Pseudoalteromonas carrageenovora: PC2016_2119
Help
Entry
PC2016_2119 CDS
T06565
Name
(GenBank) Signal transduction histidine kinase
KO
K20974
two-component system, sensor histidine kinase [EC:
2.7.13.3
]
Organism
pcar
Pseudoalteromonas carrageenovora
Pathway
pcar02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcar00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
PC2016_2119
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01001 Protein kinases [BR:
pcar01001
]
PC2016_2119
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02022 Two-component system [BR:
pcar02022
]
PC2016_2119
Enzymes [BR:
pcar01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.13 Protein-histidine kinases
2.7.13.3 histidine kinase
PC2016_2119
Protein kinases [BR:
pcar01001
]
Histidine kinases
Other
PC2016_2119
Two-component system [BR:
pcar02022
]
Other families
SagS-HptB-HsbR (swarming activity and biofilm formation)
PC2016_2119
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
HATPase_c
HisKA
MCP-like_PDC_1
HATPase_c_2
HMMR_N
DegS
Coagulase
Phage_GPO
DUF2203
CENP-Q
FUT8_N_cat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBJ72315
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2428225..2430984)
Genome browser
AA seq
919 aa
AA seq
DB search
MPQRSKWTLAVLLGLLGGLVNLSPLYFFDSSEFLFGQVFVLCSLVFIGLRYACLSLAIVS
GFLLYRWGHCWPSIVYLLELFWLYTFCLRRSKPILPLGTVFWLLVGLPIIWGIGQFLIGL
PWLTLVVAISKYLINALISLALVDLFSVFVPHASRAYQGRPLARILSYVVSVIIILVILL
TSVILVNDHHSRLEYEVDAQLEEKAKYISTQLSDYLTFHKNAIVMSSDAISAGTDSEQQL
KRLMNLFPGFATSLYANPSGFVEITSPNNLIAGLTKAQRNVTDREYFNQAKQYPLGYSGG
VFQGRGLGNEAIVALSAPIYRDGEFFGVVEGSLKLGRLEQFIPNLFENTGELVVLDDKQK
VVFSSLEQFKILTDFNEDGFNARNMGDKNLFRSNNNEVYHSSKYVNPQSKWQVITFYNRK
HLSMAVAKAWLPSILLGAMLIIMVVLFVRQLANLLVQPISGLTNLMQSFNKSKKQTFNTD
SSWQEVLQLQQQFEMLATALQHSIENLQASNIKNQDLNKQLSEFNQQLEKQVAEQTNKLK
QAVERANLANVAKSQFLANMSHELRTPMNGILGMGEVLLRDSSLTDEQRDLLDTQQKSAQ
NLLKILNDILDFSKIEANAMQISPRPTNLAPFIENIKSLFSPIVSSDDVQFIVQCSNTLP
DCINVDDLRLNQVIINLLSNAYKFTERGFVRLSFDYSGQQLFVSVSDSGIGIAKDQQSLL
FSEFTQADVGVARKYGGTGLGLAISQGLIKKMQGEISLNSQPGKGSMLKFYINAPKAEFI
KPTAAVQSQSVPNLGSKKLLLVEDNPINRQVIAKMLEPTHVQLTMANDGIEALKVLKGNT
FDLILMDCQMPNMDGYECTQTIRANEVNTKAHVPIIAITANAYEDDKQRCLSVGMDDFVS
KPVSTQGLYEVIARVINAH
NT seq
2760 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctcaaagaagtaagtggacactcgctgttttattagggttgctagggggtttagtt
aacctctcgccgttatattttttcgacagttctgagtttttatttgggcaagtatttgta
ttatgtagcttagtgtttattgggctgcgttatgcgtgcttaagccttgcgatcgtatct
ggctttttactttataggtgggggcattgctggccgagtattgtttatttactcgagctt
ttttggctttacactttttgtttacgccgctctaaacccatactccctcttggtactgtt
ttttggctgttagttggtttacctataatttggggaatagggcagtttcttattggtctg
ccatggttaacgctagttgttgcaatatcaaagtacctcataaatgcgttaattagctta
gctttagttgatttatttagtgtatttgtaccccacgccagccgtgcctatcagggcagg
cctcttgctcgcattcttagctatgttgtaagcgttattattatattggttatactgctt
accagtgtaattttagtgaacgatcaccactctcggttagagtatgaggtagacgcccag
cttgaagaaaaagccaaatatataagcactcaattaagtgattatttaacgtttcataaa
aatgccattgtaatgagtagcgacgccataagcgcgggcactgatagtgagcagcagtta
aaaaggctaatgaatctatttccagggtttgctacaagcttgtatgcaaaccctagcggc
tttgttgaaataacgtcgcctaataaccttatagcggggttaactaaggcgcagcgtaat
gtcactgatcgcgagtactttaatcaggctaagcagtatcctcttggttatagcggtggt
gtgtttcaagggcgagggcttggcaatgaggccattgttgcgctgtcggcacctatttat
cgtgatggtgagtttttcggcgtagtagaggggtcgttaaagcttggacgattagaacag
tttattcctaatctatttgaaaacactggtgaattagttgtactggatgataaacaaaaa
gtggtttttagctcgcttgagcagtttaaaatattaaccgactttaacgaagatggtttt
aatgcgcgtaatatgggcgataaaaatttatttcgttccaataataacgaggtttaccat
agctctaaatatgttaatccgcagagcaaatggcaagtaatcactttttataatcgtaaa
catttgagtatggctgtagccaaagcatggctgccaagtatcttgctaggcgctatgcta
attattatggtggtgctgtttgtacgccaacttgcaaatttattagtgcagccaatcagt
ggtttaactaatttaatgcaaagctttaataaatcaaaaaaacagacttttaatacagat
tcaagttggcaagaagtactgcaacttcagcagcagtttgaaatgctcgccactgcgctg
cagcattcaatagaaaacctgcaagcgtcaaatataaaaaaccaagacctaaacaaacaa
ctcagtgagtttaaccagcagctagaaaaacaagttgctgagcaaaccaataagcttaag
caagcagtagagcgtgctaatttagctaatgtggctaaatcgcagtttttagcaaatatg
agtcatgaactacgcaccccaatgaacggtattttgggcatgggtgaggtattgctgcgt
gatagttcgttaaccgacgagcaaagagatcttttagatacgcaacaaaaaagtgctcaa
aacttattgaaaatcttaaacgatattttagatttttctaaaattgaggctaatgcaatg
caaattagcccgcgtcctacaaatttagcgccttttatcgaaaatattaaatcgttgttt
tcacccattgtaagctctgacgacgtgcagtttatagttcagtgcagtaacaccttgcca
gattgtattaacgtagatgatttacgcttaaaccaagtaattattaatttattatctaac
gcgtataagtttactgagcgcgggtttgtacgtttatcgtttgattacagtggccagcag
ttatttgtaagtgtgtctgatagcgggataggcatagcaaaagatcagcaatcgttattg
tttagcgagtttacacaagctgatgtaggtgttgcacgtaaatacggtggtaccgggctt
ggtttggccattagccaagggttaattaaaaaaatgcagggtgaaatatctttaaatagt
cagcccggtaaaggcagcatgcttaagttttacattaatgcgcctaaagctgagtttata
aagcccacagctgcagtacagtcgcaatcagtacctaaccttggtagcaaaaaattactc
ttagtggaagataaccccataaaccgccaagtaattgcaaaaatgttagagccaactcat
gtacaacttacaatggctaacgatggaattgaagcgttaaaagtgcttaagggtaatacc
tttgacttaattttaatggattgccaaatgccaaatatggatggttacgaatgtacccaa
accatacgtgctaacgaagtaaacactaaggcacatgtgcccattattgcaattaccgct
aatgcctacgaagatgataaacagcgctgtttaagtgtaggtatggatgactttgtatct
aaacctgtaagcacacaaggtttgtacgaagtaatcgctagggtgataaacgcgcattag
DBGET
integrated database retrieval system