KEGG   Pseudoalteromonas carrageenovora: PC2016_1287
Entry
PC2016_1287       CDS       T06565                                 
Name
(GenBank) pilin biogenesis protein
  KO
K02674  type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
pcar  Pseudoalteromonas carrageenovora
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pcar00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:pcar02044]
    PC2016_1287
   02035 Bacterial motility proteins [BR:pcar02035]
    PC2016_1287
Secretion system [BR:pcar02044]
 Type II secretion system
  Pilin secretion/fimbrial assembly protein
   PC2016_1287
Bacterial motility proteins [BR:pcar02035]
 Pilus system
  Pilus assembly proteins
   PC2016_1287
SSDB
Motif
Pfam: T4P_PilY1 VWA_2 VWA
Other DBs
NCBI-ProteinID: QBJ71511
LinkDB
Position
I:1458120..1461302
AA seq 1060 aa
MKFKFNCVVASFIAATISLSVTAEDIELYVNHNVETDEKPRVLIVFDTSGSMWSKLPNNG
PRKIDAAKDAMTDLVNNNESIDFGLMRFQSNYGGYVMAEIGSSRATVKNQIKSLPASGST
PVTETLWEAYLYLTGQQVLYGYEEYSGDEDFLSKTVTYEKNHYNKKKKVTTLTYISPFGT
DLDSDERCDNSINLILMTDGDPQSDTESNNDIYHLYKSKFGSNPSTTSGSYLAALAQIIH
GTSDVEVDLYDSTPEIADTGRVFTIGFGSGMSTNGKKLLEKTAQVGGGEYLHANTSAELS
EKLNSTISKIREVNDTFSSPTVASNNVDQTRSREAIYFTMFYPETGARWGGNLKKLAMSG
STIVDSDGNEAIGDDGLIKEDARTFWLPTNKSADGNLVAQGGVNAFLSTLDGQGRKLYID
SGGRIVDFTFDKVKEILNIVSETLGGLIPGTDISISLNDINWARGIDVDDEDSDGSYVDQ
RSDIFGDPLHSKPVSIDYGDGDIRILVGTNAGFLHMFNDKGDSVEEEWAFTPAELLKNIP
ALRSNQANSKVYGMDGPISVYFNNQSLNSKGLNDGVVDASQGDEVWAFAGMRRGGNNYYA
LDISTPDKPKQLWNKPIVGGSEDFKYLAQTWSKPQIAYIKAFGDEPLLVFGAGYDTNKDE
AIRSEDETGLGIYIVKARTGEKVWALTPEDNNFQGKHSIAADIATLDSDYDGYIDRLYAT
DTGGNVWRVDMPGSDKNDISYFKLAELGSSLASQDRRFFYKPLVARTMFSKASKTTNENG
VEITTRLDTPYDAIVIGSGNRSNPLATNEQDHLYMIRDEHTVTQTFNSEDKPTAIVPSDL
MLMNDDPFGNALDNVDDFVDLEVDLAGFKGWRYELSNGEKSLAAATVVGGVAYFTSFTPA
LESNKNQCSLTGGGGAMYAFHLHYGTKVYDQLKFTTSYDVPDTAQLYFGEGDSCIDANNN
GLCDVPTPDDGTPDDDGPDGGYEYEETIPVSQVSQFYLIGPSLTGEGAVNPIKPVEITGP
GLTVVDGKVKLVNDSDTLGFGFKTQQTYIYKREEYESGDQ
NT seq 3183 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaattcaaattcaattgcgtagttgcgtcttttattgctgcaactattagcctttct
gttaccgccgaagatatagagctttacgtaaaccacaacgtagaaaccgatgaaaagcct
cgagttttaattgtattcgatacatctgggagtatgtggagtaagcttcctaataatggg
ccaagaaaaattgatgccgctaaagatgcaatgaccgacttggttaataataatgagtct
attgattttggtcttatgcgctttcaaagtaactatggcggttatgttatggctgagatt
ggttcttcaagagctacggttaaaaatcagataaagagcttacctgctagtggcagtaca
ccagttactgaaacattatgggaagcttatttgtacttaactggccaacaagttttatat
gggtatgaagaatattcaggagatgaagattttttaagtaaaactgttacttatgaaaaa
aaccattataacaaaaagaaaaaagtaaccactcttacatatatttcgccattcggaact
gatttagacagcgatgaacgctgtgataattctattaaccttattttaatgacggatggc
gatcctcaaagtgacactgaaagtaataatgatatataccatctttataaatctaaattt
ggttcaaacccaagtacaacaagtggaagttatttagctgctctagcacaaataattcac
ggaacaagtgacgtagaagttgatctgtacgatagcacacctgaaattgcggatactggt
agagtctttaccataggttttggcagtggaatgagtactaatggtaaaaagctacttgaa
aaaacagctcaagtcggtggcggagaatatttacatgccaatacttctgcagaactttca
gaaaaattaaatagcaccatttctaaaataagagaggtaaacgataccttctcttcccca
actgtagcgagcaataatgttgatcaaactcgtagccgcgaagctatatactttacaatg
ttttaccctgaaaccggtgctcgctggggtggaaacttaaaaaagttggctatgtcgggc
tctactattgttgattctgatggtaatgaagcaataggtgatgatggcttaattaaagaa
gacgctcgaacgttttggctgcctactaataaatcagcggacggtaatttagtagcacaa
ggtggagtaaacgcttttctttctaccttagatgggcaaggtcgtaaattatacatagat
tcaggcggtagaattgtcgattttaccttcgataaagtaaaagaaattttaaatattgtt
tcagaaaccttaggcggtttaataccaggcacagatatttcaatttctcttaacgatatt
aattgggcaagaggcatagacgttgacgatgaagattcagatggctcatatgttgatcag
cgctctgatatttttggagatccacttcactctaagcctgtttctatagattacggtgat
ggtgatatacgtatccttgtaggaactaatgccggctttttacatatgtttaatgacaaa
ggcgatagcgttgaagaagagtgggcttttacaccagctgagttattaaaaaatatacca
gcgcttcgctcaaaccaagctaactctaaagtgtacggtatggatggcccaattagtgtg
tactttaataaccaaagcctaaatagcaaaggcttaaatgatggtgttgttgacgcatca
caaggtgatgaagtttgggcgtttgccggaatgcgccgtggtggtaataattactacgca
cttgatatcagcactccagataagccaaaacaattatggaataaacccattgttggaggc
tctgaagattttaaatacttagctcaaacatggtctaaaccacaaatagcgtacataaaa
gcgtttggagatgaaccgctattggtatttggcgcaggctacgatacaaataaagatgaa
gcaatcagaagcgaagacgaaacaggactcggcatttatattgttaaagcgagaaccggt
gagaaggtttgggcattaacgcctgaagataataactttcaaggaaagcacagtattgca
gctgatattgcaacgcttgactctgattacgatggctatatagaccgcttatatgcaaca
gatactggcggtaatgtatggcgtgtagatatgccagggtcagataaaaatgacatttct
tattttaaattagcagaacttgggagctcattagcttcacaagacaggcgctttttttac
aagccactcgttgcacgtactatgtttagtaaagcgagtaaaactacaaacgaaaatggc
gttgaaataacaacacgattagatacgccatacgatgcaattgttattggtagtggcaac
cgctcaaacccgcttgcaactaacgagcaagatcatttgtacatgatccgtgatgagcat
actgttacacaaacatttaactcagaagataaacctaccgctattgttccaagcgattta
atgcttatgaatgacgacccgtttggaaatgcattagataacgttgatgactttgtggat
ctagaggttgaccttgctggctttaaaggttggcgttatgagcttagtaatggcgaaaaa
tcgctagcagcggcaaccgtagttggtggtgttgcctattttacttcttttacacctgcg
cttgagtcaaataaaaaccagtgttcgttaacgggtggcggcggggctatgtatgcattt
cacttgcactatggtactaaggtttacgaccaacttaaatttactaccagttacgatgta
cctgatactgctcagttgtattttggtgaaggtgactcatgtatagacgctaacaataat
ggattatgtgatgttccaacacctgatgatggtaccccagacgacgatggcccagatggt
ggctacgagtacgaagaaacaatcccagtgagtcaggttagtcagttttatttaattggc
cctagcctaacaggcgagggtgcggtaaatccaataaagcctgttgaaattacaggccca
ggtttaacggttgtcgatggcaaagttaagttagttaatgatagcgatactttaggtttt
ggttttaaaactcagcaaacttatatttataaacgcgaagagtatgaatcaggagatcaa
taa

DBGET integrated database retrieval system