KEGG   Plasmodium berghei: PBANKA_1356400
Entry
PBANKA_1356400    CDS       T01111                                 
Name
(RefSeq) DNA repair protein RAD5, putative
  KO
K15505  DNA repair protein RAD5 [EC:5.6.2.-]
Organism
pbe  Plasmodium berghei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pbe00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pbe03400]
    PBANKA_1356400
DNA repair and recombination proteins [BR:pbe03400]
 Eukaryotic type
  TLS (translesion DNA synthesis) factors
   Rad6 epistasis group
    PBANKA_1356400
SSDB
Motif
Pfam: SNF2-rel_dom Helicase_C zf-C3HC4_3 zf-C3HC4 zf-RING_2 zf-RING_5 zf-RING_UBOX Prok-RING_4 RING_XB3-XBAT31 ComJ zf-RING_10 zf-C3HC4_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 55151920
NCBI-ProteinID: XP_034423721
UniProt: A0A509ASZ4
LinkDB
Position
13:<2130499..>2135067
AA seq 1433 aa
MTTSNYFKCENNICNESNNVSKYNYGDDVIELVNLNSNGCKPYNAKETNSLTKPSRNKAN
YNKFKESDSDVEVIGDIRIYNDKIDEIELLNKDGELIRGKGVYFEYYLGCIETDSIILSS
EICDVKNDKDISISYEITPKSTKRSYSPMYNLKINDSYISSNDYIKIIGRNIQNKTQKGK
KNVPQKKQKKENNNDSSTVCYDILSRKSNNNFNEILSSDKKYVEMNKYKCEVLKDINEGH
PCIRLKHNNRDISKLKSHLSKTLSVLLVLNAIRIEIKLEKVSLCDFKFGGSLKTFVHVIL
YPDSFKIDVHKYHEYNSLIKYSVNNLFKELKIAPLRLAKNVSSDSFDDLNTKIVTGKNFT
KNIDNFSNKYESSSVTINTNNAFYLDFALKEGTQGSSTISQGKEYEEILDTASENEVEEK
NEDTTNLVFSEEKYRGGYLLEEFKEIYPNSVYFKPTLKTYQAEGIWWMYLKENPPEYLKE
NIFKGEKKNEIDLDQIIRSKSIYSEIHVYNDVYIDKEVHINSDVYIDKEVNVNKYMHNCE
IYLLDMKTENESSNPNIKIKDENDEEYGHMNEMKNKELVKTEDYNNDDDNDIRNKEPLNP
VWEEHAFIPNIKIYEEGKLIFVLKYFYINKITGCLSLTYPQYVPQFRGGILADEMGLGKT
IQSIGLIAHDIYQNKLHIKNNNIENKNNITYLIENTIKGFAYNKGGTLIIAPLGLIYQWK
QEIDKHTKEGFISSYIYYGSSKDINSDLLSKYSVVLTTYSTLVSEYKNTWNKILSSKPTI
EVKGNATNVGKSEYNIENKFSYTKWAKEKQEKDEKPETVDKFEEGSNNGQGKGNGIKKRK
LNNFFMKSSLNNGKNSILSSTGDKKTNKVLNSMKDYPLYKITWRRIIIDEAHVIKNKNSI
QSIAVWKLRGERKWCLTGTPIQNSLYDIFPLLRFLGIKPYGNVEWWNKEIVDYVNRNKLN
IALDIVRKISSPILLRRTKSSKTKEGCNIITLPKKNVHILKLKFSLEEEDFYRAIFYRSK
TKFDTYMHDGNVLSHYSHVLQLLLRLRQCCSHPLLLFSKPFFEEWNDEDIINGMYEENSR
ITESSIDSATDKSSIYVKLSNMKVDDTLKSDTVKNEVLKKDTLIYNFLQKSSNSNKLSSE
YVEEIEMLKNGTAMQCVICLEDSVYPLISKCLHIMCKKCADFYFNLTQIAEKKCPGCDNY
ISLKSLKTLQQNKSPLDDFLKKMKKDNFVYSTKLRILFDHIKEDIKNELHVVVFSQWIGF
LKIIEKLLTLHEIPNKIYDGSLTYEQRKSTLYWFNIQKGKIYQPGIGFCQSTCDIPIENE
SGKVLLCSLKAGGVGLNLTVSSKVYLMDLWWNPAIEDQAFERIHRIGQLKDVNIYKFVLE
KTVEERILQIHQSKQYTANQCLAQVGNKISTDVNLVTQKLGMDDFILMFKDWN
NT seq 4302 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgactacttcaaattattttaaatgtgaaaataatatttgtaatgaatcaaataacgtg
tcaaaatataactatggcgatgatgttatcgaacttgtgaatttaaacagcaatggatgt
aaaccatataatgcaaaagaaacaaatagtcttacaaaaccctcgagaaacaaagctaac
tacaacaaatttaaggaatcggatagtgacgttgaagtaattggtgatataagaatttac
aatgacaaaatagacgaaatagagttattaaataaggatggagaattaattagaggtaaa
ggtgtctattttgaatattatttaggttgtatagagacagattctattatattatctagt
gagatatgcgatgttaaaaatgataaagatataagtataagttatgaaataacacccaaa
tctactaaaagatcgtattctcctatgtataatttaaaaattaatgatagttatattagt
tcaaatgattatataaaaataataggtagaaatatacaaaataaaacgcaaaaaggtaaa
aaaaatgtgcctcaaaaaaagcaaaaaaaagaaaataataacgatagttctacagtatgc
tatgatatactatctcggaaaagtaataataattttaatgaaatattatcatcagataaa
aaatatgtagaaatgaataaatataaatgtgaagttttaaaagatattaatgaaggacat
ccatgtataagacttaaacataataatagagatatatcaaaattaaaaagccatttatca
aaaactctaagcgtacttttggtattaaatgctataagaatagaaataaaattagaaaaa
gtatcattatgtgattttaaatttggtgggagtttaaaaacttttgtgcatgttatttta
tatcctgattcatttaaaatagatgtacataaatatcatgaatataattctttaatcaaa
tatagtgtaaataatttatttaaagaattaaaaattgcaccattaagattggcaaaaaat
gtaagctccgattcttttgacgatttaaatactaaaatagttactggaaaaaactttaca
aaaaatattgataatttctccaataaatatgaaagctcatcagtaactatcaacactaac
aacgccttttatttagattttgcattaaaggaggggacacaaggttcttctaccatatct
caaggaaaggaatacgaagaaattttggatacagcaagcgaaaacgaagtagaagaaaaa
aacgaagacacaacgaatctggttttttccgaagaaaaatatagaggtgggtatttactc
gaggagtttaaagaaatatatccaaatagtgtttattttaagcccactctaaaaacatac
caagcagaaggaatatggtggatgtatttaaaggaaaatccacctgaatatctgaaggaa
aatatcttcaaaggggaaaagaaaaatgaaattgacttggaccaaattattagaagtaag
agtatatatagtgaaatacatgtatataatgacgtatatatagataaagaagtacatata
aatagcgatgtatatatagataaagaagtaaatgtaaataaatacatgcataattgtgaa
atttatttattggatatgaaaacagaaaatgaatcttctaatccgaatataaaaataaaa
gatgaaaatgacgaagaatatggtcacatgaacgaaatgaagaataaggagctagtaaag
actgaagattataacaatgacgatgataatgatattcgaaacaaggagccattaaatcct
gtgtgggaagaacatgcatttatacctaatataaaaatatatgaagaaggaaaattaata
tttgtattaaagtatttttatataaataaaataactggatgcttatctttgacatatcca
caatacgttcctcaatttcgaggtggaattttagcagatgagatgggtttaggtaaaaca
atacaaagtataggtttaatagcacatgatatttatcaaaataaattacatataaaaaat
aataatatagaaaataaaaataatattacatatttaattgaaaatacaataaagggattt
gcttacaacaaaggtgggacattaataattgcacctcttggtttgatttatcaatggaaa
caagaaatagacaagcatacaaaagaaggttttataagttcatatatatattatggaagt
tcaaaagatataaatagcgatttattgtcaaaatattcagtggtccttactacatattca
actttagtttctgaatataaaaatacatggaataaaatactttctagcaaacccactatt
gaggtgaagggaaatgcaactaatgtgggcaagagtgaatacaacatagaaaacaaattc
tcttatacaaaatgggcgaaagaaaaacaagaaaaggatgagaaaccagaaaccgttgat
aaatttgaagaagggtcaaacaatgggcaaggaaaaggtaatggaattaaaaagaggaaa
ttaaacaacttttttatgaaatcatcattaaataatggaaaaaattcaatattatcttca
actggggataaaaaaacaaataaagtattaaatagtatgaaagactatccactatataaa
ataacatggagaagaataataattgacgaagctcatgttataaaaaataaaaattcaatt
caatcaattgctgtttggaaattaagaggagaaaggaaatggtgtttaacaggaacacct
atacaaaattctctatacgatatatttcccttattgagatttttaggaataaaaccatat
ggtaatgttgaatggtggaataaagaaattgttgattatgtaaatcgaaataaattaaat
atagcattagatatagttagaaaaatatcttctcccattttattaagaagaacaaaaagt
tccaaaacaaaagaaggatgtaatattattactttacctaaaaaaaatgtacacatatta
aaattaaagttttctttagaagaagaagatttttatcgagccatattttatagaagcaaa
acaaaatttgatacatatatgcatgatggtaatgtattaagtcattactctcacgtttta
caactccttctaaggttacgacaatgttgttcccatcctctgttgctattttcaaaacca
ttttttgaagagtggaatgatgaagatattataaatggaatgtatgaagaaaactctaga
ataacagaatcttccattgattcagcaactgacaaatcgagtatctatgtaaaattatca
aacatgaaagtagacgatacattgaaaagtgatacagtaaaaaatgaagtattgaaaaag
gatactttgatatacaactttttgcaaaaatcgtcgaattcgaataaattgagcagtgag
tatgtagaagaaatagaaatgctaaaaaatggtacagctatgcaatgtgttatttgttta
gaagattcggtatatccattaatcagtaaatgtttacatataatgtgtaaaaagtgtgca
gatttttattttaatttaacacaaatagcagaaaaaaaatgccccggatgtgataattat
ataagtttaaaatcgttaaaaactttacaacaaaataaatcacctttagatgatttttta
aaaaaaatgaaaaaggataattttgtatattctactaaattaagaatattatttgatcat
ataaaagaagatataaaaaatgagcttcatgtagttgtattctcacaatggatagggttt
cttaaaataattgaaaaattattaacacttcatgaaataccaaataaaatatatgatgga
tcattaacatatgaacaaaggaaaagcacactttattggtttaacattcaaaaaggaaaa
atatatcaaccaggaattggattttgccaatcaacttgtgatattcctatcgaaaatgaa
tcaggaaaggttttattgtgttcattaaaggctggaggagtaggattaaacttgacagtt
tcatcaaaagtataccttatggatttgtggtggaacccagccattgaggatcaagcattt
gaaagaatacatcgaataggacaattgaaggatgtaaatatatacaaatttgttttggaa
aaaacagtagaagaacgaattttgcaaatacatcaaagcaaacaatatacagctaatcaa
tgtttagcgcaagttggaaataaaataagtacagatgttaatttagttacacaaaaacta
ggaatggacgattttatacttatgttcaaggattggaactga

DBGET integrated database retrieval system