Pituophis catenifer annectens (San Diego gophersnake): 139311280
Help
Entry
139311280 CDS
T11059
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
pcae Pituophis catenifer annectens (San Diego gophersnake)
Pathway
pcae04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcae00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
139311280 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pcae00536
]
139311280 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pcae00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
139311280 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
hEGF
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139311280
NCBI-ProteinID:
XP_070791782
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2890 aa
AA seq
DB search
MGRRRALCLQPYFLWLGCVAFWAHGSAGQQRQGRPAEGADTSRYSIMGSLEGGTASAAAA
ANRVRRRGQQDMLRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMC
TCSNGQILPSCGPKSIQQCNIRCLNGGTCLDDQCQCQKGYIGNYCGQPVCEHGCQNGGRC
IGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFIQVNNQMCQGQLAGIVCTKTLCCATIGRAWGHP
CEMCPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDIDECQAIPGICQGGTCINTVGSYECKCPAGHKQN
EATQKCEDINECSLIPGICDAGECSNTVGSYICLCPRGFATSTDGSHCIDQRAGTCFSSL
LNGRCAQDLPGRFTKMQCCCESGRCWALGSIPEMCPVRSSDEYRGLCIDGIPVIGGSRPG
GTGGNGFGPGTGFIPIPSGNGFSPGVHGTGIGTGGQGPTGNGPIITGLTVLNQTIDICKH
HPNLCLNGRCIPTISSYRCECNMGYKQDANGDCTDVDECISNPCSNGDCVNTPGSYYCKC
HTGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTDGSFQCICNAGFELTTDGKNCVDHDE
CTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCTDIDECKTPGICMNGHCINTEGSF
RCDCPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGACVRPFPGAVTKSECCCANLDYGFGEP
CHPCPAKNSAEFHGLCSGGVGITVDGRDINECALDPDICSNGVCENLRGSYRCNCNSGYE
SDVSGQNCVDIDECFVNRLLCDNGLCRNTPGSYSCVCPKGYIFSSETDTCEDINECESSP
CVNGACRNNLGSFICECLSGSKLDSTGFICIDSLKGTCWLNIQDNRCEVNLNGATLKSEC
CATLGAAWGSPCERCEFDTACPRGFARVKGVSCEDVNECEVFPGVCPNGRCINSRGSFHC
ECPSGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLRWDEDDCVQPVPGKFRMDTCCCAIGAAWGSDCEEC
PKPGTKEYEDLCPRGPGFSNRGDILTGRPFYKDINECKMFSGMCTNGKCRNTIGSFKCRC
NNGFALDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFEGYESGFMMMKNCMDID
ECERNPLLCRGGKCLNTEGSFQCDCPLGHELSSSREECVDINECSLSDNLCRNGKCVNVI
GMYQCSCNPGYQATPDKQGCIDIDECMIMNGGCDTHCSNSEGSYECSCSDGYALMPDMRS
CADIDECDSNPDICDGGQCINIPGEYRCLCYDGFMASVDMKICIDVNECDLNSNICMFGE
CENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDMHGLCLNVPGSFRCSCKEGWI
GNGIKCIDLDECSNGTHQCSINAQCVNAPGSYHCTCAEGFTGDGFICSDIDECAENINLC
DNGQCLNIPGGYRCECEMGFTSTSNSRTCQDIDECAFQNICVFGTCNNLPGMFHCICDDG
YELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGFCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCVDNRVGNCY
LKYGPRGDGSLSCSTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVNSSEYNTLCPGGEGFR
PNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPHGYYLSEETRICEDIDECVAHP
GVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYNGTSCDNELPFNITKR
MCCCTYNVGKAWNKLCEPCPAPGTVEFKTLCGNIPGFTFDIHTGKAVDIDECKEIPGICA
NGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNADCINSPGSYRCECAT
GFKLSPNGACIDRNECQEIPNVCSHGTCVDKEGSYYCICQNGFKASRDQTMCMDVDECER
HPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDIDECSSFFGQVCRNGRCFNEIGSFKCL
CNEGYELTPDGKNCIDINECVVLPGSCFPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVKSESCIDIDEC
NEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPPGFVISDNGRRCFDTRQSFCFTNFENGKCSVPKAFN
TTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPFGHGTIPGIDDTREDVNECLENPG
ICSNGHCINTDGSFRCECPLGYNLDYTGVQCVDTDECSIGNPCGNGTCSNVIGSFECNCL
DGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPVGYELREDQKMCKDLDECAE
GLHDCESRGMMCKNLIGTFLCICPPGMTRRPDGEGCIDENECHSKPGICENGRCINIIGS
YICECNEGFQSSPSGTECIDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLVTKSECCCDGGRGWGN
QCEICPLLVTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDIDECKVMPNLCTHGQCINTMGSFRCFCKVGY
TTDISGTSCVDLDECSQSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILQDDGKSCRDLDECQTKQ
HNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPSLCGSKGICQNTPGSFACECQ
RGFSLDSTGLNCEDVDECEGNHRCQHGCQNILGGYRCSCPHGYIQHYQWNQCVDENECSN
PSICGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQLNSACHDVNECSSTKNPCNYGCSNTEGGYLCG
CPPGYYRAGQGHCVSGMGFSKGQYLPVDQGEENALSPEACYECKINGYSQKDSRKKRSLN
QSEPVEVKQISLESLDIDLPLKMRFSVTGLGNKEHILDLMPAIQSLTNHNRYAISFGNHN
STFRIHQKDGLSYLQVAKKKATVGIYTLEIVSIPLYKKEELKKLEESNEDNYLLGELGEA
LKMKLWIELY
NT seq
8673 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggagacggcgggcgctttgcctgcagccttatttcctttggctggggtgtgtggcg
ttctgggcgcatggatccgctgggcagcagcggcagggtcgtccggcggagggtgcggat
actagccgctactctatcatggggagcctggaaggaggcacagcgtccgccgccgccgcc
gccaaccgcgtccgcaggagaggccaacaggacatgctcaggggaccaaatgtgtgtggc
tccagattccactcctactgttgccctggatggaaaacactccctgggggaaatcagtgt
attgttccaatttgtagaaatagttgtggtgatggattttgttctcgtcctaatatgtgc
acttgctccaatggacagatattgccaagctgtggaccaaaatctatacaacagtgtaac
atcagatgtctgaatggtggtacctgtctagatgaccaatgccagtgtcaaaaaggatat
attggcaattattgtgggcaacctgtctgtgaacatggatgccagaatggaggtcgctgc
atcgggcccaatcgttgtgcatgtgtatatggattcacaggccctcaatgtgaaagagat
tatagaacagggccttgttttattcaagtcaacaaccagatgtgtcaaggtcagctagcc
ggtattgtttgcacgaagacactttgttgtgcaactattggacgtgcatggggccatcct
tgtgaaatgtgccctgctcaacctcaaccatgtcgtcgtggtttcattccaaacatccgc
actggagcatgtcaagatatagatgaatgtcaggctatccctggaatctgtcagggggga
acttgcatcaatacagtcggatcatatgaatgcaaatgccctgctggtcataaacagaat
gaagcaactcaaaaatgtgaagatattaatgaatgcagcctcatcccaggaatctgtgat
gctggtgaatgttccaatacagttggaagttatatttgtttatgtccacgtggctttgcg
acatccacagatggctctcattgcattgatcaaagagcaggtacttgtttctccagtctg
ctgaatggtcgctgtgcacaagaccttccaggcaggtttaccaagatgcagtgctgttgt
gagtctggacggtgttgggctcttggatccattccagaaatgtgtcctgttagaagctct
gatgaatatcgtgggctttgcatagatggcattcctgttatagggggttccaggcctggt
ggcacaggaggaaatggctttggcccaggaacaggattcatccctattcctagtggaaat
gggttttccccaggtgtgcatggaacgggaataggaactggtggccaaggtcccacagga
aatggccccatcattacaggactaacagtactcaatcagacaatagatatctgtaagcat
catccaaatttatgcttaaatgggcgttgcatcccaacaatttccagttaccggtgtgaa
tgcaatatgggatataagcaggatgccaatggagactgtactgatgttgatgagtgtata
tcaaatccatgctctaatggagactgtgtgaacacacctggctcttattattgcaaatgc
catacaggtttccaaagaacacctactaagcaggcttgcattgacattgatgagtgtatt
cagaatggtgtcctttgtaagaatggtcgttgtgtgaacactgatggtagtttccagtgc
atttgtaatgctggctttgaactaacaactgatgggaaaaactgtgttgaccatgatgaa
tgtacaactaccaacatgtgtttgaatggaatgtgtattaatgaggatggcagtttcaag
tgcatctgtaaacctgggtttgtcctggctcctaatggacgttactgtactgatattgat
gaatgcaagactccaggtatttgcatgaatggccattgcattaatacagaaggatcattt
cgttgtgattgtccacctggactagctgttggagttgatggtcgagtttgtgtagatact
catatgcgaagcacatgctatggtggaatcaaaaagggggcatgtgtacgcccttttcct
ggagcagtgacaaaatctgaatgttgctgtgctaatttagactatggctttggtgaacca
tgccacccatgtcctgccaagaattcagctgagttccatggcctttgtagtggaggagta
ggaattactgtggatggaagagatataaatgaatgtgctttagatcccgatatttgctct
aacggggtttgtgaaaacctacgtggcagctatcgttgtaactgcaacagtggatatgaa
tcggatgtttcaggacaaaattgtgttgacattgatgaatgttttgtgaatcgattatta
tgtgacaatggcctttgtcgaaatacacctggaagttacagctgtgtgtgtccaaaagga
tatatattcagcagtgaaactgacacatgcgaagatataaatgaatgtgaaagcagccct
tgtgtcaatggtgcttgcaggaacaatcttgggtctttcatctgtgaatgtttatccggc
agcaaactagactctacgggcttcatttgcattgatagtctgaaaggaacatgctggttg
aacatccaagataatcgctgtgaagtgaaccttaatggagctactttgaaatcagaatgc
tgtgctactctgggagctgcttggggtagtccttgcgagcgttgtgaatttgatactgca
tgccctagaggatttgcaagagtcaaaggtgtttcttgtgaagatgtaaatgagtgtgaa
gtttttccgggggtgtgtcccaatgggcggtgcatcaacagcagaggctcttttcattgt
gagtgtcccagcggtttgacattggatggaacaggcagggtgtgtttagatatccgaatg
gaacagtgttacctgagatgggatgaagatgactgtgttcaacctgtacctgggaaattc
cgcatggacacgtgttgctgtgctataggtgctgcttggggttcagactgcgaggaatgc
cccaagccaggcacaaaagaatatgaagacttatgccccagaggtccaggcttctccaac
cgtggggatattttaactggaaggccattttacaaagatataaatgaatgtaaaatgttc
tctggcatgtgcacaaatggcaaatgtagaaatacaattggaagcttcaaatgtagatgc
aataatggatttgcacttgatatggaagagagaaactgtacagatattgatgaatgccgt
atctcacctgatctttgtggaagtggcacttgtgtcaacactccaggaagctttgagtgt
gaatgctttgagggctatgaaagtggatttatgatgatgaaaaactgtatggacatagat
gaatgtgaacgtaacccccttctttgtagaggtgggaaatgcttgaatactgaaggaagc
tttcagtgtgactgtcctcttgggcatgaattgtcttcatcacgtgaagaatgtgtggat
atcaatgaatgttctcttagcgataatttatgtagaaatgggaaatgtgtgaatgtgatt
ggaatgtatcagtgttcctgtaatcctgggtaccaggcaactccagataagcaaggctgc
atcgatattgatgagtgcatgattatgaatggaggctgtgacactcactgcagtaattca
gaaggcagctatgaatgtagttgcagtgatggatatgctctgatgccagatatgaggagt
tgcgcagatattgatgaatgtgacagtaacccagatatctgtgatggtggacagtgcatt
aacattccaggagaatatcgttgtctttgttatgatggattcatggcttctgttgacatg
aaaatatgcattgatgtgaatgaatgtgatctaaattcaaacatttgcatgtttggagaa
tgtgagaacaccaaaggatccttcatttgtcattgccaactgggttattctgtcaagaaa
ggaaccactgggtgcacagatgtggatgaatgtgagattggtgcccacaactgtgacatg
catggtctgtgtctcaatgttccgggaagcttcaggtgtagctgtaaggaaggatggatt
ggaaatggaattaagtgtatagatcttgatgagtgttctaatggaacacatcaatgtagc
ataaatgctcagtgtgtgaatgctcctggatcatatcattgcacctgtgcagaaggattt
actggagatggatttatttgttcagatattgatgaatgtgcagaaaatattaatctgtgt
gacaatggacaatgtcttaatattcctggtggataccgttgtgagtgtgagatgggcttc
acttcaacttccaatagccgaacttgccaagatatcgatgaatgtgcctttcagaatata
tgtgtgtttggtacttgcaataacttacctggcatgtttcactgtatttgtgatgatggc
tatgaactggacagaactggaggaaattgtacagatattgatgagtgtgctgatcctata
aattgtgtcaatggcttttgtgtaaatactcccggaaggtatgaatgtaactgtcctcca
gatttccagctgaacccaacaggagttggctgtgttgataacagagttggcaactgttac
ttgaaatatggaccaaggggtgatggaagtctgtcctgcagtactgaaattggtgttgga
gtcagtcgttcttcttgttgctgttctttgggaaaagcctgggggaatccctgtgagaca
tgcccacctgtaaatagcagtgaatataataccttgtgtccaggaggtgaaggcttcaga
ccaaatcccataacaattatcttagaagacattgatgaatgccaagaattgcctggtcta
tgccaaggtggaaactgcatcaatacttttggcagcttccaatgtgaatgtccccatggg
tactatctcagtgaagaaacacgtatctgtgaagatattgatgagtgtgttgcacatcct
ggtgtatgtggtcctgggacatgctataacaccttaggaaattatacctgtatttgcccc
ccggaatatatgcaggtgaatggaggacacaactgtatggatatgagaaagagcttttgt
tatagaagctacaatggaacatcttgtgataatgaactgccctttaatattaccaagaga
atgtgttgctgcacttacaatgttgggaaagcctggaacaagctgtgtgagccatgccca
gctccagggacagttgaattcaaaacattatgtggaaatattcctggtttcacctttgac
attcatactggaaaagcagttgatattgatgaatgtaaagagattccaggtatttgtgca
aatggtgtttgcatcaaccagattggaagttttcgttgtgaatgccccacaggatttagc
tacaatgatctgctcttggtctgtgaagatattgatgaatgtagcaatggtgataatctc
tgtcaacgaaatgcagattgtatcaatagccccggtagttaccgctgtgaatgtgctaca
ggtttcaaactttcacccaatggtgcttgcattgatcgcaatgaatgccaggaaatacct
aatgtatgtagtcatggcacatgtgtggataaagaggggagttactattgcatctgtcaa
aatggttttaaggcatcccgtgatcaaacaatgtgtatggatgtagatgaatgtgaaaga
catccttgtgggaatggaacttgtaaaaatacagttggatcatataactgcctgtgctat
ccaggatttgagctaactcataataatgactgtatggatattgatgagtgcagttccttc
tttgggcaggtgtgcagaaatggaaggtgctttaatgaaattggttctttcaaatgttta
tgtaatgaaggttatgaacttactccggatggcaaaaactgtattgatattaatgagtgt
gtagtgcttcctggctcatgctttcctgggacatgtcaaaatttggaaggatcattcaga
tgtatctgcccaccaggatatgaagtaaaaagtgaaagctgcattgatattgatgaatgt
aatgaggatccaaacatttgcttatttggatcctgcactaatactccaggaggatttcag
tgtatctgccctccaggttttgtaatatctgacaatggtaggagatgttttgatactcga
cagagcttctgcttcactaactttgagaatgggaagtgctctgtgccaaaagcatttaat
accaccaaggcaaaatgttgttgcagcaagatgccaggagaaggttggggtgatccatgt
gaactgtgtcctaaagaagaagaagttgcttttcaggatctgtgtccatttggccatgga
acaatacctggaatagatgatacacgagaagatgtcaatgaatgtctggagaatcctggt
atttgttccaatggacactgcataaacactgatggatcattccgttgtgaatgtcccttg
gggtacaaccttgactacactggagtgcaatgtgtagatactgatgaatgttccattggt
aatccttgtggaaatggcacatgttccaatgtgattggtagttttgaatgcaattgcctg
gatggatttgaacctgggccaatgatgaattgtgaggatataaatgaatgtgcacaaaat
cctttgctttgtgcttttcgctgtataaatacttatggtttttatgaatgcacctgtcca
gtgggatatgaattaagagaggaccaaaaaatgtgcaaagatcttgatgaatgtgcagag
ggtctacatgactgtgaatcaagaggcatgatgtgcaaaaatctgattggaaccttcttg
tgcatatgtccccctggaatgactcgaagaccagatggagaaggttgtattgatgaaaat
gaatgccacagtaagcctggtatctgtgaaaatggtcgttgtataaacattattggaagt
tacatatgtgagtgtaatgaaggtttccagtcaagcccatctggaactgaatgcattgac
aaccgacaaggtttctgctttgctgaagtcttgcagacaatgtgtcaaatggcttccagt
agccgtaatcttgtcaccaaatcagaatgctgttgtgatggtggaagaggatggggcaat
cagtgtgagatttgcccactcttagtaacaactcagtacaaaaagctgtgtccacatggt
ccaggatacaccactgatggaagagatattgatgagtgtaaggtcatgccaaatttatgt
acacatggccaatgcataaacaccatgggttccttcagatgtttttgtaaagttggctat
actactgatataagtggtacttcttgtgtggatcttgatgaatgctcccagtctcccaaa
ccatgcaattttatctgcaagaatactgaaggaagctatcaatgttcatgcccacgtggc
tatatcctccaagatgatggaaaatcctgtagagatcttgatgagtgtcaaactaaacaa
cataactgtcaattcctttgtgtcaatactctggggggattcacatgtaaatgtccacca
ggtttcactcaacatcatacggcctgtatagataacaatgaatgtggatcacagccttca
ctttgtggatcaaaaggaatctgtcaaaatactcctggaagttttgcctgtgaatgccaa
agaggtttctctttagattccactggattgaactgtgaagatgtggatgagtgtgaggga
aatcacagatgccaacatggctgccaaaatattcttggtggctacagatgcagctgccca
cacggatatatccagcattatcagtggaatcagtgtgtggatgaaaatgaatgctcaaat
cctagcatttgtggttcagcttcatgctacaacactctaggaagctacaaatgtgcgtgt
ccctctggattttcttatgatcagctcaatagcgcatgccacgatgtcaatgaatgttct
tctactaagaatccctgcaattatggctgttccaatactgaaggcggatacctctgtggc
tgccctccaggttattacagagcagggcaagggcactgtgtctccggtatgggatttagt
aaagggcagtatctaccagtggatcaaggtgaagagaatgctttgtccccagaagcatgt
tatgagtgtaaaattaatggatattcccaaaaagacagcaggaagaaaagaagcctcaat
caatctgagcctgtagaggtaaaacagatcagtttggaaagtttggacattgatcttcca
ttgaagatgagatttagcgtaactggccttggcaataaagaacatatattagatctcatg
cctgcaatacagagcctcacaaatcacaaccgctacgctatctcctttggtaatcacaac
agcaccttccggatacaccagaaagatgggctcagttatcttcaggttgctaagaaaaaa
gccacagttggtatttacacactggaaatagttagcattcctctgtacaaaaaggaagaa
ctaaagaaattggaagaaagcaacgaggacaactacctcctaggagaacttggagaagct
cttaaaatgaaactttggattgaactctattaa
DBGET
integrated database retrieval system
