KEGG   Pseudoalteromonas sp. Bsw20308: D172_005145
Entry
D172_005145       CDS       T04175                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pbw  Pseudoalteromonas sp. Bsw20308
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pbw00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pbw02000]
    D172_005145
Transporters [BR:pbw02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   D172_005145
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug Reprolysin_5 PAS_7
Other DBs
NCBI-ProteinID: ALQ07511
LinkDB
Position
1199057..1201204
AA seq 715 aa
MVYKSKTQKTYLLSPVALFISGVLSPFAFADDTPLEVIEVHGHAQNKHLALGSSESLLSD
LGVDFSAAGGVSNLPILNGLMGDRVKVLIDGADVTAACANHMNPPLSYISANQITSYNVV
AGVSPVSAGGDNIAGVISVNSISPQYSDSNELDWHSGYVSAKYSSVDNGRKLGVGARLAS
DTFSLNYQGSFSDADSYEDGNDDVVLDTLYRAQNHSLTAAMRDDKQQLVIKLTHQKIPYQ
GFANQYMDMTDNTSYGAIAQYKRSFENSELEGQVNWHSVKHEMGFFSEEKTGMMPMKTDA
QDISTQLKWRIALNKNSSILLAQEYYNYSIDDWWPGIEGSTMMGPDDYVNINNGKRERIA
AFAEFESQINTKLWLNVGVRIESINTHVGEVQSYNDGMSMMGIGSMETMTMSDTSTDNSI
AAQNFNAANRDKTDTIVDANLLINYQITNYDELQFGLARKNRAPNLYERYSWGVSNMATT
MIGWYGDGNGYIGNPDLDVETAHTISATYIKQAKDDGWRLSTNVWYTDVNDYIDADIVRS
FNSYDLDNTARNILQFTNVDAILYGAKIDLTANIYESKDLGNWQLHANVTNTRGKRDDTN
QPLYQIKPLQTQLGISQQINRFENALSWQWVDAKSRVDNNRFENQTDSYSLINLSSKATW
DSLTLSAEVSNVFDEYYQLPLGGVSIAALKQDSGNGFEQLAGQGRSFNVSVSYAF
NT seq 2148 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtttataaaagcaaaactcaaaaaacttacttactttcccctgtcgcactttttatt
agcggtgtgctatctccttttgcatttgccgacgatacacctttagaagtaattgaagta
cacggacatgctcaaaataagcatttagcacttggttcgtcagaatcgttattaagtgat
ttaggtgtcgacttttcagctgcgggcggcgtatctaacctccctattttaaatggttta
atgggcgacagagttaaagtgttaattgatggcgcagatgttaccgctgcatgcgctaat
cacatgaacccgccactgtcgtatatctcggctaatcaaattacgtcttacaatgtggtt
gcaggcgtgtcgccagtgagcgcgggcggcgataatattgcaggcgtaataagcgttaat
tctatttcaccacagtatagcgatagcaatgaattagattggcactcaggttatgtgtca
gcaaagtacagtagcgttgataacggacgtaaacttggcgttggtgcacgtttagcaagt
gacacgtttagccttaattatcagggttcgtttagtgatgcagatagttatgaagacggt
aacgacgatgtagtgcttgatacattgtatcgagcgcaaaatcatagtttaaccgcagct
atgcgcgatgataaacagcaattagttataaagctaacgcatcaaaaaatcccgtatcag
ggatttgcaaatcagtatatggatatgaccgataacaccagttacggtgcaatagctcaa
tacaaacgctcctttgaaaacagcgagcttgaagggcaagttaattggcacagtgtaaag
cacgaaatgggttttttcagtgaagaaaaaacaggcatgatgccaatgaaaaccgatgca
caagatataagtacgcagcttaaatggcgtatcgcgcttaataaaaacagcagtatttta
ctcgctcaagaatattacaattacagcattgatgattggtggccaggtattgaaggctca
accatgatgggaccagacgattacgtaaatataaataacggtaaacgagagcgcatagcg
gcatttgctgaatttgagagtcaaataaatacaaagttatggttaaacgtaggcgtgcgt
attgaaagtattaatacccacgttggggaggttcaatcttacaacgatggtatgagcatg
atgggtataggcagtatggaaactatgaccatgagcgatacgtctacagataatagcatt
gctgcacagaactttaatgctgccaacagagataaaactgacaccatagttgatgctaat
ttattaattaactaccaaataacaaattatgatgagctgcaatttggccttgcccgtaaa
aaccgcgcgcctaatttatacgagcgatacagctggggcgtaagcaatatggcaaccacc
atgattggttggtatggcgatggtaatggctatattggtaaccctgatttagacgttgaa
acagcgcatacaataagtgctacttatattaagcaggctaaagatgatggttggcgttta
agcaccaatgtttggtatacagatgtgaatgattatattgatgctgatattgtaagaagc
ttcaatagttatgatttagataatacagcgcgtaacattttgcagtttactaatgtagat
gccattttatatggtgcaaaaatagatttaacagccaacatttatgaatctaaggattta
ggtaactggcagttgcacgctaatgttactaatacgagaggtaagcgcgacgatactaac
cagccgctttatcaaattaaaccactgcaaacccagctaggtattagccagcaaattaat
cgatttgaaaatgcgttatcttggcagtgggtagatgcaaaaagccgtgtagataataat
cgttttgaaaaccaaacagacagctacagcctgattaatttaagctctaaagccacatgg
gattcattaactctaagcgcagaagtgagtaacgtgtttgatgaatattaccagctcccc
cttggcggtgtaagtattgcagcgcttaaacaagatagcggcaacgggtttgagcaatta
gcagggcaaggtcgttcatttaatgtaagcgttagttacgcgttttaa

DBGET integrated database retrieval system