Pseudoalteromonas carrageenovora: PC2016_2204
Help
Entry
PC2016_2204 CDS
T06565
Name
(GenBank) TonB-dependent Receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pcar
Pseudoalteromonas carrageenovora
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcar00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pcar02000
]
PC2016_2204
Transporters [BR:
pcar02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PC2016_2204
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
KdgM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBJ72396
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2527363..2529585)
Genome browser
AA seq
740 aa
AA seq
DB search
MKLRTLSQLSLAIVAALSTSVNAEEAKTTAKQDAFEKIEVTARKRTESLFESPTAITSIG
ANLIDKANMSNLEDIGKYVPNLNITRYGVGNAAHASVFIRGIGLQDHIITTDPGVGVYLD
GVYLGRQMGSNLSLPNVERVEVLRGPQGTLYGRNTLGGAVNVITKQPGDEGIVTTSAKIG
SRGRIAGDVYFNNSLNDELSMSASASYKTRDGVGEAVNLANPEKEIGEEEEFSGRVALKW
QANSDLAFTFSLDGVDNESGQSPYTIELTEPLDANDVFNGDFPLLTQDMIPSDPDDLGTT
VAGIESTSYSGWGSSFTADWAINDTYTAKFISSYRTSEYEGGLDDDASPLNLSEFPEEGG
ADQYSFEIQLNATYDNMDFVSGLYFFNEDGFTRSGPFVFSPFNTPNGLLNDGVTPSFGGY
GDFEINQETNSYAVYFNTSYDLTDDLSIGGGLRYSKDEKDADAIFPTFAERKYVSAEFDA
VTWDVNASYQISNNMNVYGQIQKGYQTGGFPPRPFGGPDQFVSFDETKAVNYEMGLKGQV
HENVSMMLAVFVTDYTDLALPFSDPTAGGGFVTIVENAGQSKAQGIELETTVAITDDFTI
RSAVGYLDSEITEVDAGVQGIGKGDSPALTPRWTVMIAPSYFMDLDSGATVAFNANYSYR
SDMQGQSVYNESETIDSRELVGFNVSYTNPYGDMEVTIYGENVLNEVYDVGRLQQSGFVG
VMRSNDRSEFGLKFKKDFEL
NT seq
2223 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaactacgcacactctcacagttaagcctagcaattgttgctgcactatctacctca
gtaaatgctgaagaagctaaaacaacagcaaaacaagacgcgtttgaaaaaatcgaagtt
acagctcgtaaacgtacagagagcttatttgaatctccaaccgctatcacatcaattggg
gcgaaccttattgataaagccaatatgagtaaccttgaagatattggtaaatatgttcca
aacttaaatatcacccgctatggcgttggtaatgcagcacatgcgtctgtatttattcgt
ggtattggtctgcaggatcatattatcactactgatccaggtgtaggcgtttatttagat
ggcgtttatttaggtcgtcaaatgggctcaaacttatcacttcctaatgttgagcgtgtt
gaggttctacgtggcccacaaggtacgctatatggtcgtaacacattaggtggcgcggta
aatgtaattactaagcaaccgggtgacgaaggtattgttactacttcggcaaaaattggt
agccgcgggcgtattgccggcgatgtttattttaataactcactaaacgatgaactaagc
atgtcagctagtgcatcatacaaaacacgtgatggtgttggtgaagctgttaatttagca
aatcccgagaaagaaattggtgaggaagaagaatttagtggtcgtgttgcccttaagtgg
caagcgaatagcgatttagcatttactttctctctcgatggtgttgataacgagtcgggt
caatcgccttacacgatagaattaactgagccgctagatgcaaacgatgtattcaatggt
gactttccactacttacacaagacatgatcccgtcagaccctgatgatttgggtactact
gttgctggtattgagtctacatcttattcaggttgggggtcgtcatttactgctgattgg
gcaattaatgacacatatacagctaagtttatttcaagctaccgtacttctgaatatgaa
ggcggtctagatgatgatgcctcaccacttaatttatctgagtttccagaagagggcgga
gctgaccaatactcgtttgaaattcaactcaatgctacttacgataatatggattttgta
tcaggcctttatttctttaatgaagatggatttacgcgttcaggaccatttgtatttagc
ccgttcaatacgcctaatggattattaaacgatggtgtaactccttcgtttggtggctat
ggcgactttgaaattaaccaagaaactaattcatacgcagtttattttaatactagttac
gatttgactgatgatttaagtattggtggcggccttcgctactcaaaagatgaaaaagat
gcagacgctatcttcccaacatttgcagagcgtaaatatgtaagtgctgaatttgacgct
gtaacgtgggatgttaatgcatcttaccaaatcagtaataacatgaatgtgtatggtcaa
atacaaaaaggatatcagacaggtggtttccctcctcgcccatttggtggaccagatcag
tttgtatcatttgatgaaactaaagcggttaactacgagatgggcttaaaaggccaagta
catgaaaatgtatctatgatgctagcggtatttgtaactgactacaccgacttagcactg
ccattttcagatcctacagcaggtggtggcttcgtaacaattgtagaaaatgcaggccag
tctaaagcacaaggtattgagcttgaaacaacggttgcaataacagacgactttaccatt
cgcagtgccgttggttacttagactctgaaattacagaggtcgatgcaggcgttcaaggg
attggtaaaggtgactcaccagcacttacacctcgttggactgtcatgattgcaccttct
tactttatggatttagacagcggtgcaacagttgcgtttaacgctaactattcatatcgt
agcgatatgcaaggacagtcggtttacaacgaaagtgagactatagactcacgtgagtta
gttggttttaatgtatcttacacgaacccttacggcgacatggaagttacgatatacggt
gaaaacgtattgaacgaagtttacgatgtaggtcgcttacaacaatctggttttgttggt
gttatgcgcagtaatgaccgtagtgagtttggcttaaaattcaaaaaagattttgagtta
taa
DBGET
integrated database retrieval system
