Pseudoalteromonas carrageenovora: PC2016_3101
Help
Entry
PC2016_3101 CDS
T06565
Name
(GenBank) sensor histidine kinase
Organism
pcar
Pseudoalteromonas carrageenovora
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
HATPase_c_3
HATPase_c_2
OATP
dCache_1
HAMP
Spectrin_Anc-1_2
DUF1351
Hormone_1
FlgN
HATPase_c_5
OmpH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBJ73286
LinkDB
All DBs
Position
I:3526022..3527506
Genome browser
AA seq
494 aa
AA seq
DB search
MNLSLYQKLAVSLVVIFCFICALVYSWSKQLELTSKHHGEQNLHLALAEHLVQDNPLIKE
GVYDYAALENLFHTLMLLGPAFEFYFVDENGKILTYSAEPGKVKRTHINLAPLKKLINNP
DAAPIYGDNPRNKAQQKIFSVAPVFNNDKLQGYLYVIIGGEAYDTSLNTIKNNDKLWLAA
LWLGSALVFLLIAMLILLRFFTNPIQRLARDVSKIEAANYSITDTKLSNYSTQKSNEVHS
LGRSIQAMVTRIDEQFKELEQSDKQRKELLTHLSHDLRTPLASLQGFLEVLNQSGAQLSA
KEQREYLHVSLNNCDQLKQLIEQIFELAHLENGEISIHKETFNLGELIYDCIAKFSLTAE
KKGLNLTVEPAICDFPVVADIAKLERVLSNLIDNAIRHTPKGGSIAVHVKRIDQKQLFVQ
VSDTGVGIKHDELNAIFNPHYQASNSHNEGRQQGGLGLAICKGLLKLMDSEINVQSELGK
GTMFSFNLPQKIKV
NT seq
1485 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacctatctttgtatcaaaaattagcggtgtcgttggttgttatattttgttttatt
tgcgcactagtttacagctggagtaaacaactagagctcacctcaaagcatcatggcgag
caaaacctgcacttagcccttgctgagcatttagtacaagataacccattaataaaagaa
ggtgtatacgactacgcagccctagaaaacctatttcataccttaatgttattaggcccc
gcatttgagttttattttgtagatgaaaacggaaaaatcctcacttactcagcagagcct
ggtaaagttaaacgtactcatattaatttagcacccttaaaaaagctgattaacaaccca
gatgcagcaccaatttatggagataacccaagaaataaagcgcagcaaaaaatattctcc
gtagcgcctgtatttaataacgataagttgcaaggatacttatatgtaattattgggggc
gaagcttacgacacatctttaaacacaattaaaaataatgacaagctatggctagctgct
ttatggcttggatcagcacttgtatttttactgattgcaatgcttattttactgcgtttt
tttaccaaccctattcaacgattggcgcgggatgtaagtaaaattgaagcggctaattac
agtattaccgatacaaagctcagtaactattcaacacaaaaaagcaacgaagtgcacagt
ttaggccgaagcattcaagctatggttactcgtattgacgagcaatttaaagaacttgag
caaagcgataaacagcgcaaagagcttcttacccatttatcgcacgacttacgtacgcct
cttgcctctttgcagggattcttagaagtgcttaatcagtcaggcgcacagttaagcgct
aaagaacaacgagagtacttgcatgtttcacttaataactgcgatcaacttaaacagctt
attgagcaaatttttgagcttgcccatttagaaaatggcgaaataagcatacacaaagaa
acctttaatttaggtgagcttatttacgattgcattgctaagttttctcttaccgctgag
aaaaaaggccttaacttaacagtagagccggcaatttgcgactttcctgttgtagccgat
attgcaaaacttgagcgtgtgttgagtaatttaattgataatgcaataaggcacacacct
aaaggcggcagtatagctgtacacgttaagcgcattgatcagaagcaattatttgtgcag
gtttctgatactggtgtgggaattaagcatgatgagctaaacgctatttttaatccgcat
tatcaggcttcaaactcacataacgaagggcgacaacaaggtggcttaggacttgctatt
tgtaagggcctattaaaacttatggacagcgaaataaatgtacaaagtgagctgggcaaa
ggcactatgtttagctttaacttgccacaaaaaataaaggtatag
DBGET
integrated database retrieval system