Pseudoalteromonas carrageenovora: PC2016_1503
Help
Entry
PC2016_1503 CDS
T06565
Name
(GenBank) BCCT transporter
KO
K03451
betaine/carnitine transporter, BCCT family
Organism
pcar
Pseudoalteromonas carrageenovora
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcar00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
PC2016_1503
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BCCT
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBJ71723
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(1716639..1718219)
Genome browser
AA seq
526 aa
AA seq
DB search
MKENHDKYSIDNTDYTVGQDNVQKWGFDIHNPVFGISAGLIVIFLIAILVTEPQTAKAAL
DGVKLDIINNFDALFMWAANFFVLFCLALIVSPYGNIRLGGDDAKPSHSRISWLAMLFAA
GMGIGLMFWGVAEPVAYFTGWYETPLNVTANTPEAAKLAMGATMFHWGLHPWAIYAVVAL
SLAFFTYNKGLPLSIRSIFYPILGDKAWGWPGHIIDILAVLATLFGLATSLGLGAQQASA
GINHVFGTDGGVGSQILVIVGVTLLAIISVVRGIDGGVKLLSNINMLIAFALLVFVCLVG
FAVAMGNVPNTIMGYVENIIPLSNPHGREDETWMHGWTVFYWAWWISWSPFVGMFIARVS
RGRTIREFLIAVLLIPTLVTILWMSIYGGIAIDQVVKGVGSLGTNGLTDVPLAMFQMLDE
LPMANILSFIAIVLVLVFFITSSDSGSLVIDSITAGGKIDAPVPQRIFWASVEGAIAAAL
LWIGGTEAIQALQAGAVSTGLPFTIVLLLMCVSLLLGLRTEPRSAK
NT seq
1581 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaggaaaatcatgacaaatatagtatcgacaatacggattacaccgtaggtcaggat
aatgtacaaaaatggggctttgatatacacaaccctgtttttggtattagtgcaggcctg
attgtcatttttttaatcgccattttggttactgagccgcaaactgcaaaagccgcactt
gacggtgttaagctcgatattattaataattttgatgctttatttatgtgggcagcaaac
ttttttgtattattttgcttagcattaattgtatctccttacggtaacattcgcttaggt
ggagatgatgctaaaccatcacattctcgtatctcttggcttgccatgttatttgctgct
ggtatgggtattggccttatgttttggggcgtagcagaacctgtagcctattttactggc
tggtatgaaacaccacttaacgtaacagcaaatacacctgaagctgcaaaacttgccatg
ggtgcaactatgttccattggggattacacccatgggcaatttacgcagttgttgcgctc
tctttggcattctttacctacaataaagggttacccctttcaattcgttctattttttac
ccaatattgggcgacaaagcttggggctggcctggtcatataattgatattttagccgtg
cttgcgactttgtttggccttgctacatcgttaggtttaggtgctcagcaagcatctgct
ggtattaaccacgtatttggaacagatggcggtgttggctctcaaatattagttatagtg
ggggtaacactactggctattatttcagttgtgcgcggtattgatggcggcgtaaaactt
ttaagtaacattaacatgttaattgcttttgcattattagtgtttgtttgcttagtgggt
tttgctgttgctatgggtaatgtacctaatactattatgggttatgttgaaaatataatt
cctcttagtaatcctcatggtcgtgaagacgaaacatggatgcatggctggactgtattt
tattgggcttggtggatttcgtggtcaccgtttgtaggtatgtttatagcacgcgtatca
cgtggtcgaactattcgagagttcttaattgcggtattactaatccctacgctagttact
attttatggatgtcgatttacggcggtattgcaattgatcaagtggttaaaggtgttggt
agcttaggcacaaacggtttaaccgatgtaccgttagccatgttccaaatgcttgatgaa
ctacctatggctaatattttatcgtttattgctattgtgttagtgttagtattttttatt
acttcgtctgactcaggctcgcttgtaatagactctattacagcaggcggtaaaattgat
gcacccgtgccacagcgtatcttttgggcatcggtagaaggcgctattgcagcagctcta
ctttggattggtggtacagaggctattcaagcgcttcaagcaggtgcagtatcaactggc
ttaccattcaccattgtattattacttatgtgtgtaagcttattattaggtttacgtact
gagccacgctcagctaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system