Pseudoalteromonas carrageenovora: PC2016_2303
Help
Entry
PC2016_2303 CDS
T06565
Name
(GenBank) Type IV fimbrial biogenesis protein PilY1
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
pcar
Pseudoalteromonas carrageenovora
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcar00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
pcar02044
]
PC2016_2303
02035 Bacterial motility proteins [BR:
pcar02035
]
PC2016_2303
Secretion system [BR:
pcar02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
PC2016_2303
Bacterial motility proteins [BR:
pcar02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
PC2016_2303
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Neisseria_PilC
VWA_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBJ72495
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2632011..2635232)
Genome browser
AA seq
1073 aa
AA seq
DB search
MKLNKILASLISLTLSASAFAEDIELYVNHDVDVEEKPRVLLIFDTSGSMAFSSSNGDNC
GYNNFLGLYNLCVDSRLAAAQFAMNKVVSDNEDTIDFGLMRFKSTTGGYIVNGVGSDSSV
VRNSIAALPADGGTPLTETLWEAYLYITGQGVQYGLEATTLERDTSAELRTGSQYTEVEC
DWVWKGRRSGWVYECENVVKDNYQYTYISPFEDSDAEAIRCDNSINIIYMTDGDPSGDND
SDSQISAEHEKYFGEGLNWNTDSYYSSYLHQMAKIIHGTSDVTVDLYPSTPDIHETGRLY
TIGFGSGMSASGQELLRRAASLGGGENLPASTPDELSNSLNSAISRIREVNDSFSSPSVA
SNNVDQTRSRDAIYFAMFYPETNTRWGGNLKKLKVSGSEIVDSADNTALDSDGLIDTDAK
TFWLPDGQSADGNLVAQGGVNYHLATLTGTPAEDRRNLYTDKQGDIVDFTTNIVSDILDL
VTNNPISLSSSDIEWAMGIDVDDEDNDGSNTDQRSDIFGDPLHSKPVAIDYGNDDIRILI
GTNAGFLHMFKDDDTNNEVSESWAFIPSDLYDIIQPLRNEDTGKVYGMDGPISVYFSDKS
LNDEGVNDGIVDASDGDDVWAFAGMRRGGRNYYALDITNPNEPKKLWDNPIEGGKGDFTE
LAQTWSKPQIAYIKAFGDKPLLVFGAGYDTNKDAVVRSEDSVGRGIYIVEAETGKKVWAL
TPSENGFKGKHSIAANVSTLDSDYDGYIDRIYAADTGGDIWRIDMPGSSTSNFTHFKLAE
LGSSLASQDRRFFYQPLVARTLYSKVSETTINGETVITRLDTPYDAIVIGSGNRSKPTGT
NEDDQLFMIRDENTVTKSFTTSPTAIKPTDLMQMNSDPFGNALDDVDEFVDLEVDLAKFK
GWRYELGSGEKSLAAATVVGGVAYFTSFTPSSDTSTENQCSLSGGGGSLYAFHLHYGTKV
YDDLKFTTSYDVPDTPQLYFGEGPSCADGNGDGMCDDNPTIEVTQESQFYLIGPGIKGED
AQNPMKPVEVVGPGLTVVDGTIQLVNDSDTVGFGFKTQQTYIFKREENDEVGN
NT seq
3222 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacttaacaaaatacttgcctcattaattagtttgacgcttagtgcatctgctttt
gctgaagatatagagctgtatgttaaccatgatgttgatgtagaggaaaaaccccgcgta
ttattaatttttgatacatcaggaagtatggctttttcatcttcaaacggagataactgt
ggttataataattttttaggattgtataacctatgtgtggatagccgacttgcagctgcc
cagtttgcaatgaataaagtggtatcagataacgaagacactattgattttggcttaatg
cgttttaagagcactacaggtggctacattgtaaacggtgttgggagtgactcttcagta
gtacgcaattccatagcggctttgccagctgatggcggaaccccgcttacagagacttta
tgggaagcctatttatatattaccggacaaggagttcaatatggtcttgaagcaaccaca
cttgaacgcgatacaagcgctgaattaagaaccggtagccagtatacagaggttgaatgt
gattgggtttggaaagggcgacgttctggatgggtatatgagtgtgaaaatgtagtaaaa
gataactaccaatatacttacatatccccttttgaagacagcgatgctgaagctatacgc
tgtgataattcaatcaatatcatttatatgactgatggcgacccatctggtgataatgac
agtgatagccaaattagtgccgagcatgaaaaatactttggtgaaggactaaactggaat
acagatagttactacagcagctaccttcaccaaatggctaaaattattcatggtacaagt
gatgtaacagttgatttatacccttctactcccgatattcacgaaacaggtcgcttatat
accataggttttggctcgggtatgagcgcaagcggtcaggaacttttaaggcgtgcagcc
tctttaggtggcggtgaaaacttacctgcaagtacccccgatgagctctctaactcacta
aatagcgcaatttctcgtattcgtgaagtaaacgatagcttttcatctccctcagtagca
agtaataacgtagaccaaacacgtagccgcgatgctatttactttgccatgttctaccca
gaaactaacacaagatggggcggtaatttaaaaaaattaaaagtatcaggcagtgaaata
gtcgactcagcagataatacagcgcttgattctgacggtttaattgacaccgatgctaaa
acattttggttacctgatggccaatctgccgatggtaacttagtagcgcaaggtggagtg
aattaccatttagctacattaacaggtaccccagcagaagacaggcgcaacctctacact
gataaacaaggcgatattgtagattttaccactaatatagtgagtgatattttagactta
gtaactaataacccgattagcttatccagttcagatattgaatgggctatgggcattgat
gttgatgacgaggataacgatggttcaaatacagaccaacgcagcgatatttttggcgac
cctcttcactctaaacctgttgccatagactacggtaacgatgatatacgtatacttatt
ggcactaacgccggctttttacatatgtttaaagacgacgatactaataacgaagtaagt
gaaagctgggcattcatcccttcagacttgtacgatattattcagcctttacgcaacgaa
gatactggtaaagtgtatggtatggacggcccaatcagtgtttattttagcgataaaagc
ttaaatgatgaaggtgttaacgatggtattgttgatgccagcgatggcgacgatgtttgg
gcctttgcaggaatgcgacgtggcgggagaaactactatgcgcttgatatcacaaaccct
aatgaaccaaaaaaattatgggataatccgattgaagggggtaaaggcgattttacagag
cttgcacaaacgtggtcaaagccacagatagcttacataaaagcgtttggtgataaacca
ttattagtatttggtgcagggtatgatacaaataaagacgctgttgtaagaagtgaagat
tcagtaggtcgtggtatttatattgttgaagctgaaacaggtaaaaaagtgtgggcttta
acgcctagtgagaatggctttaaaggaaaacactcaatagcagctaatgtatctacatta
gattctgattacgatggctatattgatagaatatatgcagctgatactggcggagatatt
tggcgtattgatatgcctggtagtagcacaagtaattttacacactttaaacttgctgag
ttaggcagttcattagcgagtcaggatagacgttttttctatcaaccactagtagcgcgt
acgctttatagtaaagtaagtgaaacaacgattaatggtgaaacagtcattactcgttta
gatacaccctatgatgcaattgtgattggaagtggtaatcgctctaaaccaaccggtaca
aatgaagacgatcagttatttatgatccgggatgaaaatacagtaactaaatcgtttact
acttcgcctacagcgattaagccaacggatctaatgcaaatgaatagcgacccatttggt
aatgcattagatgatgttgatgaatttgttgatttagaagttgatttagctaaatttaaa
ggctggcggtatgagctaggttcgggtgaaaaatcattagcggcagctacagtggtaggg
ggggtagcatactttacaagttttacgccatcttctgacacgtcaactgaaaatcagtgc
tcgttaagtggcggtggaggttcgttatatgctttccacttacactatgggaccaaagtg
tatgacgatttgaaatttacaactagttatgatgtgcctgatactcctcaattatacttt
ggagaggggccgtcatgtgctgatgggaatggcgacggcatgtgcgacgacaacccaact
attgaagtaacacaggagagtcaattttatttaattggtcctggaattaaaggtgaggat
gcgcaaaatcctatgaaacctgtagaggtagtaggcccaggcttaacggttgtggacggt
acaatacagttagtaaatgattctgatacagtaggatttggttttaaaacacagcaaacc
tatatctttaaacgcgaagaaaatgatgaagtgggtaattaa
DBGET
integrated database retrieval system