Pseudoalteromonas carrageenovora: PC2016_3762
Help
Entry
PC2016_3762 CDS
T06565
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor for Fe
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pcar
Pseudoalteromonas carrageenovora
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcar00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pcar02000
]
PC2016_3762
Transporters [BR:
pcar02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PC2016_3762
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBJ73930
LinkDB
All DBs
Position
II:complement(677633..680173)
Genome browser
AA seq
846 aa
AA seq
DB search
MSTYRLNTLAAAVAFAFSAPSIVNAQEAPVQAQQNIEQISVLGSRVSNRTSTESSSPIDL
IDADDLNKGGFTELGQSLQATAPSFNFSRTQVSDGSDLFRPATLRGLQPDQTLVLVNGKR
RHNQSIFGLNGTVGAGAAGTDMNAIPLTALKGVEVLRDGAAAQYGSDAIAGVINLSLNNS
TGVTTGYVQYGGTSEGDGDTLSAGLNRGFDLGNEGGFINLSLEYRDADGTNRAERDTGGS
LNVEPGTLSEDVRWSQGNSESEFTSLFYNMALPMGDGELYSFGGYSERTALGNGFYRNFN
EASKNVTQVYSDGFLPRIYNEAEDISVAVGFRGDINPDWNYDVSAVYGENQYDFTSRNTI
NASYAAEYVFNNPDASDADIAANAGPSGGYSGGFRFDQTTVNLDVNGIVDIGRNEPLYVT
IGAEYRKENYEIVPGDEASYACGLANTDASYPSVNDSDQFAECGFQAYNGLRPEATNESD
RNSYAFYVDVETMITDAWNVSGALRYEDFSDAGDDLIGKLATRYEFNDDFAVRGAVSTGF
RAPSLQQSGYTAFTTNLGSDGTLTQSFTANTGTAFPSALGVDSLELETSTNYSAGFVYDV
TSELSLTVDFYRVEIKDRITLGSLLSADDVAFSDEAVAALQATGAVQANYFSNSVDSTTQ
GVDIIASYRTEVEGGNFGVTFAGNLNDTKIDNVNAEEGIPESVAFDDLQRSFFTDGQPSE
RATLTFDYERDVYTSTLRFNYFGETDVKYFGNDHISLPGELSPTGSFKPTSTVESAVLVD
LNVSYQINEIFNLSVGADNVFDETPDELGDDEVLNFITNGAFKYPVRALPYGFDGRTYYA
KVSFEF
NT seq
2541 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaacataccgtttaaacacattagctgcagccgttgcgtttgcttttagcgcaccg
agcattgtaaacgcacaagaagcgcctgttcaggcacagcaaaacatagaacaaatatct
gtattaggatcgcgcgtttctaaccgtacctcaactgagtcttcgtcacctatagattta
atagacgcagatgatttaaataaaggtgggtttacagagttagggcaaagcctgcaagca
acagcgccttcgtttaacttttcgcgtacacaggtatctgatggctctgatttatttaga
cctgcaacgcttcgtggtttacagcctgatcaaacgttagttttggttaacggtaagcgc
cgccataatcaatcaatttttggccttaacggtactgtaggtgcgggcgctgccggcacc
gatatgaacgctattccgcttactgcacttaaaggtgtagaggtattacgtgatggcgca
gcagcgcagtacggttcagatgcaattgcgggcgtaattaacttatcacttaataattca
acgggtgtaaccactggttacgttcagtacggtggcaccagtgaaggtgacggcgatacg
ctttctgcaggtttaaatcgtggttttgacttaggcaacgaaggcggctttattaactta
tcgcttgaataccgcgatgccgatggtacaaacagagctgagcgcgatacgggcggctcg
ttaaatgttgaacccggtacgcttagtgaagatgtacgttggagccaaggtaattctgaa
agtgaatttacctcgttgttttacaatatggcattgcctatgggcgacggcgagctttac
tcgtttggtggttactctgagcgaactgcactaggtaatggcttttaccgcaactttaac
gaagcctctaaaaacgtaactcaagtgtacagtgatggttttttacctcgtatttataac
gaagctgaagatatttcagtagcggttggttttagaggcgatataaacccagattggaat
tacgatgtatcggcagtgtatggtgaaaaccaatacgactttacctcacgtaatactata
aatgcctcttatgcggcggagtacgtatttaacaacccagatgcaagcgatgccgatata
gcagcaaatgcaggcccaagcggcggttactctggtggctttaggtttgatcaaactacg
gttaatttagatgtaaacggtattgtagatattggccgcaatgaacctttatatgtaact
attggtgcagaataccgtaaagaaaactacgaaatagtacctggcgatgaagcatcttac
gcatgtggcttggcaaatacggatgcttcgtatccatcagtaaacgattctgatcagttt
gcagagtgtggttttcaggcgtataacggcctgcgcccagaggcaactaatgaaagcgat
cgcaacagttacgcgttttatgtagacgtagaaactatgatcactgacgcatggaacgta
agtggtgcgctgcgctacgaggacttttcggatgcgggtgatgatttaattggtaagtta
gccacacgttatgaatttaacgatgactttgctgtgcgtggtgcggtatctactggcttt
agagcaccttcgcttcaacaaagtggttatacagcatttacgactaacctaggttctgac
ggaacacttacgcagtcgttcactgcaaatacggggactgcttttccaagtgcgttaggt
gtagatagcctagagcttgagacatcaactaactacagcgcaggttttgtttacgatgta
acaagtgagctttcgttaacggttgatttttaccgcgtagaaattaaagaccgtattacc
cttggtagtttactttctgcggatgatgttgcctttagtgatgaagccgtagctgcttta
caagcaacaggcgccgtgcaagctaactacttttcaaactctgtagactcaactacgcaa
ggtgttgatattattgcatcttaccgtacagaggttgaaggcggaaactttggtgtaacc
tttgctggcaacttaaacgacactaaaattgataacgtgaacgcagaagaaggtattcct
gagtcggttgcgtttgatgatttacaacgtagcttttttactgatgggcagccaagtgaa
cgtgccacactaacgtttgattacgagcgtgatgtttacacatcaacacttcgttttaac
tactttggcgaaacagacgttaagtactttggtaacgaccatatctctttaccaggagag
ctttcgccgactggttcgtttaaaccaacaagcacggttgaatcagcagtattagtggat
ttaaacgttagctaccaaattaacgaaatatttaatttatcagtgggcgccgacaacgta
tttgatgaaaccccagatgaattaggtgacgacgaagtacttaattttatcaccaatggt
gcgtttaaataccctgtacgtgcattgccttatggctttgacgggcgtacttactatgca
aaagtaagctttgaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
