Pomacea canaliculata (golden apple snail): 112554080
Help
Entry
112554080 CDS
T05881
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
pcan
Pomacea canaliculata (golden apple snail)
Pathway
pcan04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcan00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
112554080
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pcan00536
]
112554080
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pcan00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
112554080
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
hEGF
EGF
EGF_3
TB
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112554080
NCBI-ProteinID:
XP_025077458
LinkDB
All DBs
Position
LG13:complement(21957706..22019297)
Genome browser
AA seq
2886 aa
AA seq
DB search
MKIQGSAVWKMANVAVLTILVVLVMLLTTVEAESPRRELRSRQQNDEARTEQPRGPNVCG
IGPRSRRKCCTGWSQPSGSQLCIIPICVAGCGTGGRCMRPSMCLCSNKQISPTCTDSHDC
GSGCQNGGRCVSQDTCRCPYGFTGKSCEHDFRTGPCFTQVSNNMCRGQLTGVVCTKTLCC
STIGAAWGRPCEQCPAETHPCRRGYIINPQTNTCQDVNECQAIPGLCVGGECVNTLGSYR
CDCKAGQTQNPITKICEDVNECETIRDVCRNGQCTNTEGSYFCTCNPGYEATPDRTACTS
AQLGYCYTRIVDMNCQDRITEKLTLRDCCCTVNMGKGWTPNQQTCQPCPTPGSDGHNLLC
KSSEPITKDYCKLFNQDCENGRCVNTEHHFYCQCHPGFRNNTAGMCVDIDECGQRGVCRN
GRCINTKGSYRCECNEGFVLSKDGSYCTDMNECETERMCPNGRCFNMDGSYKCVCNPGYR
QSPNQQICYDVNECTENGRLCVNGECVNIDGSYRCECNPGFQLSPDGAFCLDYDECRTTG
MCTNGRCQNMMGSYKCICDPGFMLSISAGGQACIDINECQVTPGICVNGMCINNQGSFRC
DCPQGFSLGPDGRTCLDKRRGLCYPDVQNGRCLNPLAMLVSKSACCCSLSAQGSRYAWGQ
ACEICPEMTDSTFPTLCPHGKGTDHDGKDINECMLRPDICENGVCENVLTGYRCVCNPGF
KADSTGRQCIDIDECELNPRLCDGGRCRNTPGSYQCVCPAGYRFNTASRMCEDIDECAER
PCVGGTCVNIAGSFRCDCPPNTIKDASGRVCIDNRKGLCWLSITNGQCENSIAASVTQSE
CCGSIGKAWGSPCVPCPTDVERHCPPGFSFKNGITCVDINECEMFPNICRGGGQCVNTEG
SFRCTCPNGLTLDRSGRRCVDLRKNVCFQEYSSMLCSRPLMGEYTRADCCCAIGKGFGDP
CHACPLKGSDDYKDLCDEDIINGITNGVSPEQAKDVNECMMFRGLCANGRCRNTIGSFEC
DCNPGYAVDNLGTNCTDIDECHISMTDICGNGRCVNTPGGFHCECDAGYVGVMMNQMCVD
VDECKEQKSLCLGGNCVNSAGSYECQCPDGHELAPDSRSCKDIDECSSISSICSNGHCEN
FMGGYQCICNPGYMPNDLKSTCIDNNECHDNNGGCQSVCINTPGSFSCGCESGFLLLTDG
RSCVDVDECKEQAEICDGGRCDNLPGSYRCICSGGLTPSPDQRRCLDVDECLLNKNLCLN
GVCQNSHGSFACKCDIGFSIKTDIGATGCTDDNECEAGEATCNENALCINTLGSYKCDCK
TGYTGDGFTCRDVNECVRDNGGCARDAGCVNFAGSFRCICDDGFSGDGYECRDVDECSLE
HGICENGNCFNFPGGYRCECDMGFAPTEDERACVDINECDMFPNLCVNGRCENVFGMFRC
ACNQGYKLDATGGNCTDIDECQNSDNCQYGTCINQQGSYLCQCPPNFESNPTGTGCVDRR
MGRCYMDVPLYESGRLGVCDDEIARDVSRATCCCTVGLGWGEVPGFCEPCPKNGTAERSN
LCPGGPGFRPNLVTLVLEDINECAEVAGMCEGGECQNTFGSYVCRCPPGYELDDTNHRCI
DIDECRVDPFRCGIGTCINKDGNFSCLCPDGHIMMPDGVTCMDMRKSRCYRSFTNTSLPP
YHLICEPEDAVIMDVSHFHCCCLFGVAWGLGCDPCPVRGSRAFRELCEEGPVTVYDVNEC
DVNQDLCRNGQCIDTPGSFRCRCFTGFVYNAITQSCDDEDECQRLPSPCIGNAQCLNMPG
SFTCDCPDGYRIRPDGRRCEDVNECSERSDICLHGECRNLQGSFSCICRPGYHLSPDRTM
CIDMDECIMRPGLCRNGSCDNMDGAYRCHCNPGFKLTDTGECMDIDECRTVVGVCENGRC
INTQGSFTCQCQRGYTLSATNNCIDVDECFETPDICKRGMCQNVEGSYLCQCRNGYRLSR
HQDECVDINECLEVEGVCFNGRCENTEGGHICTCPSGFMLTSDGKACLDMRHGVCFRQYE
SGRCLDPFPGNLTRAECCCTSGLGFVVGRECRPCPKPGDAGFPYLCPEGFGYVVVMPGGV
VGDVNECVIHPGICKNGICVNTDGSFRCECAPGYHLDASGTNCVDSDECHDLGVCGNGTC
ANTEGSFECYCSPGFEPGLEKTCQDVDECETGANQCAFRCFNMLGTFRCICPMGYKIAED
QMHCEDVDECATPANLCKYACKNTVGSFLCVCPEGYVQRGADECIDVDECRTLPGVCRNG
RCYNTQGGYRCDCNPGYQVTSDGKACTDRRMDYCFLELTSGRCVQSPNLALLTKADCCCS
LAAAWGRSCERCPPLSSSAFNLLCPMGPGLTPEGQDIDECSSMPGACENGRCLNTMGSYR
CVCNKGYKTDQSGKRCIDADECEQTPKVCEFTCSNTVGSYVCGCPPGYVLNMDQRTCRDL
DECTTMRHNCPHTCINTPGSFECGCQEGFKKGPRGHCQDIDECAETSDLCGPVGTCRNTA
GSFECMCPRGYRRDSTGTKCIDLDECTDGKCEGECENTVGSFHCLCLPGFSEHFGTCIDE
NECSASSGAVCGLALCINTRGSYDCQCGGGHNFDLNLMSCVDQNACGGNPCLFGCSPTSS
GPGFQCGCPPGYIPVGQGHCMASNPSITQYPPGIQLPHEPGPSNGQLPSGEGCYHCDHDF
GELPLTRRSKRSVIKIEDGEEDGIEGMLKVFTKRSTAEVGMTVGEIVRTRRSADPTQLQR
RHYKQHANSTMAREMGRLYNPSNNGTFILYVNHKLTRPKTRIIKVIPSLAALKHNVHYSI
VKGNDDGVFALHDHHGINSLHFTHKLAGPAHYTLDILCQPTLADVESGGEALHLEPYTIQ
LIVWVE
NT seq
8661 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagatacaaggtagcgcagtctggaagatggcaaatgttgctgtgctaacgattctg
gtggtgttggtgatgctgctgaccacggtggaagcggagagtccacgtcgcgaattgcgc
tcgcgtcagcagaacgacgaggcccgaactgagcagccgcgaggaccaaatgtttgtggg
atcggaccaagatctcgaagaaagtgctgcacagggtggagtcagccctccggcagccag
ttgtgcattatcccaatttgtgtggctggatgtggcactggtggacggtgcatgcggcct
agcatgtgtctgtgttctaacaaacagatctcgccaacctgcaccgacagccacgactgt
ggctctggctgtcagaatgggggcaggtgtgtgagtcaggatacgtgcaggtgtccctat
ggcttcaccggcaaaagctgtgaacatgacttcagaacaggcccttgcttcacgcaggtt
tccaacaacatgtgccgtggacagctgactggagttgtctgcaccaaaacactgtgctgt
tctacaattggagctgcttggggtcgtccttgtgagcagtgtccagcagagacacatcct
tgtcgtcgtgggtacatcatcaaccctcagaccaacacctgccaagatgtcaatgaatgc
caagccattcctggcctgtgtgttggtggagagtgtgtcaacaccctgggctcttacagg
tgtgattgtaaggctggccaaacacaaaaccccatcactaagatctgtgaagacgtcaat
gagtgtgaaaccatacgggatgtctgtcgcaatgggcagtgcacaaacactgagggcagc
tacttctgcacctgcaaccctggttatgaggctactcctgacagaacagcatgcacatct
gcccagcttggctactgctatacacgaatcgtggatatgaactgccaagaccgcataaca
gagaagcttactctgcgggactgttgttgtactgtgaatatgggaaagggttggacccca
aatcaacaaacatgtcagccttgtccaacacctggttcagatggccataacctcttgtgc
aagagtagcgagccaattacaaaggattattgtaagctattcaaccaggattgtgagaat
ggccggtgtgtgaacacagaacaccacttctactgccaatgccatcctggctttcgcaat
aacacagctggcatgtgtgtggacattgatgaatgcggccagcgaggagtttgcagaaat
ggtcgatgcatcaacacaaagggcagctacagatgtgaatgcaatgaaggttttgtgtta
tcaaaagatggcagttactgcacagacatgaatgaatgtgagactgaaaggatgtgcccc
aatggccgctgcttcaatatggatggctcttataaatgtgtgtgtaatccagggtacagg
cagtcacctaaccaacagatatgttatgatgtcaacgagtgcacagagaatggcagattg
tgtgttaatggagagtgtgtcaatattgatggcagttaccgctgtgagtgcaaccctggc
ttccagttgtctccagatggtgccttctgtttagactatgatgagtgtcgcaccacaggc
atgtgtacaaatggacgatgtcagaatatgatgggcagctacaagtgtatctgtgaccca
ggttttatgctgtcaatttctgcaggtggacaagcttgtatagatatcaatgagtgccag
gtaactccaggaatctgtgtcaatggaatgtgcatcaataatcagggcagtttccgttgt
gattgtccacaaggcttctctctaggccctgatggtaggacatgtttagacaaacgacga
ggcctgtgctatccagatgtgcaaaacggtcgttgcttgaaccctctagcaatgctagtc
tccaagtctgcatgttgctgcagcctgtcagctcagggctccaggtatgcatggggtcaa
gcatgtgagatctgtcctgagatgacagactccactttcccaacgctctgcccccatggc
aaaggcacagatcatgatgggaaagacatcaatgagtgcatgcttaggcctgacatctgt
gaaaacggtgtgtgtgagaacgtcctcacaggctaccgctgtgtgtgtaatccaggtttc
aaggcagacagcacaggacgtcagtgtatagatattgatgaatgtgagttaaaccccaga
ctctgtgatggtggccggtgtcgcaacacacctggcagttatcaatgtgtttgccctgct
ggctacaggttcaacacagcttccagaatgtgtgaagatattgacgagtgtgctgagcga
ccctgtgttggaggtacatgtgtcaacattgctggcagttttcggtgtgattgtccaccc
aacaccatcaaagatgctagtggaagggtctgcattgacaataggaagggtctctgctgg
ctcagtataaccaatggccagtgtgagaacagcattgcagcatcagtgacacagtcagaa
tgctgcgggtccattggcaaagcttggggaagtccttgtgtgccttgtcctacagatgtt
gaaagacactgccctcctgggttttcttttaaaaatggcatcacctgtgttgacattaat
gaatgtgagatgtttcccaacatttgtcgtgggggaggtcagtgtgtcaacactgaaggc
tcattccggtgcacctgccctaatggcttaacactggatcgttcaggacgtagatgcgtt
gacttgcgtaagaacgtgtgtttccaggagtatagcagtatgctctgctccagacccctg
atgggtgaatacacacgtgctgactgttgctgtgccattggcaaaggttttggtgaccct
tgccatgcttgcccattaaaaggttcagatgattacaaagatctttgtgatgaagacatt
ataaatggaattacaaatggtgtaagccctgaacaggcaaaagacgtgaatgaatgcatg
atgttccgtggtttatgtgccaatggccgatgtcgcaacacaattggcagttttgaatgt
gactgcaaccctgggtatgctgttgacaaccttggcactaactgcacagacatcgatgaa
tgccacatctccatgacggatatctgtggtaatggtcggtgtgtcaacactcctggtggt
ttccactgtgagtgtgatgctggctatgtgggtgttatgatgaaccagatgtgtgttgat
gtggatgagtgtaaggaacagaaatcactctgtctgggtgggaactgtgtgaacagtgca
ggcagttatgagtgccagtgtccagatggccatgagctagcaccagatagtcgatcctgc
aaagacatagacgaatgctcctcaattagcagtatttgctccaatggacactgtgagaac
ttcatgggtggttatcagtgcatctgtaaccctggctacatgcccaatgatctgaagtcc
acttgcatagacaacaatgagtgccatgataacaatggaggctgccagtctgtttgcatc
aacactccaggtagtttcagctgtggctgtgaaagtggcttcctcttgctaacagatggg
cgctcctgtgttgatgtggatgagtgcaaagagcaggcagaaatctgtgatggaggacgc
tgtgacaatttgcctgggtcttatcgctgtatttgttcagggggtctcacaccatctcca
gatcaaagaaggtgtctagatgttgatgaatgtctactcaacaaaaatctttgtctcaat
ggagtttgtcaaaacagccatgggtcttttgcttgcaaatgtgacattggcttcagcata
aagacagatattggtgcaactgggtgcacagatgacaatgagtgtgaagcaggtgaggcc
acctgtaatgagaatgccctctgcatcaacacactaggctcatacaaatgtgactgcaaa
actggctacactggtgatggcttcacctgtcgagatgtgaatgagtgtgtcagagacaat
ggaggctgtgcccgtgatgctgggtgtgtcaactttgccggaagtttccgctgtatctgt
gatgatggattcagtggggatggctatgagtgtagagatgttgatgaatgtagcctggag
catggcatctgtgaaaatggcaattgtttcaactttcctggtggttatcgctgtgaatgt
gatatgggatttgctcctacagaggatgaaagggcatgtgttgatatcaatgaatgtgac
atgttccccaacctgtgtgtgaacggacgatgcgaaaatgtctttggcatgtttcgctgt
gcgtgtaaccagggctacaagctggatgcaacaggaggaaactgtacagacattgatgag
tgccagaattctgacaactgccaatacggtacatgcatcaaccagcagggaagctacctt
tgtcagtgcccacccaattttgagagcaatcccacggggactggttgtgtagataggcgt
atgggaaggtgctacatggatgtcccgctgtatgagtcaggtcggctgggtgtttgtgat
gatgaaatagccagggatgtttcccgagccacctgttgctgcactgtagggcttggatgg
ggtgaagtgccaggtttttgtgagccttgcccaaagaatgggacagctgagcgcagtaat
ctttgtcctggaggcccaggattccgtccgaaccttgtgacgctggtactagaagacatt
aacgagtgtgcagaagtggccggtatgtgtgaaggaggcgagtgtcagaatacatttggg
tcttatgtgtgccgctgtccccctggttatgaactagacgacacaaatcatcgctgtatt
gatattgacgagtgtcgggttgacccattccgctgtggcattggcacctgcatcaacaag
gatggcaatttcagttgtctttgtcctgatggacatattatgatgccagatggtgtaact
tgcatggacatgcgaaagagccgctgttatcggagcttcaccaacaccagcttgccacca
taccatctgatctgtgagcctgaagatgctgtcatcatggatgtctctcacttccactgc
tgctgtctttttggtgttgcatggggattgggctgtgacccttgtcctgtccgtggatca
cgtgcctttagggagctttgtgaagaaggtcctgttactgtgtatgatgttaatgagtgt
gatgtcaatcaagacctgtgtcggaatggccagtgcattgacactccagggagtttccga
tgtcggtgcttcacaggttttgtgtacaatgccatcactcagtcttgtgatgatgaggat
gagtgtcagcggcttccaagcccctgtattgggaatgctcagtgtctcaacatgcctggc
agctttacctgtgactgtcctgatggctacagaatccgccctgatggcaggcgctgtgaa
gatgtaaatgagtgtagtgaaagatctgacatctgcctgcatggcgaatgtaggaacctt
cagggaagcttcagctgtatttgtcgtccaggctatcacctctctccagacaggacaatg
tgcattgatatggatgagtgtattatgcggcctgggctgtgcaggaatggcagctgtgac
aacatggatggtgcttaccgctgtcactgtaatcctggtttcaaacttacagacacagga
gagtgcatggacattgatgagtgcaggacagtcgttggtgtttgtgaaaatggccgttgt
atcaacacccagggtagctttacatgtcagtgccagcgtggctacactctgtcagctaca
aacaactgtattgatgttgatgagtgctttgaaactccagacatctgcaagcgtggtatg
tgtcagaatgttgaaggatcatatttatgtcagtgtagaaatggctatcgtctgtctcgc
caccaagatgagtgtgttgatatcaatgagtgtttggaagttgagggtgtctgctttaat
gggcgatgtgagaacactgaaggaggccacatctgtacctgtccatctggattcatgctt
acatctgatggaaaagcttgtcttgatatgagacatggggtgtgcttccgtcagtatgaa
tctggccggtgcttagacccttttccaggaaacctgactcgagctgagtgctgctgcacc
agtgggttggggtttgtggtgggacgtgagtgtcgtccttgtccaaaaccaggagatgct
ggcttcccatacctgtgccctgagggctttggctatgttgtggtcatgcctggtggagtt
gtgggagatgtaaatgagtgcgtcatacatcctggcatctgcaaaaatggaatctgtgtc
aacacagacggctccttcagatgtgagtgtgcacctggttatcacctggatgctagtggc
acaaactgtgtggattctgatgagtgccatgaccttggggtctgtggaaatggcacgtgt
gctaacacagaaggctcttttgaatgctactgcagccctggatttgagcctggcttagag
aagacttgtcaagatgttgatgaatgtgagactggggctaaccagtgtgcattccgctgc
ttcaacatgcttggcacattccgatgtatctgcccaatgggctacaagattgcagaggac
caaatgcactgcgaagatgttgatgaatgtgccactccagccaacttgtgcaaatatgct
tgcaagaacaccgtgggatcttttctgtgtgtttgccctgaaggctatgttcagcgtgga
gcagatgagtgtattgatgttgatgagtgccgaacactgccaggagtctgtcgtaatggg
cgttgttacaatacacagggtgggtatcgatgtgattgtaatcctggctatcaagttacc
agtgatggaaaggcatgcactgaccgacgtatggactactgctttttggaactgactagt
gggagatgtgtgcagtctcccaatctggctcttctgaccaaagctgattgctgttgttca
ttagcagcagcctggggtagatcatgtgaacgttgcccaccattgtcttcctctgctttt
aatttgctttgccctatgggaccaggacttacccctgaaggacaagacatcgatgaatgt
tctagcatgccaggtgcctgtgagaatggccgatgtctcaatactatgggatcctatcgt
tgcgtctgcaacaaaggatacaaaactgatcagtctgggaagagatgcattgacgctgac
gagtgtgagcagactccaaaggtatgcgaattcacctgttccaacacagttggtagttat
gtatgtggatgcccacctggttatgtccttaacatggatcagcgcacttgtagggatctg
gatgagtgcactaccatgcgccacaactgtcctcacacgtgcattaacacaccaggtagt
tttgagtgtggctgccaggaaggtttcaagaaggggccaagaggtcactgtcaagatatt
gatgagtgtgcggagacctctgacctgtgtggtccagtaggcacttgtcgcaacactgct
ggtagctttgagtgcatgtgtcctcgagggtacaggcgtgattcaactggtactaaatgc
attgatctagatgagtgtactgatggcaaatgtgaaggagagtgtgagaatactgtgggc
agttttcactgcctttgcttgcctggtttctctgagcactttggtacctgcattgatgag
aatgaatgttcggcttctagtggtgcagtatgtggtttggcattatgtatcaacacacga
ggaagctacgactgccagtgcggtggaggacacaactttgatctgaatttaatgtcttgt
gttgaccagaatgcttgtggaggcaatccttgtctgtttggatgctcaccaacatccagt
ggtcctggctttcagtgtggttgccctcctggctatataccagtgggccaggggcactgc
atggccagcaacccgtcaataactcaatacccaccaggcattcagctgcctcatgaacct
ggaccatccaatggtcagctgcccagtggagaaggttgctaccactgtgatcatgacttt
ggagaactgcctctcacacgtcgttctaagcgcagtgttattaagatagaagatggagaa
gaggatggtattgagggaatgcttaaggtcttcaccaaacgcagtactgcagaagttgga
atgacagtgggagaaattgtgcgaaccaggcgtagtgcagatcccacccagcttcaacgg
cgacattataaacaacatgcaaatagcaccatggctagagagatgggaagactgtataac
cccagtaacaatggcaccttcatcttgtatgtcaatcacaaactgactcgtccaaagaca
cgcatcatcaaagttatcccatcacttgcagccctcaagcacaatgtccattattctatt
gtcaagggcaacgatgatggtgtcttcgccctacatgaccaccatggcatcaattccctg
cattttacacacaaacttgctggcccagctcattacaccctagacatcctttgtcagccc
acactggcagatgtggaaagtggtggtgaggcgttgcatttagagccttacacaatacaa
ctgattgtctgggtggagtga
DBGET
integrated database retrieval system
