Phalacrocorax carbo (great cormorant): 104042529
Help
Entry
104042529 CDS
T08596
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
pcao
Phalacrocorax carbo (great cormorant)
Pathway
pcao04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcao00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
104042529
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pcao00536
]
104042529
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pcao00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
104042529
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104042529
NCBI-ProteinID:
XP_009500287
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2373 aa
AA seq
DB search
VDECTSNPCSNGDCVNTPGSYYCKCHTGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTD
GSFQCICNAGFELTADGKNCVDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPNGRY
CSDIDECQTSGICMNGHCINTEGSFRCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGVC
VRPFPGAVTKSECCCASPDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGIGITVDGRDINECALD
PDICSNGICENLRGSYRCNCNSGYEPDHSGRNCVDIDECSVNGLLCDNGLCRNTPGSYSC
TCPKGYVFSTETDTCEDINECESSPCVNGACRNNLGFFSCECSPGSKLDSTGLICIDSLK
GTCWLNIQDSRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACSRGFARVKGVTCED
VNECDVFPGVCPNGRCINSRGSFRCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECIQS
VPGKFRMDACCCAVGAAWGSDCEECPKPGTKEYEALCPRGPGFSNRGDILTGRPFYKDIN
ECKVFPGMCMNGKCRNTIGSFKCRCNSGFTLDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTP
GSFECECFDGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFQCDCPLGHELSRSR
EECIDVNECSLSDTLCRNGKCVNMVGTYQCSCNSGYQATPDRQGCIDIDECMIMNGGCDT
HCTNSEGSYECSCSDGYALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFM
ASMDMKTCIDVNECDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGATGCTDVDECEIGA
HNCDTHATCVNIPGSFKCSCREGWIGNGIKCIDLDECSNGTHQCSVNAQCVNTPGSYRCA
CAEGFTGDGFTCSDVDECAENVHLCENGQCLNVPAAYRCECEMGFTPASDSKSCQDIDEC
SFQNICVFGTCNNLPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYE
CNCPPDFQLNPTGVGCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWG
NPCETCPPVNSTEYNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQC
ECPKGYYLSEETRICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDM
RKSFCYRSYNGTSCENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKNICGNIP
GFTFDIHTGKAVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECG
NGDNICQRNADCINSPGSYRCECAAGFKLSPSGVCVDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGSY
QCICHNGFKASQDQTMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDID
ECSSFFGQVCRNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTLDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQNL
EGSFRCICPPGYEVKSESCIDINECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPTGFVLSDNGRR
CFDTRQSFCFTNFENGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFHDLC
PYGHGTIPGIDDTREDVNECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGVHCIDTD
ECSVGNPCGNGTCTNAIGSFECNCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFY
ECTCPVGYELREDQKMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMTRRPDGEG
CTDENECRTKPGICENGRCMNIIGSYRCECNEGFLSSPSGTECLDNRQGFCFAEVLQTMC
QMASSSRNLVTKSECCCDGGRGWGNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDIDECKV
MPNLCRNGQCINTMGSFRCFCKIGYTTDISGTSCIDLDECSQSPKPCNFICKNSEGSYQC
SCPRGYILQEDGKTCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNEC
GSQPSLCGSKGICQNTPGSFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGY
RCGCPQGYIQHYQWNQCVDENECSNPNTCGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQFSNACHD
VNECSSTKNPCNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPLDRDADEEN
ALSPEACYECKINGYSKKDNRKKRSANDTIEQISLESLDMRSPLKMRVNISRLDNKDHIL
ELMPAIEPLTNHVRYIISRGNDDGIFRIHQKDGLSYLHTVKKKSVPGTHTLEITSIPLYK
KKELKKLEDSNEDNYLLGELGEALRMRLWLDLY
NT seq
7124 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgatgaatgcacttcaaacccatgctctaatggagactgtgtcaacacacctggtt
cctattactgcaagtgccacacaggtttccagagaactcctactaagcaagcttgcattg
atatagatgagtgcatccagaatggtgttctctgtaaaaatggccggtgtgtaaacactg
atggaagtttccagtgtatttgcaatgctgggtttgaactgactgcagatggaaaaaatt
gtgtggaccatgatgaatgtacgactacaaacatgtgtttaaatgggatgtgcataaacg
aagatgggagttttaaatgcatctgcaaaccaggatttgtcctggctccaaatgggcgtt
actgttctgatatcgatgaatgtcagacatcaggaatttgcatgaatggtcattgcataa
atactgaaggatcgtttcggtgtgagtgtccacctggcttggctgtgggagttgatggtc
gtgtgtgtgtagatactcatatgcgtagcacatgctatggaggcatcaaaaaaggagtat
gtgtccgtcctttccctggtgctgtgacaaagtctgaatgttgctgtgccagtcctgact
atggttttggagagccatgtcacccctgccctgctaaaaactcagctgaattccatggtc
tgtgtagcagtggaataggtattactgtggacgggcgagatattaatgagtgtgcattgg
atcctgatatttgctccaatggaatttgtgaaaacttacgtggcagctatcgttgtaact
gtaatagtggctatgagcctgatcattctggaaggaattgtgtggacattgatgaatgct
cagtgaacgggctgctgtgtgataatgggctctgtcgaaacacccctggaagctacagct
gtacttgtccaaagggttatgtgttcagcactgagacagacacatgtgaagatataaatg
aatgtgaaagcagcccgtgtgtcaatggtgcctgcaggaacaatcttggatttttcagtt
gtgaatgttcaccgggcagcaagttggactctacaggactgatatgtattgatagcctga
aggggacttgctggcttaacatccaagacagtcgctgtgaagtcaacatcaatggtgcta
cactgaaatctgaatgctgtgctaccttaggagcagcctggggtagcccttgtgagcgat
gtgaattagacacagcttgctcaagaggatttgccagagtgaagggtgttacctgtgaag
atgtaaatgagtgtgatgtcttcccgggggtttgtcccaatgggcggtgcattaacagca
gaggctcatttcgctgcgagtgccctgaaggactgacactggatggaacagggcgagtgt
gtttagatattcgcatggagcaatgctacctgaaatgggacgaagatgagtgcattcagt
ctgtgcctggcaagtttcgtatggatgcctgctgctgtgctgtgggggctgcctggggct
ccgactgtgaggagtgtcctaagcctggcaccaaggaatatgaggccctgtgccccagag
gtcctggcttttccaacaggggagatattctaactggcaggccattttataaagatatca
atgaatgtaaagtgttccctggtatgtgcatgaatggtaaatgcagaaacacaattggaa
gtttcaaatgtagatgtaacagtgggtttactttagatatggaggaaagaaactgtacag
acattgatgagtgccggatctccccagacttatgtggaagtggtacttgtgtcaacactc
ctggaagctttgagtgtgagtgctttgatggttatgaaagtggatttatgatgatgaaga
actgtatggatattgatgaatgtgaacgcaaccctctgctgtgcaggggtggcacatgtg
tgaacactgaagggagttttcagtgtgactgtcctttgggacatgagctgtcacgatcac
gtgaggaatgcatagatgtaaatgagtgctcattaagtgacactctctgcagaaatggca
agtgtgtgaacatggttggaacataccagtgttcctgtaactctgggtaccaggccactc
ctgacagacaaggctgcatagatattgatgaatgtatgataatgaatggaggctgtgaca
cccactgcactaactcagaaggcagctatgaatgtagctgcagtgatggctatgctctaa
tgccggatgtcaggacctgtgcagatattgatgaatgtgaaaacaatccagatatctgtg
atggtgggcaatgtactaatattccaggggaatatcgctgtctctgttatgatggattta
tggcttctatggacatgaaaacttgtattgatgtgaacgaatgtgatttgaattccaaca
tctgtatgtttggggagtgtgaaaacactaaaggttccttcatttgtcactgtcagctag
gatattcagtcaagaaaggagccactggatgcacagatgtggatgagtgcgagattggtg
ctcacaactgtgacacgcatgccacatgtgtcaacataccaggaagttttaaatgtagtt
gcagagaaggatggattggaaacggcattaaatgtattgatctcgatgaatgctccaacg
gaacccaccagtgcagcgtgaacgctcagtgtgtgaacaccccagggtcataccgctgtg
cctgtgcggagggattcactggtgatggatttacttgttctgatgttgatgagtgtgcag
aaaatgttcatctgtgtgaaaatggacagtgtttgaatgtccctgctgcctaccgttgcg
agtgtgagatgggattcactcctgcctcagacagcaaatcatgccaagatatcgatgaat
gctccttccagaatatatgtgtatttggtacctgtaataatctaccaggaatgtttcatt
gtatctgtgatgatggctatgaactagatcgaaccggtggaaactgtacagatattgatg
aatgtgccgatcccattaattgtgttaatggtctctgtgtaaatactcctggaaggtatg
agtgtaattgccctccagacttccagctgaatccaactggagtgggttgcgtagataacc
gtgttggcaattgctacctgaagtatggaccacgaggggatggcagcctatcctgcaaca
ctgaaattggggttggagtcagtcgttcctcatgctgctgctcgctgggaaaggcttggg
gaaacccctgtgagacatgcccccctgtaaacagcacggaatataatactctctgtccag
ggggagaaggattcagaccaaatcccatcaccattattttagaagacattgatgaatgtc
aggaactgccaggtctctgccaaggtggaaattgcatcaatacttttggcagcttccagt
gtgaatgtccaaaaggctactacctcagtgaagagacaagaatttgtgaagatattgatg
agtgtgttgcacatcctggtgtctgtggtcctggcacctgctacaatactttggggaact
acacttgcatttgcccacctgaatatatgcaggtgaatggaggacataactgcatggaca
tgaggaaaagcttttgctacagaagctataatggaacctcctgtgagaatgaactaccct
tcaatgtgaccaaaaggatgtgttgctgtacatacaatgttgggaaagcctggaacaaac
cttgtgaaccatgtccaactccaggaacagctgaattcaagaacatatgcgggaatattc
ctggcttcacttttgatattcatactggaaaagctgttgacattgatgaatgtaaggaaa
tcccaggaatctgtgcaaatggtgtttgcatcaatcagattggcagcttccgctgtgaat
gccccactggattcagctacaatgacctgctcttggtctgtgaagatattgacgagtgcg
gcaatggagacaatatctgccagagaaatgcagactgtatcaacagtcctggtagttacc
gctgtgaatgtgctgctggttttaaactttcacccagtggtgtctgtgttgatcgcaatg
aatgtctggaaattcctaatgtttgcagtcatggtttatgtgtggacatgcaagggagtt
accagtgcatatgtcacaatggttttaaggcatcccaagaccagactatgtgcatggatg
ttgatgaatgtgaacgccatccatgtggaaatggaacttgtaaaaacacggttggatcat
ataactgcctgtgttatcccggatttgaattaactcataataatgattgtatggatatcg
atgagtgcagttccttctttggtcaggtgtgcagaaacgggcggtgtttcaatgaaattg
gttccttcaaatgtttatgtaatgaaggatatgaacttactctagatggcaagaattgca
ttgatactaatgagtgtgtggcgctacccggttcatgctctcctggtacctgtcaaaatt
tggaaggatcattcagatgcatctgtccaccaggatacgaagtaaaaagtgaaagttgta
ttgatattaatgagtgtaatgaggatcccaacatctgtctctttggctcttgtacaaaca
ctccaggaggattccagtgcatctgtcctacaggttttgtgctctctgataatggacgga
gatgttttgatactcgccagagcttctgtttcactaattttgagaatgggaaatgctcag
tgccaaaggctttcaacaccacaaaggcaaagtgttgctgcagtaaaatgccaggagaag
gatggggtgatccttgtgagctctgcccaaaggaagaagaagttgcttttcacgacctgt
gtccatatggtcatggaactattcctggaattgatgatacacgtgaagatgtcaatgaat
gccttgaaagcccagggatttgctcaaatggtcactgcatcaatactgatggatcattcc
gctgtgagtgccccatgggatacaacttagattacactggagtacattgcatcgatactg
atgaatgttcagttggcaacccatgtggaaacggtacatgcactaacgcgataggcagtt
ttgagtgcaactgtcatgaaggatttgaaccaggcccaatgatgaattgtgaagatataa
atgagtgcgctcagaatcccttgctgtgtgcttttcgttgcatcaacacttatggcttct
atgaatgcacatgtccagtcggctatgaactaagagaagaccaaaagatgtgcaaagatc
tagatgagtgtgctgaaggtctccatgactgcgagtcaagaggcatgatgtgcaaaaatt
tgattggtaccttcatgtgcatttgtcctcctggaatgacccggagaccggatggagagg
gctgcacagatgaaaatgagtgccgcaccaagccaggtatctgtgaaaatggtcgttgca
tgaacattattgggagctaccgatgtgaatgtaatgaaggattcctctcaagtccgtcag
gcactgagtgtcttgataatcgtcaaggattttgctttgctgaagttttacagacaatgt
gtcagatggcttccagtagtcggaatcttgtcactaaatctgagtgctgctgtgatggag
gccggggctggggtaaccagtgtgagctctgtcctcttcccggaaccacccaatataaaa
aactctgtccacatggaccaggctatactacagatggaagagatattgatgaatgtaaag
tcatgccaaacctatgtagaaatggacagtgtattaacactatgggctccttccgatgct
tttgcaaaattggctataccactgacataagtggcacatcctgtattgatcttgatgagt
gctcccagtctcctaaaccatgcaattttatctgcaagaactcagagggaagctatcagt
gctcatgtcctcggggctacatcctccaagaagatggaaagacatgtaaagatcttgatg
aatgtcaaaccaaacaacacaattgtcagtttctctgtgtcaatacccttggaggcttca
catgcaaatgtccacctggttttacacaacatcacacagcttgtattgataacaatgaat
gtggttctcagccatcgctttgtggatcaaaaggaatttgccaaaacacccctggaagtt
ttacctgtgaatgtcaaaggggattttctctggattctactggattaaactgtgaagatg
tggatgaatgtgatggaaaccatagatgccagcacggctgtcaaaatatcctgggtggat
acagatgtgggtgcccacaaggatatattcagcattaccagtggaatcaatgtgttgatg
aaaatgaatgctccaatcctaacacatgtggctctgcttcttgctataatacacttggaa
gttacaagtgtgcctgcccatctggattttcttatgaccaattctccaatgcatgccatg
atgtgaatgagtgttcttctaccaagaacccctgtaattacggttgttccaacactgaag
gtggatatctttgtggctgtccacctgggtattacagagttggacaaggccactgtgtct
cagggatgggatttaacaaaggccagtatctgccactggatagagatgctgatgaagaga
atgctttgtcccctgaagcgtgttatgagtgcaaaatcaatggctactccaaaaaagaca
acaggaagaagagaagtgctaatgacactattgagcagattagcttggaaagtctagaca
tgcgtagtcctttgaagatgagagtcaacatttccaggcttgacaacaaggaccacatcc
tagaactcatgccagccattgagccccttaccaaccacgtgcgctacatcatctcacgtg
gcaatgatgacggcatctttcgaatccatcagaaggatggactgagttatttgcacacag
ttaagaaaaagtcagtgcctggaactcacacactggaaatcactagcattcctctatata
agaaaaaggagctaaagaaactggaagacagcaatgaggacaactacctcctgggagagc
tcggggaagctctcagaatgaggctgtggctagacctctactag
DBGET
integrated database retrieval system