Segatella bryantii: L6471_04665
Help
Entry
L6471_04665 CDS
T08221
Symbol
secDF
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecDF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
pby
Segatella bryantii
Pathway
pby02024
Quorum sensing
pby03060
Protein export
pby03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pby00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
L6471_04665 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
L6471_04665 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
L6471_04665 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
pby02044
]
L6471_04665 (secDF)
Secretion system [BR:
pby02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
L6471_04665 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKK76360
LinkDB
All DBs
Position
1:97710..100754
Genome browser
AA seq
1014 aa
AA seq
DB search
MQNKGIVIVTAVLLTLASIFYLSFSVATSYFDSEAAKIKDPIAQQDYKDSVKYLGVYSYK
NCLETQIGLGLDLKGGMNVILEISVPDVIETLADHKTDAAFTKAMKDAKAEHMNSQGDFI
KLFIDAYHRVAPGHKLAEVFATQQMQGKVSPQSSDVEVENAIRSEVQAAIDNSFNVVRTR
IDKFGVVQPNIQKLEGQQGRIMVEMPGIREPERMRKLLQGSANLEFWETYNAEEIIPYLN
QVDQRFANGGETATDTTAKDSAKSTAPVTKKAEPKFKLAGAAKKDVAPKSETAQIEAAKK
QHPLLAVLQTTGQNSLALVGYANVRDTAAINKIINSQIAKQILPSDVRLLWSAKPANLQN
VKNIYELYALKVTTSTGRAPLEGDVITDAKDEFDQFSNPVVSMQMNTEGARKWAQLTKAN
VGKAVAIVLDGVVYSAPRVNQEIDGGNSQISGNFTIEETKDLSNTLKSGRMPAPAHIVQE
DVVGPTLGAQSIQQGLISFAVAFVLLMVYMVLMYDFIPGMVANGALIANLFFTLGVLASF
QSALTMPGIAGMVLTLGTAVDANVLIYERIKEEMRKGKGLREALEAGYKNAFSAIFDSNL
TSLITGIILLTTGTGPIRGFATTWIIGIVVSFFTAVFLTRLVYENRVKSGKWLNLKFYTG
FSKSMMQGSSYNFMGMYKKSFTVWGVAIFICVISFAVRGLSQSIDFTGGRNYVVALDKTV
EVEDVREVLGDAFVNTVGPDAGKTATTSVIALGTDGKTIRVSTNYNIDSTDPLEDDKAET
ILFNALKKGNFVSQANVESFKNPDIREGGSIISSAKVGPSVAKDITYGAIVSVVLAIIFI
FLYILLRFRNIGFSAGATAGLILDTTIVIGFFSLCYGWIGFSLEIDQTFIGAILTVIGYD
INDSVVVFDRIRENLNNNKNRMSRVDIQALFNNSINETLSRTINTSISTLIVLVSIFILG
GDSIRSFAFAMIIGVIIGTLSSIFIASPVAYLVLGKKIEAEQDKASVTVEEVKA
NT seq
3045 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaacaaaggaattgtaattgttactgccgtccttttgacacttgccagtatcttt
tatctttcattctctgttgcaacaagctatttcgacagtgaagctgctaagattaaagat
cctatcgcacagcaggactacaaggattctgttaagtatcttggagtatattcatacaag
aattgcttggagacacagattggtcttggtcttgacttgaagggtggtatgaacgtcatt
cttgagatttctgtaccagatgttattgaaacactggctgatcacaagacagacgctgcg
ttcacaaaagctatgaaagacgctaaagctgagcatatgaacagccagggcgatttcatt
aagttatttattgatgcttatcatcgtgttgctcctggtcataagttggcagaggttttt
gctacgcagcagatgcagggtaaggtttctcctcagagttctgatgttgaggtagaaaat
gctattcgttcggaagttcaagctgcaattgataactctttcaatgttgttcgtactcgt
attgataagttcggtgtagttcagcctaatatccaaaagcttgagggccagcaaggtcgt
attatggtagaaatgcctggtatccgtgagcctgaacgtatgcgtaaacttcttcaaggt
agtgctaacttggagttttgggagacttataatgctgaagaaattattccttatttgaat
caggttgaccagcgctttgctaatggtggtgaaactgctactgatactacagccaaggac
tcagctaagagtactgctccagttacaaaaaaagccgaacctaagttcaaactagctggt
gctgctaagaaagacgtcgctcctaagagtgaaacagctcagattgaggcagcaaagaag
caacatcctttgttggctgttcttcagacaacaggtcagaatagtttagctcttgtaggt
tatgctaacgttcgtgatacagctgctattaataagattattaattctcagattgctaaa
cagattcttccttcagatgttcgtttgctgtggagtgctaaaccagcaaacttgcagaat
gtaaagaatatctatgagttgtatgctttgaaggtaactacttctaccggtcgagcaccg
ttagagggcgatgttatcacagatgctaaagatgagttcgaccagttctctaatcctgtt
gttagcatgcagatgaatacagagggcgctcgcaaatgggctcagttgactaaggctaac
gtaggtaaggctgtggctattgtgcttgatggtgttgtttactcagctcctcgagtaaat
caggaaattgatggaggtaactctcagattagtggtaacttcactattgaggagaccaag
gacttgtctaatacattgaagtctggtcgtatgccagctcctgctcatattgttcaggaa
gatgttgttggtcctacattgggtgctcagtctattcagcagggacttatttcattcgct
gttgctttcgtacttttgatggtctacatggttcttatgtatgacttcatcccaggtatg
gttgctaatggtgctttgattgctaatcttttcttcacacttggtgttcttgcttctttc
caaagtgccttgactatgcctggtatcgctggtatggtgttaactttgggtacagcagta
gatgctaatgtgttaatctatgagcgtatcaaggaagagatgcgtaagggtaagggcctt
cgtgaggctcttgaagcaggttacaagaatgctttctctgcaatcttcgactccaacttg
acatctttgattacaggtattatcctgttgactacaggtactggtccaattcgtggcttt
gctactacttggattattggtattgtagtatctttcttcactgcagtattcttgactcgt
ttggtttatgaaaatcgtgtgaagagtggaaaatggcttaatctgaagttctatacaggt
ttcagtaagagcatgatgcagggctctagttacaacttcatgggtatgtacaagaagagt
ttcactgtgtggggtgtcgcaatctttatttgtgttattagttttgcagttcgtggtttg
agccagagtattgattttacaggtggtcgtaactacgttgtagctcttgataagacagta
gaagttgaggacgttcgtgaggttttaggtgatgcttttgttaatactgtaggaccagat
gcgggtaagacagctactactagtgttattgctttgggtacagatggcaagactattcgt
gtatctactaattataacattgacagtactgatccattagaagatgataaggctgaaaca
atcctcttcaatgcattgaaaaagggtaattttgtaagccaagcaaatgttgagtcattc
aagaaccctgatattcgtgagggtggttctatcattagcagtgctaaagttggtccatct
gttgctaaagatattacttatggtgctattgttagcgttgtattggctatcatattcatc
ttcttgtatattttgttacgtttccgtaacattggtttctctgcaggtgcaacagcaggt
ttgattcttgatacaactatcgtaatcggtttcttctctttgtgctatggttggataggt
ttctcacttgaaatagatcaaacgtttattggtgctattctgacagttatcggttatgat
atcaatgactctgtggttgtattcgaccgtatccgtgagaatttgaataataacaaaaat
cgtatgtctcgtgtagacatccaagcattgtttaacaactctattaatgagacactttca
cgtaccattaatacttctatatctactttgatagtattggtatctatctttattcttggt
ggtgacagtattcgtagcttcgcttttgctatgattattggtgttattattggtactttg
tcttctatcttcatagcttctcctgttgcttacttggtattgggtaagaaaattgaagca
gaacaagataaggcatctgtgacagttgaagaagtaaaagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
