Pseudoalteromonas carrageenovora: PC2016_0848
Help
Entry
PC2016_0848 CDS
T06565
Name
(GenBank) Voltage-gated ClC-type chloride channel clcA
KO
K03281
chloride channel protein, CIC family
Organism
pcar
Pseudoalteromonas carrageenovora
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcar00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pcar02000
]
PC2016_0848
Transporters [BR:
pcar02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
PC2016_0848
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Voltage_CLC
EcoR124_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBJ71085
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(953144..954826)
Genome browser
AA seq
560 aa
AA seq
DB search
MWLERLRRRLAKPKTSVQLCLLGVSAGLIAAFFIILFRLTILFFQSLFLETPDNFTTLPT
LERVLMPLIAALLIAIFAALTGFKHYRLGIPFVIHRIKRHYGQMPLYNTVNQFVGGALAL
ISGFSVGREGPSVHMGATGASILADKLHLPHNAMRTLSGCGVAAGIAASFNTPLAAVIFV
MEVVLREYKVHIFVPIMLAAVTGALATQFVFGEGSELALITIAPLSGWHYPYLILCGMAL
GAIAFSFNQNLMLIIKTFKPLSMFPRLLIAGCIASLIAYAVPHAMGSGMSAITIAVESPD
NVKLLTTILIAKLLATLFAIGLGIPGGLIGPVIGLGVLIGTLMAFLAQYISPGTDIAGTY
GVLGMAGLLAATLHAPLAALTTVMELTSSPEIIVPAMIVITTAYVTALQFFGNRSIFLQQ
LDFQGLPYHVSPATEALQKVGIMDDMDEDFKLLYSDDKEQIKNTLDAMDSQTPLIVFDEE
NGYRLAEYDLTLMSDQTININYISLQGISSQATLADAFDILKDKRSGALYVYNLLDNQQI
MGLLRWDQINNILTIRNSLL
NT seq
1683 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggcttgagcggctcaggcgtcgattagcaaaaccaaaaacatccgtacaattatgc
ctattaggcgtaagtgccggattaattgctgcattttttatcattttatttcgcttaact
attctgttttttcaaagcttatttttagaaaccccagacaactttacaaccttacctacg
cttgaacgtgtattaatgcctttaattgcagcgctacttattgctatatttgcagcactt
acaggttttaagcattaccgtttaggtattccgtttgttattcaccgtattaaacgtcac
tacgggcaaatgccgctatacaacacggtaaaccaatttgttggtggcgcgcttgcactt
attagtggtttttcagtgggccgcgaaggcccctctgtacacatgggtgctactggcgcg
agcatattggccgataaacttcatttaccccataatgctatgcgtacattgagcggctgt
ggtgttgctgcgggtattgcggcctcatttaacaccccgcttgctgctgttatttttgtt
atggaagtggtacttcgtgaatataaggtgcatatattcgtacctattatgttagcagcc
gtaacaggcgcactagctacacagtttgtgtttggcgaaggctcagagcttgcgcttatt
acaatagcaccgctaagtggctggcattatccatacttaattttatgcggaatggcccta
ggtgctattgcgtttagctttaatcaaaatttaatgttaattattaaaacatttaaacct
ttaagcatgttccctcgtttattaattgcaggttgcattgcgagcttaatagcatacgca
gtacctcacgctatgggctctggtatgagtgcaattaccattgcagttgaatctcctgat
aacgtaaagctgctaacgactattttaatcgctaaattattggccacactatttgctatt
ggcttgggtattcctggcggcttaattggcccagtaattgggcttggggtactcattggt
acactaatggcgtttttagctcagtatataagcccaggtactgatattgctggtacgtat
ggtgttttaggtatggctggtttattagccgcgacactgcacgctccccttgcggcttta
acgacagtaatggaacttacctcttcgcctgaaataatagtcccagcaatgatagtgatt
acgactgcttatgtaactgccctgcaattttttggtaatcgctctatatttttacagcaa
ttggattttcaaggattgccctatcatgtatccccagctactgaagcacttcaaaaagta
ggcataatggatgatatggatgaagactttaagctgctgtactcagacgataaagaacag
ataaaaaacactctagatgctatggacagccaaacaccactaatagtgtttgacgaagaa
aatggctaccgacttgctgagtatgatttaacgcttatgtctgaccaaaccataaatatt
aactacattagcctgcaaggtataagtagccaagcaaccctagctgatgcctttgatatt
ttaaaagacaagcgtagcggtgcactttacgtctacaacttattagataaccaacaaatc
atgggcttattacgctgggatcaaataaataatattttaaccattcgtaacagcttactt
taa
DBGET
integrated database retrieval system