Pseudoalteromonas sp. Bsw20308: D172_012900
Help
Entry
D172_012900 CDS
T04175
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pbw
Pseudoalteromonas sp. Bsw20308
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_19
TPR_14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ08861
LinkDB
All DBs
Position
complement(2932075..2937741)
Genome browser
AA seq
1888 aa
AA seq
DB search
MRGLATLIILASALIVTSVYSQDSTQLKGPKGADYGAQGRSIGPIKPTDTLWRIAAKVRP
DNSVSIYQVMQALYNKNPNSFLEQNLNHMQSGAYLKIPTLAEIRNVNTQLAKQRSEQDDA
LWEKKKNGTLTQSEINSAQTQVTQARKVDVDDAKKELQKEIKEIKTDQTSKLVELQQQFK
SSVDNVEEILVENNNLKKQLTGISKELENVRMQLGQDSEIQQQLKELIIKQNEMIEQQKA
EKIEPEAEFDLGSFLSNPFVLGLLMVIPGLLIVFAVVMFLRKRASKDDVQSDDDFLPQTP
TYANDDDLDTQNIEDPIVPEPLDDLSIQLDDSLENDILPDDDTPLPDDDIAFDDSLEDFT
ESDSLLDQDELESLLSDDIVFDDENIEDDELDIFMQQDFDKSPDDSPEGDIDLDSPLESS
NSDDILSNDDLDSLFNEDDGLSEFDSPQTNDIEEDNSLESNDEMAALSEELAEDDDFDID
DLLDQTNTESDLDNTEDSLSSEKDDFDLDDIDSLIDQATDDSVDEVLVEESDDFDLDDID
SLIDDAADDIAPDALVEEKDDFDLDDIDSLIDQATDDSVDEALIEESDDFDLDDIDSLID
DAADESAADALVEEKDDFDLDDIDSLIDDAADESAPDALVEEKDDFDLDDIDSLIDDAAD
DSAADALVEENDDFDLDDIDSLIDDAGDDSAADALVEEKDDFDLDGIDSLIDESADESAD
EEAETEKRDSDINVALADSADDLAEAQEELNVADVESLASTLIEEPELVEEPELEEEPEL
AEEPELEQEPELKEEPELEEEPELAEEPELEQEPELEQEPELEEEPELAEEPELVEEPEL
AGEPELVEEPELEEEPALLEEPELEEEPALLEEPELVEEPELVEEPELVEEPELEQEPEL
AEEPELEEEPELEEEPELEEEPALLEEPALLEEPELEEEPALLEEPELEDEPELAEEPEL
AADLDDFSDTSETLLDPEDALEEYNDDELKSVDELLNELQQVEDDYIETPEWSLEDLDND
IEEVEIDLGDDPLADDASTNRLPEHSDTNMVVSDENSDEYTELDIDEPYSGATDEQDVES
TQDIDLKSETKQVIASQTEQDLASALAQGSDLDSLEDDLDDELLLDNDFTELDKDLAIDA
ELQNSQIDENLNEFDNDELPISLDDDITVNESEIPELEKTQPLEPDDELLLDNDFTELDT
DSDELPINLDDAITVNESETPELEETQPLEPDDELLLDNDSAQLDTDLAIDAEPQNNSSA
EIDETLNVEDSDELPINLDDAITVNESETPELEETQPTEPDDELLLDNDSAQLDTDLAID
AEPQNNSNAEIDEALNVEGNDELPINSDAGISVNESETPELEETQPLEPDDELLLDNDSA
QLDTDLAIDAEPQNNSSAEIDEALNVEDNDELSVNSDADISVNESETPELEETQPTEPDD
ELLLDNDSAQLDTDLAIDAEPQNNSSAEIDETLNVEDDADSDELSVNLDDEPTHSLPSQT
EQDLMNALSAENDLNSLDDDFNDELLLDNDFAELNTDNDELPISLDDDITVNESEIPELE
KTQPTEPDDELLLDNNSAQLDTDLAIDAEPQNNSSAEIDETLNVEDDADSDELSVNLDVE
PTHSLPSQTEQDLMNALSAGNDLNNLDDDFDDELLLDNDFTELDAELESTAGSETMISEN
PDEALSNELAGEQTNADREAEITRTELFNGSDIASDDELDDEFMAELTETDFDSLLNELA
EPEELSVEDSSEFDVDFDSLLKEDLGVDEALVVEEPLVQSNNVEQLDNDEFVDIDSLLEE
SDDAEIEHEPYNDVNMDVGLSEFDALLAGDNPTDVDAESGGYSAKLDLARAYIEIDDFDS
ALKVIEDVINKGPEEVQEEALSLKAKLK
NT seq
5667 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcggtttagctacacttattatattagcgtctgcattgatagtaacatcagtttac
tctcaagacagtacccagttaaaggggccaaagggcgctgactatggtgcgcaagggcga
tctattgggccaataaaaccgacggatacgctttggcgtatagcggctaaggtacgcccg
gacaactcggttagcatttatcaagttatgcaggctttgtataacaaaaatcctaattca
tttttagagcaaaaccttaaccacatgcaaagtggtgcctatttaaaaattcctactcta
gctgaaattagaaatgttaatacacaactcgctaaacaacgttctgaacaagatgatgcg
ttatgggaaaagaaaaaaaacggtacgcttacgcaaagtgaaattaattcagctcaaact
caagttactcaagctcgtaaagttgatgtagatgacgcaaaaaaagaattacaaaaagaa
attaaagaaattaaaacagatcaaactagtaagttagttgagcttcaacaacaattcaaa
agttcagttgataacgtagaagaaattttagttgaaaataataatttaaaaaaacagctt
acgggcatctccaaagagcttgaaaatgtgcgtatgcagctcggtcaagacagtgaaata
cagcaacagttaaaagaactaataattaaacaaaatgaaatgatagaacagcaaaaggct
gagaaaatagagccagaagctgaatttgatctgggatcttttttatctaatccttttgtt
cttggattattgatggttattcctgggttattgattgtttttgctgttgtgatgttctta
cgcaagcgggctagtaaagatgatgtccaaagcgacgatgattttttaccacaaacacct
acctacgcaaacgatgacgatttagatactcaaaatattgaagaccctatcgtcccggaa
ccacttgatgacttaagtattcagctagatgatagtttagaaaatgatatcttaccggac
gatgataccccattaccggatgatgatattgcttttgatgacagcctagaggactttact
gagtctgatagcctacttgatcaggatgaattagaaagtttattaagcgatgatattgtt
tttgacgatgaaaatattgaagacgatgaacttgatattttcatgcaacaagatttcgat
aaatcacctgatgatagcccagaaggtgatattgatttagattcgccactagaatcatca
aatagtgatgatattttaagtaatgatgatttagatagtttatttaatgaagatgatggc
ttatcggagtttgactcaccacaaacaaacgatatagaagaagataatagcttagaatcg
aatgatgaaatggccgcccttagcgaagaactcgctgaagatgatgattttgatattgat
gacttattagatcaaacaaatactgaatcagatttagataatacagaagatagtctttca
agtgaaaaagatgattttgatttagacgatattgatagcttaattgatcaagctacagac
gatagcgttgatgaagtcttagtcgaagaaagtgatgattttgatttagatgatattgat
agtttaattgatgacgctgcggatgacattgcacctgatgcgttagtcgaagaaaaagat
gattttgatttagacgacattgatagcttaattgaccaggctacagacgatagcgttgat
gaagccttaatcgaagaaagtgacgacttcgatttagacgatattgatagtttaattgat
gacgctgcggatgaaagtgctgctgatgcgttagtcgaagaaaaagatgattttgattta
gacgatattgatagtttaattgatgacgctgcggatgaaagtgcgcctgatgcgttagtc
gaagaaaaagatgattttgatttagacgatattgatagtttaattgatgacgctgcggat
gacagtgctgctgatgcgttagtcgaagaaaatgatgattttgatttagatgatattgat
agtttaattgatgacgctggggatgacagtgcagctgatgcgttagtcgaagaaaaagat
gattttgatttagatggtattgatagtttaattgatgaatccgcagatgaatccgcagat
gaagaagctgagactgaaaagcgtgactctgatattaatgtggcattagccgattctgcc
gatgatttagccgaagcgcaggaagaattaaatgttgctgatgtagagtctctagcatct
acattaattgaagagcctgaacttgtagaagagcctgaacttgaagaagagcctgagctt
gcagaagagcctgaacttgaacaagagcctgaacttaaagaagagcctgaacttgaagaa
gagcctgaacttgcagaagagcctgaacttgaacaagagcctgaacttgaacaagagcct
gaacttgaagaagagcctgagcttgcagaagagcctgaacttgtagaagagcctgaactt
gcaggagagcctgaacttgtagaagaacctgaacttgaagaagagccggcgcttttagaa
gaacctgaacttgaagaagagccggcgcttttagaagaacctgaacttgtagaagagcct
gaacttgtagaagaacctgaacttgtagaagaacctgaacttgaacaagagcctgaactt
gcagaagagcctgaacttgaagaagagcctgaacttgaagaagagcctgaacttgaagaa
gagccagcgcttttagaagagccagcgcttttagaagagcctgaacttgaagaagagcct
gcgcttttagaagaacctgaacttgaagatgagcctgaacttgcagaagagcctgaactt
gcggcagacctagatgatttttcagatacttcagagaccttacttgatccagaagatgca
ctagaagaatacaatgatgacgaactaaaaagtgttgatgaactcttaaatgagttacag
caagtagaagatgattatattgaaacgccagagtggtctttagaagatttagataatgat
attgaagaagttgaaattgatttaggtgatgatccattagcagatgatgcaagcacaaat
cgattacctgaacattcagataccaatatggtagtgagtgatgaaaattcagacgaatat
actgaattagatatagacgaaccttactcaggtgctactgatgaacaagatgttgagtct
acacaagatattgatttaaaatctgagactaaacaagttatagcaagtcaaactgaacaa
gatttagcgagtgcacttgcgcaaggaagcgatttagatagcctcgaggatgatttagac
gatgagctgttactcgataatgactttactgaacttgataaagatctagcaattgatgct
gaactacaaaacagtcaaatagatgaaaatcttaacgaattcgataacgatgaattaccg
ataagcttagatgatgatattacggttaatgaatctgaaattccagagcttgaaaaaact
caacctttagagcctgacgacgaattgttacttgataatgattttactgagcttgataca
gatagcgatgaattaccgataaatttagatgatgctattacggttaatgaatctgaaact
cccgagcttgaagaaactcaacctttagagcctgacgacgaattattactcgataatgat
tctgctcagcttgatacagatttagcaattgatgctgagccacaaaataattcaagcgct
gaaatagatgaaactcttaatgtagaagatagcgatgaattaccgataaacttagatgat
gctattacggttaatgaatctgaaactcccgagcttgaagaaactcaacctacagagccg
gacgacgaattattactcgataatgattctgctcagcttgatacagatttagcaattgat
gctgagccacaaaataattcaaacgctgaaatagatgaagctcttaatgtagagggtaac
gatgaattaccgataaattcagatgctggtatttcggttaatgaatctgaaactcccgag
cttgaagaaactcaacctttagagccggacgacgaattattactcgataatgattctgcc
cagcttgatacagatttagcaattgatgctgagccacaaaataattcaagcgctgaaata
gatgaagctcttaatgtagaggataacgatgagttatcggtaaattcagatgctgatatc
tcggttaatgagtctgaaactcccgagcttgaagaaactcaacctacagagccggacgac
gaattattactcgataatgattctgcgcagcttgatacagatttagcaattgatgctgag
ccacaaaataattcaagcgctgagatagatgaaactcttaatgtagaggatgatgctgat
agcgatgaattatcggtaaatttagatgacgaaccaacacattcattaccgagccaaacc
gaacaagacttaatgaatgcgctctcagctgaaaatgatttaaatagcttagatgatgat
tttaacgatgaattattgcttgataatgactttgcggagcttaatacagataatgatgaa
ttaccgataagcttagatgatgatattacggttaatgaatctgaaattccagagcttgaa
aaaactcaacctacagagccggacgacgaattattactcgataataattctgcgcagctt
gatacagatttagcaattgatgctgagccacaaaataattcaagcgctgaaatagatgaa
actcttaatgtagaggatgatgctgatagcgatgaattatcggtaaatttagatgtcgaa
ccgacacattcattaccgagtcaaaccgaacaagacttaatgaatgcgctctcagctggt
aacgatttaaataacttggatgatgattttgacgacgagctgttacttgataatgatttt
acggaacttgatgctgaattagaaagtaccgcaggctctgaaactatgatttcggaaaac
ccagatgaagcgctttctaatgagctcgctggtgagcaaacgaatgccgatcgtgaagct
gaaataacccgaactgagttatttaatggcagtgatatagcatcagatgatgagcttgat
gatgagtttatggctgagctaacggaaactgattttgattcattacttaacgaattagct
gaaccagaagaattaagtgttgaagatagtagtgagtttgacgttgattttgacagtttg
ctaaaagaagacttaggagttgatgaggcgttagttgttgaagaaccgcttgtccaaagt
aacaatgttgagcaacttgataatgatgaatttgtagatattgattcattattagaagaa
agtgacgacgcagaaattgaacacgaaccttacaacgacgttaatatggatgttggcttg
agtgaatttgacgcgttacttgccggtgataacccgacggatgttgatgctgaaagtggt
ggctactcagctaaattagatttagcgcgtgcttatattgaaattgatgattttgattct
gcgcttaaagtcattgaggatgttattaacaaaggtcctgaagaagttcaagaagaggcg
cttagtttaaaagctaaactaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system