Pseudoalteromonas sp. Bsw20308: D172_006525 Help Entry D172_006525       CDS       T04175                                  Name (GenBank) DNA helicase IV   KO K03658   DNA helicase IV [EC:5.6.2.4] Organism pbw  Pseudoalteromonas sp. Bsw20308 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:pbw00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pbw03400]     D172_006525 Enzymes [BR:pbw01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase      D172_006525 DNA repair and recombination proteins [BR:pbw03400]  Prokaryotic type   Other factors with a suspected DNA repair function    DNA helicases     D172_006525 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  UvrD-helicase AAA_19 UvrD_C Zn_ribbon_Top1 UvrD_C_2 AAA_30 AAA_12 ResIII AAA_22 Sep15_SelM PhoH DEAD Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ALQ07746 LinkDB All DBs Position 1510112..1512979 Genome browser AA seq 955 aa AA seqDB search MVQYVATPSWLGRFFTRIKWVSIEQDVLVVHFRDMTKQQFLLSDFSNFSVLQNSLFSAKI YLCDPNNTCVSFLKKAEADVLNKALNKYFLNTLEQKVNNAKTLLKRYALDEFLRDSSIEI LNKAVFSLSKNYAHNQTVWQQHLSPISVKFLSILSSTPKTADAVAQLRHKYEQKQLTLRD NFYNNVESNPLTTEQRLAVIRDNDKNLVLAAAGTGKTSVMVAKSLDLIARGIALPEQVLV LAYNKTAAQELKERFIKRAAHANLSIKPPAILTFHALGLKLLQDAKKSTKLSTFATDEIQ QKTWLTAWLYKQMQTDSTFLKNVVDLLHEPVDIFSFKSSAEYERYLRDNEYRSLAGLKVK SYQELLISNWLYLQSVEHEYEPHYKNKLEISAEDITLNAQYNPNFHLSKYNIYLEHFDID REGNTRGDINKKRYNEQIAFKRKLHKNNNTILLETFHYNWFEGKLEQRLSKLLKQHSVAL VPLNDDEVFSTLNNSGLLQQGVEKYLKCLQAIRAEQLTNTQIKQRIKQSGLKNHQRYAAM LIAIHNAYMQELHTQNAIDFDDMIIHATKAVKKGEFSVPWSHILVDEFQDISGARMAFLN TLINKGKSVRFTAVGDDWQAIYRFSGGNLAFTTRFNELVGGHSLTMLQKTFRYNNSISDV AGRFVMQNPEQYKKLISTHTQVTTPHVILLDDLYQGTKSIEIKVQQSISTIQKNDASASI AILSRYRYMLNSVQQHLKDKKHTNSLYFWTLHSAKGLEADYCIIIGFEQGKLGFPSDNQN SVLVESLLPEQDEFTHSEERRLLYVGITRAKHKAYLIADPYACSAFVKELVNDDYPIQIA STLFNKSQLKQRECNTCSDGLIVPKTGQYGNYYSCTNTQICETKLRVCKSCSSPSVDKST YSQCVNIECKTQHPICEKCGREMRKRKSKHGEFLGCSGFELKEDSCKNTRKLTVT NT seq 2868 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggtgcagtatgttgccacaccaagttggttaggtcgtttttttacccgtattaagtgg gtaagtattgagcaagacgtgcttgttgtccactttagagatatgactaaacagcaattt ttattaagtgatttcagtaacttttctgtgctgcaaaatagcttgtttagcgcaaaaatt tatttatgtgatcctaataacacatgcgttagttttttaaaaaaagccgaagcagatgtg cttaataaagcgttaaataaatattttttaaatacgttagaacaaaaagtgaacaatgcg aaaacacttttaaagcgttatgcccttgatgaatttttacgcgacagttccattgaaatc ttaaataaagctgttttttctttaagtaaaaattacgcacataatcaaaccgtgtggcaa cagcatttatcgcctattagcgtaaaatttttaagtattttaagtagtacaccaaaaaca gcagacgctgtagcgcaattacgccataaatatgaacaaaagcagcttaccctaagagat aacttttataataatgttgagtctaacccgctcactacagagcagcgtttagcggttata cgcgataacgataaaaatctagtacttgcagcagccggcacaggaaaaacctcagttatg gttgccaaatcgcttgatttaatcgcacgtggaatagcactgccagagcaggtattggta cttgcttacaataaaacggctgcacaggaattaaaagagcgctttattaaacgtgcagca cacgccaatttaagtattaaaccacctgccattttaacgtttcatgcactaggattaaag ctattacaagacgcgaaaaaatcaacgaagctttctacatttgcaaccgatgaaatacag caaaaaacatggttaaccgcatggctttataagcaaatgcagaccgactctacatttttg aaaaacgttgttgatttacttcacgaaccagtcgatatttttagttttaaaagcagtgct gagtatgagcgctacctcagagataacgaatatagaagccttgcagggcttaaagttaaa agttatcaagagctacttatttcaaactggttatatttacaatcagttgagcatgagtac gagcctcactacaaaaataagctagagatttcagcagaagacataaccctaaacgcacaa tataatcccaattttcacttatcaaaatacaatatttatctagagcactttgacattgat agagagggtaatacacgcggcgatataaataaaaaacgctataacgagcaaatagctttt aagcgaaaactgcataaaaataataacactattttacttgagacttttcactacaattgg ttcgaaggcaagttagagcagcgcttaagtaaacttttaaagcaacatagtgtggcgctt gtacctttaaatgacgatgaagtatttagcacgttaaataactcagggctgttacaacaa ggggttgaaaaatacttaaagtgcttgcaagccataagagctgagcagctcactaatacg caaataaaacaacgtataaaacaaagtggactcaaaaaccatcaacgttatgccgcaatg cttatagctatacataatgcttatatgcaagagctacatacgcaaaacgccattgatttt gacgatatgattattcatgcaacaaaggctgtaaaaaaaggtgaatttagtgtgccttgg agccatattttagttgatgagtttcaagatatatcaggtgcgcgtatggcctttttaaac acacttattaacaagggcaaaagtgtacgttttactgccgtaggtgatgattggcaggca atttatcgtttttcgggtggtaatttagcgtttacaacgcgttttaatgagctggtgggt ggccactcacttactatgttgcaaaaaacatttagatataacaacagtattagcgatgta gcagggcgttttgtaatgcaaaaccctgagcaatataaaaagctgatcagcacacatacg caagtaaccacaccacacgttattttattagacgatttataccaaggtactaaatcgata gaaataaaagtacagcagagcataagcacgattcaaaaaaacgatgcatcagcgagtatt gccatacttagtcgatatcgatacatgttaaatagcgtacagcagcatttaaaagataaa aagcatacaaactctctttatttttggacattacatagtgctaaagggcttgaagccgat tactgtattattattggttttgaacaaggtaaattaggctttcctagcgataatcaaaat agcgtgctggtggagtcgttattaccagagcaagatgaattcactcactcagaggaaagg cgtttgctttatgtaggcattacacgtgctaaacataaagcgtacttaattgcagaccct tatgcatgctcagcgtttgtaaaagaactagtaaatgacgattatcctattcagatcgct tcaacgttgtttaacaagtcgcaactaaagcaaagagagtgtaatacatgcagcgacgga ttaattgtgccaaaaacgggtcagtatggtaattattatagctgtactaacacgcaaatt tgcgaaactaaactacgagtgtgtaaaagttgtagtagcccatcggttgataaaagcacg tattcacaatgtgtaaatatagaatgtaaaacacagcatccaatttgtgaaaaatgtggg cgtgaaatgcggaaacgcaaatctaagcatggtgaatttttaggatgcagtggctttgag ctcaaagaagacagctgtaaaaacactcgaaagctaactgttacatga

DBGET integrated database retrieval system