Plasmodium berghei: PBANKA_1344100
Help
Entry
PBANKA_1344100 CDS
T01111
Name
(RefSeq) myosin F, putative
Organism
pbe
Plasmodium berghei
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Myosin_head
Beta-prop_WDR5
Beta-prop_IFT122_1st
WD40
Beta-prop_WDR3_1st
Beta-prop_THOC3
WD40_WDHD1_1st
WD40_Prp19
Beta-prop_EML_2
Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd
WD40_CDC20-Fz
IQ
Beta-prop_CAF1B_HIR1
Beta-prop_TEP1_2nd
Beta-prop_TEP1_C
Beta-prop_WDR3_2nd
Beta-prop_WDR90_POC16_2nd
WD40_Gbeta
Beta-prop_EML
IQ_SCN5A_C
AAA_16
EIF3I
Myosin_N
RNA_helicase
AAA_7
Beta-prop_WDR75_1st
AAA
Roc
NBCH_WD40
Beta-prop_SCAP
AAA_33
EFL1
AAA_5
Beta-prop_Aladin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55151788
NCBI-ProteinID:
XP_034423598
UniProt:
A0A509AP76
LinkDB
All DBs
Position
13:complement(<1738325..>1744700)
Genome browser
AA seq
1965 aa
AA seq
DB search
MEPTSKCVVGTKIFIKHKEKVWISAEIIKEDTDIVVKTDDDEIVNLKEGDEFFLRNTDIF
NSNGLSAPPDLTKLTHLHEASVLHSLNIRFDIDEIYTFTGPILIAINPFKNIKNLYSDNI
LEKHIQPIKSKSPHIFATSNSAYLGMCKNNKSQTILISGESGAGKTESTKYVMKFLACAG
SDIKKRSLIESQILESNPLLEAFGNSKTLRNNNSSRFGKYIELHFDICNNGYIKGKLYGA
KILTYLLEKVRVCDQQEGERNYHIFYQLCSAVQYYKNKKLNLGNGDNYDDEYYYFPSCDK
FKQKENVKQIKIDLKRFKDHINFRYLTKSSVYELNDVNELEEFEATVYAMQIVGIEENEQ
NQIFKILEGILYIGNILFNNDDNKEESCILESTYEDLNNAAYLLDIDVDTLKDALCYKTI
IANNEHFKKPVTSAMASDIRDALARAIYGCLFLKLVERTNESIGLIKDVNLFCGVLDIFG
FESFPVNSFEQLCINYTNECLQYFFNNFIFKCEEKLYIEEGIKWSSLDFPDNKDCVNILQ
SKPFGIFCMLDEESFIPGGKDKTFCNKIISKHANNKRFESIKTDPNSFIIVHFAGKVMYN
SCGFLEKNKDQLSDDAQNVLLQSQNEYIHNLFKKYLRRNFEKKRFVTVSSEFKQQLDVLM
TRINQTEPHFIRCIKPNSKNVPDIFDRHSVNEQLKYGGVLQAIKVSRAGYPVRLTHQNCI
NEYYILLTKEEKTAFSKHYGDKSLSEKANYILSKLENRDKIQDYIKSLKHIRQTQNQENI
FYGSVLKKQYSKNPNLIEKKNITQYENNLSNNVIDNDKFIWYVGKTLSFFKIEAYNILLT
MRQDFRSLNAVIIQKNYKCYIEKKKYKLLKKKIVTIQRWIRNILIILKKKKIIMINAQKL
ICSYIYAYALRKIFLYKRKCAIIIQSAFRGYLIRQSYKVYRKNYYASKIQAIWKSKKERI
RYLKLIESTKKIQLKWKGILARRQLRRLKDEAKEVGALLSKNQVLMNELKNEKSEKIEIE
NKLLKASANAQKLTKRIEVLEQINKNNEVLIKNLIEKVENLSLKQKEENTEKNISNEHKK
YISDNNEISRKQDSMSDQNLSKLLDKIKKLEIQNEEYIKKNTLLNERYNKMLNIFSYFKG
KHNLINEANEKNIPNNVKKDQLNMINSILYNEMYEQNFIKNQSHINQTPSVVKDKKEIFD
NNLTEFKEHQNLTKVGNKTRDNVIDILICGPKGVGKTSLVEDLFVRLGDENNLNILRKKN
KKKEIDGINHPNYNTYIVNHKLSQIKIVDCGYSDNTNSEEILFEYIKNSICIIIVFDSTN
KESIIPALHLLQEASLINVKKSTKLYLLENIFNEKINLNPNVNDVSYAQKVSKTCNATYI
RALDIYDILNDHVNRMTTSSTYFLNNFISEESISKDMFISSKHFNTYDNNIIEYSETANS
RWFQNENNYKQYIKNGNNLIFDKTDGYFQHFNKSDKFQEDKINLLHHQSSTHSVRNMQNT
KDMENKNLIYLKNESDIYRESYDKFSTKNVGKKKQVIQLLRESLPHNNYVYNSKKYNPEL
GKGLQPVYEIMIKGNIPITYLCIGQNSINKNYTILAVGCKDGIIYIYKCFRTKMEQSDSF
QTRGQGNGIVNNSSHEEEVIRNRKRGNLSNEEINNSELSTPEEEQDENNTIEYINETIKD
ESSFALSEDNSMSTVLLSKLSGHRKAITCLVFSFSEDKIISSSIDRTIKIWEVSTGFLLK
VFSDSSATLSVLLFPTNLDIFLCSNCTSLLRIVNLNSGQVYQKIKVESEIRALEMDYTCL
NIFAGSKNGTIYLLECLYNERVEIKFRFLFSLLPITCIKFVPRKYIHTPPTIIVNSCDNH
IGIIECMYGNKGIITNLSVKHRIRINHALLPIRSCYTKFGGGWLVSGSEDGNIYVCSLLP
QSNYKLILLKHHKAPVMSVVVNDIDTLMISGDSKGNIVFWRRSLI
NT seq
5898 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagcctacgagtaaatgtgttgttgggacaaaaatatttattaaacacaaagaaaag
gtatggataagcgcagaaattataaaagaagatacagatattgttgtaaaaactgatgat
gatgaaattgtgaatttaaaagaaggagatgagttttttcttcgcaatacagatatattc
aattctaatggtttgtctgcgcctccagatttaacaaaactgacacatctccatgaagca
tcagttttgcatagtttaaacattcgatttgatattgatgaaatatatacatttactggt
ccgatacttattgcaataaatccgtttaagaatattaaaaatttatattcagataatata
ttagaaaaacatattcagcctataaaatccaaaagcccgcatatttttgctacatctaat
agtgcatatttaggaatgtgcaaaaataataaatcacaaacaatattaataagtggtgaa
tcaggtgctggtaaaacagaatcaacaaaatatgtaatgaaatttttagcatgtgcaggt
tctgatataaaaaaaagatctctaatagaatcacagattttggaaagtaaccctttatta
gaagcatttggtaactccaaaacattaagaaataataactctagtcgttttggaaaatat
atagaactacattttgatatatgtaataatggatatataaaaggaaaactatatggtgca
aaaatattgacttatcttttggagaaagttagagtatgtgatcaacaagaaggtgaaaga
aattatcatattttttatcagctttgtagtgctgttcaatattataaaaataaaaagttg
aatttaggaaatggtgataattatgatgatgaatattattatttcccatcttgtgataaa
ttcaaacaaaaagaaaatgtgaaacaaataaaaatagatttgaaacgatttaaggatcat
ataaattttcgatatttaacaaaatcaagtgtttacgaattaaatgatgttaatgaattg
gaggaatttgaagcaactgtgtatgctatgcaaatagtaggaatagaagaaaatgaacaa
aatcagatttttaagattttagaaggtatattatatattggtaatatattatttaataat
gatgataacaaagaagaatcatgtattttagaatctacatatgaagatttaaataatgcg
gcttatttattagatatagatgtagatacattaaaagatgcattatgttataaaactata
atagctaataatgaacatttcaaaaaaccagttacctcagcaatggctagtgatatacgt
gatgctttagctcgagcaatttatggttgtttatttttaaaattagtagaacgaactaat
gaatcaataggattgataaaagatgtaaatttattttgtggtgttttagatatatttggt
tttgaatcttttccagtaaattcttttgagcaattatgtattaattatacaaatgaatgt
ttacaatatttttttaataattttatttttaaatgtgaagaaaagttatatatagaagaa
ggaataaaatggagctcattagattttccagataataaagattgtgtaaatatattacaa
agcaaaccctttggaatattttgtatgcttgatgaagaaagctttatacctggtggtaaa
gataagacattttgtaataagattatttcaaaacatgctaataataaaagatttgaatct
ataaaaacagatccaaatagttttattattgtgcattttgctggaaaagttatgtataat
tcatgtggattcttagaaaaaaataaagatcagctttctgatgatgcacaaaatgtttta
ttacaaagtcagaatgaatatatacataatttatttaaaaaatatttaagaagaaatttt
gaaaagaaaaggtttgtaacagtttctagtgaatttaaacaacagttagatgtattaatg
acacgaataaaccaaacagaaccgcattttattagatgcataaaaccgaattcgaaaaat
gtaccagatatatttgatagacattcagttaatgaacaattaaaatatggtggtgtatta
caagctatcaaagttagtagggctggatatccagttcgattaactcaccaaaattgtata
aatgaatattatattttattaacaaaggaggaaaaaacagcttttagtaaacattatggt
gataaatcgttgtctgaaaaagctaattatattttatctaaattagaaaatagagataaa
atacaagattatattaaatcacttaaacatattagacaaacacaaaatcaagaaaacata
ttttatggatctgtattaaaaaaacaatattctaaaaatccaaatttaatagaaaaaaaa
aatattacacaatatgaaaataatttatctaataatgtaattgacaatgataaatttata
tggtatgttggtaaaactttatctttttttaaaatagaagcatataatattttattaact
atgagacaagactttcgaagtttaaatgcagtaataatacaaaaaaattataaatgttac
attgaaaaaaaaaaatacaaattattaaaaaaaaaaattgttactatacaaagatggata
agaaatatattaattattttaaaaaaaaaaaaaataataatgataaatgcacaaaaatta
atatgttcatatatatatgcatatgcattaagaaaaatatttttatataaaagaaaatgt
gctattattattcagtcagcttttcgaggatatttaataagacaatcatataaagtatat
agaaaaaattattatgccagtaaaatacaagcaatatggaaatctaaaaaagaaaggatt
agatatttaaaattaatagaatcgacaaaaaaaattcaattaaaatggaaaggaatatta
gctagaagacaattaagaaggctgaaagatgaagcaaaagaagttggtgctttactttca
aaaaatcaggttttaatgaatgaattgaaaaatgaaaaatctgaaaaaattgaaattgaa
aataaattgttaaaagcttctgcaaatgctcagaaattaacaaaaagaatagaagtatta
gaacaaattaataaaaataatgaagttcttataaaaaatttgatagaaaaagtggaaaac
ctttcattaaaacagaaagaagaaaatacagaaaaaaatatatcgaatgaacataaaaaa
tatattagtgataataatgaaattagtagaaaacaagattctatgtcagatcagaattta
tccaaacttttagataaaataaaaaaattagagatacaaaatgaagaatatataaaaaaa
aatactttactaaatgaacgatacaataaaatgttgaatatattttcttattttaaagga
aaacataatttaattaatgaagcaaatgaaaaaaatatccccaataatgtaaaaaaagat
caattaaacatgataaatagtattctttataatgaaatgtacgaacaaaattttataaaa
aatcaatcccatattaatcaaactccatcagttgtaaaagataaaaaagaaatatttgat
aacaatctaacagagtttaaagaacatcaaaatttaacaaaagttggaaataaaacgcga
gataatgttatagacattctaatatgtggaccaaaaggagtaggaaagacaagtttggta
gaagacttatttgtaaggcttggggatgaaaataatttaaatattttgagaaaaaaaaat
aaaaaaaaagaaattgatggtattaatcatcctaactataatacatatatagttaatcat
aaattatctcaaataaaaatagtagattgtggatattcagataatacaaattcagaagaa
attctttttgaatatataaagaattcaatttgtattattattgtatttgattctacaaat
aaagaatcaataataccagctttacatctattacaagaagcatcacttattaatgtaaaa
aaaagtacaaaattgtatttattggaaaatatttttaatgaaaaaatcaatttaaatcca
aatgttaacgatgtttcgtatgcacaaaaagtttcaaaaacatgtaatgctacttatatt
cgagctttagatatttacgacatattaaatgatcatgtaaatagaatgacaacgagttct
acttattttttaaataattttatatctgaagaaagtatttcaaaagatatgtttattagt
tcaaagcattttaatacatatgataataatataattgaatattcagaaacagctaattct
cgttggtttcaaaatgaaaataattataaacaatatattaaaaatggaaataatctcata
tttgataaaacagatggatattttcaacattttaacaaatctgataaatttcaagaagat
aaaataaatttattacatcatcaaagtagcacacattcagttaggaacatgcaaaatact
aaagatatggaaaataaaaatttaatttatctaaaaaatgaaagtgatatttatcgagaa
agttatgataaattttctacaaaaaatgttggaaaaaaaaaacaagttattcaactttta
agagaatcattaccacataataattatgtttataatagtaaaaagtataatcctgaattg
ggaaaaggattacagcccgtttatgaaattatgataaaaggtaatatacctatcacatat
ttatgtataggccaaaattcaataaataaaaattatacaatattagcagtagggtgtaaa
gatggaatcatatatatatataaatgttttagaaccaaaatggaacaaagtgatagtttt
caaacacgtggtcaaggaaatggaatagtaaacaattccagtcatgaagaagaagttatt
agaaatcgaaaaagaggaaacttatcaaatgaagaaataaataatagtgagctaagcacc
cctgaagaagaacaagatgaaaataatacaattgaatatattaacgaaactataaaagat
gaatcatcatttgcattatctgaagataattcaatgtcaacagttttattatcaaaattg
tcaggacatagaaaagctataacatgtttagtattttctttttcggaagacaaaataata
tcatcctctattgatagaacaataaaaatatgggaagtaagtacaggatttttattaaaa
gtattttcagattcatctgcaaccttatctgtattattatttccaacaaacctggatata
tttttatgttcaaattgtacatctcttttacgaatagttaatttaaatagtggacaagtt
tatcaaaagattaaagttgaaagtgaaataagagcattagaaatggattatacttgttta
aatatatttgctgggtctaaaaatggaactatatatttattagaatgcttatataatgaa
cgagtagaaataaaattccgatttcttttttcattattaccaattacttgtattaagttt
gttccaagaaaatatattcacaccccaccaactattattgtcaattcttgtgataatcat
attggaataatcgaatgtatgtatggaaacaaaggaattataacaaacttatctgttaaa
catagaataagaataaatcatgctcttttaccaattagaagttgttatactaaatttggt
ggtggatggcttgtttcaggatcagaagatggtaacatttatgtttgttctttgcttcca
caatccaattataaactcatccttttgaagcatcacaaggcgccagtcatgtcagttgtg
gtgaacgacatagacacattaatgatctcaggagattcaaagggaaatatagttttttgg
agaagatcactgatataa
DBGET
integrated database retrieval system