaagaagatttcttaaaatattatcccact
gtggttccattaatgaaagaaataatacaaaaagctgtatccgaagaagaaagaacatgt
agaggtaaagcaatagaatgtatatcaataataggtttatctgtaggaaaagaaatattt
attgaagatgcaaaagaatgtatgagcgcattattacaaataagtagcacaaaaatggat
ccagatgatacagtaaaagaatacatacaagaagcaattggacgtatatgtcgtgcctta
ggaaatgatttttatccatatcttagcagtatagtaccaacgatattgtctcttctttct
atatcaccaacgccattagttgatgatgatgatgatttaactattactatggtttctaat
ggacaatatgtaggattaaaaacttctttattagaagatcaagaaaaggctcttgattta
ttaattattattatagaagtattaaaagaaaattataaagaatatatagaagctacagct
agtgctatattacctatgcttgattatgaattatctgatgaaataaaacagaaggctttg
tcagctattagtgaattaattgaagcagcaagaataatatcagatcaaacagataataat
aaatctatgctattagctatacttacaacatctgctgaaaaagtattaaaaagtttatca
gatacaaaattagatgataattatgaatatgtattagatataatgattatcgaatctaat
ggtttatatatgtgcttacaaaaagccggtgctaatatattacctaacaatacattaaaa
atgttttttaatgaaatatttaaattattacaatattcaacagatagaagagtcatttat
aatcaaaaaaaaaataatgaagatgtcgatgatgatgaattattaattatagacagagaa
gaagagctagaacaaacatatcgaacaaacttattagacatattgggagtattaataaaa
catcacacaaatcaattcttaagtacatgttgtgatatatgtattacatttataaataat
tatttaaactcaccacatgcagaagatattgcattggctttatatgtttgtgatgatttg
ttagaatttttgcaagataatagtgtatgcttgtgggaatattttatgaacccattatta
ttaaatattaatcatacagatcataaagttaaacaagcagcttgttatggtgttatacaa
gcaaataaaatagaagcatttggaaaatatgcaaatttggccatagaatatttattaaaa
ctattacatcaaactcccccaagtaaaaaacccaaggaatacatatctgctattgataat
gctgtagctgcattaggagatgttgtcttaatgcacacatccaaattcaataattcagaa
gaattaattaagttgtggttaaataatttaccaattaaagaagatgaatcagaaggaaga
cgagtgcacaaaaacttaatcgatttagtttctcaaaatcacccacttttattcggaaaa
gataattctaatattggaaaaattatagaaatattcctatcaatatatgaaacagaattt
tctgattcagattgtaacaaaaaaatagtatccttgataagttctttagatcaatcttat
ttaagcaatttggcttccacatctctcaccaacaaacaatccaaaaaattgaatcacatt
atgaacgcctctagaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system