Plasmodium chabaudi: PCHAS_0403000
Help
Entry
PCHAS_0403000 CDS
T01108
Name
(RefSeq) spindle pole body protein, putative
KO
K16569
gamma-tubulin complex component 2
Organism
pcb
Plasmodium chabaudi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
pcb03036
]
PCHAS_0403000
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04812 Cytoskeleton proteins [BR:
pcb04812
]
PCHAS_0403000
04147 Exosome [BR:
pcb04147
]
PCHAS_0403000
Chromosome and associated proteins [BR:
pcb03036
]
Eukaryotic type
Centrosome formation proteins
Microtubules and associated factors
gamma-tubulin ring complex
PCHAS_0403000
Cytoskeleton proteins [BR:
pcb04812
]
Eukaryotic cytoskeleton proteins
Microtubules
Tubulin-binding proteins
Gamma-tubulin complex components
PCHAS_0403000
Exosome [BR:
pcb04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of haemopoietic cells (B-cell, T-cell, DC-cell, reticulocyte, and mast cell)
PCHAS_0403000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GCP_N_terminal
GCP_C_terminal
FAM180
UvsW-1
TPP_enzyme_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3498283
NCBI-ProteinID:
XP_745161
UniProt:
A0A4V0K2T0
LinkDB
All DBs
Position
4:123103..128559
Genome browser
AA seq
1818 aa
AA seq
DB search
MDITKIKKKVEKENADRINIIDTKFRTCLCLFNNYSKCYINIKKKYFMDTCRYDKIYGFE
NIKINEERINEINKESSLEYPYPYKYENNRNIFLIINSKNVNSTNTCIYNNDIIYIIYNN
KKYEHINIQKRSSKKTKYTKKKNERTSHIHNQILASQDKSTSDFSNNTNSIFSSSENNEE
KEDDENEQNPLYNSTIFETRNMNFSETLEKKSKKKKIISSKSNKRNLIYSDIDSDNNYEN
VFTHINSNLYFLSVSNNHIENEQNLYIQNEKYINNNDIIFRKLKFTKSLFINLDTYNSWI
VIKKSILLNEFLNRSKKNELVDINDVLYDITNSYGKIKNCHTRLYVNDGFLLINNKTKEI
LGVRKINNATSKIKYNSNIDTNYNTQKHGHTYNEEINNGDKNKIIDESETYKLVLIKKMN
LNHLFCMSTDINIVFNFHDVCLKSYNKIDMANHYLLASHTLNIHNIRPEYNKENPTNLDL
SNPDYTYFNNYITQKIVENYNSYNLYIKESLLIIDILYILNNSYGNLIYIKEYYKYDHQN
YYSDIVTFLKQNKNTFNDSHANNAQSSLEPHKDINEYDEKKTKKIQKSKKKHSNTSIYSI
SSYSNSDEEDENYEPPSASSYCSSNRYSYSKMDTTNKKKFQELNNYLVYIIPKYKIVIYP
SIYNSKDQNNSNIKMVKEILKLGIYLRRIQKFIEINKRSQSCNATFEIFSCCLNNITLHI
INHINRIEQNIRNIYNFTKMNMQGKEEIALSLFDENRMSFSANNEQQNLFFTINSLFNKN
VKDFNLFFNINIEKADDISLYKIKLCILPLMQIAKLLNKIINKIAIKKKFNDTKYLIDLI
YKLQEYLNKDDINKTVLTYILKNITIPLFDFIKNYIFHGKVKDTFREFFIHENKHITPFY
KQNNKIYYINHNFYKYIFKKYIDLSTNYWGAKYVILNSKVPKFLKSIANQIFITGKYIDV
LLACSTILNFNTPLFFDLNFSDNNYNDSSCSYIPGKLLLLNYEDKPNTYSYNKSKQNNQT
NTYTGTITKYEQAQNKVTDEFSSIESYITYKKQRKTSATGFDINHSENRFRDEHNYYDNQ
NKFNNQFLIDQTNNNECFLLYDSEQKTYEELIHNQHLYASKKMFELYIKNIDIKEKIRHH
FFFYFLQISDYLKYFYILSHDHLEKLYNHKKNNVLTKIKNFFDISLRSSVLDNLKYRKDY
TIHVSDILNITDNINLIIDLKKFCKFNKSARNSIGNNHTHRRSRNNMDDSSDNSNENDNT
NRHQSNNNYDNNFQSHTQIKERSKSPINIQTNVNVEIYKGLILSYHNVFPYNLIFNNITI
FKYTLIFRILNYCKYIEHKLTEVWINHMFIKNVDMTNECRNNLMLCIHTRESMIHFIKCY
IYHVQDDVIKSEYMSMNDKLKETFIFDDIIYIHNNYLNNIFKYSFIINQNIINSILKIIS
IAHIFTRHILKFSFNKNDPASDITRSRPERVQNNSINKDLSNQKNFNTNNKTDKNNYQKK
FINELLRDKAYISMIHNTIKHYDKHFKNFFLLLTEYVNNNIDDYAHNFLIKLDYNFYYTN
KYKQSFQANSSNYHAQNNVEWTPNQSQDHHQSKNYLSQNQDHISINPTNNEYTGKINSSD
YHYGNSAHLHRPHKDTNINEHPEHARNYNNYINNNNNAWPVIPDISPTSNHMPMHTSNDN
MSPMMHHSANNYNENHLKYEINRNNFANINRDSNNAYNQIPIQQNNYNKSKLIDNNILNE
NSYTTLYPQNNQQNIPITHDNYEHAINNVSPNNINYAKLKKYTPYNNNTNQQINNINVSN
IDLNSIDNSMNNSRMFNL
NT seq
5457 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatattacaaaaataaaaaaaaaagtggaaaaagaaaatgcagacagaataaatata
attgatactaaatttcgaacatgcttatgcttattcaataattattcaaaatgctatatt
aatattaaaaaaaaatattttatggacacatgtagatatgataaaatatatggctttgaa
aatataaaaattaatgaagaaagaataaatgaaataaataaagaaagcagtctcgaatat
ccatacccttataaatatgaaaataatcgaaatatttttttaattataaatagtaaaaat
gttaactctacgaatacttgtatatataacaatgatattatatacatcatttataataat
aaaaaatatgaacatataaatatacagaaaaggtcaagtaaaaaaacgaaatacacaaaa
aaaaaaaatgaacggactagccatattcataatcaaattttagctagccaagacaaatca
actagcgatttttcaaataacacaaatagcatattttcaagttcagaaaataatgaagaa
aaagaagatgacgaaaatgaacaaaacccattatataatagtactatttttgaaacacga
aatatgaatttttctgaaacattggaaaaaaaatcaaaaaaaaaaaaaattataagctca
aaaagtaataaaaggaatttaatctattcagatattgattcagataataattatgaaaat
gtatttacacacataaattcaaatttatattttttaagtgtatcaaataatcatatagaa
aatgaacaaaatctatatatacaaaatgaaaaatatataaataataatgatatcatattt
agaaaacttaaatttactaagtcgctatttattaatttagatacatataattcatggatt
gttatcaaaaaaagtatcctactaaatgaatttctaaatcgttctaaaaaaaatgagcta
gtagatattaatgatgtactatatgatattacaaactcgtatggaaaaattaaaaattgt
catactagattatatgttaacgatggatttttattaataaataataaaacaaaagaaata
ttgggagtaaggaaaataaataatgctacgtctaaaataaagtataactcaaatatagac
acaaattataatacacaaaagcatggtcatacatataatgaagaaataaataacggcgat
aaaaataaaataattgatgaatcagaaacttataaattagtattaattaaaaaaatgaat
ttaaatcatttattttgtatgtctacagatataaatatagtctttaattttcatgatgtt
tgtttaaagagttataataaaattgatatggctaatcattatttattagctagccacaca
ttaaatattcataatatacgcccagaatataataaagaaaatccaacgaatctagatcta
tcaaaccctgattacacatattttaataattatattacacaaaagattgtagaaaattat
aatagttacaatttatatattaaagaatcattactaattattgatatattatacatttta
aataatagttatggaaatttaatatacataaaggagtattataaatatgaccatcaaaat
tattattcagatatagtaacatttttaaaacaaaataaaaacacatttaatgattctcac
gcgaataatgctcaaagtagtttagaaccccataaagacatcaatgaatatgatgaaaaa
aaaacaaaaaaaatacaaaaatcaaaaaaaaaacatagtaatacatcaatttattctata
tcatcttatagtaacagtgatgaagaagatgaaaattatgaaccaccctctgcttcttca
tattgttcaagtaatagatatagctattcaaaaatggatactacaaataaaaaaaagttt
caagaacttaacaactacttagtatatatcatccctaaatataaaattgtcatatatcca
agtatatacaattccaaagatcaaaataatagtaatattaaaatggtgaaggaaatactt
aaactaggaatatatttaagacgaattcaaaaatttattgaaataaataaacgaagtcaa
tcatgtaatgctacatttgaaatattttcatgctgtttaaataatatcaccttacatata
attaatcatataaatcgaattgaacaaaatataagaaatatttataattttactaaaatg
aatatgcaaggaaaagaagaaatcgctttatcactttttgatgaaaatcgaatgtctttt
tctgcaaataatgaacaacaaaatttattttttactattaatagtttatttaataaaaat
gtaaaagattttaatctattttttaatattaatatagaaaaagcagatgatatttcttta
tacaaaattaaattatgtatattgccgttaatgcaaatagccaaattgttaaataaaatt
attaacaaaatagctataaaaaaaaaatttaatgacacaaaatatttaattgatttaatt
tataaacttcaagaatatttaaataaagatgatattaataaaacggttttaacatatata
cttaaaaatattactatcccattatttgattttatcaaaaattatatattccatggtaaa
gtaaaagacacatttagagaattttttattcatgagaataaacatatcacaccattttat
aaacaaaataataaaatatattatattaatcataatttttataaatatatttttaaaaaa
tatattgatttgtctacaaattattggggtgctaaatatgttatattaaattcaaaagtt
ccaaaatttttaaaatcaattgctaatcaaatatttattactggaaaatatatagacgta
ttattggcttgttcgactatacttaattttaatacaccattattttttgatttaaatttt
tcggataataattataatgactcgtcttgttcatacatacctggcaagctacttcttctc
aactatgaagacaaaccaaatacctattcctataataagtcaaaacaaaataatcaaacg
aatacatatacaggaaccataaccaaatatgaacaagctcaaaataaagttacagacgaa
ttttcctccatcgaatcatatataacttataaaaaacaaagaaaaacaagtgccaccgga
tttgatataaatcattcggaaaatcgtttcagagatgaacataattattatgacaatcaa
aacaaattcaataatcaatttttaatagaccaaacaaataataacgaatgttttttatta
tatgactcagaacaaaaaacttatgaagaacttatacataatcaacatttatatgcatcc
aaaaaaatgtttgaattgtacataaaaaatattgatataaaagaaaaaataagacatcat
ttttttttctattttttacaaattagcgattatttaaaatatttttatatattatcacat
gaccatttagaaaagttatataaccataaaaaaaataatgtgcttactaaaatcaaaaat
ttttttgatatatctttaagatcatcagttttagataatttaaaatatagaaaagattat
actattcatgtttccgatattttaaatattacagacaatataaatctcattattgattta
aaaaaattttgtaaatttaataaatcagctcgaaattctattgggaacaatcatacccat
cgaagaagtagaaacaatatggatgatagtagtgacaatagtaatgaaaatgataataca
aatagacatcaatcaaataataattatgataacaatttccaatcacacacacaaataaag
gaacgatcaaaatcacctattaatattcaaacaaatgtaaatgtagaaatatataaaggt
cttattttatcatatcataatgtttttccatataatttaatatttaataatataactata
tttaaatatactttaatatttcgtatattaaattattgtaaatatatcgaacataaatta
accgaagtatggataaatcatatgtttattaaaaatgttgatatgactaatgaatgtaga
aataatttaatgttatgtatacatactagagaatctatgattcattttatcaaatgttat
atttatcatgttcaggatgatgttataaaatcggaatatatgtctatgaatgacaaatta
aaagaaacttttatttttgatgatattatatatattcataataattatttaaataatatt
tttaaatattcttttattattaatcaaaatattattaactctattttaaaaattatttcc
attgctcatatttttacaagacatatcctaaaattcagttttaacaaaaatgatccagct
agcgatattacacgatctcgacctgaacgtgttcagaataattcaatcaataaagattta
tcaaatcaaaaaaattttaatacaaataataaaacagataaaaataactatcaaaaaaaa
tttataaatgaactattacgagataaagcatatatatctatgatacataatacaataaaa
cattatgataaacattttaaaaattttttccttcttttaacggaatatgtaaataataat
attgatgactatgctcataattttttaatcaaacttgattataatttttattacacaaat
aaatataagcaatcctttcaagctaattcatctaattatcatgcacaaaataatgtagaa
tggacacctaatcaaagtcaagatcaccatcaatcaaaaaattatttatcacaaaatcaa
gaccatatctctattaaccctactaataatgaatatactggaaaaatcaattcttctgat
tatcattatgggaatagtgcccatttacatcggccccataaggacacaaacattaacgaa
catcctgagcatgctcgaaattataataactacataaataataataacaatgcctggcca
gttataccagacatttctccaacctcaaatcatatgcccatgcacacatcaaatgataat
atgtcccctatgatgcatcattccgcaaacaactataatgaaaaccatttaaaatatgaa
attaacagaaacaactttgcaaatataaatcgtgatagcaacaatgcatataaccaaata
ccaatacaacaaaataattataataaatcaaaattaattgataataatatcttaaatgaa
aatagctatactacattatatccccaaaataatcaacaaaatattccaataacccatgat
aattatgaacatgcaataaataatgtatcacctaataacattaattatgcgaaattgaaa
aagtatactccatataataataatactaatcaacaaattaataatataaatgtaagtaac
atcgatttgaacagtattgataatagtatgaacaacagcagaatgttcaacctttag
DBGET
integrated database retrieval system