KEGG   Phalacrocorax carbo (great cormorant): 104049067
Entry
104049067         CDS       T08596                                 
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) collagen alpha-2(I) chain
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
pcao  Phalacrocorax carbo (great cormorant)
Pathway
pcao04510  Focal adhesion
pcao04512  ECM-receptor interaction
pcao04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pcao00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    104049067 (COL1A2)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    104049067 (COL1A2)
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    104049067 (COL1A2)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:pcao00536]
    104049067 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:pcao00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   104049067 (COL1A2)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI
Other DBs
NCBI-GeneID: 104049067
NCBI-ProteinID: XP_009507976
UniProt: A0A093THE9
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1184 aa
GHNGLDGQKGQPGTPGIKGEPGAPGENGTPGQPGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGST
GPTGPAGPIGAAGPPGFPGAPGAKGEIGPAGNVGPTGPAGPRGEIGLPGSSGPVGPPGNP
GANGLPGAKGAAGLPGVAGAPGLPGPRGIPGPPGPAGPSGARGLVGEPGPAGAKGESGNK
GEPGAAGPAGPPGPSGEEGKRGANGEPGSAGPPGPAGLRGVPGSRGLPGADGRAGVMGPA
GNRGPSGPVGVKGPSGDGGRPGEPGLMGPRGLPGQPGSPGPAGKEGPVGFPGADGRVGPI
GPAGNRGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKPGEKGNVGLAGPRGAPGPEGNNGAQGPPGVTGNQ
GGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEAGKPGERGLHGEFGVPGPAGPRGERGPPGESGAV
GPAGAIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGNVGAAGGPGPAGPGGIPGERGVAGVPGGKGEKGPP
GLRGDTGATGRDGARGLPGAVGAPGPAGGAGDRGEAGPAGPAGPAGARGIPGERGEPGPV
GPNGFAGPPGAAGQPGAKGERGPKGPKGETGPTGAIGPVGASGPPGPAGAAGPAGPRGDA
GPPGMTGFPGAAGRVGPPGPAGITGPPGPPGPAGKDGARGPRGDVGPVGRTGEQGIAGPP
GFAGEKGPSGEAGAAGPPGSPGPQGILGAPGILGLPGSRGERGLPGISGAPGEPGPLGVS
GPPGARGPSGPVGSPGPNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGAPGFKGERGAPGSPGPSGAL
GAPGPHGQVGPSGKPGNRGDPGPVGAVGPAGAFGPRGLAGPQGPRGEKGEPGDKGPRGLP
GLKGHNGLQGLPGLAGQHGDQGPPGNTGPAGPRGPPGPSGPPGKDGRNGLPGPIGPAGVR
GSHGSQGPAGPPGPPGPPGPPGPNGGGYEVGYDAEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKTLNN
QIETLLTPEGSKKNPARTCRDLRLSHPEWSSGFYWIDPNQGCSADAIRAYCDFATGETCI
HANPDNIPIKNWYINKNPKDKKHVWFGETINGGTQFEYNDDGVTSKDMATQLAFMRLLAN
HASQNITYHCKNSIAYMDEETGNLKKAVILQGSNDVELRAEGNSRFTFSVLEDGCSRKNN
QWGKTIIEYRTNKPSRLPILDIAPLDIGGADQEFGLDIGPVCFK
NT seq 3555 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ggacacaatggtctggatggtcaaaagggacagcctgggactcctggcatcaagggagaa
cctggtgcccctggtgaaaatggtaccccaggacaacctggtgcccgtggtctccctggt
gaaagaggaagagtaggtgcccctggaccagctggtgctcgtggaagtgatggcagcact
ggccccaccggacctgctggccctattggtgctgctggtcctccaggcttcccaggtgct
cctggtgctaagggtgaaatcggacctgctggtaacgttggtcctactggtcctgctggt
ccaagaggagagattggacttcccggttctagtggtcccgttggccctccaggcaaccct
ggtgcaaatggtcttccaggggctaaaggtgcagctggtcttcctggtgttgctggtgct
cctggtctgcccggtccccgtggtattcctggtcctcccggccctgctggtcctagtggt
gctagaggacttgttggtgaaccaggccctgctggtgccaagggagaaagtggtaacaag
ggtgagcctggtgctgctggacccgctggccctccaggtcctagtggtgaggaaggcaag
agaggcgccaatggtgaacctggctctgctggtcccccaggccctgctggtctaagaggt
gtgcctggatctcgtggtctccctggagctgatggcagagctggtgtcatgggacctgct
ggtaaccgtggtcctagtggtcctgttggtgttaagggtcctagtggtgatggtggccgt
cccggtgagcctggtcttatgggtccaagaggtctcccaggtcagcctggaagcccaggt
cctgctggcaaggaagggcctgttggtttccctggagcagatggtagggtcgggccaatt
ggtccagctggtaacagaggtgagcctggcaacattggattccctggaccaaaaggtccc
actggtgaacctggcaaacctggtgaaaaaggcaatgttggtcttgctggcccacggggt
gctcctggaccagagggaaacaacggtgctcaaggtcctcctggagtcactggcaaccaa
ggtggaaagggtgaacaaggtcccgctggtcctcctggcttccagggtctcccaggtccc
tcaggtccagctggtgaagctggtaaaccaggcgaaaggggtcttcatggtgaatttggt
gtccctggtcctgctggcccaagaggtgaacgtggtcctcctggtgaaagtggtgctgtt
ggtcctgctggtgccattggaagccgtggtccatctggcccaccaggccctgatggtaac
aagggtgagcctggcaatgttggtgctgctggtggtcctggtcctgctggccctggtgga
atcccaggagaaagaggtgttgctggtgttccaggaggcaagggtgaaaagggtccccca
ggtctgagaggtgatactggtgcaacaggaagagatggtgctcgtggtctccctggcgct
gttggtgctcctggccctgctggtggtgctggtgatcggggtgaagcaggtcctgctggt
cccgctggtcctgctggtgcccgtggtatccctggtgaacgtggtgagcctggtcccgta
ggtcctaacggatttgctggacctcctggtgcagctggtcagcctggtgctaaaggcgag
cgtgggcctaaaggacctaagggtgaaactggaccaacgggtgctattggcccagttggt
gcttctggaccaccaggtcctgctggtgctgctggtcctgctggccctcgtggtgatgct
ggtcctcctggcatgactggtttccctggtgctgctggaagagttggtcctcctggccct
gctggtatcacaggtccccctggtcctcctggcccagccggcaaagatggtgctagaggt
ccacgtggcgatgttggtccagttggccgtactggtgaacaaggtattgctggcccaccc
ggttttgctggtgagaaaggtccatctggagaggctggtgctgctggtcctcctggtagc
ccaggtcctcagggtattcttggtgctcctggtatccttggtctgcctggctctcgggga
gaacgcggtcttccgggcatctctggagcaccaggtgaacctggtcccctgggtgtttct
ggtcctcctggtgctcgtggtccttctggtcctgtgggttctcctggtccaaatggtgct
cctggtgaagctggtcgtgatggcaaccctggaaacgatggtcctccaggccgtgatggt
gctcctggtttcaagggtgagcgtggtgctcctggtagtcctggtcccagtggtgctctg
ggtgctcctggtcctcatggccaagttggtccttctggaaagcctggaaaccgtggtgat
cctggtcctgttggtgctgtcggtcctgctggtgcttttggcccaagaggtcttgctggc
ccacaaggtccacgtggtgaaaaaggtgaacctggtgataaggggccgagaggtctgcct
ggcttgaagggacacaatggattgcagggtcttcctggtcttgctggccaacatggtgat
caaggtcctcctggtaacaccggccctgctggcccaaggggtccacctggtccttctggt
cctcctggtaaagatggtcgcaatggtctccctggacctattggccctgctggtgtgcgt
ggctctcatggtagccaaggccctgctggtcctcctggtcctcctggtccccctggtccc
cctggtcccaatggcggtggatacgaagttggctatgatgcagaatactaccgggctgat
cagccttctctcagacccaaggattatgaagttgatgccactctgaaaacattgaacaac
caaattgagaccctgctgaccccagaaggctccaaaaagaacccagctcgcacctgccgt
gacctaagacttagccacccagaatggagcagcggcttctactggattgatcctaaccaa
ggctgctctgcagatgccattagagcatactgtgactttgccactggtgagacttgcatc
catgccaaccctgacaatattcccatcaagaactggtacatcaacaagaatcccaaggat
aaaaagcatgtatggtttggtgaaactatcaatggtggcacccagtttgaatacaatgat
gatggagtgacctcaaaggatatggccacccaacttgcgttcatgcgtctgctggccaac
cacgcctcccagaacatcacctaccactgcaagaacagcattgcctacatggatgaggaa
actggcaaccttaaaaaggctgttatactgcagggatctaacgatgttgaactacgagct
gaaggcaacagcagattcactttcagtgttctcgaggatggctgctctagaaagaacaat
caatggggcaaaacgatcattgaatacagaacaaataagccatctcgcttgcccatcctt
gacattgcacctttggatattggcggcgctgaccaagaattcggtttggacattggccca
gtctgtttcaaatga

DBGET integrated database retrieval system