Pseudoalteromonas sp. Bsw20308: D172_006955 Help Entry D172_006955       CDS       T04175                                  Name (GenBank) ligand-gated channel protein   KO K02014   iron complex outermembrane recepter protein Organism pbw  Pseudoalteromonas sp. Bsw20308 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:pbw00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:pbw02000]     D172_006955 Transporters [BR:pbw02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    D172_006955 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TonB_dep_Rec_b-barrel Plug MVD-like_N Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ALQ07813 LinkDB All DBs Position 1613319..1616354 Genome browser AA seq 1011 aa AA seqDB search MQIKLMLDKVAPIKISRKKKIKKKKQNHRGFLFVSCLYKMRSNHTYLLGGLSVLVPAIFS ISVQAATQTTGQMVQFDIKAQRADKALIEFAKQTEQTVVFSYELAKQYDANSVYGFYTQL DALQALLGGTELDAVVDQNGLLSIKLKQINRNDNNMMKLSAVSAAILPALLAANSQGVNA AEEVAQEKIEKIAIVGSRVAGRSVEDLPVPVDILSAEALENTGQTEVGRMLQSIAPSFNF SSSSISDGTDALRPATLRGLGPDQTLVLINGKRRHQASIIHINTSVGRGTAGTDMNAIPA SAIKRIEVLRDGAAAQYGSDAIAGVINIVLKDGSEGGKAAINYGQYSEGDGETVNVDFNK GFALGDDGYLNATINYRDRSPTNRAGLHGSCQFYGCTELSDGTLLAGDPREVTADRDTFR IGDADSQQFGLTINTGYELGDGELYGFITYSTRDNESAAFFRHNANAGGNPVLQDNDATI PLGFLPKINTTIDDISYNFGYKTQFDNDASLDLSYTYGENSIDYTTSDTINASYANFLRY DQGLSAADIRTTIPREAYAYGMELSLQTINLDFTQNFDDYSLAMGAEIRTDEYRILEGNE YAYRDYDTNNGVSIYDGLSGGVGSEDASGGTQGFGGSSPASSVDESRDVISFYMDAEAYF IEDVIISGALRYDNYKGFGDTVNFKLAGNWSVTDDISLRGALSSGFRAPSMQQLYFNNIS TQFVTGPNGTLVAEEVGTFRNDSTLAQSLGIPKLKEEKSENRSLGIVYNVTDNINLTVDY YSIDIDDRIVISNRLGKGLSSSLDAALVSSGAGAGQFFLNGADTETRGIDFVATWNTEGL GGTLDFTLAANFTETDVVSLFTPSGSGLETVPVEDVFSEQEISIIEEWQPEDRINLSALY QRDDWTVNLSLNRFGEYTVEDGDSQTYSAEILTDVKVNYFVTEDLSVNIGANNLFDVYPD KNKIGNSRSGTIVDANGNTVVSSSGVFEYSRRSAPFGFNGAYYYIGAEYRF NT seq 3036 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgcaaatcaagctaatgttagataaagttgcacctataaagatatcacgtaaaaaaaag attaaaaaaaagaaacaaaaccatagaggatttttgtttgtcagctgtttatataagatg cgcagtaaccatacgtatttattgggtggtttaagtgtgcttgtccccgctatttttagc atcagtgtacaagccgcgacgcaaaccactgggcaaatggtgcaatttgatataaaagcg cagcgagcagacaaagccttaattgaatttgctaagcaaacagagcaaaccgtggtgttt tcttatgagttagctaagcagtatgatgcaaattcggtatatggattttatacccaactt gatgctttacaggcattactaggtggaactgagctcgatgcggttgttgatcaaaatgga ttactgagtataaaactcaaacaaatcaacaggaatgataacaacatgatgaagctttca gcggtcagtgcagctatattaccagcgttacttgcggcaaattcgcaaggtgtgaatgca gcagaagaagttgctcaagaaaaaattgaaaaaattgctattgtcggtagccgtgtagcg ggacgttcagttgaagatttacccgttccagtagatattctaagtgcagaagcgcttgaa aatacgggccaaacagaagttggccgtatgttacagtctattgccccttcatttaacttt tcaagctcgtcgattagtgatggtaccgatgcattaagacctgccacactgcgtggttta ggtccagatcaaacgttagtgttgatcaatggtaaacgtcgccaccaagcaagtattatt catattaatacatcagtaggacgtggtactgcgggtactgacatgaatgcaatacctgcg tcagctattaaacgtattgaagttctgcgtgatggcgctgcggctcagtatggttctgat gcaattgccggtgtaattaatattgtacttaaagatggtagtgaaggcggtaaagcggct atcaattatggtcaatattcagaaggtgatggcgaaacagttaacgtcgattttaacaaa ggttttgcactaggcgatgacggttatttaaatgcaacaattaactatcgcgaccgttca cctactaaccgtgctggtttacatggttcatgccaattttacggttgtacagaattaagt gacggtactttactggctggcgatccacgagaagtgaccgcagacagagatacatttaga attggtgatgccgactctcaacagtttggtttaacaattaatacaggttatgagttaggc gatggcgagctttatggctttattacttattcaacgcgtgataacgaatcagctgcattt ttccgtcacaatgcaaatgcgggtggcaacccagtactacaagataatgatgcgacgatt ccgctaggttttttaccaaaaatcaacacaacgatcgatgatatttcatataactttggt tataagacacaatttgataacgatgctagcttagacttatcctacacttacggcgaaaac agcattgattacacgacaagtgacacaattaatgcttcatacgctaattttttacgttac gaccaaggcttaagtgcagctgatatccgtacaactattccacgtgaagcatacgcttat ggcatggagctctcactacaaacaatcaatcttgatttcacacaaaactttgatgattat tctttagcaatgggtgctgagattcgtactgacgaataccgtatcctagaaggtaatgaa tatgcataccgagattatgatacaaacaatggcgtaagtatttacgatgggttaagtggt ggtgtaggcagtgaagatgcatctggtggcacacaaggttttggtggttcatctccagca tcgtcggttgacgagtcacgcgatgttatttcattttatatggatgcagaagcttacttt attgaagatgttattatatctggcgcacttcgctacgataactacaaaggttttggtgat actgttaactttaaactagcgggtaactggtcggttacagatgatatttcattacgtggt gcattaagttcaggctttagagcgccatctatgcaacaactatactttaacaatattagt acgcagttcgtgacaggccctaatggtacattagttgctgaggaagtagggacatttaga aatgactcaacacttgcacaaagtttaggtattccaaaactcaaagaagagaaatctgaa aaccgtagtttaggtatcgtttacaacgtgacagataacatcaacttaacagttgattac tactcaattgatattgacgaccgtattgttattagtaaccgtttgggtaaagggctttct tcaagcttagatgcggccttagttagctcaggtgcaggcgctggtcagtttttcttaaat ggtgcagatacagaaactcgtggtatcgattttgttgcaacatggaatacagaaggctta ggcggtacgcttgattttacacttgcggctaactttactgaaactgatgttgtatcgtta tttacgccatcaggttctggtttagaaactgtgccggttgaagatgtattctcggaacaa gagatttcaatcatcgaagagtggcaaccagaggatcgcattaatttaagcgcgctttat caacgtgatgactggacggttaatttatcactgaatcgttttggtgaatacaccgtagag gatggtgatagccaaacttattcggcagaaatcttaacggatgttaaagttaattacttc gtaacagaagatttatctgtgaatattggtgctaataacctgtttgacgtttacccagac aaaaacaaaattggtaactcacgttcaggcacaatcgttgatgctaacggtaacactgta gtaagcagctccggtgtatttgaatactctcgccgttcagctccatttggttttaatggt gcttattactacataggcgcagaatatcgtttttaa

DBGET integrated database retrieval system